Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2S4VNV1

Protein Details
Accession A0A2S4VNV1    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-78ESRALPRDSPPRQPPPRDRNAERIHRDBasic
430-470ARVITRGHSPRRARSPRRSPSPSRRPPTHRRPLGRSQPPYEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
435-464RGHSPRRARSPRRSPSPSRRPPTHRRPLGR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSAQKDITRPQNDQPHHREDYRASRSRVEDDVRDSDRRGFQPSVSTRERPAESRALPRDSPPRQPPPRDRNAERIHRDPPTSEMIHHGASLPVEAATADSVLDHIPNVPVPNPSKIYIGGLPELTRPEDLEDCFSQLGRIKNIELKTGYGFVEYDSSQAACDAVAKYHEGTFLGSQIKVELSHGGSRPRHIAVSNNPEACYTCGIIGHWARDCPAAESQLYSKRRLRDRSVTPPRHRENPYMSRDPRHDLEVSPHEHRHHRRRSPLGEIDYTRTERDRLPLSARESYFLPAHAEDKRFRPDHSFRGDRERDDQRALDLKILPRGEEYRAPYLIPSSRSRSPPPGSRDYYTRHPAPYPVRSLPRNDYQGRVHELKSYAPEPAYYRDHVRAPEPPRLGRYEDRSPDRQQYAYPLERIVEPTRIDRRYEVPEARVITRGHSPRRARSPRRSPSPSRRPPTHRRPLGRSQPPYESAGYGRPTSYPIRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.68
3 0.68
4 0.66
5 0.62
6 0.6
7 0.64
8 0.64
9 0.65
10 0.6
11 0.6
12 0.62
13 0.61
14 0.6
15 0.55
16 0.49
17 0.47
18 0.52
19 0.5
20 0.48
21 0.46
22 0.46
23 0.48
24 0.45
25 0.45
26 0.39
27 0.36
28 0.44
29 0.47
30 0.48
31 0.47
32 0.48
33 0.45
34 0.51
35 0.52
36 0.45
37 0.45
38 0.46
39 0.44
40 0.51
41 0.54
42 0.53
43 0.5
44 0.54
45 0.58
46 0.54
47 0.6
48 0.59
49 0.63
50 0.67
51 0.76
52 0.8
53 0.8
54 0.86
55 0.85
56 0.81
57 0.81
58 0.82
59 0.82
60 0.78
61 0.74
62 0.69
63 0.65
64 0.62
65 0.53
66 0.47
67 0.44
68 0.38
69 0.33
70 0.32
71 0.29
72 0.28
73 0.26
74 0.23
75 0.17
76 0.16
77 0.15
78 0.1
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.06
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.04
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.06
92 0.06
93 0.08
94 0.1
95 0.1
96 0.15
97 0.18
98 0.23
99 0.25
100 0.25
101 0.26
102 0.25
103 0.27
104 0.24
105 0.24
106 0.2
107 0.19
108 0.18
109 0.18
110 0.19
111 0.17
112 0.15
113 0.13
114 0.14
115 0.15
116 0.16
117 0.19
118 0.18
119 0.18
120 0.18
121 0.17
122 0.16
123 0.18
124 0.21
125 0.19
126 0.19
127 0.2
128 0.25
129 0.26
130 0.28
131 0.25
132 0.23
133 0.22
134 0.23
135 0.21
136 0.16
137 0.15
138 0.11
139 0.13
140 0.11
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.05
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.09
153 0.1
154 0.1
155 0.11
156 0.09
157 0.1
158 0.1
159 0.12
160 0.13
161 0.12
162 0.11
163 0.12
164 0.12
165 0.1
166 0.11
167 0.09
168 0.09
169 0.14
170 0.15
171 0.21
172 0.22
173 0.23
174 0.25
175 0.24
176 0.24
177 0.2
178 0.24
179 0.25
180 0.33
181 0.37
182 0.35
183 0.34
184 0.33
185 0.33
186 0.29
187 0.23
188 0.15
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.13
193 0.13
194 0.14
195 0.13
196 0.13
197 0.14
198 0.15
199 0.15
200 0.13
201 0.13
202 0.13
203 0.12
204 0.13
205 0.15
206 0.22
207 0.24
208 0.26
209 0.28
210 0.33
211 0.41
212 0.46
213 0.49
214 0.5
215 0.55
216 0.62
217 0.69
218 0.72
219 0.72
220 0.75
221 0.72
222 0.72
223 0.68
224 0.61
225 0.59
226 0.58
227 0.58
228 0.57
229 0.55
230 0.51
231 0.5
232 0.49
233 0.41
234 0.35
235 0.29
236 0.21
237 0.25
238 0.27
239 0.28
240 0.27
241 0.28
242 0.28
243 0.34
244 0.42
245 0.47
246 0.51
247 0.54
248 0.6
249 0.65
250 0.67
251 0.67
252 0.66
253 0.59
254 0.53
255 0.48
256 0.43
257 0.38
258 0.36
259 0.29
260 0.23
261 0.21
262 0.17
263 0.2
264 0.2
265 0.19
266 0.22
267 0.26
268 0.3
269 0.34
270 0.33
271 0.31
272 0.28
273 0.28
274 0.24
275 0.2
276 0.17
277 0.12
278 0.15
279 0.17
280 0.2
281 0.2
282 0.23
283 0.3
284 0.29
285 0.3
286 0.35
287 0.37
288 0.42
289 0.48
290 0.49
291 0.44
292 0.53
293 0.55
294 0.49
295 0.5
296 0.48
297 0.43
298 0.41
299 0.39
300 0.32
301 0.35
302 0.33
303 0.3
304 0.27
305 0.26
306 0.28
307 0.28
308 0.25
309 0.21
310 0.23
311 0.22
312 0.24
313 0.26
314 0.25
315 0.25
316 0.25
317 0.23
318 0.24
319 0.25
320 0.24
321 0.25
322 0.26
323 0.31
324 0.35
325 0.39
326 0.44
327 0.46
328 0.5
329 0.53
330 0.56
331 0.55
332 0.54
333 0.55
334 0.52
335 0.54
336 0.53
337 0.49
338 0.43
339 0.4
340 0.44
341 0.46
342 0.47
343 0.46
344 0.45
345 0.49
346 0.49
347 0.53
348 0.52
349 0.53
350 0.54
351 0.5
352 0.48
353 0.46
354 0.49
355 0.49
356 0.47
357 0.4
358 0.37
359 0.36
360 0.33
361 0.34
362 0.29
363 0.25
364 0.22
365 0.24
366 0.21
367 0.26
368 0.28
369 0.25
370 0.29
371 0.31
372 0.34
373 0.34
374 0.34
375 0.36
376 0.37
377 0.43
378 0.43
379 0.43
380 0.43
381 0.45
382 0.47
383 0.46
384 0.48
385 0.49
386 0.53
387 0.56
388 0.59
389 0.6
390 0.63
391 0.6
392 0.54
393 0.46
394 0.45
395 0.47
396 0.46
397 0.42
398 0.35
399 0.32
400 0.32
401 0.36
402 0.31
403 0.28
404 0.25
405 0.31
406 0.39
407 0.4
408 0.41
409 0.39
410 0.41
411 0.43
412 0.5
413 0.47
414 0.41
415 0.44
416 0.46
417 0.44
418 0.44
419 0.37
420 0.32
421 0.37
422 0.42
423 0.44
424 0.5
425 0.55
426 0.59
427 0.7
428 0.78
429 0.79
430 0.82
431 0.86
432 0.87
433 0.91
434 0.9
435 0.89
436 0.9
437 0.91
438 0.91
439 0.89
440 0.88
441 0.87
442 0.89
443 0.9
444 0.9
445 0.89
446 0.87
447 0.86
448 0.87
449 0.88
450 0.88
451 0.85
452 0.8
453 0.77
454 0.71
455 0.67
456 0.58
457 0.5
458 0.42
459 0.4
460 0.37
461 0.32
462 0.29
463 0.26
464 0.28