FuNGI

A0A2S4W7C7

Protein Details

Accession

A0A2S4W7C7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
64-85	ADPTPTMPPKKSKPEEKPAVAI	Hydrophilic
309-328	RERGHWKRDCPTRPENRGRT	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 12, cyto 7.5, plas 3, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MSGSQLDSEEKLGSPSGSQASPKSENPETASGLVSGSISSSDSGNTEIASGLVTSSQPSTSLPADPTPTMPPKKSKPEEKPAVAIDEGSPALAKFLSNPQAYVSYISPQLLLDGSNISQWPDSLEDLALLVFGICKLFRRVKLHVAKCHNGSVASPISLVKLDSAPTPAHFNKFFLIVSELGGLGLHIPLELQGLFLQVLTQPPTGTTRTTLNNLSWLRKTDQLTGPLRASRHHVQVMYNSLITESVDGDGSQNSPFQINQLSAGRRAPEGSNGSRNTGQSGSGRRPPFGNDGIGGHQALALDQCGYCRERGHWKRDCPTRPENRGRTSGGPGLQKNPVGSYAPAIRVAAADAQGIVDTGATNHVSGSFHLLTNVRPLKQSILLNLASFDGSVTATHVGTLSLPSKHSTISLENVLYSPAVRGTLISLGQLVDEGFQVELKNDSLVISDLVSGEMVEGSFGGRAWNIALKSSHPLFSSSTSPTPAVMKLSGDWGSSLEWHCRLGHVSDKIIKSFLKRYVPSFDLRSWVPFFCETCAATKSERRRAELSSEISSKDKLDLVVSDVLGPVNPPDIFGNEYVLTLRDHATTFSYCFVIKSRSEVETKLQHALKIISVQQKPPKHFRCDNAKEYTKKSFVTFLNSLGTTMALTAAYTPEQNGEAERLNRTLGDMARSMLKHSGLPKTMWTFAYKAAVFLHNRLPNSRTKDKTPLELWAGVTPQVENMYPFGAKAYVHIPKENRIKMDDRGRLCFLVGYLEDGRGWYFWDAESKSVISSSAATFVEYAGRPLIPKNTNKASVDFMLNQLELPLGKVPVEIICKEQDTMLEQIPQISDLEIPKNLKNAKKSELWDWWKKACVEELKSLEEFDVWDVLDEDPKMKVAGSRWVFALKRNSDNLILRFKARFVVQGFTQVLGVDCFATFAPTASLSSLRVLFALAEINGWEINTFDVSTAYLHSPIDEEIYVRPPVELCPELKGKVLKLKKALYGTKQAPRCWWKFFKSVMEKLGFVVEEVEQSIYRCKRNDDLLLVWMHVDDGVVFTNSSLLRDEIKEGMEKDLKIKWEFGISRVVGIDVERKDGIRLSQSHLAKQIVDEAEKYLRKSILAVTTPLPDENLFTCFTNEPVDVTQYQHFIGCLNYLALGTRPDISYAVNYLARYSQNPQKSHWRALTHLIGYIKRTGNDKLVIAPRGNELQLWVDAGWGGEFSRSTSGFLVQLGGAVVAWGSRRQKTVAMSTCAAEYISMGSGIEFLIFLKSLIENCWKKIGGSIYCDNKTAILVMEDNASRGRLKHLDRQFFYSNEMIRKHDLQLSWVKTTEQLADVFTKRLGPVNQTKARRCFFSS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.16
3	0.18
4	0.19
5	0.21
6	0.23
7	0.29
8	0.34
9	0.36
10	0.4
11	0.39
12	0.42
13	0.44
14	0.45
15	0.41
16	0.37
17	0.35
18	0.28
19	0.25
20	0.21
21	0.16
22	0.11
23	0.08
24	0.08
25	0.07
26	0.08
27	0.08
28	0.08
29	0.09
30	0.11
31	0.11
32	0.1
33	0.1
34	0.1
35	0.09
36	0.09
37	0.08
38	0.06
39	0.07
40	0.07
41	0.08
42	0.09
43	0.1
44	0.1
45	0.11
46	0.15
47	0.16
48	0.19
49	0.2
50	0.22
51	0.26
52	0.26
53	0.28
54	0.32
55	0.39
56	0.42
57	0.45
58	0.5
59	0.55
60	0.65
61	0.72
62	0.75
63	0.77
64	0.81
65	0.86
66	0.82
67	0.79
68	0.71
69	0.66
70	0.55
71	0.46
72	0.35
73	0.28
74	0.23
75	0.17
76	0.15
77	0.1
78	0.11
79	0.1
80	0.09
81	0.09
82	0.16
83	0.24
84	0.25
85	0.25
86	0.26
87	0.29
88	0.3
89	0.3
90	0.24
91	0.19
92	0.21
93	0.21
94	0.19
95	0.16
96	0.16
97	0.14
98	0.13
99	0.1
100	0.1
101	0.1
102	0.12
103	0.13
104	0.13
105	0.13
106	0.12
107	0.13
108	0.13
109	0.14
110	0.13
111	0.13
112	0.12
113	0.12
114	0.11
115	0.09
116	0.06
117	0.05
118	0.04
119	0.04
120	0.06
121	0.06
122	0.08
123	0.15
124	0.22
125	0.29
126	0.36
127	0.41
128	0.5
129	0.6
130	0.67
131	0.7
132	0.72
133	0.72
134	0.68
135	0.67
136	0.58
137	0.48
138	0.4
139	0.37
140	0.3
141	0.24
142	0.21
143	0.17
144	0.17
145	0.17
146	0.16
147	0.12
148	0.11
149	0.12
150	0.12
151	0.15
152	0.15
153	0.16
154	0.23
155	0.24
156	0.29
157	0.29
158	0.29
159	0.28
160	0.29
161	0.27
162	0.22
163	0.22
164	0.16
165	0.16
166	0.15
167	0.14
168	0.11
169	0.11
170	0.09
171	0.06
172	0.06
173	0.05
174	0.04
175	0.04
176	0.04
177	0.06
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.07
182	0.07
183	0.07
184	0.08
185	0.07
186	0.1
187	0.12
188	0.13
189	0.12
190	0.13
191	0.17
192	0.18
193	0.19
194	0.18
195	0.2
196	0.23
197	0.27
198	0.29
199	0.26
200	0.33
201	0.35
202	0.38
203	0.37
204	0.37
205	0.36
206	0.39
207	0.41
208	0.41
209	0.43
210	0.47
211	0.48
212	0.48
213	0.48
214	0.45
215	0.43
216	0.36
217	0.38
218	0.35
219	0.37
220	0.37
221	0.36
222	0.35
223	0.39
224	0.43
225	0.38
226	0.33
227	0.26
228	0.22
229	0.2
230	0.18
231	0.14
232	0.09
233	0.07
234	0.07
235	0.07
236	0.08
237	0.08
238	0.09
239	0.09
240	0.09
241	0.09
242	0.1
243	0.1
244	0.11
245	0.13
246	0.12
247	0.16
248	0.2
249	0.22
250	0.23
251	0.25
252	0.25
253	0.23
254	0.25
255	0.22
256	0.23
257	0.27
258	0.3
259	0.36
260	0.36
261	0.39
262	0.4
263	0.39
264	0.36
265	0.3
266	0.28
267	0.25
268	0.3
269	0.31
270	0.37
271	0.38
272	0.36
273	0.36
274	0.38
275	0.39
276	0.35
277	0.31
278	0.24
279	0.25
280	0.27
281	0.27
282	0.23
283	0.17
284	0.14
285	0.12
286	0.11
287	0.09
288	0.07
289	0.06
290	0.06
291	0.07
292	0.09
293	0.1
294	0.12
295	0.13
296	0.16
297	0.27
298	0.36
299	0.45
300	0.51
301	0.58
302	0.66
303	0.74
304	0.77
305	0.74
306	0.76
307	0.77
308	0.78
309	0.8
310	0.8
311	0.75
312	0.73
313	0.69
314	0.63
315	0.57
316	0.52
317	0.46
318	0.44
319	0.4
320	0.38
321	0.38
322	0.36
323	0.31
324	0.27
325	0.25
326	0.2
327	0.19
328	0.18
329	0.19
330	0.19
331	0.19
332	0.18
333	0.16
334	0.14
335	0.15
336	0.13
337	0.09
338	0.08
339	0.07
340	0.07
341	0.06
342	0.06
343	0.05
344	0.04
345	0.03
346	0.04
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.07
352	0.08
353	0.08
354	0.14
355	0.14
356	0.13
357	0.15
358	0.16
359	0.15
360	0.24
361	0.28
362	0.23
363	0.23
364	0.24
365	0.25
366	0.3
367	0.3
368	0.23
369	0.25
370	0.24
371	0.23
372	0.23
373	0.2
374	0.15
375	0.13
376	0.11
377	0.06
378	0.05
379	0.05
380	0.06
381	0.07
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.07
387	0.09
388	0.1
389	0.1
390	0.11
391	0.13
392	0.13
393	0.14
394	0.14
395	0.15
396	0.15
397	0.17
398	0.19
399	0.17
400	0.17
401	0.17
402	0.16
403	0.13
404	0.11
405	0.08
406	0.06
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.09
412	0.08
413	0.08
414	0.08
415	0.08
416	0.08
417	0.08
418	0.06
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.04
423	0.05
424	0.05
425	0.06
426	0.07
427	0.07
428	0.07
429	0.06
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.07
434	0.06
435	0.06
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.05
440	0.04
441	0.04
442	0.04
443	0.03
444	0.03
445	0.03
446	0.03
447	0.04
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.05
452	0.08
453	0.08
454	0.1
455	0.11
456	0.12
457	0.17
458	0.18
459	0.19
460	0.17
461	0.18
462	0.18
463	0.2
464	0.22
465	0.2
466	0.21
467	0.2
468	0.2
469	0.19
470	0.19
471	0.17
472	0.16
473	0.13
474	0.12
475	0.1
476	0.13
477	0.14
478	0.12
479	0.11
480	0.1
481	0.1
482	0.12
483	0.13
484	0.12
485	0.12
486	0.13
487	0.13
488	0.13
489	0.14
490	0.14
491	0.19
492	0.18
493	0.21
494	0.25
495	0.26
496	0.26
497	0.26
498	0.25
499	0.22
500	0.26
501	0.29
502	0.31
503	0.31
504	0.33
505	0.37
506	0.39
507	0.38
508	0.36
509	0.31
510	0.27
511	0.26
512	0.26
513	0.23
514	0.2
515	0.19
516	0.17
517	0.17
518	0.16
519	0.17
520	0.15
521	0.15
522	0.16
523	0.16
524	0.16
525	0.22
526	0.28
527	0.35
528	0.37
529	0.39
530	0.4
531	0.4
532	0.43
533	0.43
534	0.39
535	0.34
536	0.32
537	0.3
538	0.28
539	0.27
540	0.22
541	0.17
542	0.14
543	0.11
544	0.1
545	0.09
546	0.11
547	0.12
548	0.11
549	0.1
550	0.1
551	0.09
552	0.08
553	0.08
554	0.05
555	0.06
556	0.06
557	0.06
558	0.06
559	0.08
560	0.09
561	0.09
562	0.11
563	0.1
564	0.1
565	0.09
566	0.1
567	0.09
568	0.09
569	0.09
570	0.08
571	0.08
572	0.08
573	0.1
574	0.1
575	0.11
576	0.11
577	0.11
578	0.1
579	0.1
580	0.11
581	0.13
582	0.12
583	0.15
584	0.16
585	0.18
586	0.2
587	0.2
588	0.23
589	0.25
590	0.26
591	0.28
592	0.26
593	0.24
594	0.24
595	0.24
596	0.2
597	0.17
598	0.2
599	0.22
600	0.22
601	0.27
602	0.32
603	0.36
604	0.4
605	0.48
606	0.5
607	0.5
608	0.53
609	0.56
610	0.6
611	0.62
612	0.64
613	0.62
614	0.62
615	0.58
616	0.57
617	0.56
618	0.47
619	0.41
620	0.36
621	0.34
622	0.28
623	0.31
624	0.28
625	0.24
626	0.24
627	0.23
628	0.22
629	0.16
630	0.15
631	0.08
632	0.07
633	0.06
634	0.03
635	0.03
636	0.03
637	0.04
638	0.04
639	0.04
640	0.04
641	0.05
642	0.06
643	0.06
644	0.06
645	0.07
646	0.09
647	0.1
648	0.11
649	0.11
650	0.11
651	0.1
652	0.1
653	0.11
654	0.1
655	0.11
656	0.1
657	0.1
658	0.12
659	0.13
660	0.13
661	0.12
662	0.12
663	0.12
664	0.14
665	0.18
666	0.17
667	0.17
668	0.19
669	0.2
670	0.21
671	0.2
672	0.19
673	0.16
674	0.16
675	0.2
676	0.17
677	0.16
678	0.15
679	0.18
680	0.16
681	0.17
682	0.23
683	0.22
684	0.22
685	0.23
686	0.24
687	0.26
688	0.34
689	0.4
690	0.35
691	0.36
692	0.45
693	0.46
694	0.48
695	0.44
696	0.39
697	0.34
698	0.33
699	0.3
700	0.21
701	0.2
702	0.16
703	0.15
704	0.11
705	0.09
706	0.08
707	0.07
708	0.06
709	0.06
710	0.07
711	0.06
712	0.06
713	0.06
714	0.06
715	0.06
716	0.07
717	0.11
718	0.15
719	0.16
720	0.19
721	0.2
722	0.27
723	0.36
724	0.37
725	0.34
726	0.32
727	0.34
728	0.37
729	0.45
730	0.44
731	0.38
732	0.39
733	0.39
734	0.36
735	0.33
736	0.27
737	0.18
738	0.14
739	0.11
740	0.11
741	0.1
742	0.1
743	0.1
744	0.1
745	0.1
746	0.08
747	0.09
748	0.06
749	0.06
750	0.06
751	0.1
752	0.11
753	0.11
754	0.12
755	0.12
756	0.11
757	0.11
758	0.11
759	0.07
760	0.08
761	0.07
762	0.09
763	0.09
764	0.09
765	0.09
766	0.09
767	0.12
768	0.1
769	0.11
770	0.08
771	0.08
772	0.09
773	0.1
774	0.17
775	0.19
776	0.22
777	0.27
778	0.31
779	0.35
780	0.36
781	0.37
782	0.33
783	0.29
784	0.29
785	0.24
786	0.21
787	0.18
788	0.16
789	0.14
790	0.12
791	0.1
792	0.07
793	0.07
794	0.07
795	0.05
796	0.06
797	0.06
798	0.06
799	0.08
800	0.11
801	0.1
802	0.12
803	0.13
804	0.13
805	0.14
806	0.14
807	0.12
808	0.12
809	0.14
810	0.13
811	0.13
812	0.13
813	0.13
814	0.13
815	0.13
816	0.1
817	0.08
818	0.09
819	0.08
820	0.1
821	0.12
822	0.14
823	0.15
824	0.2
825	0.24
826	0.27
827	0.31
828	0.34
829	0.36
830	0.39
831	0.41
832	0.41
833	0.47
834	0.5
835	0.52
836	0.52
837	0.5
838	0.49
839	0.47
840	0.42
841	0.38
842	0.37
843	0.33
844	0.35
845	0.35
846	0.34
847	0.33
848	0.33
849	0.27
850	0.2
851	0.17
852	0.11
853	0.09
854	0.06
855	0.06
856	0.07
857	0.07
858	0.08
859	0.08
860	0.08
861	0.08
862	0.08
863	0.08
864	0.07
865	0.09
866	0.09
867	0.19
868	0.2
869	0.2
870	0.21
871	0.26
872	0.26
873	0.29
874	0.36
875	0.31
876	0.34
877	0.34
878	0.36
879	0.35
880	0.39
881	0.38
882	0.35
883	0.32
884	0.3
885	0.29
886	0.27
887	0.26
888	0.22
889	0.23
890	0.19
891	0.21
892	0.19
893	0.25
894	0.25
895	0.23
896	0.22
897	0.17
898	0.16
899	0.13
900	0.13
901	0.06
902	0.05
903	0.06
904	0.05
905	0.06
906	0.06
907	0.06
908	0.07
909	0.07
910	0.07
911	0.08
912	0.09
913	0.08
914	0.1
915	0.1
916	0.1
917	0.09
918	0.09
919	0.08
920	0.07
921	0.08
922	0.06
923	0.06
924	0.05
925	0.06
926	0.06
927	0.06
928	0.05
929	0.04
930	0.05
931	0.05
932	0.05
933	0.05
934	0.05
935	0.06
936	0.06
937	0.08
938	0.08
939	0.09
940	0.09
941	0.09
942	0.09
943	0.09
944	0.1
945	0.09
946	0.09
947	0.09
948	0.13
949	0.13
950	0.13
951	0.12
952	0.11
953	0.12
954	0.16
955	0.17
956	0.14
957	0.18
958	0.21
959	0.21
960	0.24
961	0.25
962	0.23
963	0.3
964	0.35
965	0.35
966	0.39
967	0.42
968	0.44
969	0.49
970	0.52
971	0.48
972	0.52
973	0.53
974	0.54
975	0.56
976	0.53
977	0.54
978	0.57
979	0.55
980	0.55
981	0.55
982	0.52
983	0.54
984	0.56
985	0.58
986	0.58
987	0.59
988	0.57
989	0.52
990	0.47
991	0.41
992	0.39
993	0.29
994	0.2
995	0.17
996	0.1
997	0.09
998	0.09
999	0.1
1000	0.08
1001	0.09
1002	0.16
1003	0.19
1004	0.22
1005	0.24
1006	0.27
1007	0.3
1008	0.36
1009	0.4
1010	0.37
1011	0.35
1012	0.35
1013	0.34
1014	0.31
1015	0.27
1016	0.21
1017	0.16
1018	0.11
1019	0.09
1020	0.05
1021	0.05
1022	0.05
1023	0.06
1024	0.06
1025	0.06
1026	0.09
1027	0.09
1028	0.1
1029	0.11
1030	0.11
1031	0.13
1032	0.14
1033	0.16
1034	0.15
1035	0.16
1036	0.18
1037	0.18
1038	0.23
1039	0.25
1040	0.24
1041	0.25
1042	0.26
1043	0.3
1044	0.28
1045	0.29
1046	0.24
1047	0.28
1048	0.28
1049	0.27
1050	0.31
1051	0.27
1052	0.26
1053	0.25
1054	0.24
1055	0.16
1056	0.17
1057	0.21
1058	0.14
1059	0.17
1060	0.17
1061	0.17
1062	0.17
1063	0.19
1064	0.2
1065	0.2
1066	0.22
1067	0.24
1068	0.32
1069	0.33
1070	0.35
1071	0.38
1072	0.37
1073	0.31
1074	0.29
1075	0.3
1076	0.24
1077	0.24
1078	0.21
1079	0.2
1080	0.26
1081	0.28
1082	0.29
1083	0.26
1084	0.24
1085	0.23
1086	0.24
1087	0.26
1088	0.27
1089	0.27
1090	0.28
1091	0.25
1092	0.28
1093	0.28
1094	0.27
1095	0.23
1096	0.16
1097	0.16
1098	0.15
1099	0.15
1100	0.14
1101	0.14
1102	0.16
1103	0.15
1104	0.16
1105	0.17
1106	0.16
1107	0.16
1108	0.16
1109	0.19
1110	0.17
1111	0.2
1112	0.21
1113	0.19
1114	0.2
1115	0.18
1116	0.17
1117	0.14
1118	0.14
1119	0.12
1120	0.1
1121	0.09
1122	0.09
1123	0.08
1124	0.09
1125	0.09
1126	0.1
1127	0.1
1128	0.11
1129	0.11
1130	0.12
1131	0.13
1132	0.13
1133	0.14
1134	0.14
1135	0.17
1136	0.17
1137	0.17
1138	0.17
1139	0.2
1140	0.2
1141	0.21
1142	0.25
1143	0.3
1144	0.36
1145	0.38
1146	0.41
1147	0.49
1148	0.54
1149	0.59
1150	0.6
1151	0.56
1152	0.51
1153	0.57
1154	0.59
1155	0.49
1156	0.46
1157	0.42
1158	0.37
1159	0.35
1160	0.39
1161	0.34
1162	0.29
1163	0.32
1164	0.31
1165	0.33
1166	0.34
1167	0.33
1168	0.33
1169	0.37
1170	0.38
1171	0.36
1172	0.34
1173	0.32
1174	0.32
1175	0.31
1176	0.24
1177	0.19
1178	0.19
1179	0.18
1180	0.18
1181	0.15
1182	0.11
1183	0.11
1184	0.11
1185	0.1
1186	0.07
1187	0.07
1188	0.06
1189	0.07
1190	0.08
1191	0.12
1192	0.13
1193	0.14
1194	0.15
1195	0.17
1196	0.16
1197	0.17
1198	0.16
1199	0.12
1200	0.12
1201	0.1
1202	0.09
1203	0.07
1204	0.06
1205	0.06
1206	0.05
1207	0.06
1208	0.11
1209	0.16
1210	0.19
1211	0.22
1212	0.24
1213	0.29
1214	0.33
1215	0.42
1216	0.44
1217	0.45
1218	0.44
1219	0.42
1220	0.41
1221	0.37
1222	0.32
1223	0.21
1224	0.14
1225	0.1
1226	0.09
1227	0.08
1228	0.07
1229	0.07
1230	0.07
1231	0.07
1232	0.07
1233	0.05
1234	0.05
1235	0.06
1236	0.06
1237	0.06
1238	0.08
1239	0.09
1240	0.1
1241	0.14
1242	0.23
1243	0.25
1244	0.27
1245	0.34
1246	0.33
1247	0.32
1248	0.36
1249	0.41
1250	0.35
1251	0.39
1252	0.45
1253	0.47
1254	0.49
1255	0.5
1256	0.45
1257	0.37
1258	0.33
1259	0.27
1260	0.2
1261	0.14
1262	0.13
1263	0.13
1264	0.17
1265	0.16
1266	0.17
1267	0.17
1268	0.17
1269	0.16
1270	0.16
1271	0.22
1272	0.26
1273	0.31
1274	0.4
1275	0.49
1276	0.58
1277	0.6
1278	0.66
1279	0.64
1280	0.57
1281	0.57
1282	0.53
1283	0.48
1284	0.45
1285	0.44
1286	0.41
1287	0.41
1288	0.43
1289	0.42
1290	0.42
1291	0.37
1292	0.36
1293	0.43
1294	0.44
1295	0.42
1296	0.41
1297	0.38
1298	0.34
1299	0.36
1300	0.33
1301	0.27
1302	0.22
1303	0.21
1304	0.26
1305	0.27
1306	0.26
1307	0.25
1308	0.24
1309	0.23
1310	0.29
1311	0.29
1312	0.31
1313	0.39
1314	0.48
1315	0.56
1316	0.62
1317	0.7
1318	0.72
1319	0.74

A0A2S4W7C7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer