FuNGI

A0A2T3Z474

Protein Details

Accession

A0A2T3Z474

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
484-504	ISSTRRWNRDHKSTKLRDAAF	Hydrophilic
526-552	GIQRRVYHSGRPKSKTRPRNLEQFCQV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 10, nucl 8, cyto 5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024500 DUF3074 IPR002078 Sigma_54_int IPR023393 START-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF11274 DUF3074
PROSITE	View protein in PROSITE PS50045 SIGMA54_INTERACT_4

Amino Acid Sequences

MADQHGPYVRLWGIRPSQLPSEATSAQDLTPLLQSILSEAVSFVSSVPPHSSESSSLSSSGRSSQNNGNNGTGPWKAKGCRAFHHSAAPVHMFERVISAEELKTIAKDQNLPQANGGSKIKPETWSLRRSVHEEAKKAGTADWEEWVRCFKEGHADAEMKFTPTVMSHRLKKQWDCAGVEVMLGGDTYENLTLKLEESVHKMPAPLNNRVFPVLQVTAAVRGRREFVVVQIAAVPETPSAEESRSDGALRGTYTAIERFREIDDQGNVEWVMGTVSDARGVLPAWIQKMAVPGQIAKDVDMFLEWIASEREPNSKLLASADALARMTIELNVRAMSAQTERLEKSLGALMMCTKEDKEFRKSHDARLQSMVQEMQVVKQRMEEIQGPEWNSKSNDNLEQCKKDMDESIAQLRKEMSDLKGLVGDITTALDKIPTVAEAEALISRTQAAGSATKGSKTQAKPDVEKSRSGPKTARTIKQRIEDTISSTRRWNRDHKSTKLRDAAFIANYLKQQSKRDPQMAVYIQKGIQRRVYHSGRPKSKTRPRNLEQFCQVLVWKDVLDAAEDILVKNRGQTAKAIGQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.39
3	0.39
4	0.41
5	0.42
6	0.42
7	0.37
8	0.38
9	0.33
10	0.32
11	0.3
12	0.26
13	0.22
14	0.23
15	0.2
16	0.15
17	0.16
18	0.15
19	0.13
20	0.12
21	0.12
22	0.11
23	0.13
24	0.11
25	0.09
26	0.09
27	0.09
28	0.09
29	0.1
30	0.08
31	0.11
32	0.11
33	0.13
34	0.16
35	0.17
36	0.2
37	0.22
38	0.24
39	0.22
40	0.27
41	0.28
42	0.27
43	0.26
44	0.24
45	0.23
46	0.22
47	0.25
48	0.26
49	0.25
50	0.28
51	0.36
52	0.42
53	0.47
54	0.48
55	0.44
56	0.4
57	0.39
58	0.38
59	0.33
60	0.28
61	0.26
62	0.29
63	0.28
64	0.34
65	0.41
66	0.41
67	0.44
68	0.5
69	0.52
70	0.49
71	0.55
72	0.53
73	0.47
74	0.47
75	0.42
76	0.35
77	0.3
78	0.3
79	0.22
80	0.17
81	0.18
82	0.14
83	0.14
84	0.13
85	0.15
86	0.13
87	0.13
88	0.14
89	0.12
90	0.12
91	0.12
92	0.14
93	0.15
94	0.2
95	0.22
96	0.3
97	0.35
98	0.35
99	0.34
100	0.35
101	0.34
102	0.34
103	0.34
104	0.26
105	0.23
106	0.26
107	0.27
108	0.24
109	0.28
110	0.32
111	0.37
112	0.41
113	0.43
114	0.46
115	0.46
116	0.48
117	0.51
118	0.52
119	0.51
120	0.48
121	0.48
122	0.46
123	0.44
124	0.4
125	0.33
126	0.27
127	0.24
128	0.22
129	0.22
130	0.21
131	0.2
132	0.21
133	0.23
134	0.21
135	0.19
136	0.18
137	0.15
138	0.22
139	0.24
140	0.27
141	0.27
142	0.28
143	0.27
144	0.32
145	0.32
146	0.23
147	0.2
148	0.17
149	0.14
150	0.13
151	0.16
152	0.18
153	0.24
154	0.29
155	0.36
156	0.43
157	0.49
158	0.51
159	0.55
160	0.56
161	0.55
162	0.51
163	0.46
164	0.42
165	0.35
166	0.31
167	0.23
168	0.16
169	0.1
170	0.08
171	0.06
172	0.03
173	0.03
174	0.04
175	0.05
176	0.05
177	0.05
178	0.06
179	0.06
180	0.07
181	0.08
182	0.09
183	0.1
184	0.15
185	0.17
186	0.18
187	0.19
188	0.19
189	0.19
190	0.25
191	0.28
192	0.3
193	0.31
194	0.32
195	0.33
196	0.33
197	0.31
198	0.25
199	0.24
200	0.17
201	0.14
202	0.12
203	0.12
204	0.15
205	0.17
206	0.17
207	0.14
208	0.14
209	0.16
210	0.16
211	0.18
212	0.13
213	0.12
214	0.18
215	0.17
216	0.16
217	0.16
218	0.15
219	0.13
220	0.13
221	0.12
222	0.05
223	0.06
224	0.06
225	0.05
226	0.06
227	0.07
228	0.07
229	0.09
230	0.1
231	0.1
232	0.1
233	0.1
234	0.1
235	0.1
236	0.1
237	0.1
238	0.08
239	0.08
240	0.09
241	0.12
242	0.12
243	0.12
244	0.12
245	0.13
246	0.14
247	0.15
248	0.15
249	0.15
250	0.15
251	0.15
252	0.15
253	0.14
254	0.13
255	0.11
256	0.1
257	0.06
258	0.05
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.05
267	0.05
268	0.05
269	0.06
270	0.07
271	0.07
272	0.08
273	0.08
274	0.08
275	0.1
276	0.11
277	0.11
278	0.1
279	0.1
280	0.1
281	0.13
282	0.12
283	0.1
284	0.1
285	0.09
286	0.08
287	0.07
288	0.07
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.04
293	0.05
294	0.05
295	0.06
296	0.06
297	0.1
298	0.11
299	0.12
300	0.13
301	0.12
302	0.12
303	0.13
304	0.13
305	0.1
306	0.1
307	0.1
308	0.09
309	0.08
310	0.08
311	0.07
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.07
323	0.07
324	0.1
325	0.1
326	0.13
327	0.13
328	0.14
329	0.15
330	0.13
331	0.13
332	0.13
333	0.12
334	0.1
335	0.1
336	0.1
337	0.11
338	0.11
339	0.1
340	0.08
341	0.1
342	0.16
343	0.2
344	0.26
345	0.29
346	0.34
347	0.45
348	0.46
349	0.52
350	0.54
351	0.53
352	0.48
353	0.49
354	0.45
355	0.34
356	0.34
357	0.26
358	0.19
359	0.18
360	0.16
361	0.14
362	0.19
363	0.19
364	0.18
365	0.19
366	0.2
367	0.18
368	0.21
369	0.22
370	0.19
371	0.23
372	0.25
373	0.26
374	0.27
375	0.27
376	0.27
377	0.24
378	0.22
379	0.2
380	0.21
381	0.26
382	0.28
383	0.36
384	0.4
385	0.41
386	0.4
387	0.4
388	0.36
389	0.31
390	0.29
391	0.25
392	0.22
393	0.22
394	0.3
395	0.32
396	0.31
397	0.31
398	0.29
399	0.25
400	0.23
401	0.23
402	0.16
403	0.18
404	0.19
405	0.19
406	0.2
407	0.19
408	0.17
409	0.14
410	0.13
411	0.06
412	0.07
413	0.06
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.06
419	0.06
420	0.05
421	0.07
422	0.07
423	0.07
424	0.07
425	0.08
426	0.08
427	0.09
428	0.09
429	0.07
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.07
434	0.08
435	0.09
436	0.1
437	0.17
438	0.17
439	0.18
440	0.19
441	0.21
442	0.27
443	0.28
444	0.35
445	0.37
446	0.43
447	0.47
448	0.56
449	0.64
450	0.58
451	0.6
452	0.55
453	0.57
454	0.53
455	0.53
456	0.48
457	0.43
458	0.51
459	0.55
460	0.6
461	0.58
462	0.64
463	0.67
464	0.71
465	0.69
466	0.62
467	0.6
468	0.54
469	0.51
470	0.52
471	0.48
472	0.42
473	0.45
474	0.48
475	0.48
476	0.52
477	0.56
478	0.55
479	0.64
480	0.71
481	0.74
482	0.78
483	0.79
484	0.83
485	0.82
486	0.74
487	0.66
488	0.61
489	0.56
490	0.46
491	0.42
492	0.35
493	0.29
494	0.29
495	0.3
496	0.31
497	0.3
498	0.36
499	0.42
500	0.5
501	0.56
502	0.6
503	0.59
504	0.55
505	0.61
506	0.6
507	0.55
508	0.47
509	0.41
510	0.38
511	0.4
512	0.42
513	0.37
514	0.38
515	0.38
516	0.42
517	0.47
518	0.51
519	0.56
520	0.62
521	0.68
522	0.71
523	0.73
524	0.75
525	0.77
526	0.82
527	0.83
528	0.83
529	0.83
530	0.8
531	0.85
532	0.84
533	0.82
534	0.78
535	0.71
536	0.61
537	0.52
538	0.47
539	0.4
540	0.34
541	0.26
542	0.2
543	0.16
544	0.17
545	0.15
546	0.16
547	0.13
548	0.11
549	0.12
550	0.13
551	0.13
552	0.16
553	0.18
554	0.15
555	0.18
556	0.24
557	0.24
558	0.25
559	0.28

A0A2T3Z474

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer