Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J4IAN9

Protein Details
Accession J4IAN9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
57-83SVENLLRKKSRKQTRTEKKGARYFQQDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
62-75LRKKSRKQTRTEKK
Subcellular Location(s) mito 10, nucl 9.5, cyto_nucl 7.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045116  Clp1/Grc3  
IPR032319  CLP1_P  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0051731  F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF16575  CLP1_P  
Amino Acid Sequences MLSAVAARKARLEGKNLPVDVLPKSSPTALAQPSPPPEPVASIGSSKTSSKRKPSESVENLLRKKSRKQTRTEKKGARYFQQDEFRKQEDLILIDDSEDDEDDDESQDDLSVDGEVFDYSGLTSQNAAVAASTGRNKRAWSPSEPLQDSSSEEEDEVSNGDEAGLGALPFRQGRAPPESPILLSTFQPILNQNMFHLTTEETRALCLTHLSSNSNATLLIMVPSETLTLVGVYSLTVIYGSVSLSGAILSASAISYRVFAPRSAPLPVIQCLTSGASTLCGETSAIPPRAHTAAAQSAALIVLQELYTGVEGLERVCRTFDGIFAPTGWRRGEPSALNLQGAHMASLSAHGLSPLLILPSWRTAFDAVLSNIPENSLEFDYSRRVYLVKGPRNSGKSTFARTLINKLTHRYRRVAFLECDPGQSEFTPGGLIALNIIDKPVFGPPFTHPSIPHAAHYIGATSPRSCPTHYLECIKALVQTYNIDIQHAALLSNEGTESADDRIADVIPLVVNTMGWTKGLGADLAWKIEQMVEPSDIFKFENSEEEWFSADFSGSSLSRGREPHRARLHFLNPAVSTELSKRYTASDHRNMSILSYLHATFPSDASTDPLGNTTATSWNTALPLCAHLPYEVDCRTAFDDIVLTGPGMEDIVLSELHHVLNGAIVGLVEYEPGTFENEVRNDSSTPSSTFPYSQGAPPPPPSISTCRGLALLRSLSPSSLVLHLLTPIPPLLLSSSRTLVKGELELPVWGMLDFRTMDSGDVAGIEAGKVPFLKWGKSEGVGGERRRVRRNLMRRNQM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.57
3 0.55
4 0.52
5 0.45
6 0.43
7 0.38
8 0.35
9 0.27
10 0.21
11 0.23
12 0.23
13 0.23
14 0.23
15 0.29
16 0.27
17 0.31
18 0.32
19 0.36
20 0.39
21 0.4
22 0.38
23 0.33
24 0.3
25 0.29
26 0.29
27 0.27
28 0.24
29 0.23
30 0.23
31 0.23
32 0.25
33 0.25
34 0.3
35 0.36
36 0.42
37 0.51
38 0.59
39 0.63
40 0.7
41 0.75
42 0.78
43 0.75
44 0.75
45 0.74
46 0.74
47 0.71
48 0.7
49 0.68
50 0.62
51 0.65
52 0.67
53 0.69
54 0.68
55 0.74
56 0.78
57 0.83
58 0.89
59 0.9
60 0.89
61 0.88
62 0.89
63 0.85
64 0.82
65 0.8
66 0.74
67 0.71
68 0.72
69 0.69
70 0.66
71 0.67
72 0.62
73 0.54
74 0.49
75 0.45
76 0.38
77 0.33
78 0.28
79 0.23
80 0.19
81 0.18
82 0.18
83 0.14
84 0.11
85 0.1
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.09
91 0.09
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.04
107 0.06
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.11
119 0.17
120 0.18
121 0.21
122 0.23
123 0.25
124 0.32
125 0.4
126 0.42
127 0.42
128 0.45
129 0.51
130 0.58
131 0.59
132 0.54
133 0.46
134 0.42
135 0.38
136 0.36
137 0.3
138 0.21
139 0.18
140 0.17
141 0.16
142 0.15
143 0.13
144 0.1
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.1
159 0.11
160 0.16
161 0.24
162 0.26
163 0.27
164 0.31
165 0.31
166 0.29
167 0.29
168 0.27
169 0.2
170 0.18
171 0.18
172 0.16
173 0.15
174 0.16
175 0.17
176 0.19
177 0.2
178 0.2
179 0.17
180 0.2
181 0.2
182 0.19
183 0.19
184 0.15
185 0.15
186 0.18
187 0.2
188 0.15
189 0.15
190 0.15
191 0.14
192 0.12
193 0.12
194 0.11
195 0.12
196 0.14
197 0.16
198 0.16
199 0.18
200 0.18
201 0.17
202 0.15
203 0.11
204 0.1
205 0.08
206 0.08
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.03
220 0.04
221 0.04
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.06
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.13
248 0.16
249 0.18
250 0.19
251 0.19
252 0.19
253 0.21
254 0.22
255 0.21
256 0.17
257 0.15
258 0.14
259 0.14
260 0.12
261 0.1
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.07
267 0.06
268 0.07
269 0.07
270 0.11
271 0.15
272 0.19
273 0.19
274 0.19
275 0.21
276 0.22
277 0.21
278 0.18
279 0.15
280 0.15
281 0.16
282 0.16
283 0.13
284 0.12
285 0.11
286 0.11
287 0.07
288 0.04
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.03
298 0.04
299 0.05
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.11
306 0.11
307 0.12
308 0.11
309 0.12
310 0.12
311 0.12
312 0.15
313 0.14
314 0.16
315 0.16
316 0.13
317 0.14
318 0.15
319 0.18
320 0.16
321 0.2
322 0.23
323 0.23
324 0.23
325 0.2
326 0.19
327 0.18
328 0.17
329 0.13
330 0.07
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.05
346 0.08
347 0.09
348 0.09
349 0.09
350 0.1
351 0.1
352 0.11
353 0.13
354 0.1
355 0.12
356 0.12
357 0.11
358 0.11
359 0.11
360 0.09
361 0.07
362 0.08
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.08
367 0.11
368 0.12
369 0.12
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.18
374 0.26
375 0.3
376 0.32
377 0.35
378 0.4
379 0.42
380 0.44
381 0.38
382 0.36
383 0.31
384 0.33
385 0.32
386 0.29
387 0.3
388 0.28
389 0.31
390 0.28
391 0.31
392 0.28
393 0.3
394 0.37
395 0.4
396 0.42
397 0.42
398 0.38
399 0.4
400 0.41
401 0.43
402 0.35
403 0.32
404 0.35
405 0.31
406 0.31
407 0.25
408 0.23
409 0.19
410 0.17
411 0.15
412 0.08
413 0.08
414 0.07
415 0.06
416 0.06
417 0.05
418 0.05
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.03
425 0.03
426 0.04
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.1
431 0.12
432 0.18
433 0.19
434 0.2
435 0.18
436 0.21
437 0.27
438 0.26
439 0.24
440 0.21
441 0.19
442 0.18
443 0.18
444 0.15
445 0.09
446 0.1
447 0.11
448 0.09
449 0.11
450 0.14
451 0.15
452 0.15
453 0.18
454 0.22
455 0.28
456 0.3
457 0.33
458 0.31
459 0.3
460 0.31
461 0.28
462 0.24
463 0.17
464 0.15
465 0.12
466 0.11
467 0.11
468 0.15
469 0.14
470 0.13
471 0.12
472 0.11
473 0.11
474 0.11
475 0.09
476 0.05
477 0.06
478 0.05
479 0.06
480 0.05
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.06
485 0.06
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.08
490 0.07
491 0.07
492 0.06
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.05
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.06
501 0.05
502 0.05
503 0.06
504 0.05
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.06
509 0.1
510 0.11
511 0.12
512 0.11
513 0.1
514 0.1
515 0.11
516 0.12
517 0.09
518 0.1
519 0.11
520 0.11
521 0.12
522 0.12
523 0.12
524 0.12
525 0.1
526 0.1
527 0.09
528 0.12
529 0.13
530 0.15
531 0.15
532 0.15
533 0.16
534 0.14
535 0.14
536 0.11
537 0.1
538 0.07
539 0.06
540 0.08
541 0.07
542 0.09
543 0.11
544 0.12
545 0.16
546 0.19
547 0.23
548 0.31
549 0.35
550 0.43
551 0.5
552 0.52
553 0.53
554 0.57
555 0.58
556 0.54
557 0.51
558 0.46
559 0.36
560 0.35
561 0.33
562 0.25
563 0.22
564 0.19
565 0.24
566 0.21
567 0.21
568 0.2
569 0.2
570 0.24
571 0.3
572 0.36
573 0.39
574 0.41
575 0.42
576 0.43
577 0.41
578 0.37
579 0.34
580 0.25
581 0.17
582 0.16
583 0.15
584 0.14
585 0.15
586 0.15
587 0.11
588 0.12
589 0.12
590 0.1
591 0.1
592 0.12
593 0.14
594 0.13
595 0.12
596 0.13
597 0.12
598 0.12
599 0.12
600 0.1
601 0.13
602 0.13
603 0.15
604 0.15
605 0.15
606 0.16
607 0.16
608 0.15
609 0.11
610 0.14
611 0.12
612 0.13
613 0.13
614 0.12
615 0.13
616 0.15
617 0.2
618 0.18
619 0.18
620 0.17
621 0.19
622 0.21
623 0.21
624 0.18
625 0.13
626 0.13
627 0.11
628 0.12
629 0.1
630 0.08
631 0.06
632 0.06
633 0.06
634 0.05
635 0.05
636 0.03
637 0.04
638 0.05
639 0.05
640 0.05
641 0.07
642 0.08
643 0.08
644 0.08
645 0.08
646 0.06
647 0.07
648 0.07
649 0.06
650 0.05
651 0.05
652 0.05
653 0.05
654 0.05
655 0.04
656 0.04
657 0.04
658 0.05
659 0.06
660 0.08
661 0.08
662 0.09
663 0.15
664 0.17
665 0.19
666 0.2
667 0.22
668 0.21
669 0.23
670 0.26
671 0.22
672 0.23
673 0.23
674 0.24
675 0.23
676 0.24
677 0.24
678 0.24
679 0.24
680 0.25
681 0.3
682 0.33
683 0.35
684 0.37
685 0.39
686 0.35
687 0.35
688 0.36
689 0.36
690 0.36
691 0.35
692 0.33
693 0.3
694 0.31
695 0.29
696 0.27
697 0.26
698 0.24
699 0.21
700 0.24
701 0.23
702 0.21
703 0.22
704 0.21
705 0.17
706 0.16
707 0.16
708 0.13
709 0.13
710 0.14
711 0.14
712 0.14
713 0.13
714 0.11
715 0.11
716 0.1
717 0.1
718 0.12
719 0.14
720 0.16
721 0.18
722 0.22
723 0.23
724 0.24
725 0.25
726 0.22
727 0.22
728 0.22
729 0.2
730 0.19
731 0.18
732 0.18
733 0.18
734 0.16
735 0.15
736 0.12
737 0.11
738 0.08
739 0.1
740 0.11
741 0.1
742 0.12
743 0.12
744 0.13
745 0.13
746 0.13
747 0.1
748 0.09
749 0.09
750 0.07
751 0.07
752 0.06
753 0.08
754 0.08
755 0.1
756 0.1
757 0.1
758 0.17
759 0.2
760 0.23
761 0.22
762 0.27
763 0.3
764 0.31
765 0.34
766 0.29
767 0.35
768 0.4
769 0.41
770 0.45
771 0.49
772 0.54
773 0.6
774 0.61
775 0.62
776 0.66
777 0.74
778 0.76