Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J7RS63

Protein Details
Accession J7RS63    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
148-178DGSNEGNKRKNKPKKNEKSRRGRYYIRRNKLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
154-171NKRKNKPKKNEKSRRGRY
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 14, cyto 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034247  Rrt5_RRM2  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
CDD cd12410  RRM2_RRT5  
Amino Acid Sequences MLRFRSNVVPKEPVKESNRVFVDNLHYYTGEQEFYEFLKDYGAKSVFIPYEMNWSFRNEYPRSLGFAVAECEDVEVARALIATLQDFQYKGRSLKLAWHVPFVPKGKWATPKDKKQIGAPVEPVLEVSQSPVNDNSISTTLSGADVADGSNEGNKRKNKPKKNEKSRRGRYYIRRNKLADDTLYAHILPEGTEDPNLREFFKGFGPTEIWVFQRYEKRHCLPYPKGPFISALVTLPDYKGKLDEAIEQLREKELFGEKVVFKPATISKLEEVKRIAKKEALEKEGRRLLAQCQAEEEVAQVTDVAVSGEMPETGADLVEPVRNGGTDHSVQEVGTQQANEGMPTQTVKPIEETMKAEVANSPIQVAGTTRPDRAFHQDIQRPDY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.57
3 0.54
4 0.54
5 0.55
6 0.51
7 0.47
8 0.43
9 0.45
10 0.41
11 0.4
12 0.33
13 0.3
14 0.27
15 0.3
16 0.28
17 0.21
18 0.15
19 0.14
20 0.14
21 0.14
22 0.17
23 0.14
24 0.12
25 0.16
26 0.17
27 0.17
28 0.24
29 0.24
30 0.22
31 0.22
32 0.28
33 0.24
34 0.24
35 0.25
36 0.17
37 0.26
38 0.26
39 0.28
40 0.23
41 0.28
42 0.3
43 0.32
44 0.4
45 0.32
46 0.35
47 0.38
48 0.38
49 0.39
50 0.36
51 0.33
52 0.26
53 0.25
54 0.24
55 0.19
56 0.17
57 0.12
58 0.11
59 0.1
60 0.09
61 0.08
62 0.07
63 0.06
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.06
68 0.07
69 0.07
70 0.08
71 0.09
72 0.1
73 0.11
74 0.12
75 0.16
76 0.19
77 0.19
78 0.21
79 0.22
80 0.21
81 0.29
82 0.37
83 0.4
84 0.38
85 0.41
86 0.39
87 0.4
88 0.46
89 0.41
90 0.34
91 0.29
92 0.32
93 0.33
94 0.4
95 0.44
96 0.49
97 0.55
98 0.64
99 0.69
100 0.72
101 0.68
102 0.63
103 0.66
104 0.59
105 0.54
106 0.46
107 0.39
108 0.34
109 0.32
110 0.27
111 0.19
112 0.14
113 0.1
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.11
118 0.11
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.12
123 0.11
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.07
138 0.09
139 0.1
140 0.17
141 0.22
142 0.3
143 0.4
144 0.51
145 0.58
146 0.68
147 0.78
148 0.82
149 0.89
150 0.93
151 0.92
152 0.93
153 0.93
154 0.91
155 0.86
156 0.84
157 0.83
158 0.83
159 0.83
160 0.79
161 0.76
162 0.69
163 0.65
164 0.61
165 0.53
166 0.43
167 0.35
168 0.31
169 0.25
170 0.24
171 0.2
172 0.15
173 0.13
174 0.12
175 0.08
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.08
181 0.09
182 0.13
183 0.13
184 0.13
185 0.12
186 0.12
187 0.13
188 0.14
189 0.16
190 0.13
191 0.13
192 0.14
193 0.14
194 0.14
195 0.14
196 0.13
197 0.12
198 0.12
199 0.15
200 0.22
201 0.24
202 0.29
203 0.34
204 0.37
205 0.42
206 0.45
207 0.49
208 0.48
209 0.55
210 0.57
211 0.55
212 0.52
213 0.46
214 0.43
215 0.36
216 0.32
217 0.23
218 0.15
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.11
223 0.11
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.1
229 0.11
230 0.14
231 0.16
232 0.19
233 0.2
234 0.2
235 0.2
236 0.2
237 0.19
238 0.15
239 0.14
240 0.14
241 0.14
242 0.14
243 0.19
244 0.18
245 0.2
246 0.24
247 0.21
248 0.18
249 0.2
250 0.22
251 0.21
252 0.21
253 0.22
254 0.21
255 0.29
256 0.3
257 0.3
258 0.31
259 0.35
260 0.4
261 0.4
262 0.4
263 0.36
264 0.38
265 0.43
266 0.47
267 0.45
268 0.47
269 0.46
270 0.51
271 0.53
272 0.5
273 0.42
274 0.36
275 0.33
276 0.34
277 0.34
278 0.26
279 0.24
280 0.25
281 0.23
282 0.22
283 0.19
284 0.12
285 0.1
286 0.09
287 0.07
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.04
303 0.05
304 0.06
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.09
310 0.1
311 0.11
312 0.15
313 0.15
314 0.16
315 0.18
316 0.18
317 0.18
318 0.19
319 0.2
320 0.17
321 0.18
322 0.17
323 0.14
324 0.18
325 0.18
326 0.17
327 0.16
328 0.14
329 0.13
330 0.16
331 0.17
332 0.17
333 0.19
334 0.19
335 0.2
336 0.24
337 0.26
338 0.29
339 0.3
340 0.29
341 0.31
342 0.3
343 0.28
344 0.25
345 0.26
346 0.24
347 0.21
348 0.18
349 0.15
350 0.15
351 0.15
352 0.14
353 0.16
354 0.22
355 0.24
356 0.28
357 0.3
358 0.32
359 0.36
360 0.43
361 0.44
362 0.42
363 0.5
364 0.52