FuNGI

A0A2S4W7Y8

Protein Details

Accession

A0A2S4W7Y8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
17-36	FTFTRFRALCYKKRVCQRCG	Hydrophilic
1217-1236	LDARRRAKGKCDYLLRWKNT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 12.5, cyto 7, mito 1, plas 1, pero 1, cysk 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH PF00665 rve PF08284 RVP_2 PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50013 CHROMO_2 PS50994 INTEGRASE PS50878 RT_POL
CDD	cd00303 retropepsin_like cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MGPAPMDLDVLSAESSFTFTRFRALCYKKRVCQRCGGSFNDEHKANKGCPLPSEKHINVQRKVELFRNWLAQGGQDVVDALARAAEDERVAKTSRGSNPSGGTAEVPLDAIPPLSLGELCWQQAASEIFADNMEVDRDLCKSNESIFLPFSSPRPIVPIHLLPPNLPSISALSLFDSGASASFIDERFVSRNHLVLHRLAQPLLCRGFDGSLNRSGQITHCWQGQIIIPLPHSKTFRSSVVLYVTRLASASVILGFPWFSSNKISLSGCPSGISFPFSNQSLSVSAAEILPDFLQEFKNVFVTQSLSSLPPHRGEFDCSINLKPNSNPPFVGMYNLSASETEQLREYVDENLRKGFIRESSSPAGAPIFFVKTQNKADRPCVDYRLLNSMTVRDSYPLPLISRLLNNLSGCKFLSKVDLKAAFNLLRIAPGHEWKTAFRTPWGLYEYCVMPFGLANAPAIFQRFIQHVLREYLDVCCFVYIDDILIFSRTEEQHKEDLRKVLSKLQDYSLKASLNKCQFFQSEVKFLGFVITRDGIRMDPSKLSTILDWPYPNSLQQLRRFLGFSNFYRRFIPKFSDLARPLTNLTKEGLCTQENLSKDFPRISFSALKKCFAKAPLLHHFDFSLPRVLHVDSSGYAIAAVLSQPDSNGALHPVSYFSRKLSDRERSWPIFDLEMLAIVSAFEEWRAWLMGTEEPVKVYSDHANLRYFRSAKYLTPKQARWASFLDGFNFVIYHIPGKVNPADGPSRRPDFLSDRPEIKQSGILTKHLHGETVDDIELPAEIAESASHDLFFQRPADDLLELIRNQYSTLEDDEKEALTFRENLFWHQDRVFVPVSHRERIIQFHHDAPTTGHPGIARTLSLLTRSFSWPGIRKDVIQFVKSCDSCQRVKARRQLQEGQLNSLDIPQRPWSVIGMDFITKLPKSGGFDSIMVVIDLLSKATHFIPCKETYSAPQVAQLFRTNVFRLHGIPEKIISDRGLVFVSEFWKSFMFSLGIKKGFSTAYHPQTDGQTERMNQVLEDYLRHFCSYYQDNWDKLLDLAEFSINNLDSSSLGVSPFFFSYGFHPKFSVLNRSSSKKSLDGFIQDMQEVQERAVECLTQAQQRQARYYNAHKRPATQYNPGDQVLLLRKFIESRRINSKLDYRFIGPFKVIEMVGNNAVRLDISRDYPKLHPVFNVSLVVKYISPSEVAGRGTEVGLKDSYYRTARVVDWSKLGQVLDARRRAKGKCDYLLRWKNTNPGEDTWVLDQHIPNFLLGKMEKFRDHLEESHKRSPKTRNR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.07
2	0.1
3	0.09
4	0.11
5	0.12
6	0.12
7	0.2
8	0.21
9	0.25
10	0.33
11	0.41
12	0.49
13	0.57
14	0.67
15	0.67
16	0.77
17	0.82
18	0.77
19	0.78
20	0.79
21	0.78
22	0.75
23	0.72
24	0.69
25	0.67
26	0.66
27	0.64
28	0.58
29	0.49
30	0.49
31	0.49
32	0.43
33	0.43
34	0.43
35	0.38
36	0.41
37	0.47
38	0.46
39	0.47
40	0.55
41	0.5
42	0.54
43	0.61
44	0.64
45	0.62
46	0.63
47	0.64
48	0.59
49	0.62
50	0.59
51	0.56
52	0.53
53	0.51
54	0.5
55	0.44
56	0.41
57	0.38
58	0.32
59	0.27
60	0.24
61	0.2
62	0.14
63	0.14
64	0.11
65	0.12
66	0.1
67	0.08
68	0.07
69	0.06
70	0.07
71	0.07
72	0.08
73	0.09
74	0.11
75	0.13
76	0.15
77	0.18
78	0.18
79	0.21
80	0.28
81	0.35
82	0.39
83	0.4
84	0.41
85	0.42
86	0.45
87	0.42
88	0.35
89	0.27
90	0.23
91	0.2
92	0.16
93	0.14
94	0.1
95	0.09
96	0.09
97	0.08
98	0.07
99	0.06
100	0.06
101	0.07
