Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J4G0S1

Protein Details
Accession J4G0S1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-68AAWKTKIDRDPQRTPHFRSRTHydrophilic
419-441LSPISTPRTPRRREENTRLGNPPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045030  LYSM1-4  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF01476  LysM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51782  LYSM  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MPSHNGTQDYPEHVLSNPWTAHSDSSFSSAVNTNATRPAVRRRGSEGAAWKTKIDRDPQRTPHFRSRTLDVDLDDGAGSHPLASGSAPKKGFIGGWFSAHNTRPHMKRLLSDVELASDGQSTDAAVGRSEAGRTSQRTDERLVVVHEVMPKDSLAGVALKYGVSMPDLRRANQLWPSDPIHLRKVLYIPLEIARHSKQLQAAFLDVDSPTNPTESRQSAPHGGDSDEEAKDTGKDRSLPPLNIVRVPVSQLSFFPPSSSSSVTPREPSIPSKSHTLPRRPKSSHPTLPRSLSGSESSLIHPPTSAPPSSTTHSLSPISRSQNRSLGSLFNVIPPRISPIHKNVFVGRLSIDSVSATTSTQSDDLEWGHEMEDVSFASSAGKSLQGSDIHRRYESHLHNLSASASNKPSTLPEGLELNALSPISTPRTPRRREENTRLGNPPEPLRSPRQDSPYAALDSGRLPSLPNTRVRTAQMEPSPAMQLPLSPKRRKSSDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.27
3 0.3
4 0.24
5 0.23
6 0.25
7 0.25
8 0.27
9 0.25
10 0.25
11 0.2
12 0.24
13 0.22
14 0.2
15 0.21
16 0.21
17 0.21
18 0.23
19 0.23
20 0.2
21 0.25
22 0.27
23 0.26
24 0.28
25 0.37
26 0.41
27 0.45
28 0.46
29 0.49
30 0.54
31 0.54
32 0.57
33 0.55
34 0.55
35 0.57
36 0.55
37 0.49
38 0.45
39 0.49
40 0.48
41 0.48
42 0.5
43 0.52
44 0.61
45 0.69
46 0.76
47 0.78
48 0.81
49 0.82
50 0.78
51 0.76
52 0.71
53 0.67
54 0.62
55 0.59
56 0.53
57 0.43
58 0.38
59 0.32
60 0.28
61 0.21
62 0.16
63 0.12
64 0.09
65 0.08
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.06
70 0.06
71 0.14
72 0.16
73 0.22
74 0.23
75 0.23
76 0.23
77 0.24
78 0.25
79 0.19
80 0.24
81 0.18
82 0.2
83 0.21
84 0.23
85 0.27
86 0.29
87 0.3
88 0.29
89 0.35
90 0.36
91 0.42
92 0.45
93 0.43
94 0.42
95 0.45
96 0.46
97 0.41
98 0.4
99 0.34
100 0.29
101 0.27
102 0.24
103 0.18
104 0.12
105 0.1
106 0.07
107 0.07
108 0.05
109 0.06
110 0.08
111 0.08
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.11
119 0.15
120 0.18
121 0.21
122 0.27
123 0.3
124 0.32
125 0.35
126 0.35
127 0.32
128 0.31
129 0.28
130 0.23
131 0.2
132 0.2
133 0.2
134 0.17
135 0.16
136 0.15
137 0.13
138 0.12
139 0.12
140 0.09
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.1
152 0.1
153 0.18
154 0.2
155 0.21
156 0.25
157 0.26
158 0.29
159 0.32
160 0.33
161 0.27
162 0.3
163 0.31
164 0.32
165 0.35
166 0.34
167 0.31
168 0.31
169 0.29
170 0.27
171 0.26
172 0.24
173 0.22
174 0.19
175 0.17
176 0.18
177 0.18
178 0.17
179 0.19
180 0.17
181 0.19
182 0.19
183 0.2
184 0.2
185 0.21
186 0.22
187 0.2
188 0.19
189 0.16
190 0.15
191 0.13
192 0.1
193 0.09
194 0.07
195 0.08
196 0.07
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.13
201 0.15
202 0.16
203 0.16
204 0.19
205 0.23
206 0.23
207 0.24
208 0.21
209 0.19
210 0.17
211 0.18
212 0.18
213 0.13
214 0.13
215 0.11
216 0.1
217 0.1
218 0.12
219 0.11
220 0.1
221 0.12
222 0.13
223 0.21
224 0.25
225 0.24
226 0.26
227 0.3
228 0.3
229 0.29
230 0.29
231 0.22
232 0.18
233 0.19
234 0.17
235 0.12
236 0.11
237 0.1
238 0.13
239 0.14
240 0.13
241 0.13
242 0.12
243 0.14
244 0.16
245 0.17
246 0.15
247 0.17
248 0.21
249 0.21
250 0.22
251 0.21
252 0.21
253 0.21
254 0.24
255 0.26
256 0.25
257 0.26
258 0.3
259 0.32
260 0.36
261 0.42
262 0.48
263 0.52
264 0.56
265 0.64
266 0.63
267 0.67
268 0.69
269 0.71
270 0.7
271 0.68
272 0.68
273 0.63
274 0.62
275 0.56
276 0.5
277 0.41
278 0.34
279 0.27
280 0.21
281 0.18
282 0.16
283 0.16
284 0.16
285 0.16
286 0.14
287 0.12
288 0.12
289 0.15
290 0.17
291 0.16
292 0.14
293 0.17
294 0.2
295 0.23
296 0.25
297 0.23
298 0.21
299 0.24
300 0.25
301 0.22
302 0.23
303 0.26
304 0.3
305 0.34
306 0.37
307 0.38
308 0.41
309 0.42
310 0.39
311 0.35
312 0.3
313 0.26
314 0.26
315 0.22
316 0.21
317 0.23
318 0.21
319 0.2
320 0.18
321 0.21
322 0.2
323 0.22
324 0.22
325 0.27
326 0.35
327 0.37
328 0.38
329 0.36
330 0.37
331 0.36
332 0.32
333 0.24
334 0.17
335 0.17
336 0.15
337 0.13
338 0.09
339 0.09
340 0.08
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.08
349 0.09
350 0.1
351 0.11
352 0.11
353 0.1
354 0.1
355 0.11
356 0.1
357 0.09
358 0.1
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.07
367 0.09
368 0.08
369 0.1
370 0.14
371 0.16
372 0.2
373 0.3
374 0.34
375 0.35
376 0.36
377 0.36
378 0.38
379 0.44
380 0.44
381 0.44
382 0.43
383 0.42
384 0.41
385 0.41
386 0.38
387 0.34
388 0.31
389 0.25
390 0.23
391 0.22
392 0.22
393 0.22
394 0.22
395 0.2
396 0.2
397 0.18
398 0.18
399 0.19
400 0.19
401 0.2
402 0.18
403 0.14
404 0.13
405 0.12
406 0.1
407 0.09
408 0.11
409 0.14
410 0.17
411 0.23
412 0.32
413 0.42
414 0.48
415 0.56
416 0.64
417 0.69
418 0.77
419 0.81
420 0.82
421 0.81
422 0.82
423 0.79
424 0.73
425 0.67
426 0.6
427 0.55
428 0.5
429 0.45
430 0.44
431 0.48
432 0.51
433 0.54
434 0.57
435 0.59
436 0.59
437 0.57
438 0.57
439 0.55
440 0.49
441 0.42
442 0.35
443 0.3
444 0.26
445 0.24
446 0.2
447 0.13
448 0.13
449 0.18
450 0.26
451 0.3
452 0.37
453 0.41
454 0.44
455 0.48
456 0.5
457 0.5
458 0.46
459 0.5
460 0.47
461 0.46
462 0.43
463 0.42
464 0.41
465 0.35
466 0.33
467 0.23
468 0.23
469 0.27
470 0.36
471 0.43
472 0.48
473 0.55
474 0.63