Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T3Z1H0

Protein Details
Accession A0A2T3Z1H0    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
200-219SDDDKKPQAKKPQAKKQKVEBasic
340-367PLPPNPYDLKKEKKKNEPFSRIDRNIKVHydrophilic
389-416LIVTKGKGFTKEKNKKKRGNFRAGVIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
167-171KNLKR
205-217KPQAKKPQAKKQK
395-407KGFTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSNASKPPSWLFSNNTNNNPSQSKDQSSNSSSTNNSSNGEMAKSKTPAADKGAEAQESSAQPPAQLLDLVEQFLSDNSFSSALSAFKKQRSKKGWGEASENTSGSTLVAVFKAWENSAKAPADRDVDMDDSSSSSSSSDSSSSSESSSSESESESESEDEKPALGKKNLKRKAPPSSSSDSSSDSSSSDSDSDSSSDSDSDDDKKPQAKKPQAKKQKVEAKPTPSSDSDSDSDSESESSSSDESSSDESSSDESSSSDEDSSSDDSSDSESEVDAKEAAKVPLPESDSDSSSSDSDSDSDSDSDSDKKPKVNGVAKTKSEAKESSDSSSSATMDSVPNPPLPPNPYDLKKEKKKNEPFSRIDRNIKVDPKFASNEYVPISYSQRAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGNFRAGVIDITEKKAVYFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.61
3 0.6
4 0.57
5 0.57
6 0.55
7 0.48
8 0.46
9 0.45
10 0.44
11 0.46
12 0.49
13 0.52
14 0.53
15 0.52
16 0.46
17 0.44
18 0.4
19 0.38
20 0.37
21 0.32
22 0.29
23 0.27
24 0.27
25 0.24
26 0.26
27 0.25
28 0.23
29 0.26
30 0.27
31 0.27
32 0.29
33 0.3
34 0.31
35 0.34
36 0.35
37 0.31
38 0.36
39 0.38
40 0.35
41 0.32
42 0.28
43 0.28
44 0.25
45 0.25
46 0.22
47 0.18
48 0.17
49 0.18
50 0.18
51 0.14
52 0.13
53 0.12
54 0.12
55 0.13
56 0.14
57 0.13
58 0.12
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.07
63 0.07
64 0.08
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.1
69 0.12
70 0.14
71 0.2
72 0.24
73 0.31
74 0.41
75 0.46
76 0.55
77 0.59
78 0.65
79 0.67
80 0.73
81 0.73
82 0.68
83 0.68
84 0.62
85 0.6
86 0.54
87 0.45
88 0.35
89 0.28
90 0.24
91 0.17
92 0.13
93 0.09
94 0.07
95 0.07
96 0.06
97 0.07
98 0.08
99 0.1
100 0.1
101 0.13
102 0.15
103 0.16
104 0.21
105 0.22
106 0.21
107 0.22
108 0.24
109 0.24
110 0.22
111 0.21
112 0.18
113 0.18
114 0.17
115 0.16
116 0.13
117 0.11
118 0.11
119 0.1
120 0.08
121 0.06
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.1
128 0.11
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.11
133 0.13
134 0.12
135 0.12
136 0.11
137 0.1
138 0.1
139 0.11
140 0.11
141 0.1
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.12
146 0.11
147 0.1
148 0.11
149 0.13
150 0.18
151 0.21
152 0.28
153 0.34
154 0.45
155 0.52
156 0.56
157 0.6
158 0.62
159 0.69
160 0.68
161 0.65
162 0.61
163 0.61
164 0.57
165 0.53
166 0.47
167 0.39
168 0.33
169 0.29
170 0.23
171 0.17
172 0.16
173 0.12
174 0.12
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.12
188 0.13
189 0.14
190 0.16
191 0.22
192 0.26
193 0.31
194 0.4
195 0.46
196 0.53
197 0.62
198 0.7
199 0.76
200 0.8
201 0.79
202 0.79
203 0.79
204 0.76
205 0.75
206 0.71
207 0.67
208 0.63
209 0.6
210 0.54
211 0.45
212 0.42
213 0.34
214 0.31
215 0.24
216 0.21
217 0.2
218 0.17
219 0.16
220 0.13
221 0.12
222 0.09
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.08
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.08
245 0.07
246 0.07
247 0.09
248 0.11
249 0.1
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.11
254 0.1
255 0.09
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.1
265 0.11
266 0.12
267 0.13
268 0.14
269 0.17
270 0.19
271 0.18
272 0.2
273 0.22
274 0.2
275 0.21
276 0.22
277 0.19
278 0.17
279 0.17
280 0.13
281 0.11
282 0.11
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.11
289 0.12
290 0.14
291 0.16
292 0.21
293 0.22
294 0.25
295 0.26
296 0.3
297 0.38
298 0.42
299 0.48
300 0.51
301 0.57
302 0.56
303 0.58
304 0.6
305 0.53
306 0.5
307 0.43
308 0.39
309 0.37
310 0.38
311 0.37
312 0.32
313 0.31
314 0.28
315 0.28
316 0.23
317 0.17
318 0.15
319 0.12
320 0.12
321 0.14
322 0.15
323 0.15
324 0.17
325 0.17
326 0.19
327 0.22
328 0.24
329 0.24
330 0.26
331 0.31
332 0.34
333 0.41
334 0.47
335 0.53
336 0.6
337 0.68
338 0.73
339 0.77
340 0.83
341 0.87
342 0.9
343 0.89
344 0.86
345 0.85
346 0.87
347 0.84
348 0.81
349 0.75
350 0.71
351 0.69
352 0.7
353 0.63
354 0.57
355 0.51
356 0.48
357 0.47
358 0.42
359 0.39
360 0.33
361 0.34
362 0.31
363 0.3
364 0.25
365 0.24
366 0.26
367 0.25
368 0.26
369 0.26
370 0.27
371 0.28
372 0.3
373 0.29
374 0.29
375 0.27
376 0.31
377 0.32
378 0.28
379 0.27
380 0.3
381 0.3
382 0.35
383 0.37
384 0.4
385 0.48
386 0.59
387 0.67
388 0.74
389 0.82
390 0.85
391 0.91
392 0.92
393 0.92
394 0.92
395 0.87
396 0.83
397 0.82
398 0.74
399 0.65
400 0.55
401 0.52
402 0.43
403 0.41
404 0.36
405 0.26
406 0.25