FuNGI

A0A2S4V706

Protein Details

Accession

A0A2S4V706

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
516-553	IIKRDKNEDKEAKKIRKNQLKSDRAARRLEKKNTKLDF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
518-547	KRDKNEDKEAKKIRKNQLKSDRAARRLEKK

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MAPASIYRGPEAKHYAVVHRSQRDPLINDPQAGERVLHQVQRQNITNKQRKKALTRQELESTLGDQGVRSNVGEASSYDIYYDDSEYDYMQHLKPVGLTQDAILLEKPSTTQKKEDSSIKLRDDLIPEPTPNSEMLSYSDHLQYALPSNSAIPENGLLPIDNDPGLREVLDALDDEAYVEEDTEDDFFIGIVKDGERDQSETPDWIDSVHDHPQSQWESEMAKFKKPHLTQDDDDQSIPEQKPNPRSNIHTSVRQSLNGSSFSMSSSSMFRNEGLTDLDDRFDKIEKEYESDDSDEEDSSDGDSTTSNQTATPHKNKATMRADLESIMDEFLDKYEVIGGKMKPVMEGKTAIDKLDTLRTQLLGPDSDDHQAENDRLQVKELILKKLKADQAEHDNHIKSTRKFVSLDDHQQDKWDCQTILTTYSNVENHPRVIKIRDAIGSTPKTKREKCVSKQEEETQKIGIDRHTGFPIVNGVIIKGNQSKFNTTKTGVQPDDDEDEEDSDSDGSSSVVHKGIIKRDKNEDKEAKKIRKNQLKSDRAARRLEKKNTKLDFVHQKNLQVQFNSKILVKKSNDIAGLGGKGVISLL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.41
3	0.44
4	0.51
5	0.53
6	0.53
7	0.54
8	0.52
9	0.57
10	0.56
11	0.54
12	0.53
13	0.55
14	0.51
15	0.5
16	0.47
17	0.43
18	0.38
19	0.35
20	0.28
21	0.2
22	0.24
23	0.26
24	0.28
25	0.29
26	0.33
27	0.39
28	0.45
29	0.5
30	0.49
31	0.55
32	0.61
33	0.67
34	0.7
35	0.72
36	0.73
37	0.74
38	0.77
39	0.79
40	0.79
41	0.8
42	0.76
43	0.74
44	0.72
45	0.66
46	0.6
47	0.51
48	0.41
49	0.31
50	0.27
51	0.21
52	0.15
53	0.15
54	0.14
55	0.14
56	0.12
57	0.12
58	0.12
59	0.13
60	0.14
61	0.12
62	0.16
63	0.16
64	0.15
65	0.14
66	0.14
67	0.15
68	0.15
69	0.15
70	0.1
71	0.1
72	0.11
73	0.11
74	0.12
75	0.13
76	0.16
77	0.15
78	0.17
79	0.16
80	0.16
81	0.17
82	0.19
83	0.18
84	0.16
85	0.16
86	0.14
87	0.17
88	0.17
89	0.17
90	0.15
91	0.14
92	0.12
93	0.12
94	0.13
95	0.18
96	0.24
97	0.26
98	0.31
99	0.36
100	0.42
101	0.48
102	0.54
103	0.53
104	0.55
105	0.6
106	0.57
107	0.54
108	0.5
109	0.48
110	0.44
111	0.38
112	0.36
113	0.31
114	0.29
115	0.27
116	0.26
117	0.24
118	0.2
119	0.2
120	0.14
121	0.12
122	0.14
123	0.16
124	0.16
125	0.18
126	0.19
127	0.17
128	0.17
129	0.16
130	0.14
131	0.16
132	0.16
133	0.14
134	0.13
135	0.13
136	0.14
137	0.15
138	0.14
139	0.09
140	0.09
141	0.09
142	0.1
143	0.1
144	0.08
145	0.09
146	0.1
147	0.1
148	0.1
149	0.09
150	0.09
151	0.1
152	0.1
153	0.09
154	0.08
155	0.07
156	0.07
157	0.07
158	0.07
159	0.06
160	0.06
161	0.06
162	0.06
163	0.05
164	0.06
165	0.05
166	0.05
167	0.04
168	0.04
169	0.05
170	0.05
171	0.05
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.05
176	0.05
177	0.05
178	0.05
179	0.05
180	0.06
181	0.07
182	0.09
183	0.1
184	0.12
185	0.13
186	0.16
187	0.17
188	0.17
189	0.17
190	0.16
191	0.14
192	0.12
193	0.12
194	0.1
195	0.13
196	0.18
197	0.18
198	0.18
199	0.18
200	0.23
201	0.24
202	0.23
203	0.2
204	0.15
205	0.16
206	0.18
207	0.27
208	0.23
209	0.27
210	0.27
211	0.3
212	0.39
213	0.38
214	0.45
215	0.43
216	0.48
217	0.43
218	0.5
219	0.52
220	0.43
221	0.42
222	0.34
223	0.28
224	0.27
225	0.26
226	0.2
227	0.21
228	0.24
229	0.33
230	0.37
231	0.41
232	0.38
233	0.43
234	0.47
235	0.52
236	0.5
237	0.47
238	0.46
239	0.48
240	0.46
