Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2S4VSR3

Protein Details
Accession A0A2S4VSR3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
280-299VKKAEPKKATAVKKTTKKAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
112-165SKPASKAKAAKAKAPSSKTKAAPAASKKPASAPKKPTSSTTKKATAPKKASPPK
235-306PKGASGKVKLAKTVPEPKAPKPVLATAKPASKPTVKKAVAAKAAPVKKAEPKKATAVKKTTKKAPTAPTKKV
Subcellular Location(s) nucl 18, mito_nucl 13.333, cyto_nucl 9.833, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005818  Histone_H1/H5_H15  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0000786  C:nucleosome  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006334  P:nucleosome assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF00538  Linker_histone  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51504  H15  
CDD cd00073  H15  
Amino Acid Sequences MGWVLDKGVCESESKRAPKSSKPDQSQLTTQSNRAQAQTKSVTAGITQSLPPSPYPPHLEHLSHQPEPTTHSHLHNQLILTHHPAKHVCLSFRAAIDPQVVAATGSPSAAASKPASKAKAAKAKAPSSKTKAAPAASKKPASAPKKPTSSTTKKATAPKKASPPKEAAADTKVSMEDMIKDAIKNDKENVRGGVSRPAIKKYLAFRFKVLDTPSNIARLNKAITKGAEKGIFALPKGASGKVKLAKTVPEPKAPKPVLATAKPASKPTVKKAVAAKAAPVKKAEPKKATAVKKTTKKAPTAPTKKVAAAKQPIIFSQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.4
3 0.46
4 0.5
5 0.56
6 0.63
7 0.66
8 0.67
9 0.7
10 0.73
11 0.71
12 0.73
13 0.7
14 0.68
15 0.66
16 0.59
17 0.55
18 0.53
19 0.53
20 0.49
21 0.46
22 0.45
23 0.37
24 0.42
25 0.43
26 0.37
27 0.33
28 0.32
29 0.29
30 0.23
31 0.24
32 0.17
33 0.15
34 0.15
35 0.14
36 0.15
37 0.16
38 0.16
39 0.18
40 0.2
41 0.23
42 0.28
43 0.29
44 0.33
45 0.36
46 0.38
47 0.37
48 0.43
49 0.45
50 0.41
51 0.38
52 0.35
53 0.3
54 0.33
55 0.35
56 0.31
57 0.27
58 0.29
59 0.35
60 0.38
61 0.4
62 0.37
63 0.33
64 0.3
65 0.3
66 0.28
67 0.29
68 0.3
69 0.28
70 0.29
71 0.29
72 0.29
73 0.33
74 0.35
75 0.3
76 0.27
77 0.3
78 0.28
79 0.28
80 0.27
81 0.21
82 0.19
83 0.19
84 0.16
85 0.12
86 0.1
87 0.09
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.06
96 0.06
97 0.08
98 0.09
99 0.12
100 0.16
101 0.2
102 0.21
103 0.22
104 0.27
105 0.32
106 0.4
107 0.38
108 0.41
109 0.44
110 0.49
111 0.53
112 0.54
113 0.53
114 0.5
115 0.56
116 0.51
117 0.49
118 0.46
119 0.42
120 0.44
121 0.43
122 0.46
123 0.44
124 0.43
125 0.39
126 0.4
127 0.47
128 0.46
129 0.48
130 0.47
131 0.49
132 0.54
133 0.55
134 0.55
135 0.55
136 0.57
137 0.55
138 0.53
139 0.51
140 0.51
141 0.58
142 0.59
143 0.59
144 0.58
145 0.57
146 0.61
147 0.63
148 0.62
149 0.57
150 0.55
151 0.47
152 0.45
153 0.41
154 0.33
155 0.27
156 0.24
157 0.21
158 0.18
159 0.16
160 0.12
161 0.11
162 0.09
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.09
169 0.14
170 0.15
171 0.16
172 0.18
173 0.21
174 0.23
175 0.24
176 0.25
177 0.22
178 0.22
179 0.22
180 0.26
181 0.24
182 0.28
183 0.28
184 0.29
185 0.28
186 0.27
187 0.3
188 0.29
189 0.37
190 0.37
191 0.37
192 0.36
193 0.37
194 0.38
195 0.38
196 0.35
197 0.29
198 0.27
199 0.28
200 0.28
201 0.28
202 0.29
203 0.24
204 0.23
205 0.21
206 0.2
207 0.2
208 0.21
209 0.2
210 0.21
211 0.24
212 0.25
213 0.26
214 0.25
215 0.22
216 0.23
217 0.24
218 0.24
219 0.2
220 0.21
221 0.17
222 0.19
223 0.21
224 0.21
225 0.18
226 0.19
227 0.26
228 0.28
229 0.29
230 0.28
231 0.28
232 0.31
233 0.37
234 0.46
235 0.43
236 0.46
237 0.49
238 0.5
239 0.59
240 0.55
241 0.5
242 0.43
243 0.47
244 0.46
245 0.44
246 0.47
247 0.41
248 0.47
249 0.46
250 0.45
251 0.42
252 0.42
253 0.45
254 0.46
255 0.52
256 0.46
257 0.5
258 0.54
259 0.58
260 0.57
261 0.52
262 0.51
263 0.5
264 0.53
265 0.49
266 0.45
267 0.41
268 0.43
269 0.52
270 0.56
271 0.53
272 0.53
273 0.61
274 0.68
275 0.72
276 0.72
277 0.73
278 0.73
279 0.77
280 0.8
281 0.8
282 0.78
283 0.76
284 0.75
285 0.76
286 0.77
287 0.77
288 0.77
289 0.75
290 0.71
291 0.7
292 0.69
293 0.65
294 0.63
295 0.62
296 0.61
297 0.59