FuNGI

A0A2S4VN28

Protein Details

Accession

A0A2S4VN28

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
89-115	ALSTTSRKIAKKPTRNCKNGHNPNIGH	Hydrophilic
121-141	YFLHPEKKPEWMKKRDKASAY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto 5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MAKYIAEMEVSLAEMNSIRLDVSGKLVSCGIIGRITDKRPTLVQTLFADLKAVAEPRRLIAKLRDICNHEAVTKRKIVEEESTPSSSTALSTTSRKIAKKPTRNCKNGHNPNIGHSADECYFLHPEKKPEWMKKRDKASAYISAPSNPDQEQLSSTALIQPSFGYNTILTDHSDTISMVLDSGASHHMLNSLAYFQKTVKTLIQITTGNDKGADKLVAIARGDATLKFENGNTIILKNALYVPDLSRNLISMIQLLRHKATIYNNNRRFEVKIDNGIPIQVNIDNFILEIEGIIEPKVIAMAAQIKPIIQDFTLWHNRLGHASANQIAASLSLSKKFNKLRSFSSPLEVVHGDLVGPITPATNGGARYFLTLVDQFTGYIHTDILKEKSDACNSIIDFIRFFEKQTERPFKKLITDRGGEFCNKSLSDFLKIEGIQHNVSPPYTPQHNGLAERANRTIIEMTRCMLMQANVAPQWWGEAVRTATATTNCLPSLSKSKSSPIELMFGIKPNFHFLRPFGCVLLGYENDYSSYKVARMDTKDIITTKHAYFDESSFPECGPRNKSFTTYGINKLPVFTTEEPQPIEVDNVNEDEMMNEENEIRGILNENDSINRMEVENQTRESITKDINHLVEESSLINGNISQENIVSTKRIRKQLYTVTASVDPKTHKQAMASEDNMKWKEAELKEINNMLKHEVWSVRLQLPDDEPIPATWAFRRKLGSSNEVIEYKARICAQGFKQTYGLNFLAKYAPTGKAASLRFLLSFAINNDMKIHQLDVRSAFLTCPLTDKVTMLPPQGYNIPENLVLSLNKAIYGLKQSPLVWYKRLTNFLKSIGFQIGVSDPCVFWRKESNNQPATWIFAHVDDLVIVSKDPLVFKAQMEKEFEIKYLGDATFLLGMNIERFSNGIQINQSQYIDRKLQEYNLQDEHVASCPINPREYMKKATSNEIIEFNKMNVNYRALIGSLTYLSILTRPDISYAVSTLSQYLDNPGIKHYYAAVQVFRYLKGTYRFGLIFKKEKGAQLKAFADADWGNCPDTRRSTTGFLVMVGTHIINWKSTKQATISLSSAEAEYKALSD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.08
2	0.09
3	0.08
4	0.08
5	0.07
6	0.08
7	0.1
8	0.1
9	0.14
10	0.17
11	0.17
12	0.18
13	0.18
14	0.18
15	0.17
16	0.17
17	0.14
18	0.13
19	0.13
20	0.17
21	0.22
22	0.25
23	0.31
24	0.32
25	0.33
26	0.34
27	0.38
28	0.39
29	0.36
30	0.38
31	0.34
32	0.39
33	0.37
34	0.34
35	0.31
36	0.24
37	0.23
38	0.2
39	0.21
40	0.16
41	0.2
42	0.21
43	0.22
44	0.29
45	0.29
46	0.31
47	0.35
48	0.43
49	0.46
50	0.51
51	0.56
52	0.54
53	0.58
54	0.59
55	0.53
56	0.47
57	0.47
58	0.46
59	0.45
60	0.45
61	0.42
62	0.4
63	0.4
64	0.4
65	0.39
66	0.4
67	0.4
68	0.4
69	0.41
70	0.38
71	0.36
72	0.32
73	0.26
74	0.21
75	0.15
76	0.13
77	0.14
78	0.17
79	0.2
80	0.27
81	0.33
82	0.35
83	0.41
84	0.49
85	0.57
86	0.64
87	0.71
88	0.76
89	0.8
90	0.85
91	0.83
92	0.83
93	0.83
94	0.83
95	0.82
96	0.81
97	0.71
98	0.68
99	0.71
100	0.6
101	0.5
102	0.4
103	0.36
104	0.27
105	0.29
106	0.24
107	0.19
108	0.22
109	0.23
110	0.28
111	0.27
112	0.32
113	0.31
114	0.41
115	0.48
116	0.56
117	0.64
118	0.68
119	0.75
120	0.77
121	0.85
122	0.84
123	0.79
124	0.75
125	0.71
126	0.69
127	0.62
128	0.59
129	0.5
130	0.45
131	0.43
132	0.39
133	0.35
134	0.26
135	0.25
136	0.21
137	0.21
138	0.2
139	0.2
140	0.19
141	0.16
142	0.16
143	0.18
144	0.18
145	0.16
146	0.15
147	0.13
148	0.14
149	0.15
150	0.15
151	0.13
152	0.12
153	0.13
154	0.15
155	0.15
156	0.15
157	0.15
158	0.16
159	0.14
160	0.15
161	0.13
162	0.12
163	0.12
164	0.1
165	0.08
166	0.07
167	0.06
168	0.06
169	0.07
170	0.08
171	0.08
172	0.08
173	0.08
174	0.09
175	0.1
176	0.1
177	0.09
178	0.11
179	0.12
180	0.13
181	0.14
182	0.13
183	0.17
184	0.18
185	0.21
186	0.2
187	0.22
188	0.25
189	0.26
190	0.3
191	0.27
192	0.29
193	0.33
194	0.31
195	0.27
196	0.25
197	0.24
198	0.2
199	0.21
200	0.19
201	0.11
202	0.14
203	0.16
204	0.18
205	0.18
206	0.17
207	0.15
208	0.16
209	0.17
210	0.13
211	0.16
212	0.14
213	0.15
214	0.15
215	0.14
216	0.16
217	0.16
218	0.18
219	0.14
220	0.13
221	0.13
222	0.13
223	0.13
224	0.12
225	0.12
226	0.1
227	0.1
228	0.11
229	0.13
230	0.19
231	0.2
232	0.2
233	0.19
234	0.19
235	0.19
236	0.19
237	0.17
238	0.13
239	0.13
240	0.16
241	0.18
242	0.19
243	0.19
244	0.19
245	0.2
246	0.2
247	0.26
248	0.33
249	0.41
250	0.5
251	0.56
252	0.58
253	0.59
254	0.57
255	0.52
256	0.45
257	0.44
258	0.37
259	0.38
260	0.36
261	0.37
262	0.35
263	0.35
264	0.31
265	0.22
266	0.19
267	0.13
268	0.12
269	0.11
270	0.11
271	0.1
272	0.09
273	0.09
274	0.07
275	0.05
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.04
286	0.03
287	0.04
288	0.11
289	0.12
290	0.13
291	0.14
292	0.14
293	0.14
294	0.15
295	0.15
296	0.08
297	0.09
298	0.1
299	0.18
300	0.26
301	0.27
302	0.28
303	0.28
304	0.29
305	0.29
306	0.29
307	0.24
308	0.17
309	0.18
310	0.18
311	0.18
312	0.17
313	0.15
314	0.13
315	0.11
316	0.1
317	0.1
318	0.09
319	0.12
320	0.14
321	0.16
322	0.23
323	0.29
324	0.36
325	0.4
326	0.43
327	0.45
328	0.52
329	0.58
330	0.52
331	0.49
332	0.44
333	0.37
334	0.37
335	0.3
336	0.22
337	0.15
338	0.14
339	0.1
340	0.08
341	0.09
342	0.05
343	0.05
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.05
348	0.06
349	0.07
350	0.08
351	0.08
352	0.1
353	0.1
354	0.11
355	0.11
356	0.1
357	0.1
358	0.1
359	0.1
360	0.1
361	0.1
362	0.09
363	0.09
364	0.1
365	0.09
366	0.09
367	0.08
368	0.08
369	0.09
370	0.11
371	0.13
372	0.13
373	0.13
374	0.15
375	0.19
376	0.2
377	0.21
378	0.2
379	0.21
380	0.19
381	0.23
382	0.22
383	0.18
384	0.16
385	0.15
386	0.18
387	0.14
388	0.15
389	0.19
390	0.2
391	0.25
392	0.34
393	0.44
394	0.43
395	0.47
396	0.49
397	0.43
398	0.48
399	0.5
400	0.49
401	0.44
402	0.43
403	0.41
404	0.42
405	0.42
406	0.35
407	0.29
408	0.22
409	0.19
410	0.17
411	0.16
412	0.16
413	0.16
414	0.19
415	0.18
416	0.17
417	0.18
418	0.18
419	0.2
420	0.2
421	0.2
422	0.16
423	0.16
424	0.17
425	0.14
426	0.14
427	0.13
428	0.11
429	0.12
430	0.14
431	0.15
432	0.16
433	0.21
434	0.23
435	0.23
436	0.24
437	0.27
438	0.26
439	0.28
440	0.26
441	0.21
442	0.19
443	0.19
444	0.2
445	0.15
446	0.16
447	0.14
448	0.14
449	0.14
450	0.14
451	0.13
452	0.12
453	0.1
454	0.08
455	0.09
456	0.1
457	0.1
458	0.1
459	0.1
460	0.08
461	0.09
462	0.08
463	0.07
464	0.05
465	0.08
466	0.08
467	0.09
468	0.09
469	0.09
470	0.11
471	0.11
472	0.13
473	0.11
474	0.12
475	0.11
476	0.11
477	0.11
478	0.11
479	0.19
480	0.2
481	0.22
482	0.22
483	0.27
484	0.29
485	0.31
486	0.32
487	0.25
488	0.24
489	0.21
490	0.22
491	0.19
492	0.19
493	0.17
494	0.15
495	0.14
496	0.16
497	0.17
498	0.15
499	0.15
500	0.13
501	0.17
502	0.19
503	0.19
504	0.15
505	0.14
506	0.13
507	0.13
508	0.14
509	0.1
510	0.09
511	0.09
512	0.09
513	0.09
514	0.1
515	0.1
516	0.08
517	0.08
518	0.07
519	0.09
520	0.11
521	0.14
522	0.16
523	0.2
524	0.21
525	0.21
526	0.22
527	0.21
528	0.21
529	0.19
530	0.2
531	0.16
532	0.19
533	0.18
534	0.17
535	0.18
536	0.18
537	0.19
538	0.17
539	0.18
540	0.14
541	0.14
542	0.16
543	0.17
544	0.19
545	0.21
546	0.23
547	0.26
548	0.26
549	0.29
550	0.28
551	0.29
552	0.31
553	0.29
554	0.3
555	0.29
556	0.3
557	0.27
558	0.25
559	0.23
560	0.18
561	0.2
562	0.18
563	0.17
564	0.18
565	0.2
566	0.19
567	0.2
568	0.19
569	0.13
570	0.13
571	0.12
572	0.09
573	0.08
574	0.08
575	0.08
576	0.08
577	0.07
578	0.06
579	0.06
580	0.06
581	0.05
582	0.05
583	0.05
584	0.05
585	0.05
586	0.05
587	0.04
588	0.04
589	0.06
590	0.06
591	0.07
592	0.08
593	0.09
594	0.09
595	0.1
596	0.11
597	0.09
598	0.09
599	0.08
600	0.1
601	0.13
602	0.17
603	0.18
604	0.18
605	0.19
606	0.19
607	0.19
608	0.18
609	0.17
610	0.15
611	0.15
612	0.17
613	0.19
614	0.19
615	0.19
616	0.18
617	0.16
618	0.13
619	0.12
620	0.1
621	0.07
622	0.07
623	0.06
624	0.06
625	0.06
626	0.07
627	0.07
628	0.07
629	0.06
630	0.06
631	0.07
632	0.08
633	0.08
634	0.08
635	0.1
636	0.18
637	0.24
638	0.32
639	0.33
640	0.35
641	0.41
642	0.48
643	0.53
644	0.49
645	0.44
646	0.39
647	0.41
648	0.39
649	0.34
650	0.28
651	0.23
652	0.21
653	0.27
654	0.26
655	0.23
656	0.23
657	0.27
658	0.29
659	0.32
660	0.32
661	0.3
662	0.3
663	0.35
664	0.34
665	0.3
666	0.24
667	0.2
668	0.26
669	0.22
670	0.28
671	0.26
672	0.27
673	0.29
674	0.34
675	0.34
676	0.28
677	0.28
678	0.22
679	0.2
680	0.19
681	0.19
682	0.16
683	0.17
684	0.17
685	0.2
686	0.21
687	0.21
688	0.21
689	0.19
690	0.2
691	0.2
692	0.19
693	0.16
694	0.13
695	0.12
696	0.14
697	0.13
698	0.12
699	0.13
700	0.2
701	0.2
702	0.22
703	0.25
704	0.24
705	0.31
706	0.35
707	0.37
708	0.33
709	0.35
710	0.34
711	0.32
712	0.31
713	0.25
714	0.22
715	0.17
716	0.18
717	0.15
718	0.13
719	0.14
720	0.21
721	0.24
722	0.32
723	0.33
724	0.31
725	0.33
726	0.33
727	0.33
728	0.31
729	0.28
730	0.19
731	0.18
732	0.17
733	0.17
734	0.16
735	0.17
736	0.14
737	0.15
738	0.15
739	0.16
740	0.16
741	0.21
742	0.21
743	0.22
744	0.21
745	0.2
746	0.18
747	0.18
748	0.17
749	0.11
750	0.12
751	0.11
752	0.15
753	0.15
754	0.15
755	0.16
756	0.16
757	0.16
758	0.15
759	0.16
760	0.12
761	0.13
762	0.16
763	0.16
764	0.18
765	0.17
766	0.17
767	0.16
768	0.16
769	0.17
770	0.14
771	0.16
772	0.15
773	0.17
774	0.17
775	0.17
776	0.16
777	0.2
778	0.22
779	0.21
780	0.22
781	0.2
782	0.22
783	0.24
784	0.23
785	0.19
786	0.17
787	0.17
788	0.15
789	0.15
790	0.14
791	0.13
792	0.11
793	0.12
794	0.13
795	0.11
796	0.11
797	0.11
798	0.1
799	0.1
800	0.16
801	0.17
802	0.16
803	0.19
804	0.19
805	0.25
806	0.31
807	0.32
808	0.29
809	0.3
810	0.36
811	0.39
812	0.48
813	0.44
814	0.44
815	0.44
816	0.45
817	0.45
818	0.38
819	0.35
820	0.29
821	0.26
822	0.21
823	0.19
824	0.18
825	0.15
826	0.16
827	0.14
828	0.12
829	0.15
830	0.19
831	0.17
832	0.17
833	0.26
834	0.3
835	0.39
836	0.49
837	0.55
838	0.57
839	0.57
840	0.59
841	0.5
842	0.49
843	0.4
844	0.32
845	0.23
846	0.18
847	0.19
848	0.15
849	0.15
850	0.1
851	0.1
852	0.09
853	0.08
854	0.08
855	0.06
856	0.07
857	0.09
858	0.09
859	0.1
860	0.14
861	0.15
862	0.16
863	0.25
864	0.28
865	0.3
866	0.35
867	0.36
868	0.36
869	0.35
870	0.35
871	0.27
872	0.24
873	0.2
874	0.19
875	0.17
876	0.13
877	0.12
878	0.13
879	0.14
880	0.13
881	0.12
882	0.09
883	0.1
884	0.1
885	0.11
886	0.1
887	0.07
888	0.08
889	0.08
890	0.14
891	0.14
892	0.15
893	0.17
894	0.19
895	0.23
896	0.25
897	0.25
898	0.22
899	0.24
900	0.27
901	0.28
902	0.27
903	0.27
904	0.26
905	0.3
906	0.34
907	0.36
908	0.37
909	0.35
910	0.35
911	0.32
912	0.31
913	0.29
914	0.23
915	0.21
916	0.15
917	0.15
918	0.22
919	0.24
920	0.25
921	0.25
922	0.29
923	0.36
924	0.41
925	0.45
926	0.43
927	0.49
928	0.49
929	0.55
930	0.56
931	0.5
932	0.47
933	0.48
934	0.43
935	0.38
936	0.36
937	0.3
938	0.29
939	0.26
940	0.29
941	0.24
942	0.26
943	0.24
944	0.24
945	0.24
946	0.19
947	0.19
948	0.14
949	0.13
950	0.1
951	0.09
952	0.08
953	0.08
954	0.08
955	0.09
956	0.1
957	0.1
958	0.12
959	0.12
960	0.13
961	0.14
962	0.15
963	0.15
964	0.15
965	0.16
966	0.14
967	0.14
968	0.14
969	0.14
970	0.13
971	0.12
972	0.15
973	0.19
974	0.2
975	0.21
976	0.22
977	0.24
978	0.24
979	0.24
980	0.22
981	0.2
982	0.23
983	0.25
984	0.25
985	0.23
986	0.28
987	0.29
988	0.28
989	0.27
990	0.23
991	0.26
992	0.29
993	0.32
994	0.28
995	0.31
996	0.32
997	0.33
998	0.4
999	0.41
1000	0.43
1001	0.42
1002	0.48
1003	0.47
1004	0.53
1005	0.57
1006	0.57
1007	0.55
1008	0.55
1009	0.54
1010	0.5
1011	0.47
1012	0.4
1013	0.36
1014	0.29
1015	0.26
1016	0.22
1017	0.22
1018	0.2
1019	0.21
1020	0.24
1021	0.26
1022	0.31
1023	0.35
1024	0.35
1025	0.38
1026	0.42
1027	0.43
1028	0.45
1029	0.39
1030	0.33
1031	0.29
1032	0.25
1033	0.21
1034	0.17
1035	0.14
1036	0.1
1037	0.14
1038	0.14
1039	0.16
1040	0.19
1041	0.21
1042	0.27
1043	0.29
1044	0.32
1045	0.3
1046	0.37
1047	0.38
1048	0.4
1049	0.39
1050	0.33
1051	0.32
1052	0.29
1053	0.27
1054	0.2
1055	0.17
1056	0.13

A0A2S4VN28

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer