Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2S4VDI3

Protein Details
Accession A0A2S4VDI3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
300-326ENSLALIKPKPNKNKVARKATKCAMGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
309-317KPNKNKVAR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000232  HSF_DNA-bd  
IPR027725  HSF_fam  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00447  HSF_DNA-bind  
Amino Acid Sequences MTPTTNPVPFSLTLDNSSGPLQHPYEYSDGVESNHSYSHHHSVTVETMHLPNTPTTLLKRTRPSPNPAESGDHTPYHNFHSTVSVPHSPYPHNVNNQSTPYYHRQENSNYLSSPSQQPMPLNSGLPFISKMSQMPSSSRRQNLAVSSHELLPISNRSRLESPGISARYSHMSLIKSDSPDGLDIPRAPKPDASGTPQCTAFISKLYHLCGHEEYRSYIRWNGPGDAFVLAHGAQHRVCHANLTEVFRHNNVSSFIRQLNLYNFTRLPTIKLLDQVDNVQTNSSTSAFSGFSHPHFRRGDENSLALIKPKPNKNKVARKATKCAMGSDDKGGKCGRKHPPLPGKLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.28
3 0.25
4 0.25
5 0.21
6 0.17
7 0.2
8 0.19
9 0.19
10 0.2
11 0.22
12 0.25
13 0.24
14 0.24
15 0.21
16 0.2
17 0.19
18 0.21
19 0.19
20 0.17
21 0.18
22 0.17
23 0.18
24 0.23
25 0.29
26 0.27
27 0.27
28 0.26
29 0.26
30 0.3
31 0.28
32 0.24
33 0.18
34 0.19
35 0.19
36 0.2
37 0.18
38 0.15
39 0.15
40 0.15
41 0.16
42 0.18
43 0.25
44 0.3
45 0.35
46 0.42
47 0.48
48 0.57
49 0.61
50 0.66
51 0.67
52 0.67
53 0.65
54 0.6
55 0.58
56 0.51
57 0.51
58 0.46
59 0.39
60 0.33
61 0.31
62 0.3
63 0.3
64 0.3
65 0.24
66 0.21
67 0.24
68 0.24
69 0.25
70 0.29
71 0.28
72 0.26
73 0.29
74 0.31
75 0.27
76 0.3
77 0.35
78 0.35
79 0.38
80 0.41
81 0.43
82 0.44
83 0.46
84 0.44
85 0.37
86 0.37
87 0.37
88 0.37
89 0.35
90 0.33
91 0.35
92 0.38
93 0.45
94 0.44
95 0.41
96 0.36
97 0.35
98 0.34
99 0.32
100 0.31
101 0.25
102 0.21
103 0.2
104 0.21
105 0.21
106 0.24
107 0.23
108 0.2
109 0.19
110 0.18
111 0.16
112 0.16
113 0.14
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.11
118 0.12
119 0.15
120 0.15
121 0.18
122 0.22
123 0.28
124 0.34
125 0.35
126 0.35
127 0.33
128 0.35
129 0.34
130 0.33
131 0.28
132 0.26
133 0.25
134 0.24
135 0.23
136 0.2
137 0.16
138 0.15
139 0.17
140 0.16
141 0.17
142 0.17
143 0.19
144 0.2
145 0.22
146 0.24
147 0.19
148 0.18
149 0.21
150 0.22
151 0.19
152 0.18
153 0.18
154 0.17
155 0.18
156 0.17
157 0.14
158 0.14
159 0.14
160 0.18
161 0.18
162 0.16
163 0.16
164 0.15
165 0.13
166 0.12
167 0.12
168 0.09
169 0.08
170 0.09
171 0.11
172 0.13
173 0.14
174 0.15
175 0.15
176 0.16
177 0.2
178 0.21
179 0.25
180 0.29
181 0.3
182 0.32
183 0.31
184 0.29
185 0.25
186 0.24
187 0.18
188 0.15
189 0.13
190 0.14
191 0.16
192 0.17
193 0.19
194 0.19
195 0.2
196 0.2
197 0.21
198 0.2
199 0.2
200 0.21
201 0.2
202 0.21
203 0.21
204 0.22
205 0.22
206 0.25
207 0.25
208 0.25
209 0.23
210 0.22
211 0.21
212 0.18
213 0.16
214 0.11
215 0.1
216 0.08
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.09
221 0.1
222 0.12
223 0.13
224 0.13
225 0.15
226 0.15
227 0.19
228 0.22
229 0.26
230 0.28
231 0.28
232 0.3
233 0.28
234 0.31
235 0.25
236 0.24
237 0.22
238 0.22
239 0.21
240 0.23
241 0.23
242 0.21
243 0.21
244 0.22
245 0.23
246 0.26
247 0.26
248 0.25
249 0.25
250 0.25
251 0.28
252 0.26
253 0.25
254 0.22
255 0.24
256 0.22
257 0.27
258 0.29
259 0.27
260 0.28
261 0.27
262 0.27
263 0.26
264 0.25
265 0.2
266 0.17
267 0.16
268 0.17
269 0.15
270 0.12
271 0.1
272 0.11
273 0.11
274 0.12
275 0.16
276 0.16
277 0.19
278 0.29
279 0.3
280 0.36
281 0.37
282 0.38
283 0.41
284 0.45
285 0.49
286 0.43
287 0.43
288 0.38
289 0.39
290 0.36
291 0.32
292 0.3
293 0.29
294 0.34
295 0.42
296 0.5
297 0.55
298 0.66
299 0.73
300 0.8
301 0.84
302 0.87
303 0.88
304 0.86
305 0.87
306 0.82
307 0.8
308 0.7
309 0.63
310 0.58
311 0.54
312 0.49
313 0.48
314 0.5
315 0.41
316 0.43
317 0.44
318 0.44
319 0.42
320 0.49
321 0.51
322 0.54
323 0.59
324 0.67
325 0.73