Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J7SA69

Protein Details
Accession J7SA69    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-67SNASTSPKQQFKRFQKKPGMFAARRHydrophilic
86-116RNGKANRGSNNNNRKKKKARGKYKESEGFRVHydrophilic
302-360AGSIAGNNKNKKKKKKKTKTDKDASTGAGLSKTDTKNKKKKPKKSKLLNAKRTERNNAQHydrophilic
373-415LEDAGKRELQKRKSLQKKKETEQKKSMKKLVPQSKKQPRMDVGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
81-109KAKGPRNGKANRGSNNNNRKKKKARGKYK
280-293LAKKKKAEAAVKRK
308-353NNKNKKKKKKKTKTDKDASTGAGLSKTDTKNKKKKPKKSKLLNAKR
378-408KRELQKRKSLQKKKETEQKKSMKKLVPQSKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MEGQDAQPTGNGSTTPKRDNREQESTTKVKNGLRNPQAFEDISNASTSPKQQFKRFQKKPGMFAARRNKAAESSQDESVTKAKGPRNGKANRGSNNNNRKKKKARGKYKESEGFRVVMRLLPPNLTFEELCTTLKTEITSDFVSVYRISDIYYVQGHYSVKAFNEPIFSRCYFHFDDMENLKAFVMKLQGIMLVDDRDNAVKPTIKLTPYAKKLSDTNPNGFGKSKTFVLEGSLEETKLFKNFMKSLKYIEKTQEAGDEGSLFNLLDGSISLLKPLEKELAKKKKAEAAVKRKTENALTELAGSIAGNNKNKKKKKKKTKTDKDASTGAGLSKTDTKNKKKKPKKSKLLNAKRTERNNAQDSTDKKNNNIVILEDAGKRELQKRKSLQKKKETEQKKSMKKLVPQSKKQPRMDVGTLSRYSISSQPFVPSTTKPEN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.39
3 0.44
4 0.49
5 0.57
6 0.66
7 0.7
8 0.71
9 0.69
10 0.67
11 0.69
12 0.68
13 0.63
14 0.58
15 0.55
16 0.51
17 0.54
18 0.56
19 0.58
20 0.62
21 0.64
22 0.64
23 0.62
24 0.61
25 0.53
26 0.46
27 0.4
28 0.32
29 0.27
30 0.23
31 0.19
32 0.17
33 0.19
34 0.22
35 0.26
36 0.32
37 0.38
38 0.45
39 0.56
40 0.65
41 0.75
42 0.78
43 0.8
44 0.83
45 0.84
46 0.81
47 0.81
48 0.8
49 0.72
50 0.74
51 0.75
52 0.72
53 0.7
54 0.65
55 0.56
56 0.49
57 0.5
58 0.47
59 0.43
60 0.39
61 0.37
62 0.37
63 0.36
64 0.34
65 0.33
66 0.26
67 0.22
68 0.25
69 0.27
70 0.33
71 0.38
72 0.43
73 0.5
74 0.54
75 0.59
76 0.62
77 0.66
78 0.65
79 0.67
80 0.7
81 0.7
82 0.76
83 0.78
84 0.79
85 0.78
86 0.81
87 0.82
88 0.84
89 0.85
90 0.85
91 0.86
92 0.86
93 0.9
94 0.9
95 0.91
96 0.89
97 0.82
98 0.77
99 0.67
100 0.58
101 0.48
102 0.4
103 0.3
104 0.24
105 0.22
106 0.2
107 0.19
108 0.2
109 0.2
110 0.21
111 0.21
112 0.21
113 0.19
114 0.15
115 0.18
116 0.16
117 0.17
118 0.14
119 0.15
120 0.13
121 0.14
122 0.14
123 0.12
124 0.11
125 0.14
126 0.14
127 0.12
128 0.13
129 0.12
130 0.13
131 0.12
132 0.12
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.1
140 0.1
141 0.09
142 0.12
143 0.12
144 0.11
145 0.12
146 0.12
147 0.11
148 0.13
149 0.13
150 0.12
151 0.17
152 0.17
153 0.17
154 0.2
155 0.21
156 0.2
157 0.2
158 0.24
159 0.21
160 0.22
161 0.23
162 0.19
163 0.24
164 0.24
165 0.27
166 0.21
167 0.19
168 0.17
169 0.16
170 0.15
171 0.1
172 0.1
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.09
177 0.08
178 0.09
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.1
189 0.1
190 0.13
191 0.16
192 0.16
193 0.19
194 0.23
195 0.29
196 0.32
197 0.36
198 0.33
199 0.31
200 0.34
201 0.35
202 0.4
203 0.37
204 0.34
205 0.37
206 0.37
207 0.36
208 0.35
209 0.31
210 0.23
211 0.21
212 0.19
213 0.14
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.14
218 0.12
219 0.13
220 0.12
221 0.11
222 0.11
223 0.12
224 0.1
225 0.09
226 0.11
227 0.09
228 0.12
229 0.17
230 0.22
231 0.25
232 0.26
233 0.3
234 0.37
235 0.38
236 0.37
237 0.36
238 0.35
239 0.32
240 0.31
241 0.28
242 0.21
243 0.19
244 0.16
245 0.14
246 0.1
247 0.09
248 0.09
249 0.06
250 0.05
251 0.05
252 0.04
253 0.03
254 0.03
255 0.05
256 0.06
257 0.06
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.09
263 0.13
264 0.13
265 0.19
266 0.29
267 0.39
268 0.43
269 0.45
270 0.46
271 0.47
272 0.53
273 0.57
274 0.57
275 0.57
276 0.63
277 0.66
278 0.65
279 0.61
280 0.57
281 0.5
282 0.43
283 0.34
284 0.27
285 0.22
286 0.21
287 0.19
288 0.16
289 0.13
290 0.1
291 0.08
292 0.11
293 0.14
294 0.19
295 0.26
296 0.34
297 0.44
298 0.54
299 0.65
300 0.71
301 0.78
302 0.85
303 0.9
304 0.93
305 0.94
306 0.97
307 0.97
308 0.96
309 0.92
310 0.85
311 0.78
312 0.68
313 0.58
314 0.47
315 0.37
316 0.28
317 0.2
318 0.16
319 0.2
320 0.22
321 0.28
322 0.37
323 0.47
324 0.56
325 0.67
326 0.76
327 0.79
328 0.88
329 0.91
330 0.93
331 0.93
332 0.94
333 0.94
334 0.95
335 0.95
336 0.95
337 0.93
338 0.91
339 0.89
340 0.84
341 0.82
342 0.78
343 0.75
344 0.71
345 0.63
346 0.58
347 0.56
348 0.53
349 0.54
350 0.54
351 0.47
352 0.43
353 0.48
354 0.46
355 0.42
356 0.39
357 0.32
358 0.27
359 0.27
360 0.28
361 0.23
362 0.22
363 0.2
364 0.2
365 0.21
366 0.26
367 0.33
368 0.35
369 0.44
370 0.52
371 0.62
372 0.72
373 0.8
374 0.83
375 0.85
376 0.89
377 0.89
378 0.9
379 0.89
380 0.88
381 0.88
382 0.88
383 0.87
384 0.87
385 0.87
386 0.84
387 0.82
388 0.83
389 0.83
390 0.83
391 0.83
392 0.85
393 0.87
394 0.89
395 0.87
396 0.85
397 0.8
398 0.78
399 0.72
400 0.7
401 0.65
402 0.63
403 0.57
404 0.5
405 0.45
406 0.37
407 0.35
408 0.32
409 0.3
410 0.25
411 0.25
412 0.28
413 0.28
414 0.31
415 0.32
416 0.29