Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J4HXV6

Protein Details
Accession J4HXV6    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
535-562CSVPVMVARRRLKRPPRRSAHLAPHRARHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
321-324RRRK
543-558RRRLKRPPRRSAHLAP
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR006016  UspA  
Pfam View protein in Pfam  
PF00582  Usp  
CDD cd00293  USP_Like  
Amino Acid Sequences MSDVQPPPHPRKRSWIGKYGAGPKDPQPTPSLPTPREGYEQSFEYPFGSSATASSSTATLTGALSRSNSLTSIASLLPSRLAPPAPLKRSSTTNLLIKDDPDSQNALSRTVSTQSNSSKTGDTNVTRPPSGSFSRMTLSSMMGGLSSLSLSRSTAADERGRSEKKSKDKGTGVRSSSYSGASPEDQDATRGRTRSQSPFRLRRTRTRDPSPAVEALTASDIESDTDSVQIRPRNAFTLSSASVDESGDETEDDDDDDDSWSDEDAFDPVTESNTERNALIPADLDHDVVDVPDPLGEGVNVVVPPEPYFPSTLNGGARNPRRRKSMKPDALPLSTSRPEFQRDRCTITLCHGHPQRDLDENGRRGRRYVLASDLSDESRYALEWGIGTVLRDGDEMLIVTVIENENKIDPPVPNPTDRTAKLRSQQERQALAYILVRQATSLLQRTRLNVTIACQAWHAKNRRHMLLDIVDYFEPSMLIVGSRGLGNLKGSAPPPPLRNPPRIYIPLSDPGELPRISISAHRPQALTLRACLQKCSVPVMVARRRLKRPPRRSAHLAPHRARVSLAQAAGVDRMAPKVDQDVEDMRTQIEQQDDDRQTVGQTDVDDDADTEVEVDQIGRNVSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.74
3 0.69
4 0.7
5 0.75
6 0.74
7 0.7
8 0.61
9 0.56
10 0.52
11 0.58
12 0.51
13 0.46
14 0.42
15 0.39
16 0.42
17 0.48
18 0.52
19 0.43
20 0.47
21 0.49
22 0.46
23 0.48
24 0.46
25 0.42
26 0.38
27 0.39
28 0.36
29 0.34
30 0.31
31 0.27
32 0.25
33 0.2
34 0.16
35 0.14
36 0.11
37 0.1
38 0.14
39 0.14
40 0.13
41 0.14
42 0.13
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.09
47 0.08
48 0.1
49 0.1
50 0.11
51 0.12
52 0.13
53 0.14
54 0.14
55 0.14
56 0.14
57 0.13
58 0.13
59 0.15
60 0.13
61 0.14
62 0.13
63 0.13
64 0.13
65 0.13
66 0.13
67 0.13
68 0.14
69 0.15
70 0.24
71 0.33
72 0.37
73 0.41
74 0.44
75 0.45
76 0.49
77 0.5
78 0.48
79 0.44
80 0.45
81 0.44
82 0.44
83 0.42
84 0.37
85 0.37
86 0.37
87 0.32
88 0.28
89 0.28
90 0.24
91 0.29
92 0.29
93 0.27
94 0.2
95 0.2
96 0.2
97 0.21
98 0.22
99 0.18
100 0.23
101 0.27
102 0.3
103 0.31
104 0.31
105 0.3
106 0.28
107 0.31
108 0.32
109 0.29
110 0.29
111 0.34
112 0.36
113 0.34
114 0.34
115 0.32
116 0.31
117 0.31
118 0.3
119 0.25
120 0.23
121 0.25
122 0.25
123 0.24
124 0.2
125 0.17
126 0.15
127 0.14
128 0.11
129 0.09
130 0.08
131 0.07
132 0.06
133 0.05
134 0.04
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.1
141 0.12
142 0.16
143 0.2
144 0.21
145 0.25
146 0.32
147 0.34
148 0.35
149 0.4
150 0.43
151 0.49
152 0.58
153 0.59
154 0.59
155 0.65
156 0.69
157 0.7
158 0.71
159 0.63
160 0.56
161 0.53
162 0.47
163 0.4
164 0.33
165 0.25
166 0.18
167 0.18
168 0.15
169 0.16
170 0.14
171 0.15
172 0.14
173 0.16
174 0.16
175 0.19
176 0.22
177 0.22
178 0.22
179 0.26
180 0.31
181 0.39
182 0.46
183 0.51
184 0.57
185 0.66
186 0.73
187 0.77
188 0.77
189 0.78
190 0.78
191 0.79
192 0.78
193 0.77
194 0.76
195 0.7
196 0.7
197 0.64
198 0.57
199 0.46
200 0.38
201 0.29
202 0.21
203 0.18
204 0.13
205 0.08
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.08
214 0.09
215 0.13
216 0.15
217 0.17
218 0.19
219 0.2
220 0.21
221 0.21
222 0.21
223 0.19
224 0.21
225 0.2
226 0.19
227 0.18
228 0.16
229 0.15
230 0.14
231 0.12
232 0.08
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.05
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.07
258 0.08
259 0.09
260 0.1
261 0.11
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.09
267 0.08
268 0.07
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.03
282 0.04
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.05
290 0.05
291 0.06
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.09
296 0.09
297 0.1
298 0.11
299 0.13
300 0.13
301 0.13
302 0.14
303 0.2
304 0.27
305 0.35
306 0.4
307 0.42
308 0.49
309 0.53
310 0.6
311 0.63
312 0.67
313 0.66
314 0.64
315 0.67
316 0.62
317 0.59
318 0.51
319 0.42
320 0.36
321 0.3
322 0.27
323 0.21
324 0.19
325 0.22
326 0.25
327 0.29
328 0.33
329 0.33
330 0.39
331 0.39
332 0.39
333 0.35
334 0.35
335 0.38
336 0.29
337 0.35
338 0.33
339 0.33
340 0.32
341 0.34
342 0.32
343 0.29
344 0.3
345 0.27
346 0.31
347 0.34
348 0.39
349 0.4
350 0.38
351 0.35
352 0.36
353 0.35
354 0.31
355 0.28
356 0.27
357 0.26
358 0.26
359 0.27
360 0.26
361 0.22
362 0.19
363 0.17
364 0.12
365 0.09
366 0.09
367 0.08
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.06
392 0.07
393 0.07
394 0.08
395 0.09
396 0.1
397 0.13
398 0.21
399 0.23
400 0.24
401 0.26
402 0.3
403 0.34
404 0.35
405 0.38
406 0.35
407 0.38
408 0.43
409 0.5
410 0.52
411 0.52
412 0.57
413 0.58
414 0.56
415 0.52
416 0.47
417 0.38
418 0.34
419 0.29
420 0.24
421 0.18
422 0.15
423 0.14
424 0.11
425 0.12
426 0.12
427 0.13
428 0.18
429 0.18
430 0.22
431 0.24
432 0.27
433 0.3
434 0.31
435 0.3
436 0.24
437 0.25
438 0.27
439 0.26
440 0.24
441 0.21
442 0.22
443 0.24
444 0.32
445 0.37
446 0.36
447 0.44
448 0.5
449 0.53
450 0.53
451 0.49
452 0.47
453 0.44
454 0.41
455 0.33
456 0.3
457 0.25
458 0.22
459 0.22
460 0.16
461 0.11
462 0.07
463 0.07
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.06
471 0.06
472 0.07
473 0.08
474 0.1
475 0.1
476 0.12
477 0.13
478 0.17
479 0.22
480 0.25
481 0.29
482 0.33
483 0.43
484 0.46
485 0.55
486 0.54
487 0.54
488 0.57
489 0.58
490 0.55
491 0.48
492 0.47
493 0.47
494 0.45
495 0.42
496 0.34
497 0.32
498 0.33
499 0.29
500 0.24
501 0.16
502 0.14
503 0.14
504 0.19
505 0.23
506 0.27
507 0.31
508 0.33
509 0.32
510 0.33
511 0.39
512 0.41
513 0.37
514 0.3
515 0.33
516 0.37
517 0.37
518 0.38
519 0.34
520 0.31
521 0.31
522 0.34
523 0.28
524 0.24
525 0.28
526 0.36
527 0.41
528 0.46
529 0.53
530 0.56
531 0.62
532 0.7
533 0.77
534 0.78
535 0.82
536 0.83
537 0.85
538 0.86
539 0.87
540 0.87
541 0.87
542 0.86
543 0.86
544 0.79
545 0.79
546 0.71
547 0.63
548 0.54
549 0.46
550 0.41
551 0.36
552 0.32
553 0.24
554 0.23
555 0.23
556 0.23
557 0.2
558 0.15
559 0.1
560 0.11
561 0.12
562 0.11
563 0.11
564 0.16
565 0.19
566 0.18
567 0.22
568 0.25
569 0.26
570 0.28
571 0.28
572 0.23
573 0.21
574 0.21
575 0.2
576 0.2
577 0.19
578 0.2
579 0.29
580 0.31
581 0.31
582 0.31
583 0.28
584 0.25
585 0.25
586 0.24
587 0.16
588 0.14
589 0.15
590 0.16
591 0.16
592 0.16
593 0.14
594 0.14
595 0.12
596 0.11
597 0.09
598 0.08
599 0.07
600 0.07
601 0.07
602 0.07
603 0.09