241	0.42
242	0.36
243	0.29
244	0.28
245	0.22
246	0.21
247	0.14
248	0.13
249	0.12
250	0.12
251	0.1
252	0.08
253	0.09
254	0.1
255	0.1
256	0.11
257	0.11
258	0.11
259	0.11
260	0.11
261	0.1
262	0.1
263	0.11
264	0.1
265	0.11
266	0.1
267	0.1
268	0.1
269	0.1
270	0.1
271	0.09
272	0.13
273	0.13
274	0.15
275	0.16
276	0.17
277	0.17
278	0.17
279	0.16
280	0.13
281	0.13
282	0.1
283	0.09
284	0.08
285	0.07
286	0.06
287	0.06
288	0.05
289	0.04
290	0.05
291	0.06
292	0.08
293	0.08
294	0.08
295	0.08
296	0.1
297	0.16
298	0.24
299	0.28
300	0.31
301	0.32
302	0.39
303	0.39
304	0.46
305	0.45
306	0.42
307	0.38
308	0.35
309	0.34
310	0.28
311	0.27
312	0.18
313	0.14
314	0.1
315	0.07
316	0.06
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.04
322	0.07
323	0.08
324	0.08
325	0.13
326	0.13
327	0.14
328	0.16
329	0.16
330	0.15
331	0.17
332	0.17
333	0.15
334	0.16
335	0.15
336	0.21
337	0.21
338	0.19
339	0.18
340	0.16
341	0.16
342	0.21
343	0.2
344	0.15
345	0.15
346	0.16
347	0.16
348	0.17
349	0.17
350	0.11
351	0.12
352	0.12
353	0.13
354	0.14
355	0.14
356	0.12
357	0.12
358	0.12
359	0.12
360	0.11
361	0.14
362	0.14
363	0.14
364	0.16
365	0.16
366	0.15
367	0.21
368	0.23
369	0.27
370	0.29
371	0.29
372	0.3
373	0.35
374	0.37
375	0.34
376	0.33
377	0.3
378	0.35
379	0.38
380	0.4
381	0.38
382	0.36
383	0.34
384	0.37
385	0.38
386	0.3
387	0.35
388	0.35
389	0.34
390	0.34
391	0.35
392	0.39
393	0.39
394	0.47
395	0.43
396	0.42
397	0.39
398	0.42
399	0.42
400	0.35
401	0.31
402	0.26
403	0.22
404	0.19
405	0.22
406	0.19
407	0.22
408	0.22
409	0.19
410	0.16
411	0.19
412	0.2
413	0.19
414	0.22
415	0.19
416	0.21
417	0.23
418	0.24
419	0.23
420	0.25
421	0.28
422	0.25
423	0.27
424	0.26
425	0.26
426	0.26
427	0.31
428	0.33
429	0.34
430	0.37
431	0.41
432	0.47
433	0.48
434	0.55
435	0.58
436	0.64
437	0.67
438	0.74
439	0.73
440	0.7
441	0.74
442	0.74
443	0.73
444	0.67
445	0.6
446	0.49
447	0.44
448	0.4
449	0.35
450	0.28
451	0.24
452	0.22
453	0.24
454	0.24
455	0.23
456	0.21
457	0.21
458	0.22
459	0.16
460	0.16
461	0.12
462	0.12
463	0.13
464	0.13
465	0.16
466	0.19
467	0.2
468	0.24
469	0.27
470	0.33
471	0.34
472	0.39
473	0.41
474	0.37
475	0.44
476	0.45
477	0.51
478	0.45
479	0.44
480	0.41
481	0.39
482	0.41
483	0.33
484	0.28
485	0.2
486	0.2
487	0.19
488	0.17
489	0.14
490	0.1
491	0.09
492	0.08
493	0.07
494	0.06
495	0.06
496	0.07
497	0.09
498	0.1
499	0.11
500	0.16
501	0.2
502	0.3
503	0.39
504	0.44
505	0.47
506	0.56
507	0.65
508	0.67
509	0.73
510	0.73
511	0.68
512	0.73
513	0.78
514	0.78
515	0.77
516	0.8
517	0.81
518	0.82
519	0.84
520	0.84
521	0.85
522	0.84
523	0.81
524	0.82
525	0.81
526	0.76
527	0.78
528	0.75
529	0.75
530	0.76
531	0.81
532	0.81
533	0.8
534	0.83
535	0.79
536	0.77
537	0.7
538	0.69
539	0.7
540	0.66
541	0.67
542	0.6
543	0.61
544	0.61
545	0.65
546	0.61
547	0.53
548	0.51
549	0.47
550	0.46
551	0.43
552	0.39
553	0.38
554	0.37
555	0.42
556	0.41
557	0.43
558	0.46
559	0.49
560	0.46
561	0.41
562	0.39
563	0.33
564	0.31
565	0.24
566	0.19
567	0.13

A0A2S4V706

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer