Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2S4VMF2

Protein Details
Accession A0A2S4VMF2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MYYKNHRHVMKKQQQPHQKKGKQAAELHydrophilic
553-616TGDSKNDKPTEKKKMRGKNSSLKRFLRRKKRQNVITPQTEALKAKLSQRKQLYTQQQKQKAISKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
560-583KPTEKKKMRGKNSSLKRFLRRKKR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 12.166, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012952  BING4_C_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR040315  WDR46/Utp7  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08149  BING4CT  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MYYKNHRHVMKKQQQPHQKKGKQAAELQEYQVNQAQTNQYLDSNQNPDATKKLIRNETDDWKKVTQNNRKLSNHLAGIAKSKLKAIEKAQEHDNLLLLNQNQTNGNLLEPENKLEKTWKFKQSDIKASTNLHNSLKSFNLNLKDSNSGIGGPFKFDYNRNGNFVALIDQKVGKYSNINMKSLNLIFEIGLLNEHLRSVKWLHNQSFLAIAQKKYVYIYDGQQGSELHQLRGQVEVTQMEFLPYHFLLATVGLPGWLRYHDTSTGQIVAQHGTKLGSCHTMTQNPFNSIINLGHQNGTVTLWSPSINQPVVKFLAHLGPVTSLSVDPSSSGNLLTTTGLDGSLKVWDTRNWKTLTSWTLKKPAKTTAWSQKGLLAVGWGAHVSVYSDIGKAESKKGAYMNQLFPSQEVEQVQFCPFEDLLGVSHSSGFSQLIIPGSGEANFDSLEADPFETKSRKNEREVHNLLDKIPFELINLNPNFVGSLAPKPQTTHQLFQSTSATLKDKNDQTIVVNNPTSNTPYRKLNRIEKLKLSGVDPLAGEQEDENDGQEDDPDETGDSKNDKPTEKKKMRGKNSSLKRFLRRKKRQNVITPQTEALKAKLSQRKQLYTQQQKQKAISKAGGDGLSSGGALSQFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.87
3 0.88
4 0.88
5 0.84
6 0.83
7 0.85
8 0.83
9 0.79
10 0.77
11 0.75
12 0.72
13 0.69
14 0.63
15 0.56
16 0.48
17 0.44
18 0.41
19 0.33
20 0.25
21 0.26
22 0.27
23 0.25
24 0.28
25 0.26
26 0.23
27 0.25
28 0.28
29 0.29
30 0.3
31 0.29
32 0.31
33 0.31
34 0.32
35 0.33
36 0.34
37 0.34
38 0.35
39 0.42
40 0.46
41 0.47
42 0.52
43 0.55
44 0.61
45 0.64
46 0.63
47 0.59
48 0.55
49 0.57
50 0.58
51 0.62
52 0.62
53 0.63
54 0.68
55 0.73
56 0.72
57 0.7
58 0.7
59 0.67
60 0.58
61 0.52
62 0.46
63 0.38
64 0.39
65 0.39
66 0.35
67 0.29
68 0.29
69 0.3
70 0.31
71 0.35
72 0.36
73 0.41
74 0.43
75 0.47
76 0.49
77 0.48
78 0.46
79 0.41
80 0.36
81 0.26
82 0.22
83 0.22
84 0.18
85 0.18
86 0.17
87 0.17
88 0.18
89 0.18
90 0.21
91 0.17
92 0.17
93 0.14
94 0.15
95 0.19
96 0.19
97 0.22
98 0.23
99 0.23
100 0.24
101 0.29
102 0.33
103 0.36
104 0.44
105 0.5
106 0.49
107 0.55
108 0.64
109 0.65
110 0.7
111 0.67
112 0.63
113 0.58
114 0.58
115 0.58
116 0.54
117 0.49
118 0.41
119 0.38
120 0.34
121 0.33
122 0.32
123 0.28
124 0.24
125 0.25
126 0.29
127 0.28
128 0.29
129 0.29
130 0.29
131 0.27
132 0.27
133 0.22
134 0.17
135 0.15
136 0.19
137 0.16
138 0.16
139 0.16
140 0.16
141 0.18
142 0.2
143 0.27
144 0.29
145 0.32
146 0.33
147 0.33
148 0.32
149 0.3
150 0.28
151 0.25
152 0.19
153 0.17
154 0.15
155 0.15
156 0.15
157 0.16
158 0.17
159 0.13
160 0.13
161 0.18
162 0.26
163 0.28
164 0.29
165 0.28
166 0.28
167 0.32
168 0.3
169 0.26
170 0.16
171 0.14
172 0.13
173 0.13
174 0.12
175 0.08
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.07
181 0.06
182 0.06
183 0.08
184 0.11
185 0.17
186 0.25
187 0.32
188 0.34
189 0.39
190 0.39
191 0.37
192 0.37
193 0.31
194 0.31
195 0.26
196 0.25
197 0.22
198 0.22
199 0.22
200 0.19
201 0.2
202 0.14
203 0.13
204 0.15
205 0.19
206 0.19
207 0.19
208 0.19
209 0.19
210 0.19
211 0.24
212 0.23
213 0.17
214 0.18
215 0.19
216 0.18
217 0.19
218 0.18
219 0.11
220 0.11
221 0.12
222 0.11
223 0.11
224 0.1
225 0.09
226 0.09
227 0.08
228 0.11
229 0.09
230 0.09
231 0.08
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.08
244 0.08
245 0.11
246 0.12
247 0.14
248 0.15
249 0.16
250 0.16
251 0.14
252 0.14
253 0.13
254 0.12
255 0.12
256 0.1
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.09
262 0.11
263 0.11
264 0.14
265 0.16
266 0.21
267 0.22
268 0.28
269 0.29
270 0.28
271 0.28
272 0.25
273 0.23
274 0.19
275 0.18
276 0.14
277 0.14
278 0.12
279 0.12
280 0.11
281 0.11
282 0.1
283 0.1
284 0.08
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.08
290 0.09
291 0.13
292 0.13
293 0.13
294 0.13
295 0.15
296 0.16
297 0.14
298 0.13
299 0.1
300 0.12
301 0.12
302 0.11
303 0.09
304 0.08
305 0.09
306 0.09
307 0.08
308 0.05
309 0.05
310 0.06
311 0.05
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.04
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.08
332 0.11
333 0.17
334 0.21
335 0.27
336 0.27
337 0.27
338 0.28
339 0.31
340 0.33
341 0.33
342 0.34
343 0.32
344 0.4
345 0.42
346 0.43
347 0.42
348 0.43
349 0.41
350 0.4
351 0.45
352 0.46
353 0.5
354 0.48
355 0.46
356 0.41
357 0.38
358 0.35
359 0.26
360 0.16
361 0.09
362 0.08
363 0.08
364 0.05
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.05
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.07
375 0.1
376 0.1
377 0.13
378 0.14
379 0.14
380 0.16
381 0.17
382 0.2
383 0.24
384 0.28
385 0.3
386 0.3
387 0.32
388 0.3
389 0.28
390 0.29
391 0.23
392 0.2
393 0.17
394 0.16
395 0.15
396 0.16
397 0.17
398 0.13
399 0.13
400 0.13
401 0.12
402 0.1
403 0.1
404 0.09
405 0.08
406 0.09
407 0.09
408 0.06
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.06
415 0.06
416 0.07
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.08
433 0.08
434 0.09
435 0.14
436 0.15
437 0.17
438 0.25
439 0.35
440 0.39
441 0.46
442 0.54
443 0.57
444 0.65
445 0.67
446 0.63
447 0.6
448 0.55
449 0.49
450 0.44
451 0.37
452 0.27
453 0.25
454 0.19
455 0.14
456 0.17
457 0.16
458 0.21
459 0.21
460 0.2
461 0.19
462 0.19
463 0.18
464 0.15
465 0.15
466 0.09
467 0.13
468 0.17
469 0.19
470 0.2
471 0.22
472 0.25
473 0.33
474 0.37
475 0.36
476 0.38
477 0.42
478 0.42
479 0.43
480 0.42
481 0.33
482 0.29
483 0.27
484 0.24
485 0.21
486 0.23
487 0.28
488 0.29
489 0.32
490 0.32
491 0.31
492 0.31
493 0.35
494 0.36
495 0.33
496 0.31
497 0.27
498 0.27
499 0.27
500 0.29
501 0.27
502 0.28
503 0.27
504 0.35
505 0.4
506 0.48
507 0.54
508 0.6
509 0.65
510 0.7
511 0.73
512 0.7
513 0.71
514 0.67
515 0.6
516 0.52
517 0.47
518 0.38
519 0.33
520 0.27
521 0.22
522 0.19
523 0.17
524 0.16
525 0.11
526 0.11
527 0.11
528 0.11
529 0.11
530 0.1
531 0.11
532 0.1
533 0.11
534 0.1
535 0.1
536 0.1
537 0.1
538 0.1
539 0.11
540 0.12
541 0.15
542 0.17
543 0.19
544 0.26
545 0.3
546 0.35
547 0.43
548 0.52
549 0.6
550 0.65
551 0.71
552 0.74
553 0.8
554 0.85
555 0.87
556 0.86
557 0.86
558 0.88
559 0.89
560 0.89
561 0.87
562 0.87
563 0.87
564 0.88
565 0.88
566 0.89
567 0.89
568 0.9
569 0.92
570 0.92
571 0.92
572 0.93
573 0.91
574 0.88
575 0.81
576 0.73
577 0.66
578 0.59
579 0.5
580 0.41
581 0.37
582 0.32
583 0.37
584 0.44
585 0.45
586 0.5
587 0.57
588 0.62
589 0.63
590 0.7
591 0.72
592 0.74
593 0.79
594 0.8
595 0.81
596 0.81
597 0.81
598 0.8
599 0.76
600 0.72
601 0.67
602 0.59
603 0.53
604 0.52
605 0.46
606 0.37
607 0.3
608 0.24
609 0.19
610 0.16
611 0.12
612 0.08