Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J7S3T9

Protein Details
Accession J7S3T9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
211-235IQIPLTKKRAPHKIAKNKKRRNVFDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
217-231KKRAPHKIAKNKKRR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019447  DNA/RNA-bd_Kin17_WH-like_dom  
IPR037321  KIN17-like  
IPR038254  KIN17_WH-like_sf  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10357  Kin17_mid  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MSDYTSAKFISKQLKAKGLQKLRFYCQVCHKQCRDSNGFQSHIKSPSHLKRISQVTQADIDQYTSAFQQAFLKLLRVSHGEKPVEVNKFYNEYIQDKDHVHMNATRFTSLTKFVQHLGTTGEVRVQGLEDGGGVEGTTSVYISYVDRSSANTVLKQQLQDLEAHERRDQTVKQLLLQRQIARGKQNSTDSETSADTTQEDPASTRQLPPTIQIPLTKKRAPHKIAKNKKRRNVFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.59
3 0.64
4 0.68
5 0.69
6 0.68
7 0.69
8 0.69
9 0.66
10 0.7
11 0.65
12 0.62
13 0.63
14 0.67
15 0.66
16 0.69
17 0.68
18 0.68
19 0.69
20 0.71
21 0.68
22 0.64
23 0.66
24 0.62
25 0.62
26 0.55
27 0.55
28 0.51
29 0.48
30 0.41
31 0.35
32 0.37
33 0.43
34 0.49
35 0.47
36 0.44
37 0.47
38 0.54
39 0.55
40 0.53
41 0.45
42 0.39
43 0.38
44 0.37
45 0.31
46 0.23
47 0.2
48 0.14
49 0.12
50 0.1
51 0.08
52 0.09
53 0.07
54 0.08
55 0.11
56 0.11
57 0.13
58 0.13
59 0.15
60 0.14
61 0.14
62 0.16
63 0.16
64 0.19
65 0.22
66 0.28
67 0.27
68 0.27
69 0.3
70 0.34
71 0.34
72 0.31
73 0.27
74 0.22
75 0.25
76 0.25
77 0.23
78 0.2
79 0.19
80 0.2
81 0.2
82 0.21
83 0.19
84 0.2
85 0.21
86 0.19
87 0.18
88 0.18
89 0.19
90 0.21
91 0.21
92 0.2
93 0.16
94 0.16
95 0.16
96 0.16
97 0.16
98 0.13
99 0.13
100 0.14
101 0.16
102 0.15
103 0.14
104 0.13
105 0.13
106 0.11
107 0.1
108 0.1
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.04
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.04
129 0.04
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.08
134 0.09
135 0.12
136 0.15
137 0.16
138 0.15
139 0.18
140 0.21
141 0.23
142 0.22
143 0.21
144 0.2
145 0.19
146 0.19
147 0.19
148 0.24
149 0.25
150 0.27
151 0.28
152 0.26
153 0.27
154 0.31
155 0.29
156 0.26
157 0.3
158 0.29
159 0.32
160 0.38
161 0.4
162 0.41
163 0.46
164 0.41
165 0.41
166 0.45
167 0.44
168 0.44
169 0.45
170 0.42
171 0.43
172 0.47
173 0.43
174 0.45
175 0.43
176 0.37
177 0.35
178 0.33
179 0.29
180 0.24
181 0.21
182 0.15
183 0.15
184 0.16
185 0.14
186 0.13
187 0.13
188 0.15
189 0.21
190 0.2
191 0.23
192 0.24
193 0.26
194 0.27
195 0.28
196 0.3
197 0.29
198 0.3
199 0.33
200 0.36
201 0.41
202 0.48
203 0.48
204 0.5
205 0.55
206 0.63
207 0.63
208 0.68
209 0.7
210 0.74
211 0.82
212 0.87
213 0.89
214 0.89
215 0.92