Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T3YWU8

Protein Details
Accession A0A2T3YWU8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
357-376LEKTKPKEKRRENPLLRLAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
360-387TKPKEKRRENPLLRLAKKNAAVKIQKAR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, mito_nucl 13.666, cyto_nucl 9.833, mito 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MTTPPARRLGLSIRHSPGHLLKSLNPNNGTTTVAAATTTTTTTTTAAASSSAAITTTTAKTTTAAHKSDSKPRGGRSQLKIPEPIPEDIFAPPLASSDVDDDDDDDDNNDDKTAEANLESNEQARLYADSSDSEALPRGAISATNFTSSNQNGRRQSLRTRSQETKAASQLPRESAEVEPGTRKRKRQSGTSIDKGSSKKNALDEPDTSALPSSSASHFTNSQGFVKKPKVKNTFGRRSLNSQESRKSRVSEEPSLPKLRRFPISEEPTLPVLRPPEFSAIKSVRKSSQFIVPDSDDFSSPIKRRQPRQRLLHIHYGNDSDTDEDNNNDNNGDNNGDSNGDTAVLSQPKSTIDDIELEKTKPKEKRRENPLLRLAKKNAAVKIQKAREASPGSPSPPPARFVMPAQLSDFKMRKRLSGGGVNDIDNGDLSDAGSSSSDLSSLGDIFPDKEAPKDGQALCPWCGASVDMQQLKEFSEGRQRLSVKMQTKFCESHRKTSAQETYELKSYPEVQWESLTERFESHRGRLLGIINGEEESHYRTALADKISLGKGRSMNKEENLNPGYYGPRGFNMMCDYLVGEFSDMLKKKAIHDKVIAGRGPPAFIQSVLVPELGVQLIMEDMQVSLEEARGILEESKALGELVHGEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.51
3 0.51
4 0.49
5 0.44
6 0.41
7 0.36
8 0.38
9 0.47
10 0.54
11 0.56
12 0.51
13 0.48
14 0.48
15 0.46
16 0.41
17 0.31
18 0.26
19 0.19
20 0.17
21 0.16
22 0.12
23 0.12
24 0.11
25 0.11
26 0.1
27 0.1
28 0.11
29 0.11
30 0.12
31 0.11
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.12
43 0.13
44 0.13
45 0.13
46 0.14
47 0.14
48 0.19
49 0.27
50 0.3
51 0.31
52 0.33
53 0.41
54 0.46
55 0.55
56 0.56
57 0.56
58 0.55
59 0.57
60 0.64
61 0.64
62 0.68
63 0.65
64 0.7
65 0.69
66 0.67
67 0.68
68 0.58
69 0.57
70 0.52
71 0.47
72 0.39
73 0.32
74 0.29
75 0.25
76 0.26
77 0.18
78 0.15
79 0.12
80 0.11
81 0.11
82 0.09
83 0.1
84 0.11
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.13
89 0.13
90 0.14
91 0.13
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.1
97 0.08
98 0.08
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.08
103 0.1
104 0.11
105 0.13
106 0.14
107 0.14
108 0.14
109 0.13
110 0.12
111 0.11
112 0.12
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.13
118 0.14
119 0.13
120 0.13
121 0.13
122 0.12
123 0.11
124 0.1
125 0.08
126 0.07
127 0.09
128 0.1
129 0.13
130 0.14
131 0.16
132 0.16
133 0.16
134 0.21
135 0.22
136 0.29
137 0.3
138 0.37
139 0.39
140 0.44
141 0.48
142 0.47
143 0.55
144 0.55
145 0.59
146 0.59
147 0.62
148 0.64
149 0.63
150 0.65
151 0.6
152 0.56
153 0.5
154 0.51
155 0.45
156 0.43
157 0.43
158 0.39
159 0.37
160 0.32
161 0.3
162 0.22
163 0.26
164 0.22
165 0.2
166 0.24
167 0.27
168 0.35
169 0.38
170 0.44
171 0.46
172 0.54
173 0.56
174 0.59
175 0.65
176 0.66
177 0.71
178 0.72
179 0.68
180 0.61
181 0.62
182 0.54
183 0.48
184 0.43
185 0.37
186 0.32
187 0.32
188 0.35
189 0.34
190 0.36
191 0.33
192 0.32
193 0.32
194 0.28
195 0.25
196 0.21
197 0.17
198 0.13
199 0.12
200 0.09
201 0.09
202 0.13
203 0.13
204 0.15
205 0.16
206 0.17
207 0.2
208 0.2
209 0.23
210 0.23
211 0.23
212 0.27
213 0.35
214 0.43
215 0.45
216 0.53
217 0.57
218 0.6
219 0.69
220 0.74
221 0.75
222 0.74
223 0.76
224 0.68
225 0.67
226 0.66
227 0.64
228 0.6
229 0.54
230 0.54
231 0.51
232 0.54
233 0.51
234 0.47
235 0.41
236 0.43
237 0.45
238 0.44
239 0.46
240 0.47
241 0.49
242 0.53
243 0.5
244 0.45
245 0.44
246 0.4
247 0.4
248 0.36
249 0.38
250 0.42
251 0.47
252 0.46
253 0.43
254 0.41
255 0.38
256 0.35
257 0.29
258 0.21
259 0.17
260 0.16
261 0.15
262 0.15
263 0.19
264 0.19
265 0.2
266 0.25
267 0.27
268 0.31
269 0.31
270 0.32
271 0.31
272 0.33
273 0.35
274 0.29
275 0.32
276 0.3
277 0.29
278 0.3
279 0.27
280 0.24
281 0.24
282 0.22
283 0.15
284 0.14
285 0.14
286 0.16
287 0.16
288 0.22
289 0.28
290 0.33
291 0.42
292 0.52
293 0.62
294 0.66
295 0.73
296 0.77
297 0.78
298 0.77
299 0.78
300 0.68
301 0.58
302 0.5
303 0.43
304 0.33
305 0.24
306 0.19
307 0.11
308 0.1
309 0.1
310 0.1
311 0.09
312 0.11
313 0.1
314 0.1
315 0.09
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.07
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.06
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.08
331 0.09
332 0.09
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.12
337 0.12
338 0.1
339 0.09
340 0.12
341 0.13
342 0.16
343 0.17
344 0.15
345 0.19
346 0.2
347 0.26
348 0.3
349 0.37
350 0.44
351 0.53
352 0.62
353 0.69
354 0.78
355 0.78
356 0.8
357 0.8
358 0.79
359 0.73
360 0.69
361 0.62
362 0.56
363 0.54
364 0.5
365 0.43
366 0.41
367 0.4
368 0.4
369 0.46
370 0.44
371 0.44
372 0.41
373 0.39
374 0.38
375 0.39
376 0.35
377 0.31
378 0.3
379 0.29
380 0.28
381 0.29
382 0.27
383 0.25
384 0.26
385 0.23
386 0.23
387 0.22
388 0.22
389 0.27
390 0.23
391 0.23
392 0.23
393 0.25
394 0.24
395 0.28
396 0.3
397 0.24
398 0.31
399 0.3
400 0.3
401 0.3
402 0.33
403 0.32
404 0.36
405 0.36
406 0.35
407 0.36
408 0.34
409 0.31
410 0.27
411 0.22
412 0.14
413 0.13
414 0.06
415 0.05
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.07
433 0.08
434 0.1
435 0.1
436 0.11
437 0.13
438 0.14
439 0.16
440 0.22
441 0.22
442 0.24
443 0.27
444 0.3
445 0.28
446 0.28
447 0.26
448 0.19
449 0.19
450 0.14
451 0.13
452 0.14
453 0.2
454 0.21
455 0.21
456 0.22
457 0.22
458 0.22
459 0.23
460 0.19
461 0.14
462 0.22
463 0.23
464 0.26
465 0.32
466 0.32
467 0.32
468 0.38
469 0.44
470 0.4
471 0.46
472 0.48
473 0.45
474 0.49
475 0.49
476 0.48
477 0.52
478 0.48
479 0.5
480 0.52
481 0.53
482 0.5
483 0.56
484 0.59
485 0.49
486 0.51
487 0.45
488 0.42
489 0.42
490 0.4
491 0.31
492 0.26
493 0.27
494 0.23
495 0.26
496 0.25
497 0.23
498 0.24
499 0.25
500 0.27
501 0.27
502 0.27
503 0.2
504 0.2
505 0.22
506 0.26
507 0.28
508 0.27
509 0.31
510 0.3
511 0.31
512 0.32
513 0.32
514 0.29
515 0.27
516 0.25
517 0.18
518 0.17
519 0.16
520 0.14
521 0.12
522 0.13
523 0.12
524 0.11
525 0.11
526 0.11
527 0.14
528 0.17
529 0.18
530 0.15
531 0.15
532 0.2
533 0.22
534 0.24
535 0.23
536 0.24
537 0.28
538 0.34
539 0.41
540 0.43
541 0.46
542 0.47
543 0.55
544 0.51
545 0.54
546 0.5
547 0.42
548 0.37
549 0.32
550 0.31
551 0.25
552 0.25
553 0.18
554 0.17
555 0.2
556 0.19
557 0.2
558 0.23
559 0.22
560 0.21
561 0.19
562 0.19
563 0.15
564 0.16
565 0.14
566 0.09
567 0.08
568 0.1
569 0.18
570 0.18
571 0.19
572 0.23
573 0.24
574 0.3
575 0.4
576 0.44
577 0.42
578 0.45
579 0.52
580 0.55
581 0.61
582 0.56
583 0.46
584 0.46
585 0.41
586 0.38
587 0.3
588 0.25
589 0.19
590 0.18
591 0.19
592 0.15
593 0.16
594 0.16
595 0.16
596 0.12
597 0.11
598 0.13
599 0.11
600 0.1
601 0.06
602 0.05
603 0.06
604 0.06
605 0.06
606 0.04
607 0.04
608 0.05
609 0.05
610 0.06
611 0.06
612 0.07
613 0.07
614 0.07
615 0.07
616 0.08
617 0.09
618 0.1
619 0.1
620 0.1
621 0.11
622 0.11
623 0.11
624 0.11
625 0.09
626 0.08