FuNGI

A0A2T3Z4T4

Protein Details

Accession

A0A2T3Z4T4

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-53	GNPNGPPRTQKPNPLRPLRKKPVNPLVSSSRKPVPKPNRPPTNNAAST	Hydrophilic
185-208	VAKEVVPKRPKKQKEEKTMFNRAP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
16-31	KPNPLRPLRKKPVNPL
34-41	SSRKPVPK
191-202	PKRPKKQKEEKT
498-508	SKKGKSLKRAG
522-527	RKKLKK
664-670	KRLRRRK

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPSGNPNGPPRTQKPNPLRPLRKKPVNPLVSSSRKPVPKPNRPPTNNAASTSAQATANGTKPNIEELRKQYGGWSEPPPPYPFNDIPIMTTKKALLNGIRYHLMKFSQTKLGDKPIDPTDQDEFARPVTLHRRDARQPPPGRVVKEEEPERPPVDEQEAERMAQIKAEREAQRAIDQAKIAPVAKEVVPKRPKKQKEEKTMFNRAPKTSAAKKESDLRYEEALPWHLEDADGKNVWVGSYVAALSESSVAFMIDKSVFRMVPLEKSYKFNAKPPFQPFTIDQAEAFMNRKVDVGRWVMKDEEKKAGLNDLEATRRMLYGRGQMIKTESDTFKAASRAEKMEHDELDISGDEFQDDDEAPHFERNDDEDTKDSKERIRREQLGANLFGEGDEQEVDKELQEQLREELERQKYGKTTKKALIKRDREDIYESDDSGSNPWSSSSDDDSSDEEEEAGKEDEKKEGENKDGQGDSKDKSKSQSAKGSTTPQGKQKLSEMSKKGKSLKRAGSPALSESSGNESTRKKLKKASGAATDSRPSTPGLQTNTVRRPKITAGSGSDGEFTAGEMSDGAMQKKKIKLIGSSRGTPSASRAGSPNPAQAGASPSSSGGLIESWEILEKIPADGITIGDLINLFQGRVGDGPGRMPRQEWIGLVKQLCDYGPDKRLRRRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.64
3	0.68
4	0.73
5	0.78
6	0.81
7	0.87
8	0.87
9	0.92
10	0.93
11	0.93
12	0.9
13	0.9
14	0.9
15	0.87
16	0.79
17	0.75
18	0.74
19	0.72
20	0.67
21	0.62
22	0.59
23	0.57
24	0.58
25	0.62
26	0.64
27	0.66
28	0.74
29	0.79
30	0.82
31	0.81
32	0.84
33	0.81
34	0.81
35	0.74
36	0.65
37	0.6
38	0.5
39	0.47
40	0.41
41	0.36
42	0.25
43	0.21
44	0.21
45	0.21
46	0.23
47	0.24
48	0.23
49	0.22
50	0.23
51	0.3
52	0.33
53	0.33
54	0.36
55	0.39
56	0.48
57	0.47
58	0.46
59	0.42
60	0.43
61	0.43
62	0.4
63	0.39
64	0.37
65	0.4
66	0.44
67	0.44
68	0.39
69	0.39
70	0.42
71	0.39
72	0.36
73	0.37
74	0.34
75	0.32
76	0.38
77	0.4
78	0.32
79	0.32
80	0.3
81	0.28
82	0.3
83	0.32
84	0.29
85	0.31
86	0.34
87	0.37
88	0.4
89	0.37
90	0.36
91	0.35
92	0.32
93	0.3
94	0.3
95	0.3
96	0.33
97	0.35
98	0.38
99	0.39
100	0.46
101	0.44
102	0.41
103	0.42
104	0.38
105	0.41
106	0.37
107	0.37
108	0.32
109	0.31
110	0.31
111	0.28
112	0.25
113	0.21
114	0.23
115	0.19
116	0.21
117	0.28
118	0.33
119	0.38
120	0.41
121	0.48
122	0.52
123	0.62
124	0.64
125	0.65
126	0.64
127	0.63
128	0.68
129	0.67
130	0.62
131	0.57
132	0.56
133	0.52
134	0.55
135	0.53
136	0.49
137	0.46
138	0.48
139	0.45
140	0.4
141	0.34
142	0.29
143	0.29
144	0.27
145	0.24
146	0.28
147	0.27
148	0.26
149	0.25
150	0.25
151	0.2
152	0.2
153	0.2
154	0.16
155	0.17
156	0.25
157	0.26
158	0.27
159	0.3
160	0.29
161	0.3
162	0.31
163	0.3
164	0.24
165	0.22
166	0.21
167	0.2
168	0.2
169	0.18
170	0.15
171	0.14
172	0.14
173	0.14
174	0.21
175	0.21
176	0.29
177	0.38
178	0.44
179	0.52
180	0.6
181	0.67
182	0.7
183	0.8
184	0.8
185	0.82
186	0.84
187	0.85
188	0.84
189	0.85
190	0.8
191	0.76
192	0.72
193	0.61
194	0.56
195	0.49
196	0.47
197	0.45
198	0.49
199	0.46
200	0.42
201	0.43
202	0.5
203	0.51
204	0.47
205	0.42
206	0.36
207	0.34
208	0.33
209	0.33
210	0.25
211	0.24
212	0.2
213	0.17
214	0.16
215	0.13
216	0.11
217	0.11
218	0.12
219	0.14
220	0.13
221	0.12
222	0.12
223	0.12
224	0.12
225	0.11
226	0.09
227	0.05
228	0.06
229	0.06
230	0.05
231	0.06
232	0.06
233	0.05
234	0.06
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.07
242	0.07
243	0.07
244	0.09
245	0.1
246	0.1
247	0.1
248	0.14
249	0.13
250	0.17
251	0.2
252	0.23
253	0.23
254	0.26
255	0.29
256	0.33
257	0.34
258	0.35
259	0.41
260	0.41
261	0.47
262	0.49
263	0.5
264	0.43
265	0.45
266	0.4
267	0.38
268	0.36
269	0.29
270	0.23
271	0.2
272	0.2
273	0.18
274	0.18
275	0.13
276	0.1
277	0.1
278	0.11
279	0.1
280	0.11
281	0.14
282	0.16
283	0.2
284	0.21
285	0.22
286	0.22
287	0.25
288	0.28
289	0.27
290	0.27
291	0.23
292	0.23
293	0.22
294	0.24
295	0.2
296	0.17
297	0.17
298	0.14
299	0.14
300	0.14
301	0.15
302	0.12
303	0.12
304	0.12
305	0.11
306	0.11
307	0.14
308	0.18
309	0.21
310	0.21
311	0.21
312	0.22
313	0.22
314	0.21
315	0.2
316	0.16
317	0.14
318	0.14
319	0.15
320	0.15
321	0.16
322	0.15
323	0.14
324	0.16
325	0.16
326	0.16
327	0.18
328	0.2
329	0.21
330	0.2
331	0.18
332	0.16
333	0.14
334	0.14
335	0.12
336	0.08
337	0.06
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.04
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.06
347	0.07
348	0.09
349	0.09
350	0.08
351	0.09
352	0.11
353	0.15
354	0.16
355	0.16
356	0.17
357	0.19
358	0.22
359	0.23
360	0.22
361	0.22
362	0.27
363	0.32
364	0.38
365	0.44
366	0.46
367	0.48
368	0.51
369	0.51
370	0.48
371	0.44
372	0.35
373	0.27
374	0.22
375	0.18
376	0.14
377	0.09
378	0.05
379	0.05
380	0.04
381	0.04
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.07
386	0.08
387	0.09
388	0.1
389	0.1
390	0.11
391	0.13
392	0.14
393	0.14
394	0.21
395	0.22
396	0.25
397	0.25
398	0.26
399	0.28
400	0.35
401	0.42
402	0.39
403	0.43
404	0.45
405	0.54
406	0.57
407	0.63
408	0.66
409	0.67
410	0.66
411	0.67
412	0.63
413	0.56
414	0.54
415	0.45
416	0.41
417	0.34
418	0.3
419	0.23
420	0.22
421	0.2
422	0.17
423	0.17
424	0.1
425	0.09
426	0.1
427	0.09
428	0.1
429	0.12
430	0.15
431	0.15
432	0.16
433	0.17
434	0.18
435	0.19
436	0.18
437	0.16
438	0.12
439	0.11
440	0.1
441	0.11
442	0.1
443	0.09
444	0.11
445	0.11
446	0.15
447	0.15
448	0.17
449	0.21
450	0.22
451	0.26
452	0.29
453	0.29
454	0.31
455	0.31
456	0.3
457	0.28
458	0.28
459	0.25
460	0.27
461	0.28
462	0.25
463	0.27
464	0.35
465	0.38
466	0.43
467	0.5
468	0.47
469	0.5
470	0.52
471	0.54
472	0.53
473	0.53
474	0.5
475	0.49
476	0.52
477	0.49
478	0.47
479	0.46
480	0.49
481	0.47
482	0.52
483	0.51
484	0.52
485	0.56
486	0.6
487	0.65
488	0.6
489	0.62
490	0.63
491	0.65
492	0.64
493	0.65
494	0.62
495	0.57
496	0.53
497	0.48
498	0.41
499	0.33
500	0.25
501	0.21
502	0.23
503	0.22
504	0.21
505	0.23
506	0.22
507	0.27
508	0.36
509	0.4
510	0.38
511	0.44
512	0.51
513	0.57
514	0.63
515	0.65
516	0.65
517	0.66
518	0.66
519	0.61
520	0.56
521	0.48
522	0.4
523	0.33
524	0.26
525	0.24
526	0.24
527	0.26
528	0.28
529	0.33
530	0.37
531	0.44
532	0.52
533	0.56
534	0.53
535	0.49
536	0.48
537	0.46
538	0.49
539	0.45
540	0.4
541	0.38
542	0.41
543	0.41
544	0.38
545	0.34
546	0.27
547	0.23
548	0.17
549	0.13
550	0.09
551	0.07
552	0.07
553	0.06
554	0.06
555	0.1
556	0.12
557	0.14
558	0.17
559	0.19
560	0.26
561	0.3
562	0.33
563	0.34
564	0.36
565	0.42
566	0.48
567	0.56
568	0.56
569	0.57
570	0.56
571	0.55
572	0.52
573	0.44
574	0.39
575	0.37
576	0.32
577	0.28
578	0.28
579	0.28
580	0.34
581	0.35
582	0.36
583	0.29
584	0.29
585	0.28
586	0.26
587	0.28
588	0.22
589	0.21
590	0.17
591	0.15
592	0.15
593	0.15
594	0.14
595	0.09
596	0.08
597	0.07
598	0.08
599	0.08
600	0.07
601	0.09
602	0.09
603	0.08
604	0.1
605	0.1
606	0.1
607	0.11
608	0.11
609	0.11
610	0.11
611	0.11
612	0.11
613	0.1
614	0.09
615	0.09
616	0.09
617	0.07
618	0.1
619	0.1
620	0.08
621	0.09
622	0.1
623	0.1
624	0.11
625	0.14
626	0.13
627	0.14
628	0.2
629	0.26
630	0.3
631	0.29
632	0.3
633	0.3
634	0.33
635	0.35
636	0.31
637	0.31
638	0.33
639	0.38
640	0.38
641	0.37
642	0.32
643	0.31
644	0.29
645	0.27
646	0.23
647	0.25
648	0.33
649	0.4
650	0.47

A0A2T3Z4T4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer