FuNGI

A0A2S4VLA0

Protein Details

Accession

A0A2S4VLA0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
943-965	LWASRVKQAVQHNKKNRPQPPLT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 10.5, nucl 10, cyto_mito 7.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50878 RT_POL
CDD	cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MSEPTLRPSRIIVLLDVAGVQRKCLIDTGSAIDIITETAMRNSSLIRRDLTRPIKIKLALHESKAEPIFLRHFTLANIHDPRGLNAQPMDSLQDFPQDHLRLSVKRFICYGSDGHTGPLPSGRLCKKNLTEYTDLFPADIPAISEEEEDAGLFTDGSFPKKLQPESSRIRRRIILTDPTAVVNEKQYPYPRKYMVAWRTLLEQHLKAGRIRRSSSQYASPSLIIPKKDPSELPRWVCDYRKLNSVTVRDRSPLPNVDELVRLVASGKVFSILDQTNAFFQTRMREADIPLTAVKTPWGLMEWCVMPMGLTNAPATHQARLEEALGDLLNEICVVYLDDIVVFSDNFHQHETHLRRVLDRLRAANLYCSPKKTKLFQHNVKFLGHWISAEGLRRDNDKVEKIQLWPSPKSAKGVKRFLGTVQWMKKFIYGLQRYVGTLTPLTSSKLDPKDFKWGPDEEKVFQNIKRIMTSLPCLKNIDYDTTDLLWLFTDASGSGLGAALFQGKEWKTASPIAYESHQMTPAERNYLVHEQELLAVIHALQKWKMLLLGMKINVMTDHHSLQYLLKQRNLSRRQARWTELLADFNLRFEYIRGEDNTVADALSRQDSDEDQLHIKPADIACVAALTELSTEISPSVRKKIINGYATDSFCQAIRASSPLRDDCVIVDDLLFIDDRLVIPADADLKKGLIEEAHHRLGHLGYLKTLVELRRDFYWLHMAKDVTGFVRSCATCQRTKAPTTAPTGKMMTPSFPRKVLTDLAIDFVGPLRQAANYDMILTCTCRLSGFTRIIPALQSDTAEKTASRLFNGWMALFGAPASILSDRDKTWTSRFWRALMECLGIKFHMSSAFHPQADGRSERTNKSVGQILRSFTAKRQSKWLELLPAVELALNSAINVATGFSPFELIFGRKPQVFPSSVSTTDSQPSLDKWLKLREGAWAEARNMLWASRVKQAVQHNKKNRPQPPLTPGSWVLLNSADWRGRHQGGVDKLKERFEGPYLVVKVFNNGQSVEIKLPEGDKQHPTLHVSKLKPYHFPQDDSGSIAAD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.24
3	0.22
4	0.18
5	0.19
6	0.18
7	0.17
8	0.18
9	0.18
10	0.19
11	0.21
12	0.22
13	0.18
14	0.21
15	0.25
16	0.23
17	0.22
18	0.21
19	0.18
20	0.16
21	0.13
22	0.11
23	0.08
24	0.07
25	0.08
26	0.1
27	0.1
28	0.11
29	0.13
30	0.19
31	0.24
32	0.27
33	0.28
34	0.32
35	0.37
36	0.46
37	0.51
38	0.54
39	0.54
40	0.54
41	0.58
42	0.58
43	0.58
44	0.55
45	0.57
46	0.52
47	0.5
48	0.53
49	0.47
50	0.5
51	0.46
52	0.4
53	0.31
54	0.31
55	0.32
56	0.28
57	0.31
58	0.25
59	0.25
60	0.25
61	0.3
62	0.28
63	0.32
64	0.34
65	0.3
66	0.34
67	0.34
68	0.36
69	0.36
70	0.34
71	0.29
72	0.26
73	0.27
74	0.23
75	0.23
76	0.25
77	0.2
78	0.21
79	0.18
80	0.24
81	0.23
82	0.24
83	0.32
84	0.29
85	0.28
86	0.31
87	0.36
88	0.33
89	0.37
90	0.43
91	0.36
92	0.37
93	0.38
94	0.34
95	0.32
96	0.3
97	0.28
98	0.25
99	0.27
100	0.26
101	0.26
102	0.26
103	0.24
104	0.22
105	0.24
106	0.2
107	0.17
108	0.25
109	0.3
110	0.34
111	0.37
112	0.45
113	0.47
114	0.55
115	0.6
116	0.59
117	0.57
118	0.55
119	0.55
120	0.5
121	0.44
122	0.35
123	0.28
124	0.22
125	0.18
126	0.15
127	0.11
128	0.09
129	0.1
130	0.1
131	0.1
132	0.09
133	0.09
134	0.09
135	0.08
136	0.07
137	0.07
138	0.06
139	0.06
140	0.06
141	0.11
142	0.12
143	0.15
144	0.16
145	0.16
146	0.23
147	0.3
148	0.32
149	0.36
150	0.41
151	0.47
152	0.56
153	0.66
154	0.7
155	0.67
156	0.69
157	0.65
158	0.63
159	0.61
160	0.58
161	0.56
162	0.49
163	0.5
164	0.46
165	0.41
166	0.38
167	0.33
168	0.27
169	0.21
170	0.23
171	0.2
172	0.24
173	0.31
174	0.38
175	0.41
176	0.48
177	0.47
178	0.45
179	0.48
180	0.54
181	0.53
182	0.53
183	0.49
184	0.43
185	0.45
186	0.43
187	0.42
188	0.36
189	0.29
190	0.27
191	0.29
192	0.3
193	0.29
194	0.36
195	0.39
196	0.41
197	0.44
198	0.46
199	0.49
200	0.53
201	0.54
202	0.54
203	0.51
204	0.48
205	0.46
206	0.4
207	0.34
208	0.35
209	0.35
210	0.29
211	0.28
212	0.31
213	0.31
214	0.33
215	0.34
216	0.33
217	0.37
218	0.44
219	0.45
220	0.43
221	0.45
222	0.46
223	0.47
224	0.49
225	0.47
226	0.42
227	0.46
228	0.45
229	0.44
230	0.47
231	0.51
232	0.49
233	0.48
234	0.47
235	0.41
236	0.42
237	0.41
238	0.4
239	0.38
240	0.35
241	0.34
242	0.33
243	0.32
244	0.3
245	0.27
246	0.23
247	0.18
248	0.14
249	0.11
250	0.11
251	0.1
252	0.09
253	0.09
254	0.09
255	0.09
256	0.09
257	0.13
258	0.12
259	0.13
260	0.14
261	0.14
262	0.14
263	0.16
264	0.16
265	0.12
266	0.12
267	0.16
268	0.18
269	0.2
270	0.22
271	0.22
272	0.23
273	0.27
274	0.27
275	0.23
276	0.2
277	0.19
278	0.16
279	0.14
280	0.14
281	0.09
282	0.09
283	0.08
284	0.09
285	0.08
286	0.09
287	0.12
288	0.12
289	0.11
290	0.11
291	0.1
292	0.09
293	0.08
294	0.11
295	0.08
296	0.08
297	0.08
298	0.08
299	0.09
300	0.15
301	0.16
302	0.15
303	0.16
304	0.16
305	0.17
306	0.18
307	0.18
308	0.13
309	0.12
310	0.1
311	0.09
312	0.08
313	0.07
314	0.06
315	0.05
316	0.04
317	0.04
318	0.03
319	0.03
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.04
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.09
331	0.11
332	0.12
333	0.13
334	0.13
335	0.14
336	0.23
337	0.28
338	0.3
339	0.34
340	0.34
341	0.33
342	0.38
343	0.43
344	0.41
345	0.4
346	0.35
347	0.32
348	0.34
349	0.33
350	0.32
351	0.32
352	0.32
353	0.3
354	0.33
355	0.34
356	0.39
357	0.42
358	0.45
359	0.49
360	0.52
361	0.61
362	0.66
363	0.7
364	0.71
365	0.69
366	0.63
367	0.54
368	0.45
369	0.38
370	0.29
371	0.2
372	0.14
373	0.13
374	0.14
375	0.17
376	0.17
377	0.15
378	0.16
379	0.18
380	0.18
381	0.21
382	0.23
383	0.23
384	0.24
385	0.26
386	0.27
387	0.27
388	0.32
389	0.31
390	0.32
391	0.3
392	0.32
393	0.32
394	0.31
395	0.33
396	0.35
397	0.39
398	0.42
399	0.48
400	0.47
401	0.45
402	0.44
403	0.41
404	0.39
405	0.35
406	0.35
407	0.34
408	0.33
409	0.32
410	0.32
411	0.32
412	0.28
413	0.27
414	0.3
415	0.26
416	0.25
417	0.26
418	0.26
419	0.25
420	0.26
421	0.23
422	0.14
423	0.11
424	0.1
425	0.1
426	0.1
427	0.11
428	0.11
429	0.12
430	0.17
431	0.22
432	0.24
433	0.25
434	0.26
435	0.35
436	0.35
437	0.36
438	0.33
439	0.31
440	0.32
441	0.36
442	0.36
443	0.28
444	0.3
445	0.31
446	0.3
447	0.28
448	0.31
449	0.28
450	0.26
451	0.25
452	0.23
453	0.21
454	0.2
455	0.23
456	0.25
457	0.23
458	0.24
459	0.25
460	0.24
461	0.26
462	0.25
463	0.25
464	0.18
465	0.17
466	0.16
467	0.15
468	0.15
469	0.12
470	0.11
471	0.07
472	0.06
473	0.05
474	0.04
475	0.04
476	0.04
477	0.04
478	0.04
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.03
484	0.03
485	0.04
486	0.04
487	0.04
488	0.08
489	0.08
490	0.1
491	0.11
492	0.11
493	0.13
494	0.16
495	0.17
496	0.14
497	0.15
498	0.14
499	0.15
500	0.16
501	0.16
502	0.14
503	0.15
504	0.13
505	0.13
506	0.16
507	0.16
508	0.17
509	0.15
510	0.15
511	0.17
512	0.21
513	0.2
514	0.16
515	0.16
516	0.13
517	0.14
518	0.14
519	0.1
520	0.06
521	0.05
522	0.05
523	0.07
524	0.08
525	0.08
526	0.07
527	0.08
528	0.08
529	0.08
530	0.08
531	0.06
532	0.07
533	0.09
534	0.12
535	0.12
536	0.12
537	0.12
538	0.11
539	0.11
540	0.1
541	0.11
542	0.1
543	0.1
544	0.1
545	0.11
546	0.11
547	0.12
548	0.16
549	0.2
550	0.21
551	0.23
552	0.26
553	0.3
554	0.4
555	0.44
556	0.48
557	0.5
558	0.53
559	0.57
560	0.58
561	0.57
562	0.5
563	0.46
564	0.42
565	0.34
566	0.31
567	0.24
568	0.22
569	0.18
570	0.16
571	0.14
572	0.09
573	0.08
574	0.07
575	0.1
576	0.09
577	0.12
578	0.12
579	0.14
580	0.15
581	0.15
582	0.15
583	0.12
584	0.11
585	0.08
586	0.07
587	0.06
588	0.07
589	0.07
590	0.06
591	0.07
592	0.07
593	0.1
594	0.11
595	0.12
596	0.12
597	0.13
598	0.14
599	0.13
600	0.13
601	0.13
602	0.11
603	0.11
604	0.1
605	0.1
606	0.08
607	0.08
608	0.08
609	0.05
610	0.05
611	0.03
612	0.03
613	0.03
614	0.04
615	0.04
616	0.04
617	0.04
618	0.06
619	0.08
620	0.1
621	0.14
622	0.17
623	0.17
624	0.19
625	0.27
626	0.34
627	0.35
628	0.35
629	0.35
630	0.38
631	0.38
632	0.37
633	0.29
634	0.22
635	0.18
636	0.18
637	0.13
638	0.08
639	0.08
640	0.11
641	0.11
642	0.13
643	0.17
644	0.17
645	0.18
646	0.18
647	0.18
648	0.15
649	0.17
650	0.15
651	0.11
652	0.1
653	0.09
654	0.08
655	0.08
656	0.08
657	0.04
658	0.04
659	0.04
660	0.04
661	0.05
662	0.06
663	0.05
664	0.05
665	0.06
666	0.11
667	0.11
668	0.11
669	0.11
670	0.1
671	0.11
672	0.11
673	0.1
674	0.06
675	0.08
676	0.13
677	0.19
678	0.22
679	0.22
680	0.22
681	0.22
682	0.21
683	0.22
684	0.21
685	0.15
686	0.12
687	0.14
688	0.14
689	0.14
690	0.16
691	0.15
692	0.17
693	0.17
694	0.19
695	0.18
696	0.2
697	0.2
698	0.19
699	0.27
700	0.23
701	0.24
702	0.26
703	0.25
704	0.23
705	0.24
706	0.23
707	0.14
708	0.15
709	0.14
710	0.11
711	0.16
712	0.16
713	0.16
714	0.23
715	0.26
716	0.27
717	0.3
718	0.37
719	0.37
720	0.39
721	0.42
722	0.4
723	0.41
724	0.45
725	0.5
726	0.44
727	0.42
728	0.42
729	0.39
730	0.38
731	0.33
732	0.29
733	0.28
734	0.33
735	0.33
736	0.32
737	0.33
738	0.3
739	0.32
740	0.31
741	0.26
742	0.23
743	0.21
744	0.21
745	0.19
746	0.18
747	0.14
748	0.12
749	0.11
750	0.07
751	0.07
752	0.06
753	0.06
754	0.07
755	0.09
756	0.11
757	0.1
758	0.12
759	0.12
760	0.13
761	0.13
762	0.13
763	0.12
764	0.1
765	0.1
766	0.09
767	0.11
768	0.13
769	0.19
770	0.22
771	0.22
772	0.25
773	0.25
774	0.26
775	0.24
776	0.22
777	0.18
778	0.15
779	0.14
780	0.13
781	0.15
782	0.16
783	0.16
784	0.14
785	0.14
786	0.18
787	0.18
788	0.18
789	0.18
790	0.17
791	0.2
792	0.21
793	0.19
794	0.14
795	0.15
796	0.13
797	0.11
798	0.1
799	0.07
800	0.05
801	0.05
802	0.06
803	0.06
804	0.07
805	0.1
806	0.12
807	0.13
808	0.16
809	0.19
810	0.21
811	0.24
812	0.31
813	0.35
814	0.42
815	0.44
816	0.43
817	0.48
818	0.46
819	0.46
820	0.41
821	0.38
822	0.29
823	0.27
824	0.26
825	0.19
826	0.18
827	0.14
828	0.12
829	0.14
830	0.14
831	0.16
832	0.25
833	0.3
834	0.29
835	0.29
836	0.29
837	0.28
838	0.32
839	0.32
840	0.26
841	0.3
842	0.34
843	0.36
844	0.38
845	0.37
846	0.34
847	0.34
848	0.38
849	0.31
850	0.34
851	0.35
852	0.33
853	0.33
854	0.35
855	0.33
856	0.3
857	0.39
858	0.38
859	0.37
860	0.45
861	0.47
862	0.5
863	0.54
864	0.55
865	0.51
866	0.45
867	0.45
868	0.36
869	0.31
870	0.25
871	0.2
872	0.15
873	0.09
874	0.09
875	0.08
876	0.07
877	0.07
878	0.06
879	0.06
880	0.06
881	0.06
882	0.05
883	0.06
884	0.07
885	0.06
886	0.08
887	0.08
888	0.09
889	0.11
890	0.13
891	0.15
892	0.19
893	0.24
894	0.24
895	0.25
896	0.28
897	0.32
898	0.32
899	0.32
900	0.34
901	0.35
902	0.34
903	0.36
904	0.34
905	0.3
906	0.31
907	0.29
908	0.23
909	0.19
910	0.19
911	0.25
912	0.28
913	0.29
914	0.31
915	0.39
916	0.41
917	0.41
918	0.41
919	0.41
920	0.4
921	0.4
922	0.42
923	0.37
924	0.35
925	0.37
926	0.36
927	0.3
928	0.26
929	0.23
930	0.21
931	0.22
932	0.24
933	0.27
934	0.29
935	0.28
936	0.33
937	0.44
938	0.5
939	0.57
940	0.65
941	0.68
942	0.76
943	0.83
944	0.87
945	0.84
946	0.83
947	0.8
948	0.78
949	0.77
950	0.75
951	0.68
952	0.64
953	0.58
954	0.51
955	0.45
956	0.36
957	0.28
958	0.22
959	0.21
960	0.18
961	0.22
962	0.23
963	0.22
964	0.26
965	0.32
966	0.32
967	0.32
968	0.33
969	0.36
970	0.41
971	0.51
972	0.51
973	0.5
974	0.52
975	0.53
976	0.52
977	0.45
978	0.39
979	0.33
980	0.32
981	0.29
982	0.35
983	0.34
984	0.33
985	0.35
986	0.31
987	0.32
988	0.32
989	0.33
990	0.26
991	0.24
992	0.25
993	0.24
994	0.27
995	0.25
996	0.22
997	0.2
998	0.19
999	0.2
1000	0.22
1001	0.25
1002	0.28
1003	0.3
1004	0.33
1005	0.36
1006	0.39
1007	0.43
1008	0.44
1009	0.48
1010	0.51
1011	0.49
1012	0.54
1013	0.58
1014	0.58
1015	0.6
1016	0.6
1017	0.62
1018	0.59
1019	0.6
1020	0.57
1021	0.56
1022	0.53
1023	0.48

A0A2S4VLA0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer