Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2S4VW36

Protein Details
Accession A0A2S4VW36    Localization Confidence High Confidence Score 18.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
85-105RDRPRDPDRDRDRPRDRERGQBasic
163-188DGRSRRVDRSRHKSRHDRSRSRSRSGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
94-104DRDRPRDRERG
115-143ADRDRDRHRERPRDGDGNRRNLDRPARDS
145-202ASGNRDREYRDRDRSRSPDGRSRRVDRSRHKSRHDRSRSRSRSGSPGPSRRVGRARSG
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 9.5, plas 5, mito 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MRGGPSRYESRAGSPGDERAKDSSSRSQRESSVKERERSSRARDSDRDRNRYRDRDGRDRDSPPIRDRGRDYVDRDLDRDRDGDRDRPRDPDRDRDRPRDRERGQDHSKSNDRDADRDRDRHRERPRDGDGNRRNLDRPARDSTASGNRDREYRDRDRSRSPDGRSRRVDRSRHKSRHDRSRSRSRSGSPGPSRRVGRARSGDRSSPDGTRRPDSGIAMDVDPNVEDEDEEAKMARMMGFSALTTTKGKHVSGNDEAGTVDVVKVRTWRQYMNRQAYYSTFFLSLIIVVPGLSFRANSVSSRDYFFSFDQARWIQSSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.39
3 0.42
4 0.42
5 0.39
6 0.36
7 0.38
8 0.37
9 0.39
10 0.42
11 0.44
12 0.49
13 0.51
14 0.51
15 0.55
16 0.61
17 0.63
18 0.61
19 0.62
20 0.64
21 0.65
22 0.66
23 0.67
24 0.66
25 0.66
26 0.66
27 0.65
28 0.64
29 0.67
30 0.69
31 0.7
32 0.73
33 0.76
34 0.77
35 0.73
36 0.76
37 0.78
38 0.78
39 0.77
40 0.75
41 0.73
42 0.74
43 0.77
44 0.75
45 0.73
46 0.68
47 0.68
48 0.67
49 0.65
50 0.59
51 0.6
52 0.55
53 0.53
54 0.54
55 0.54
56 0.53
57 0.53
58 0.53
59 0.52
60 0.56
61 0.52
62 0.5
63 0.46
64 0.41
65 0.36
66 0.33
67 0.25
68 0.25
69 0.27
70 0.33
71 0.37
72 0.42
73 0.42
74 0.49
75 0.52
76 0.54
77 0.55
78 0.58
79 0.59
80 0.63
81 0.69
82 0.72
83 0.77
84 0.78
85 0.81
86 0.81
87 0.75
88 0.74
89 0.72
90 0.71
91 0.7
92 0.67
93 0.63
94 0.6
95 0.64
96 0.56
97 0.54
98 0.51
99 0.44
100 0.42
101 0.44
102 0.45
103 0.43
104 0.48
105 0.49
106 0.53
107 0.57
108 0.61
109 0.66
110 0.67
111 0.65
112 0.66
113 0.69
114 0.67
115 0.64
116 0.66
117 0.63
118 0.62
119 0.6
120 0.53
121 0.48
122 0.44
123 0.49
124 0.42
125 0.4
126 0.37
127 0.37
128 0.36
129 0.35
130 0.35
131 0.37
132 0.35
133 0.32
134 0.29
135 0.27
136 0.29
137 0.31
138 0.32
139 0.31
140 0.35
141 0.43
142 0.47
143 0.5
144 0.56
145 0.57
146 0.6
147 0.59
148 0.56
149 0.55
150 0.55
151 0.6
152 0.59
153 0.6
154 0.61
155 0.62
156 0.67
157 0.68
158 0.72
159 0.74
160 0.76
161 0.79
162 0.8
163 0.8
164 0.82
165 0.83
166 0.83
167 0.8
168 0.84
169 0.82
170 0.77
171 0.74
172 0.65
173 0.63
174 0.59
175 0.6
176 0.57
177 0.59
178 0.57
179 0.58
180 0.57
181 0.54
182 0.55
183 0.47
184 0.47
185 0.48
186 0.49
187 0.51
188 0.53
189 0.51
190 0.47
191 0.49
192 0.43
193 0.39
194 0.38
195 0.37
196 0.37
197 0.37
198 0.36
199 0.34
200 0.34
201 0.3
202 0.27
203 0.23
204 0.2
205 0.17
206 0.17
207 0.13
208 0.12
209 0.1
210 0.1
211 0.08
212 0.06
213 0.05
214 0.06
215 0.08
216 0.07
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.09
229 0.09
230 0.11
231 0.12
232 0.12
233 0.16
234 0.19
235 0.19
236 0.22
237 0.25
238 0.29
239 0.32
240 0.35
241 0.31
242 0.28
243 0.27
244 0.23
245 0.2
246 0.14
247 0.1
248 0.09
249 0.09
250 0.1
251 0.14
252 0.16
253 0.22
254 0.25
255 0.32
256 0.38
257 0.47
258 0.57
259 0.64
260 0.66
261 0.61
262 0.6
263 0.55
264 0.52
265 0.43
266 0.35
267 0.25
268 0.2
269 0.19
270 0.17
271 0.14
272 0.1
273 0.09
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.07
282 0.11
283 0.12
284 0.14
285 0.19
286 0.23
287 0.24
288 0.28
289 0.29
290 0.26
291 0.29
292 0.29
293 0.31
294 0.29
295 0.28
296 0.32
297 0.32
298 0.33