102	0.07
103	0.07
104	0.11
105	0.14
106	0.14
107	0.15
108	0.14
109	0.13
110	0.18
111	0.19
112	0.15
113	0.14
114	0.14
115	0.14
116	0.14
117	0.14
118	0.1
119	0.09
120	0.09
121	0.08
122	0.08
123	0.09
124	0.11
125	0.13
126	0.13
127	0.14
128	0.15
129	0.17
130	0.23
131	0.24
132	0.24
133	0.24
134	0.25
135	0.26
136	0.26
137	0.25
138	0.25
139	0.23
140	0.21
141	0.24
142	0.23
143	0.24
144	0.29
145	0.31
146	0.29
147	0.33
148	0.34
149	0.3
150	0.31
151	0.31
152	0.25
153	0.21
154	0.18
155	0.15
156	0.17
157	0.17
158	0.15
159	0.14
160	0.14
161	0.14
162	0.13
163	0.11
164	0.09
165	0.08
166	0.08
167	0.06
168	0.06
169	0.08
170	0.08
171	0.09
172	0.09
173	0.11
174	0.14
175	0.15
176	0.2
177	0.19
178	0.23
179	0.25
180	0.29
181	0.29
182	0.29
183	0.33
184	0.33
185	0.34
186	0.31
187	0.29
188	0.28
189	0.31
190	0.31
191	0.26
192	0.21
193	0.2
194	0.21
195	0.23
196	0.26
197	0.23
198	0.27
199	0.28
200	0.28
201	0.27
202	0.26
203	0.24
204	0.25
205	0.27
206	0.23
207	0.24
208	0.24
209	0.24
210	0.25
211	0.26
212	0.26
213	0.24
214	0.23
215	0.22
216	0.26
217	0.29
218	0.32
219	0.31
220	0.27
221	0.29
222	0.3
223	0.31
224	0.31
225	0.3
226	0.28
227	0.33
228	0.34
229	0.3
230	0.29
231	0.27
232	0.22
233	0.21
234	0.18
235	0.11
236	0.09
237	0.09
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.06
244	0.09
245	0.09
246	0.09
247	0.12
248	0.14
249	0.15
250	0.18
251	0.19
252	0.19
253	0.24
254	0.25
255	0.22
256	0.21
257	0.21
258	0.19
259	0.19
260	0.21
261	0.15
262	0.15
263	0.18
264	0.18
265	0.19
266	0.17
267	0.18
268	0.15
269	0.17
270	0.15
271	0.12
272	0.12
273	0.11
274	0.11
275	0.09
276	0.09
277	0.07
278	0.06
279	0.06
280	0.07
281	0.08
282	0.09
283	0.09
284	0.09
285	0.12
286	0.12
287	0.12
288	0.12
289	0.14
290	0.14
291	0.14
292	0.15
293	0.13
294	0.15
295	0.18
296	0.19
297	0.2
298	0.21
299	0.23
300	0.23
301	0.27
302	0.29
303	0.3
304	0.31
305	0.3
306	0.31
307	0.35
308	0.34
309	0.32
310	0.3
311	0.35
312	0.37
313	0.37
314	0.35
315	0.3
316	0.34
317	0.31
318	0.32
319	0.24
320	0.2
321	0.19
322	0.19
323	0.17
324	0.12
325	0.12
326	0.13
327	0.13
328	0.12
329	0.12
330	0.12
331	0.12
332	0.13
333	0.13
334	0.16
335	0.21
336	0.23
337	0.24
338	0.25
339	0.25
340	0.25
341	0.25
342	0.21
343	0.2
344	0.22
345	0.24
346	0.28
347	0.3
348	0.31
349	0.29
350	0.27
351	0.24
352	0.18
353	0.16
354	0.12
355	0.12
356	0.12
357	0.16
358	0.17
359	0.22
360	0.29
361	0.36
362	0.39
363	0.4
364	0.46
365	0.48
366	0.51
367	0.49
368	0.47
369	0.42
370	0.39
371	0.37
372	0.38
373	0.33
374	0.3
375	0.26
376	0.24
377	0.22
378	0.21
379	0.19
380	0.13
381	0.13
382	0.14
383	0.16
384	0.15
385	0.15
386	0.15
387	0.15
388	0.16
389	0.16
390	0.16
391	0.16
392	0.18
393	0.17
394	0.19
395	0.19
396	0.18
397	0.17
398	0.16
399	0.15
400	0.13
401	0.2
402	0.2
403	0.21
404	0.26
405	0.31
406	0.31
407	0.31
408	0.34
409	0.27
410	0.25
411	0.25
412	0.18
413	0.15
414	0.14
415	0.16
416	0.14
417	0.18
418	0.19
419	0.2
420	0.21
421	0.2
422	0.26
423	0.26
424	0.25
425	0.22
426	0.24
427	0.23
428	0.26
429	0.29
430	0.23
431	0.21
432	0.23
433	0.22
434	0.18
435	0.18
436	0.13
437	0.09
438	0.09
439	0.1
440	0.09
441	0.08
442	0.08
443	0.07
444	0.08
445	0.08
446	0.1
447	0.09
448	0.08
449	0.09
450	0.1
451	0.14
452	0.15
453	0.17
454	0.18
455	0.19
456	0.2
457	0.18
458	0.18
459	0.16
460	0.15
461	0.14
462	0.11
463	0.09
464	0.08
465	0.08
466	0.08
467	0.06
468	0.06
469	0.05
470	0.05
471	0.05
472	0.06
473	0.06
474	0.05
475	0.1
476	0.1
477	0.13
478	0.15
479	0.19
480	0.25
481	0.29
482	0.33
483	0.32
484	0.36
485	0.35
486	0.37
487	0.35
488	0.34
489	0.35
490	0.34
491	0.32
492	0.31
493	0.35
494	0.32
495	0.34
496	0.31
497	0.28
498	0.28
499	0.28
500	0.31
501	0.32
502	0.32
503	0.29
504	0.28
505	0.27
506	0.29
507	0.33
508	0.29
509	0.26
510	0.25
511	0.25
512	0.22
513	0.21
514	0.2
515	0.15
516	0.12
517	0.11
518	0.11
519	0.11
520	0.11
521	0.12
522	0.09
523	0.12
524	0.13
525	0.12
526	0.13
527	0.14
528	0.15
529	0.15
530	0.15
531	0.13
532	0.14
533	0.14
534	0.15
535	0.14
536	0.13
537	0.15
538	0.15
539	0.15
540	0.15
541	0.2
542	0.23
543	0.28
544	0.33
545	0.31
546	0.32
547	0.32
548	0.3
549	0.3
550	0.28
551	0.26
552	0.3
553	0.31
554	0.31
555	0.33
556	0.34
557	0.31
558	0.29
559	0.31
560	0.24
561	0.27
562	0.28
563	0.34
564	0.33
565	0.35
566	0.33
567	0.3
568	0.28
569	0.28
570	0.25
571	0.18
572	0.17
573	0.14
574	0.14
575	0.14
576	0.15
577	0.12
578	0.13
579	0.14
580	0.16
581	0.16
582	0.19
583	0.19
584	0.18
585	0.19
586	0.19
587	0.18
588	0.17
589	0.17
590	0.18
591	0.23
592	0.24
593	0.33
594	0.32
595	0.34
596	0.32
597	0.32
598	0.32
599	0.26
600	0.29
601	0.22
602	0.28
603	0.35
604	0.39
605	0.38
606	0.36
607	0.35
608	0.3
609	0.29
610	0.23
611	0.2
612	0.14
613	0.15
614	0.16
615	0.16
616	0.15
617	0.13
618	0.13
619	0.07
620	0.09
621	0.08
622	0.06
623	0.06
624	0.06
625	0.05
626	0.04
627	0.04
628	0.03
629	0.03
630	0.03
631	0.03
632	0.04
633	0.05
634	0.05
635	0.05
636	0.06
637	0.06
638	0.06
639	0.06
640	0.07
641	0.08
642	0.1
643	0.1
644	0.1
645	0.15
646	0.16
647	0.2
648	0.25
649	0.33
650	0.33
651	0.39
652	0.45
653	0.41
654	0.42
655	0.41
656	0.35
657	0.27
658	0.24
659	0.19
660	0.12
661	0.11
662	0.09
663	0.06
664	0.05
665	0.04
666	0.04
667	0.03
668	0.03
669	0.02
670	0.03
671	0.03
672	0.04
673	0.04
674	0.04
675	0.04
676	0.06
677	0.07
678	0.09
679	0.11
680	0.1
681	0.1
682	0.11
683	0.11
684	0.1
685	0.11
686	0.12
687	0.14
688	0.17
689	0.19
690	0.22
691	0.22
692	0.24
693	0.28
694	0.26
695	0.23
696	0.26
697	0.25
698	0.24
699	0.32
700	0.36
701	0.39
702	0.45
703	0.45
704	0.47
705	0.52
706	0.5
707	0.44
708	0.4
709	0.36
710	0.34
711	0.34
712	0.29
713	0.23
714	0.22
715	0.18
716	0.16
717	0.13
718	0.09
719	0.08
720	0.07
721	0.07
722	0.07
723	0.07
724	0.1
725	0.11
726	0.11
727	0.11
728	0.13
729	0.18
730	0.19
731	0.22
732	0.25
733	0.27
734	0.26
735	0.26
736	0.27
737	0.28
738	0.34
739	0.37
740	0.35
741	0.36
742	0.36
743	0.38
744	0.35
745	0.29
746	0.25
747	0.19
748	0.23
749	0.21
750	0.23
751	0.23
752	0.23
753	0.28
754	0.24
755	0.24
756	0.17
757	0.17
758	0.15
759	0.15
760	0.14
761	0.09
762	0.08
763	0.08
764	0.08
765	0.06
766	0.05
767	0.03
768	0.03
769	0.03
770	0.03
771	0.04
772	0.05
773	0.05
774	0.06
775	0.06
776	0.07
777	0.07
778	0.09
779	0.09
780	0.08
781	0.08
782	0.1
783	0.11
784	0.1
785	0.1
786	0.1
787	0.12
788	0.11
789	0.11
790	0.1
791	0.09
792	0.1
793	0.1
794	0.1
795	0.09
796	0.12
797	0.14
798	0.14
799	0.15
800	0.16
801	0.16
802	0.15
803	0.13
804	0.1
805	0.09
806	0.11
807	0.1
808	0.15
809	0.15
810	0.17
811	0.24
812	0.25
813	0.26
814	0.24
815	0.28
816	0.23
817	0.27
818	0.27
819	0.2
820	0.21
821	0.28
822	0.32
823	0.3
824	0.3
825	0.28
826	0.27
827	0.31
828	0.33
829	0.29
830	0.27
831	0.29
832	0.31
833	0.29
834	0.28
835	0.26
836	0.25
837	0.24
838	0.22
839	0.19
840	0.17
841	0.17
842	0.18
843	0.17
844	0.12
845	0.09
846	0.1
847	0.1
848	0.12
849	0.12
850	0.11
851	0.13
852	0.15
853	0.16
854	0.16
855	0.21
856	0.25
857	0.28
858	0.34
859	0.32
860	0.32
861	0.34
862	0.41
863	0.39
864	0.35
865	0.32
866	0.3
867	0.36
868	0.34
869	0.33
870	0.3
871	0.31
872	0.31
873	0.36
874	0.43
875	0.44
876	0.51
877	0.59
878	0.63
879	0.66
880	0.71
881	0.72
882	0.7
883	0.7
884	0.63
885	0.58
886	0.49
887	0.42
888	0.34
889	0.3
890	0.25
891	0.17
892	0.18
893	0.17
894	0.18
895	0.18
896	0.19
897	0.16
898	0.15
899	0.16
900	0.15
901	0.13
902	0.13
903	0.13
904	0.13
905	0.15
906	0.13
907	0.12
908	0.12
909	0.13
910	0.16
911	0.18
912	0.2
913	0.19
914	0.2
915	0.2
916	0.2
917	0.18
918	0.13
919	0.11
920	0.08
921	0.07
922	0.06
923	0.06
924	0.05
925	0.04
926	0.06
927	0.07
928	0.12
929	0.13
930	0.16
931	0.21
932	0.23
933	0.27
934	0.28
935	0.28
936	0.28
937	0.33
938	0.34
939	0.29
940	0.3
941	0.3
942	0.28
943	0.3
944	0.29
945	0.24
946	0.23
947	0.26
948	0.23
949	0.22
950	0.22
951	0.21
952	0.19
953	0.22
954	0.27
955	0.25
956	0.25
957	0.24
958	0.24
959	0.24
960	0.24
961	0.2
962	0.15
963	0.14
964	0.15
965	0.14
966	0.12
967	0.11
968	0.11
969	0.13
970	0.12
971	0.12
972	0.12
973	0.12
974	0.13
975	0.13
976	0.13
977	0.13
978	0.13
979	0.19
980	0.24
981	0.25
982	0.24
983	0.24
984	0.24
985	0.23
986	0.23
987	0.23
988	0.26
989	0.31
990	0.33
991	0.34
992	0.34
993	0.35
994	0.39
995	0.34
996	0.28
997	0.26
998	0.25
999	0.26
1000	0.27
1001	0.24
1002	0.2
1003	0.19
1004	0.19
1005	0.16
1006	0.16
1007	0.18
1008	0.19
1009	0.2
1010	0.2
1011	0.19
1012	0.16
1013	0.22
1014	0.24
1015	0.25
1016	0.32
1017	0.35
1018	0.36
1019	0.37
1020	0.37
1021	0.32
1022	0.28
1023	0.26
1024	0.17
1025	0.12
1026	0.13
1027	0.12
1028	0.11
1029	0.11
1030	0.13
1031	0.11
1032	0.11
1033	0.1
1034	0.1
1035	0.08
1036	0.1
1037	0.1
1038	0.08
1039	0.08
1040	0.08
1041	0.09
1042	0.1
1043	0.11
1044	0.1
1045	0.09
1046	0.09
1047	0.15
1048	0.25
1049	0.26
1050	0.25
1051	0.26
1052	0.26
1053	0.31
1054	0.34
1055	0.39
1056	0.3
1057	0.37
1058	0.42
1059	0.47
1060	0.5
1061	0.5
1062	0.5
1063	0.44
1064	0.44
1065	0.4
1066	0.38
1067	0.37
1068	0.36
1069	0.35
1070	0.33
1071	0.28
1072	0.27
1073	0.24
1074	0.24
1075	0.19
1076	0.16
1077	0.16
1078	0.15
1079	0.16
1080	0.16
1081	0.14
1082	0.11
1083	0.16
1084	0.2
1085	0.22
1086	0.23
1087	0.3
1088	0.34
1089	0.37
1090	0.42
1091	0.41
1092	0.44
1093	0.45
1094	0.53
1095	0.56
1096	0.61
1097	0.67
1098	0.63
1099	0.64
1100	0.67
1101	0.71
1102	0.66
1103	0.65
1104	0.62
1105	0.6
1106	0.63
1107	0.57
1108	0.49
1109	0.39
1110	0.39
1111	0.37
1112	0.34
1113	0.27
1114	0.23
1115	0.23
1116	0.27
1117	0.3
1118	0.34
1119	0.31
1120	0.35
1121	0.45
1122	0.49
1123	0.5
1124	0.52
1125	0.58
1126	0.55
1127	0.54
1128	0.52
1129	0.45
1130	0.46
1131	0.47
1132	0.44
1133	0.36
1134	0.29
1135	0.26
1136	0.26
1137	0.22
1138	0.17
1139	0.17
1140	0.18
1141	0.22
1142	0.22
1143	0.2
1144	0.17
1145	0.17
1146	0.16
1147	0.14
1148	0.15
1149	0.13
1150	0.17
1151	0.23
1152	0.25
1153	0.29
1154	0.32
1155	0.4
1156	0.39
1157	0.39
1158	0.37
1159	0.37
1160	0.39
1161	0.38
1162	0.41
1163	0.33
1164	0.3
1165	0.29
1166	0.28
1167	0.22
1168	0.19
1169	0.18
1170	0.13
1171	0.13
1172	0.13
1173	0.15
1174	0.17
1175	0.17
1176	0.17
1177	0.17
1178	0.17
1179	0.16
1180	0.19
1181	0.16
1182	0.15
1183	0.15
1184	0.15
1185	0.16
1186	0.17
1187	0.24
1188	0.23
1189	0.24
1190	0.24
1191	0.27
1192	0.27
1193	0.35
1194	0.39
1195	0.36
1196	0.37
1197	0.37
1198	0.37
1199	0.36
1200	0.34
1201	0.27
1202	0.27
1203	0.33
1204	0.37
1205	0.44
1206	0.45
1207	0.48
1208	0.54
1209	0.54
1210	0.58
1211	0.59
1212	0.58
1213	0.59
1214	0.66
1215	0.67
1216	0.73
1217	0.8
1218	0.77
1219	0.74
1220	0.69
1221	0.69
1222	0.65
1223	0.64
1224	0.58
1225	0.51
1226	0.51
1227	0.45
1228	0.45
1229	0.39
1230	0.36
1231	0.31
1232	0.3
1233	0.28
1234	0.24
1235	0.29
1236	0.26
1237	0.23
1238	0.23
1239	0.22
1240	0.24
1241	0.23
1242	0.27
1243	0.27
1244	0.31
1245	0.33
1246	0.35
1247	0.39
1248	0.39
1249	0.43
1250	0.43
1251	0.47
1252	0.53
1253	0.59
1254	0.66
1255	0.68
1256	0.64
1257	0.68

A0A2S4W7Y8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer