FuNGI

A0A2S4V2H0

Protein Details

Accession

A0A2S4V2H0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
313-332	VFQQKQQPYHHRPNPPPPPP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 9.5, cyto_nucl 9, cyto 7.5, mito 6, cysk 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR005162 Retrotrans_gag_dom IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF03732 Retrotrans_gag PF17917 RT_RNaseH PF08284 RVP_2 PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd00303 retropepsin_like cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MSVNLSSQSHPNSPILAPVGDVRSPIEQKVAQLSKQLASIKLTNANKEAEVGNVAAELDKIKKIFKGLSNNEVAGLNQMIQGFHILLEGLSAQVLEIARLGSGVQHDVPEMSILFSGNPRETRQFVFQARTVLHEKSDCFRSEKSKINWIVRHFCNPGSNSGEPCPLYNWWMSLLFENARIQDLPTDSVSVEDPYVLDSLSTSKEFLSQLELTFEDKHEIQTAKQRLFSFRQGNKSIEEFNALFNSLCYSVNLTEESRCDCYERALNPKILKIAVLRGDWKITTTLRGKQALAALAAEAQDKISSIDSGSLPVFQQKQQPYHHRPNPPPPPPPARASDVPAPMDLDVLSAESSFTFTRFRALCYKKRVCQRCGGSFNDEHKANKGCPLPSEKHIDVQRKVELFRNWLAQGGQDVVDALARAAEDKRVAKTSRGSNPSGGTAEVPLDAIPPLSLGELCWQQAASKIFADNMEVDRDLCKSNESIFLPFSSPRPIVPIHLLPPNLPSISALSLFDSGASASFIDERFVSRNHLVLHRLAQPLLCRGFDGSLNRSGQITHCWQGQIIIPLPHSKTFRSSVVLYVTRLASASVILGFPWFSSNKISLSGCPSGISFPFSNQSLSVNAAEILPNFLQEFKNVFVTQSLSSLPPHRGEFDCSINLKPNSNPPFVGMYNLSASETEQLREYVDENLRKGFIRESSSPAGAPIFFVKTQNKADRPCVDYRCKFLSKVDLKAAFNLLRIAPGHEWKTAFRTPWGLYEYCVMPFGLANAPAIFQRFIQHVLREYSRSSLNKCQFFQSEVKFLGFVITRDGIRMDPSKLSTILDWPYPNSLQQLRRFLGFSNFYRRFIPKFSDLARPSNKFNQRRTLHSGESHLPRVLHVDSSGYAIAAVLSQPDSNGALHPVSYFSRKLSDRERSWPIFDLEMLAIVSAFEEWRAWLMGTEEPVKVYSDHANLRYFRSAKYSLPNRHGGLHRPEIKQSGILTKHLHGETVDDIELPAEIAESASHDLFFQRPADDLLELIRNQYSTLEDDEKEALTFRENLFWHQDRVFVPVSHRERIIQFHHDAPTTGHPGIARTLSLLTRSFSWPGIRKDVIQFVKSCDSCQRVKARRQLQEGQLNSLDIPQRPWSVIGMDFITKLPKSGGFDSIMVVMDLLSKATHFIPCKETYLAPQVAQLFRTNVFRLHGIPEKIISDRGLVFVSEFWKSFMFLLGIKKGFSTAYHPPTDGQTERMNQVLEDYLRHFCSYYQDNWDKLLDLAEFSINNLDSSSLGVSPFFFSYGFHPKFSVLNRSSSKKSLDGFIQDMQEVQERAVECLTQAQQQQARYYNAHKRPATQYNPGDLVLLLRKFIESR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.29
3	0.24
4	0.21
5	0.22
6	0.25
7	0.22
8	0.22
9	0.2
10	0.24
11	0.26
12	0.26
13	0.28
14	0.25
15	0.27
16	0.37
17	0.39
18	0.34
19	0.37
20	0.39
21	0.35
22	0.39
23	0.4
24	0.33
25	0.33
26	0.35
27	0.33
28	0.39
29	0.41
30	0.4
31	0.4
32	0.4
33	0.35
34	0.34
35	0.31
36	0.23
37	0.22
38	0.17
39	0.14
40	0.12
41	0.12
42	0.1
43	0.1
44	0.1
45	0.11
46	0.14
47	0.15
48	0.16
49	0.18
50	0.22
51	0.29
52	0.34
53	0.43
54	0.46
55	0.53
56	0.55
57	0.53
58	0.51
59	0.44
60	0.37
61	0.29
62	0.23
63	0.16
64	0.13
65	0.14
66	0.12
67	0.12
68	0.13
69	0.11
70	0.1
71	0.09
72	0.07
73	0.06
74	0.07
75	0.07
76	0.05
77	0.05
78	0.05
79	0.04
80	0.07
81	0.07
82	0.07
83	0.07
84	0.07
85	0.07
86	0.07
87	0.07
88	0.07
89	0.08
90	0.11
91	0.11
92	0.12
93	0.12
94	0.13
95	0.13
96	0.13
97	0.11
98	0.09
99	0.09
100	0.09
101	0.09
102	0.12
103	0.15
104	0.18
105	0.21
106	0.24
107	0.29
108	0.31
109	0.35
110	0.39
111	0.43
112	0.43
113	0.46
114	0.44
115	0.45
116	0.42
117	0.43
118	0.41
119	0.34
120	0.33
121	0.31
122	0.3
123	0.31
124	0.36
125	0.33
126	0.34
127	0.36
128	0.41
129	0.44
130	0.52
131	0.51
132	0.55
133	0.61
134	0.66
135	0.67
136	0.67
137	0.69
138	0.64
139	0.67
140	0.59
141	0.54
142	0.52
143	0.48
144	0.46
145	0.44
146	0.42
147	0.38
148	0.38
149	0.4
150	0.33
151	0.33
152	0.3
153	0.24
154	0.25
155	0.23
156	0.21
157	0.19
158	0.2
159	0.19
160	0.18
161	0.21
162	0.19
163	0.2
164	0.21
165	0.19
166	0.2
167	0.19
168	0.18
169	0.18
170	0.19
171	0.19
172	0.18
173	0.18
174	0.16
175	0.17
176	0.17
177	0.14
178	0.12
179	0.1
180	0.09
181	0.09
182	0.09
183	0.08
184	0.07
185	0.06
186	0.08
187	0.11
188	0.12
189	0.11
190	0.11
191	0.14
192	0.15
193	0.15
194	0.19
195	0.17
196	0.17
197	0.19
198	0.2
199	0.19
200	0.2
201	0.2
202	0.18
203	0.17
204	0.18
205	0.21
206	0.21
207	0.21
208	0.29
209	0.36
210	0.35
211	0.4
212	0.41
213	0.42
214	0.46
215	0.53
216	0.53
217	0.53
218	0.59
219	0.58
220	0.57
221	0.55
222	0.52
223	0.46
224	0.36
225	0.35
226	0.27
227	0.24
228	0.23
229	0.21
230	0.18
231	0.15
232	0.17
233	0.13
234	0.13
235	0.11
236	0.13
237	0.13
238	0.15
239	0.17
240	0.16
241	0.16
242	0.18
243	0.21
244	0.21
245	0.21
246	0.21
247	0.2
248	0.23
249	0.28
250	0.3
251	0.35
252	0.37
253	0.42
254	0.42
255	0.44
256	0.42
257	0.35
258	0.33
259	0.26
260	0.27
261	0.26
262	0.26
263	0.26
264	0.25
265	0.26
266	0.25
267	0.24
268	0.22
269	0.18
270	0.23
271	0.25
272	0.3
273	0.34
274	0.37
275	0.36
276	0.35
277	0.37
278	0.32
279	0.28
280	0.22
281	0.16
282	0.14
283	0.14
284	0.12
285	0.08
286	0.07
287	0.06
288	0.06
289	0.07
290	0.07
291	0.07
292	0.07
293	0.1
294	0.1
295	0.12
296	0.12
297	0.12
298	0.11
299	0.16
300	0.18
301	0.17
302	0.25
303	0.28
304	0.35
305	0.42
306	0.53
307	0.57
308	0.66
309	0.71
310	0.73
311	0.75
312	0.8
313	0.82
314	0.79
315	0.76
316	0.72
317	0.72
318	0.67
319	0.63
320	0.57
321	0.52
322	0.47
323	0.46
324	0.45
325	0.41
326	0.38
327	0.34
328	0.31
329	0.24
330	0.22
331	0.17
332	0.11
333	0.07
334	0.06
335	0.06
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.07
340	0.07
341	0.08
342	0.09
343	0.09
344	0.15
345	0.16
346	0.19
347	0.27
348	0.35
349	0.42
350	0.5
351	0.59
352	0.59
353	0.68
354	0.74
355	0.68
356	0.7
357	0.7
358	0.69
359	0.66
360	0.64
361	0.59
362	0.56
363	0.56
364	0.53
365	0.47
366	0.38
367	0.37
368	0.37
369	0.32
370	0.33
371	0.33
372	0.27
373	0.29
374	0.35
375	0.35
376	0.35
377	0.43
378	0.37
379	0.4
380	0.45
381	0.49
382	0.46
383	0.46
384	0.47
385	0.41
386	0.42
387	0.41
388	0.37
389	0.34
390	0.33
391	0.33
392	0.28
393	0.28
394	0.26
395	0.2
396	0.19
397	0.16
398	0.13
399	0.09
400	0.09
401	0.07
402	0.07
403	0.07
404	0.05
405	0.04
406	0.04
407	0.05
408	0.06
409	0.07
410	0.1
411	0.12
412	0.15
413	0.2
414	0.21
415	0.23
416	0.29
417	0.36
418	0.42
419	0.45
420	0.44
421	0.42
422	0.42
423	0.41
424	0.35
425	0.28
426	0.19
427	0.15
428	0.13
429	0.1
430	0.09
431	0.07
432	0.06
433	0.06
434	0.05
435	0.05
436	0.04
437	0.04
438	0.05
439	0.05
440	0.04
441	0.08
442	0.09
443	0.09
444	0.09
445	0.09
446	0.09
447	0.14
448	0.16
449	0.14
450	0.13
451	0.14
452	0.14
453	0.14
454	0.15
455	0.12
456	0.12
457	0.12
458	0.11
459	0.11
460	0.11
461	0.13
462	0.12
463	0.11
464	0.11
465	0.1
466	0.11
467	0.17
468	0.17
469	0.17
470	0.17
471	0.18
472	0.18
473	0.18
474	0.18
475	0.17
476	0.16
477	0.15
478	0.17
479	0.16
480	0.17
481	0.2
482	0.21
483	0.2
484	0.23
485	0.23
486	0.2
487	0.21
488	0.21
489	0.17
490	0.14
491	0.12
492	0.1
493	0.11
494	0.11
495	0.1
496	0.09
497	0.1
498	0.09
499	0.09
500	0.07
501	0.06
502	0.05
503	0.05
504	0.04
505	0.04
506	0.05
507	0.06
508	0.06
509	0.06
510	0.08
511	0.09
512	0.1
513	0.14
514	0.13
515	0.16
516	0.18
517	0.2
518	0.21
519	0.2
520	0.23
521	0.24
522	0.25
523	0.22
524	0.21
525	0.19
526	0.22
527	0.22
528	0.19
529	0.13
530	0.13
531	0.14
532	0.15
533	0.17
534	0.15
535	0.19
536	0.2
537	0.2
538	0.19
539	0.19
540	0.17
541	0.18
542	0.19
543	0.16
544	0.17
545	0.17
546	0.16
547	0.17
548	0.18
549	0.17
550	0.16
551	0.15
552	0.14
553	0.17
554	0.19
555	0.21
556	0.21
557	0.18
558	0.2
559	0.21
560	0.22
561	0.22
562	0.22
563	0.2
564	0.24
565	0.25
566	0.21
567	0.2
568	0.19
569	0.15
570	0.15
571	0.12
572	0.07
573	0.06
574	0.06
575	0.04
576	0.04
577	0.04
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.08
585	0.1
586	0.1
587	0.13
588	0.13
589	0.13
590	0.17
591	0.17
592	0.16
593	0.15
594	0.14
595	0.13
596	0.13
597	0.15
598	0.1
599	0.1
600	0.12
601	0.12
602	0.12
603	0.12
604	0.12
605	0.1
606	0.12
607	0.11
608	0.09
609	0.09
610	0.08
611	0.08
612	0.07
613	0.09
614	0.07
615	0.07
616	0.06
617	0.08
618	0.08
619	0.08
620	0.1
621	0.09
622	0.12
623	0.12
624	0.12
625	0.11
626	0.13
627	0.12
628	0.12
629	0.12
630	0.1
631	0.11
632	0.13
633	0.14
634	0.14
635	0.14
636	0.16
637	0.16
638	0.19
639	0.2
640	0.21
641	0.22
642	0.21
643	0.21
644	0.25
645	0.24
646	0.22
647	0.2
648	0.26
649	0.28
650	0.28
651	0.27
652	0.23
653	0.26
654	0.25
655	0.25
656	0.17
657	0.14
658	0.13
659	0.13
660	0.11
661	0.08
662	0.08
663	0.09
664	0.09
665	0.08
666	0.08
667	0.08
668	0.09
669	0.09
670	0.1
671	0.11
672	0.15
673	0.17
674	0.17
675	0.17
676	0.18
677	0.17
678	0.17
679	0.14
680	0.13
681	0.16
682	0.17
683	0.22
684	0.23
685	0.23
686	0.22
687	0.21
688	0.18
689	0.13
690	0.12
691	0.08
692	0.08
693	0.08
694	0.11
695	0.12
696	0.16
697	0.21
698	0.27
699	0.3
700	0.31
701	0.36
702	0.37
703	0.4
704	0.42
705	0.43
706	0.45
707	0.43
708	0.45
709	0.46
710	0.43
711	0.39
712	0.34
713	0.38
714	0.34
715	0.36
716	0.37
717	0.36
718	0.34
719	0.35
720	0.36
721	0.26
722	0.23
723	0.2
724	0.15
725	0.11
726	0.11
727	0.13
728	0.11
729	0.14
730	0.16
731	0.16
732	0.17
733	0.16
734	0.22
735	0.22
736	0.21
737	0.19
738	0.21
739	0.2
740	0.23
741	0.25
742	0.2
743	0.19
744	0.2
745	0.2
746	0.16
747	0.15
748	0.11
749	0.08
750	0.08
751	0.09
752	0.08
753	0.07
754	0.07
755	0.06
756	0.07
757	0.07
758	0.09
759	0.08
760	0.07
761	0.08
762	0.09
763	0.13
764	0.14
765	0.15
766	0.17
767	0.19
768	0.21
769	0.21
770	0.2
771	0.19
772	0.22
773	0.23
774	0.25
775	0.31
776	0.36
777	0.39
778	0.39
779	0.41
780	0.36
781	0.38
782	0.39
783	0.33
784	0.3
785	0.27
786	0.26
787	0.22
788	0.21
789	0.2
790	0.15
791	0.12
792	0.11
793	0.11
794	0.11
795	0.11
796	0.12
797	0.1
798	0.12
799	0.14
800	0.13
801	0.13
802	0.15
803	0.16
804	0.16
805	0.16
806	0.14
807	0.15
808	0.15
809	0.16
810	0.15
811	0.14
812	0.16
813	0.16
814	0.16
815	0.17
816	0.21
817	0.25
818	0.3
819	0.35
820	0.33
821	0.34
822	0.34
823	0.32
824	0.32
825	0.31
826	0.28
827	0.32
828	0.33
829	0.33
830	0.35
831	0.37
832	0.33
833	0.31
834	0.33
835	0.27
836	0.3
837	0.31
838	0.38
839	0.38
840	0.43
841	0.47
842	0.44
843	0.44
844	0.49
845	0.56
846	0.54
847	0.56
848	0.59
849	0.55
850	0.6
851	0.64
852	0.6
853	0.54
854	0.49
855	0.48
856	0.44
857	0.45
858	0.41
859	0.34
860	0.28
861	0.25
862	0.26
863	0.22
864	0.17
865	0.13
866	0.12
867	0.1
868	0.12
869	0.12
870	0.08
871	0.08
872	0.07
873	0.06
874	0.05
875	0.05
876	0.04
877	0.04
878	0.04
879	0.04
880	0.05
881	0.06
882	0.06
883	0.07
884	0.08
885	0.08
886	0.08
887	0.08
888	0.1
889	0.1
890	0.13
891	0.13
892	0.13
893	0.19
894	0.2
895	0.24
896	0.31
897	0.38
898	0.39
899	0.46
900	0.52
901	0.48
902	0.49
903	0.48
904	0.41
905	0.33
906	0.29
907	0.24
908	0.16
909	0.14
910	0.11
911	0.08
912	0.06
913	0.05
914	0.06
915	0.04
916	0.04
917	0.03
918	0.03
919	0.04
920	0.05
921	0.06
922	0.05
923	0.06
924	0.08
925	0.09
926	0.11
927	0.14
928	0.13
929	0.13
930	0.13
931	0.14
932	0.12
933	0.13
934	0.15
935	0.17
936	0.21
937	0.24
938	0.28
939	0.28
940	0.31
941	0.36
942	0.33
943	0.29
944	0.32
945	0.31
946	0.3
947	0.38
948	0.44
949	0.45
950	0.49
951	0.54
952	0.49
953	0.52
954	0.52
955	0.49
956	0.47
957	0.49
958	0.51
959	0.47
960	0.48
961	0.45
962	0.43
963	0.39
964	0.33
965	0.32
966	0.26
967	0.28
968	0.28
969	0.27
970	0.32
971	0.29
972	0.28
973	0.2
974	0.2
975	0.18
976	0.18
977	0.17
978	0.11
979	0.11
980	0.1
981	0.1
982	0.07
983	0.06
984	0.03
985	0.03
986	0.03
987	0.03
988	0.05
989	0.07
990	0.07
991	0.07
992	0.07
993	0.08
994	0.09
995	0.11
996	0.11
997	0.1
998	0.1
999	0.12
1000	0.13
1001	0.12
1002	0.12
1003	0.12
1004	0.14
1005	0.14
1006	0.14
1007	0.13
1008	0.12
1009	0.12
1010	0.13
1011	0.12
1012	0.11
1013	0.15
1014	0.17
1015	0.17
1016	0.19
1017	0.2
1018	0.19
1019	0.18
1020	0.16
1021	0.13
1022	0.11
1023	0.14
1024	0.13
1025	0.18
1026	0.18
1027	0.2
1028	0.28
1029	0.29
1030	0.31
1031	0.28
1032	0.32
1033	0.26
1034	0.3
1035	0.31
1036	0.24
1037	0.25
1038	0.31
1039	0.36
1040	0.34
1041	0.34
1042	0.32
1043	0.31
1044	0.36
1045	0.38
1046	0.34
1047	0.32
1048	0.34
1049	0.36
1050	0.34
1051	0.33
1052	0.3
1053	0.3
1054	0.29
1055	0.26
1056	0.23
1057	0.2
1058	0.21
1059	0.22
1060	0.2
1061	0.15
1062	0.11
1063	0.13
1064	0.13
1065	0.15
1066	0.15
1067	0.14
1068	0.16
1069	0.18
1070	0.19
1071	0.19
1072	0.25
1073	0.3
1074	0.33
1075	0.39
1076	0.38
1077	0.38
1078	0.41
1079	0.48
1080	0.45
1081	0.41
1082	0.38
1083	0.35
1084	0.43
1085	0.4
1086	0.38
1087	0.36
1088	0.36
1089	0.36
1090	0.42
1091	0.48
1092	0.48
1093	0.56
1094	0.64
1095	0.67
1096	0.71
1097	0.76
1098	0.76
1099	0.74
1100	0.75
1101	0.68
1102	0.63
1103	0.54
1104	0.46
1105	0.39
1106	0.35
1107	0.29
1108	0.21
1109	0.22
1110	0.21
1111	0.22
1112	0.22
1113	0.23
1114	0.2
1115	0.19
1116	0.19
1117	0.18
1118	0.17
1119	0.16
1120	0.16
1121	0.16
1122	0.18
1123	0.16
1124	0.16
1125	0.15
1126	0.16
1127	0.2
1128	0.22
1129	0.25
1130	0.23
1131	0.24
1132	0.24
1133	0.24
1134	0.21
1135	0.16
1136	0.13
1137	0.09
1138	0.08
1139	0.08
1140	0.07
1141	0.06
1142	0.05
1143	0.07
1144	0.09
1145	0.14
1146	0.15
1147	0.19
1148	0.24
1149	0.27
1150	0.3
1151	0.31
1152	0.31
1153	0.3
1154	0.36
1155	0.35
1156	0.3
1157	0.31
1158	0.32
1159	0.31
1160	0.32
1161	0.29
1162	0.23
1163	0.23
1164	0.28
1165	0.25
1166	0.23
1167	0.23
1168	0.23
1169	0.23
1170	0.27
1171	0.32
1172	0.29
1173	0.29
1174	0.29
1175	0.29
1176	0.29
1177	0.29
1178	0.24
1179	0.19
1180	0.18
1181	0.18
1182	0.16
1183	0.14
1184	0.13
1185	0.14
1186	0.15
1187	0.15
1188	0.14
1189	0.14
1190	0.14
1191	0.15
1192	0.15
1193	0.15
1194	0.14
1195	0.15
1196	0.21
1197	0.25
1198	0.26
1199	0.25
1200	0.25
1201	0.23
1202	0.23
1203	0.21
1204	0.22
1205	0.25
1206	0.3
1207	0.33
1208	0.34
1209	0.34
1210	0.37
1211	0.42
1212	0.37
1213	0.31
1214	0.31
1215	0.32
1216	0.33
1217	0.35
1218	0.32
1219	0.25
1220	0.25
1221	0.26
1222	0.21
1223	0.2
1224	0.21
1225	0.23
1226	0.24
1227	0.25
1228	0.23
1229	0.19
1230	0.25
1231	0.28
1232	0.29
1233	0.35
1234	0.39
1235	0.4
1236	0.42
1237	0.42
1238	0.36
1239	0.31
1240	0.29
1241	0.2
1242	0.15
1243	0.15
1244	0.15
1245	0.14
1246	0.13
1247	0.17
1248	0.14
1249	0.14
1250	0.13
1251	0.12
1252	0.1
1253	0.12
1254	0.13
1255	0.1
1256	0.1
1257	0.1
1258	0.11
1259	0.12
1260	0.13
1261	0.12
1262	0.1
1263	0.11
1264	0.17
1265	0.27
1266	0.28
1267	0.27
1268	0.28
1269	0.29
1270	0.34
1271	0.38
1272	0.42
1273	0.34
1274	0.41
1275	0.46
1276	0.52
1277	0.55
1278	0.55
1279	0.55
1280	0.5
1281	0.49
1282	0.46
1283	0.45
1284	0.44
1285	0.42
1286	0.41
1287	0.39
1288	0.34
1289	0.32
1290	0.29
1291	0.28
1292	0.23
1293	0.19
1294	0.19
1295	0.17
1296	0.19
1297	0.19
1298	0.17
1299	0.13
1300	0.19
1301	0.21
1302	0.23
1303	0.24
1304	0.3
1305	0.33
1306	0.37
1307	0.43
1308	0.42
1309	0.45
1310	0.44
1311	0.51
1312	0.54
1313	0.58
1314	0.64
1315	0.6
1316	0.61
1317	0.65
1318	0.71
1319	0.69
1320	0.68
1321	0.66
1322	0.63
1323	0.64
1324	0.57
1325	0.49
1326	0.39
1327	0.36
1328	0.33
1329	0.28
1330	0.21
1331	0.19

A0A2S4V2H0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer