Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2S4UPU6

Protein Details
Accession A0A2S4UPU6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
343-369MTTTPKTSTIQRKKKQRLQTWDKMLKAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018983  U3_snoRNA-assocProt_15_C  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09384  UTP15_C  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MDFVKLQILQHPRLTKSNEERTEGKYWREFKNPVFVKSYAPISHITFSTKVPHRYCLPARCSDIKADGKLVVSSDDSGLIQVFDLNSRAILRTFREIKQPVHVVKFSPTSTNILTCSDDSTVRLYDLATSKTIRTFMGHTDYVRAGDFTGPNLILSGGYDGQLKLWDDRIEENGGLAVDPTASHLPLKSPKEITSLCWARGPCDEFDEGSQSTRRLLSGGLDGLVKVYDISTGSYKVRHTIKYSSPILSMAVSPDDSLLVVGCTDGSLSMRKRPKSSNEIAVNKALKAQKSLAAATHGADPTENESEIVWGRQDANLIEEMAGAGLDEETANEYPDAHTTEAMTTTPKTSTIQRKKKQRLQTWDKMLKAFRYGDALDSVLSSTVPPNTTFSLIRELMHRDGLHQALSGRDEVSLAPILRLISRHITDPRWFNIASDVLNCIINLYRAVLGKSQTIDGLLSSISFRISDELKLHSSLFAVNGQLEMILSGYD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.55
3 0.58
4 0.65
5 0.63
6 0.63
7 0.62
8 0.61
9 0.65
10 0.59
11 0.56
12 0.53
13 0.54
14 0.55
15 0.6
16 0.59
17 0.54
18 0.61
19 0.59
20 0.55
21 0.55
22 0.49
23 0.45
24 0.44
25 0.47
26 0.37
27 0.34
28 0.33
29 0.31
30 0.33
31 0.3
32 0.3
33 0.25
34 0.25
35 0.33
36 0.37
37 0.42
38 0.42
39 0.46
40 0.46
41 0.54
42 0.6
43 0.6
44 0.59
45 0.57
46 0.61
47 0.61
48 0.59
49 0.54
50 0.54
51 0.5
52 0.47
53 0.42
54 0.37
55 0.33
56 0.31
57 0.28
58 0.21
59 0.16
60 0.15
61 0.13
62 0.12
63 0.11
64 0.11
65 0.1
66 0.09
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.1
75 0.11
76 0.11
77 0.14
78 0.16
79 0.23
80 0.28
81 0.3
82 0.38
83 0.42
84 0.42
85 0.47
86 0.52
87 0.48
88 0.49
89 0.48
90 0.4
91 0.4
92 0.43
93 0.36
94 0.32
95 0.29
96 0.27
97 0.27
98 0.27
99 0.24
100 0.22
101 0.23
102 0.2
103 0.2
104 0.17
105 0.16
106 0.16
107 0.17
108 0.15
109 0.14
110 0.13
111 0.11
112 0.14
113 0.16
114 0.17
115 0.16
116 0.17
117 0.18
118 0.19
119 0.2
120 0.17
121 0.16
122 0.16
123 0.18
124 0.22
125 0.23
126 0.22
127 0.24
128 0.24
129 0.23
130 0.21
131 0.17
132 0.12
133 0.13
134 0.13
135 0.11
136 0.13
137 0.12
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.06
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.1
150 0.11
151 0.1
152 0.12
153 0.13
154 0.13
155 0.15
156 0.17
157 0.17
158 0.16
159 0.15
160 0.13
161 0.12
162 0.1
163 0.09
164 0.06
165 0.04
166 0.04
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.11
173 0.18
174 0.21
175 0.23
176 0.24
177 0.25
178 0.3
179 0.31
180 0.3
181 0.33
182 0.32
183 0.29
184 0.31
185 0.3
186 0.26
187 0.29
188 0.29
189 0.2
190 0.2
191 0.2
192 0.17
193 0.17
194 0.19
195 0.15
196 0.15
197 0.15
198 0.13
199 0.13
200 0.13
201 0.12
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.06
213 0.04
214 0.04
215 0.03
216 0.04
217 0.05
218 0.06
219 0.08
220 0.09
221 0.11
222 0.11
223 0.16
224 0.19
225 0.2
226 0.22
227 0.26
228 0.29
229 0.34
230 0.36
231 0.32
232 0.29
233 0.27
234 0.25
235 0.2
236 0.16
237 0.09
238 0.08
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.02
251 0.02
252 0.03
253 0.04
254 0.08
255 0.09
256 0.16
257 0.22
258 0.25
259 0.29
260 0.34
261 0.4
262 0.45
263 0.49
264 0.51
265 0.54
266 0.55
267 0.53
268 0.53
269 0.47
270 0.38
271 0.39
272 0.32
273 0.24
274 0.22
275 0.22
276 0.2
277 0.21
278 0.22
279 0.18
280 0.17
281 0.17
282 0.16
283 0.18
284 0.14
285 0.12
286 0.12
287 0.11
288 0.12
289 0.13
290 0.12
291 0.09
292 0.09
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.08
297 0.07
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.08
307 0.07
308 0.06
309 0.05
310 0.04
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.05
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.07
321 0.07
322 0.1
323 0.12
324 0.1
325 0.1
326 0.1
327 0.11
328 0.11
329 0.11
330 0.11
331 0.1
332 0.11
333 0.11
334 0.12
335 0.13
336 0.2
337 0.31
338 0.4
339 0.51
340 0.58
341 0.68
342 0.78
343 0.85
344 0.88
345 0.86
346 0.86
347 0.86
348 0.87
349 0.87
350 0.84
351 0.77
352 0.71
353 0.65
354 0.55
355 0.5
356 0.42
357 0.32
358 0.29
359 0.27
360 0.24
361 0.22
362 0.2
363 0.15
364 0.14
365 0.13
366 0.09
367 0.08
368 0.07
369 0.07
370 0.09
371 0.1
372 0.11
373 0.14
374 0.15
375 0.18
376 0.19
377 0.19
378 0.24
379 0.23
380 0.23
381 0.24
382 0.27
383 0.26
384 0.3
385 0.27
386 0.22
387 0.26
388 0.26
389 0.23
390 0.2
391 0.19
392 0.16
393 0.18
394 0.17
395 0.13
396 0.12
397 0.12
398 0.11
399 0.13
400 0.14
401 0.13
402 0.12
403 0.13
404 0.14
405 0.15
406 0.15
407 0.16
408 0.19
409 0.2
410 0.25
411 0.28
412 0.32
413 0.37
414 0.42
415 0.41
416 0.39
417 0.38
418 0.33
419 0.34
420 0.32
421 0.27
422 0.23
423 0.22
424 0.18
425 0.19
426 0.18
427 0.14
428 0.12
429 0.12
430 0.11
431 0.11
432 0.13
433 0.14
434 0.16
435 0.18
436 0.19
437 0.22
438 0.23
439 0.22
440 0.19
441 0.18
442 0.17
443 0.14
444 0.13
445 0.1
446 0.09
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.11
453 0.12
454 0.16
455 0.18
456 0.22
457 0.24
458 0.26
459 0.26
460 0.23
461 0.22
462 0.2
463 0.19
464 0.16
465 0.15
466 0.14
467 0.13
468 0.13
469 0.12
470 0.1
471 0.08