Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QVN0

Protein Details
Accession C4QVN0    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-39EDTDKHRKERLRQLLRSNINHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
117-121KIGKP
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR031781  SF3A2_dom  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0005686  C:U2 snRNP  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG ppa:PAS_chr1-3_0241  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF16835  SF3A2  
PF12874  zf-met  
Amino Acid Sequences MDYQNRVGSKKGSGGLASAEDTDKHRKERLRQLLRSNINIESDPYVVRTRTGQYDCKLCLTTHVNESSYISHTQGKRHQLSLMRREAEVSKNENRTDGGNIGNGMGISSIPKRKYVKIGKPGYKVKKTRDADEHLGLSLEIAMKEFNRVKPMYTIMSKMETTTTPVKGQCIVISGEPYENIGFDIPVELDGFNLGETWDYWDQDSKLYYVQLTYDRTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.25
3 0.24
4 0.22
5 0.17
6 0.15
7 0.14
8 0.18
9 0.26
10 0.28
11 0.3
12 0.36
13 0.42
14 0.5
15 0.6
16 0.67
17 0.69
18 0.72
19 0.77
20 0.81
21 0.79
22 0.74
23 0.66
24 0.56
25 0.48
26 0.41
27 0.34
28 0.26
29 0.22
30 0.17
31 0.17
32 0.18
33 0.16
34 0.16
35 0.17
36 0.18
37 0.24
38 0.28
39 0.31
40 0.32
41 0.37
42 0.37
43 0.38
44 0.37
45 0.29
46 0.3
47 0.29
48 0.29
49 0.28
50 0.3
51 0.27
52 0.26
53 0.28
54 0.24
55 0.22
56 0.2
57 0.17
58 0.2
59 0.21
60 0.26
61 0.31
62 0.37
63 0.37
64 0.38
65 0.4
66 0.41
67 0.48
68 0.51
69 0.51
70 0.44
71 0.41
72 0.42
73 0.4
74 0.37
75 0.32
76 0.29
77 0.28
78 0.31
79 0.31
80 0.31
81 0.29
82 0.26
83 0.24
84 0.2
85 0.15
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.1
90 0.08
91 0.06
92 0.05
93 0.04
94 0.04
95 0.07
96 0.1
97 0.11
98 0.16
99 0.18
100 0.2
101 0.3
102 0.38
103 0.45
104 0.51
105 0.6
106 0.62
107 0.67
108 0.74
109 0.73
110 0.73
111 0.7
112 0.65
113 0.67
114 0.62
115 0.61
116 0.59
117 0.57
118 0.53
119 0.5
120 0.45
121 0.35
122 0.32
123 0.26
124 0.19
125 0.13
126 0.08
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.1
132 0.14
133 0.14
134 0.19
135 0.2
136 0.21
137 0.23
138 0.26
139 0.25
140 0.24
141 0.25
142 0.22
143 0.25
144 0.23
145 0.21
146 0.2
147 0.16
148 0.19
149 0.21
150 0.21
151 0.22
152 0.22
153 0.23
154 0.23
155 0.24
156 0.2
157 0.18
158 0.17
159 0.15
160 0.15
161 0.15
162 0.14
163 0.13
164 0.14
165 0.12
166 0.1
167 0.1
168 0.09
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.06
173 0.07
174 0.08
175 0.07
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.06
184 0.12
185 0.14
186 0.15
187 0.16
188 0.21
189 0.22
190 0.24
191 0.25
192 0.2
193 0.2
194 0.21
195 0.2
196 0.16
197 0.19
198 0.21