Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2S4VQD2

Protein Details
Accession A0A2S4VQD2    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
279-303GSIPGGKKKRVKRERDPNAPKRPASBasic
400-420QGHPLPKKRGRPTKAEKDHPMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
282-300PGGKKKRVKRERDPNAPKR
388-394RKRRSRA
401-414GHPLPKKRGRPTKA
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 11, cyto_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSRYPPSPTSTATTPFSLFAPFPPPPTVSLFALPLQSRLSLAALLDSSNNKSSVFLNKFSSSEPLFLRRTLHNSPFHNPSHPQSYSKKSPALILSPKTFLHPPLTDPHQSSAMAHSSKETALLAAKQDHHAQSPPQDPYSRGSTTSQTGYGSHPAQYSDPPNYAHSHPLYPAPPQPQSASNPRTAAPPGPCFMTVTPGAPRQHAHGPVLAPKPRQRKPQQASANQSFASQPAQPLETDDDEDDEDDPEEPVSEDDHSHAHGPTFYNPPRQPATIPTPPGSIPGGKKKRVKRERDPNAPKRPASAYILFQNAVRQEMRAANPTADYKELARQIGDRWKNLSDDAKRPWSEAGKLAMNSWNIQNKEYKISHPEITSPQNQTGAPQAPVPRKRRSRAVEVDAQGHPLPKKRGRPTKAEKDHPMESLVHPSHQNGHQSQPAGGMSLQTINGPLVPISAPVPMTGVQYASQPQHRDEEYTDEGEEEEIEEEEEEEEEEEAPGNHQPAHPSTLPPARANGPPHVSSEMAPHSESDPEDGEEEEGSEPRSPEPNHPVNKMSVQPNGILA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.32
3 0.29
4 0.26
5 0.22
6 0.2
7 0.24
8 0.22
9 0.24
10 0.27
11 0.27
12 0.27
13 0.32
14 0.34
15 0.29
16 0.3
17 0.29
18 0.27
19 0.32
20 0.29
21 0.25
22 0.23
23 0.21
24 0.19
25 0.18
26 0.17
27 0.12
28 0.12
29 0.12
30 0.11
31 0.11
32 0.13
33 0.15
34 0.17
35 0.19
36 0.19
37 0.18
38 0.19
39 0.21
40 0.28
41 0.31
42 0.31
43 0.34
44 0.36
45 0.37
46 0.37
47 0.4
48 0.32
49 0.31
50 0.3
51 0.31
52 0.31
53 0.32
54 0.34
55 0.33
56 0.38
57 0.42
58 0.46
59 0.48
60 0.5
61 0.54
62 0.57
63 0.55
64 0.54
65 0.49
66 0.47
67 0.48
68 0.46
69 0.47
70 0.46
71 0.53
72 0.56
73 0.58
74 0.57
75 0.49
76 0.52
77 0.5
78 0.51
79 0.5
80 0.47
81 0.44
82 0.43
83 0.42
84 0.4
85 0.38
86 0.32
87 0.31
88 0.26
89 0.26
90 0.29
91 0.35
92 0.36
93 0.37
94 0.37
95 0.33
96 0.32
97 0.3
98 0.28
99 0.28
100 0.24
101 0.22
102 0.21
103 0.2
104 0.19
105 0.19
106 0.16
107 0.1
108 0.12
109 0.13
110 0.14
111 0.17
112 0.19
113 0.2
114 0.25
115 0.25
116 0.26
117 0.26
118 0.27
119 0.29
120 0.34
121 0.35
122 0.33
123 0.34
124 0.33
125 0.34
126 0.38
127 0.32
128 0.28
129 0.27
130 0.26
131 0.28
132 0.28
133 0.26
134 0.21
135 0.21
136 0.21
137 0.23
138 0.22
139 0.2
140 0.19
141 0.19
142 0.2
143 0.22
144 0.23
145 0.22
146 0.23
147 0.23
148 0.24
149 0.26
150 0.26
151 0.28
152 0.26
153 0.25
154 0.24
155 0.26
156 0.25
157 0.25
158 0.28
159 0.28
160 0.28
161 0.28
162 0.29
163 0.29
164 0.32
165 0.39
166 0.37
167 0.36
168 0.35
169 0.34
170 0.34
171 0.32
172 0.32
173 0.27
174 0.26
175 0.24
176 0.24
177 0.24
178 0.23
179 0.21
180 0.2
181 0.16
182 0.15
183 0.17
184 0.21
185 0.22
186 0.22
187 0.22
188 0.22
189 0.27
190 0.28
191 0.26
192 0.23
193 0.23
194 0.29
195 0.34
196 0.34
197 0.32
198 0.36
199 0.45
200 0.48
201 0.57
202 0.58
203 0.64
204 0.65
205 0.71
206 0.74
207 0.73
208 0.76
209 0.7
210 0.65
211 0.54
212 0.49
213 0.39
214 0.3
215 0.24
216 0.16
217 0.12
218 0.1
219 0.11
220 0.1
221 0.12
222 0.14
223 0.12
224 0.13
225 0.12
226 0.12
227 0.11
228 0.12
229 0.1
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.05
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.1
249 0.13
250 0.19
251 0.2
252 0.28
253 0.28
254 0.32
255 0.32
256 0.32
257 0.3
258 0.28
259 0.33
260 0.3
261 0.31
262 0.28
263 0.27
264 0.26
265 0.27
266 0.23
267 0.19
268 0.17
269 0.25
270 0.31
271 0.36
272 0.43
273 0.49
274 0.59
275 0.66
276 0.72
277 0.72
278 0.77
279 0.81
280 0.85
281 0.89
282 0.87
283 0.88
284 0.84
285 0.74
286 0.65
287 0.58
288 0.49
289 0.43
290 0.35
291 0.27
292 0.25
293 0.26
294 0.23
295 0.21
296 0.2
297 0.16
298 0.15
299 0.13
300 0.1
301 0.11
302 0.14
303 0.16
304 0.17
305 0.18
306 0.16
307 0.17
308 0.18
309 0.17
310 0.15
311 0.14
312 0.11
313 0.15
314 0.17
315 0.16
316 0.15
317 0.15
318 0.18
319 0.26
320 0.28
321 0.25
322 0.26
323 0.27
324 0.27
325 0.29
326 0.33
327 0.28
328 0.31
329 0.35
330 0.39
331 0.38
332 0.38
333 0.39
334 0.34
335 0.31
336 0.29
337 0.28
338 0.23
339 0.23
340 0.24
341 0.24
342 0.23
343 0.22
344 0.22
345 0.24
346 0.22
347 0.23
348 0.26
349 0.24
350 0.3
351 0.31
352 0.29
353 0.29
354 0.32
355 0.34
356 0.3
357 0.32
358 0.3
359 0.33
360 0.36
361 0.33
362 0.3
363 0.3
364 0.29
365 0.26
366 0.28
367 0.25
368 0.21
369 0.21
370 0.25
371 0.32
372 0.4
373 0.45
374 0.49
375 0.55
376 0.59
377 0.66
378 0.66
379 0.68
380 0.68
381 0.68
382 0.67
383 0.61
384 0.6
385 0.51
386 0.48
387 0.38
388 0.33
389 0.29
390 0.26
391 0.32
392 0.34
393 0.43
394 0.51
395 0.61
396 0.63
397 0.71
398 0.76
399 0.79
400 0.82
401 0.81
402 0.79
403 0.75
404 0.72
405 0.63
406 0.55
407 0.46
408 0.38
409 0.38
410 0.31
411 0.27
412 0.25
413 0.25
414 0.28
415 0.29
416 0.34
417 0.27
418 0.31
419 0.32
420 0.33
421 0.32
422 0.29
423 0.25
424 0.21
425 0.19
426 0.15
427 0.12
428 0.12
429 0.12
430 0.09
431 0.1
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.08
439 0.08
440 0.09
441 0.09
442 0.09
443 0.11
444 0.1
445 0.12
446 0.11
447 0.12
448 0.11
449 0.12
450 0.16
451 0.18
452 0.23
453 0.24
454 0.25
455 0.3
456 0.3
457 0.32
458 0.3
459 0.33
460 0.32
461 0.31
462 0.3
463 0.24
464 0.23
465 0.2
466 0.18
467 0.12
468 0.09
469 0.07
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.07
482 0.08
483 0.1
484 0.11
485 0.12
486 0.13
487 0.17
488 0.19
489 0.25
490 0.26
491 0.26
492 0.31
493 0.37
494 0.4
495 0.38
496 0.38
497 0.36
498 0.4
499 0.42
500 0.43
501 0.42
502 0.39
503 0.41
504 0.4
505 0.37
506 0.32
507 0.34
508 0.31
509 0.27
510 0.26
511 0.25
512 0.23
513 0.25
514 0.25
515 0.22
516 0.19
517 0.18
518 0.18
519 0.18
520 0.17
521 0.14
522 0.15
523 0.14
524 0.12
525 0.13
526 0.15
527 0.16
528 0.17
529 0.25
530 0.26
531 0.33
532 0.42
533 0.49
534 0.53
535 0.56
536 0.57
537 0.54
538 0.57
539 0.56
540 0.52
541 0.48
542 0.44