FuNGI

A0A2S4UQH1

Protein Details

Accession

A0A2S4UQH1

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-39	AHSTLSPRPRNSKIKSKKIETKMPPRGSRGRGRGKARET	Hydrophilic
404-427	EGVPGKPVPRKITKKKKPGLDDWL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
8-37	RPRNSKIKSKKIETKMPPRGSRGRGRGKAR
111-130	PAGRGGRGRGRGADRGGRGR
409-421	KPVPRKITKKKKP

Subcellular Location(s)

nucl 25.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

AHSTLSPRPRNSKIKSKKIETKMPPRGSRGRGRGKARETIEEPQNEPVLDPVLSRLTVEDHGGTSTSRTTGGSGDSKPAAVPSKFKPRMVKRVVKVEPDIEVEDSSKVGGPAGRGGRGRGRGADRGGRGRPDMVMTASGAFGMGPAEASTRRTIQGPNRSGMRRIDNSIVPTDNNNNKSDRSANKPWDGGPSEMLELYSDIDDEEGSDDNGGDQDEDGRSKVADLNDITLEHSMAPLSLPWDPKRIAERERLIHARNQKLIKLTNQKIKREQAEDTKPLPSTSPENSRQSSSTAPLNGRENTSNSNESVPLMKLDPVEHLDDNDENHKRDVKLKKDQLEELSNVGKQFTQKKPTHSDRSTTNPIQSTDAHSSPTQETYYVFQFPRNFPQFRDPSNIIEEEVNVEGVPGKPVPRKITKKKKPGLDDWLGWGKGGKRVECMGVPPGDNLNSDGSTSSLFEDQGRVQMIIANVAYDVLPGAQPTFHQEISVIDPKPDSNLRAMFILGSTNHKFIVVPDVSTLLKREQSLLSSSSTSIPSNPTLNHPSK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.82
2	0.85
3	0.87
4	0.88
5	0.87
6	0.89
7	0.88
8	0.89
9	0.88
10	0.88
11	0.84
12	0.82
13	0.82
14	0.79
15	0.79
16	0.78
17	0.78
18	0.77
19	0.8
20	0.82
21	0.78
22	0.78
23	0.72
24	0.7
25	0.64
26	0.63
27	0.62
28	0.57
29	0.53
30	0.49
31	0.47
32	0.39
33	0.34
34	0.27
35	0.22
36	0.17
37	0.15
38	0.14
39	0.14
40	0.14
41	0.14
42	0.13
43	0.14
44	0.15
45	0.17
46	0.15
47	0.13
48	0.14
49	0.15
50	0.14
51	0.13
52	0.13
53	0.12
54	0.12
55	0.11
56	0.12
57	0.12
58	0.17
59	0.2
60	0.2
61	0.23
62	0.23
63	0.23
64	0.22
65	0.24
66	0.26
67	0.23
68	0.26
69	0.29
70	0.4
71	0.44
72	0.49
73	0.56
74	0.59
75	0.68
76	0.73
77	0.76
78	0.71
79	0.77
80	0.77
81	0.72
82	0.67
83	0.58
84	0.5
85	0.44
86	0.39
87	0.3
88	0.25
89	0.21
90	0.18
91	0.16
92	0.13
93	0.11
94	0.09
95	0.09
96	0.1
97	0.09
98	0.15
99	0.18
100	0.21
101	0.21
102	0.24
103	0.29
104	0.33
105	0.34
106	0.33
107	0.35
108	0.36
109	0.39
110	0.43
111	0.42
112	0.44
113	0.45
114	0.42
115	0.39
116	0.36
117	0.32
118	0.27
119	0.24
120	0.18
121	0.16
122	0.14
123	0.13
124	0.12
125	0.1
126	0.08
127	0.06
128	0.05
129	0.05
130	0.04
131	0.03
132	0.04
133	0.05
134	0.06
135	0.09
136	0.11
137	0.12
138	0.13
139	0.15
140	0.21
141	0.28
142	0.37
143	0.39
144	0.41
145	0.46
146	0.46
147	0.48
148	0.47
149	0.46
150	0.39
151	0.39
152	0.39
153	0.35
154	0.36
155	0.35
156	0.31
157	0.25
158	0.24
159	0.28
160	0.31
161	0.31
162	0.31
163	0.3
164	0.3
165	0.32
166	0.36
167	0.33
168	0.35
169	0.4
170	0.44
171	0.46
172	0.47
173	0.45
174	0.45
175	0.43
176	0.35
177	0.28
178	0.23
179	0.2
180	0.19
181	0.18
182	0.11
183	0.09
184	0.09
185	0.07
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.04
190	0.04
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.05
195	0.05
196	0.05
197	0.05
198	0.05
199	0.04
200	0.04
201	0.05
202	0.06
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.08
208	0.11
209	0.1
210	0.12
211	0.12
212	0.14
213	0.14
214	0.14
215	0.14
216	0.11
217	0.11
218	0.07
219	0.07
220	0.05
221	0.05
222	0.04
223	0.04
224	0.05
225	0.08
226	0.11
227	0.12
228	0.16
229	0.16
230	0.19
231	0.24
232	0.26
233	0.28
234	0.32
235	0.36
236	0.35
237	0.4
238	0.41
239	0.38
240	0.38
241	0.42
242	0.39
243	0.4
244	0.38
245	0.35
246	0.34
247	0.35
248	0.38
249	0.41
250	0.41
251	0.44
252	0.49
253	0.52
254	0.54
255	0.57
256	0.54
257	0.47
258	0.45
259	0.45
260	0.45
261	0.45
262	0.41
263	0.38
264	0.34
265	0.31
266	0.28
267	0.21
268	0.19
269	0.18
270	0.24
271	0.27
272	0.31
273	0.32
274	0.33
275	0.33
276	0.31
277	0.28
278	0.23
279	0.2
280	0.19
281	0.19
282	0.2
283	0.23
284	0.21
285	0.22
286	0.21
287	0.2
288	0.21
289	0.23
290	0.22
291	0.19
292	0.19
293	0.17
294	0.16
295	0.16
296	0.13
297	0.11
298	0.1
299	0.11
300	0.1
301	0.1
302	0.11
303	0.12
304	0.14
305	0.13
306	0.13
307	0.13
308	0.13
309	0.14
310	0.19
311	0.19
312	0.18
313	0.19
314	0.23
315	0.22
316	0.3
317	0.37
318	0.38
319	0.46
320	0.52
321	0.57
322	0.57
323	0.6
324	0.56
325	0.52
326	0.45
327	0.37
328	0.32
329	0.26
330	0.23
331	0.2
332	0.16
333	0.16
334	0.23
335	0.26
336	0.34
337	0.37
338	0.43
339	0.52
340	0.6
341	0.66
342	0.6
343	0.58
344	0.53
345	0.58
346	0.6
347	0.53
348	0.48
349	0.41
350	0.4
351	0.39
352	0.35
353	0.33
354	0.29
355	0.28
356	0.26
357	0.23
358	0.25
359	0.23
360	0.25
361	0.19
362	0.15
363	0.15
364	0.16
365	0.18
366	0.2
367	0.19
368	0.21
369	0.25
370	0.27
371	0.36
372	0.4
373	0.39
374	0.37
375	0.47
376	0.47
377	0.45
378	0.5
379	0.43
380	0.39
381	0.42
382	0.4
383	0.31
384	0.26
385	0.23
386	0.18
387	0.16
388	0.13
389	0.09
390	0.08
391	0.08
392	0.08
393	0.1
394	0.08
395	0.12
396	0.16
397	0.21
398	0.28
399	0.37
400	0.47
401	0.57
402	0.67
403	0.74
404	0.81
405	0.84
406	0.86
407	0.84
408	0.82
409	0.8
410	0.75
411	0.67
412	0.62
413	0.61
414	0.52
415	0.44
416	0.38
417	0.3
418	0.29
419	0.32
420	0.26
421	0.23
422	0.25
423	0.28
424	0.26
425	0.27
426	0.26
427	0.24
428	0.24
429	0.22
430	0.23
431	0.21
432	0.21
433	0.2
434	0.18
435	0.15
436	0.15
437	0.14
438	0.12
439	0.12
440	0.12
441	0.12
442	0.1
443	0.11
444	0.11
445	0.14
446	0.14
447	0.17
448	0.18
449	0.16
450	0.15
451	0.17
452	0.17
453	0.17
454	0.16
455	0.12
456	0.1
457	0.1
458	0.1
459	0.07
460	0.07
461	0.05
462	0.05
463	0.05
464	0.06
465	0.06
466	0.07
467	0.13
468	0.18
469	0.17
470	0.17
471	0.17
472	0.19
473	0.26
474	0.32
475	0.27
476	0.23
477	0.24
478	0.24
479	0.29
480	0.31
481	0.25
482	0.25
483	0.27
484	0.27
485	0.27
486	0.27
487	0.22
488	0.19
489	0.2
490	0.15
491	0.2
492	0.21
493	0.22
494	0.21
495	0.21
496	0.21
497	0.19
498	0.27
499	0.21
500	0.19
501	0.19
502	0.22
503	0.22
504	0.23
505	0.25
506	0.2
507	0.22
508	0.22
509	0.24
510	0.24
511	0.26
512	0.29
513	0.28
514	0.27
515	0.25
516	0.26
517	0.25
518	0.25
519	0.23
520	0.22
521	0.24
522	0.24
523	0.27
524	0.27
525	0.32

A0A2S4UQH1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer