FuNGI

A0A2T0FM35

Protein Details

Accession

A0A2T0FM35

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
200-220	GEKPKKSGPFRRKKTYQAQGG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
202-213	KPKKSGPFRRKK

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MTGKRKFESSDPLRRSTQRRIPPGVLNRSTQVGSGASTFIAGPAGGPGGSGGISQQPFSSQPSTAAPGFVAGAPTEINANQNYVPMAQPQIGQGEPMVGIQGPSSSSLPDAPGEKYDEFPLRCCTIDDVRDSRYHMIKFHSRSKIDPATQFTPPIRFHRKDPKLLQVTVGDEVSAGAEGSNPGSVDGENGAASSQGGENGEKPKKSGPFRRKKTYQAQGGDEASEAARKLRYEEHYPWVMEDFDNKNTWVSSYEAGQSDTYVVFVFDRDGFKMIPIEKFYRLNQRSKFATLSLDEAEEKMGKRNSNIPRWIMDKLQTERGAAGPGAEAIAAGHQRRRLRTVEGSEERTNRRSGLEEEMDFDEEFADDDGAPIMDGPEEDLKEVEDRIKREQRQANALDADDNDLDALFEDGEDQIDRNGKKLRKYLRALEKNAYYDSGDDENPYLSEEEADSEPEIKPDPDAASTSAGNGQTPLVVLPFRRKVIKNRLPGMAVIQLPPRILKTFPVGELNPGVKPYDGVDRKAVSVANSASASSTNLAALNKTSKSDEDGLLQADDVRKCLMDQRPTIKELLSTLRQKLFQHPDNQARLKRILREIATLQDGRLVLTS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.68
2	0.69
3	0.69
4	0.7
5	0.69
6	0.72
7	0.74
8	0.73
9	0.75
10	0.78
11	0.77
12	0.71
13	0.64
14	0.58
15	0.53
16	0.48
17	0.39
18	0.31
19	0.21
20	0.19
21	0.17
22	0.15
23	0.11
24	0.12
25	0.11
26	0.09
27	0.09
28	0.07
29	0.06
30	0.06
31	0.07
32	0.06
33	0.06
34	0.06
35	0.06
36	0.06
37	0.06
38	0.06
39	0.11
40	0.12
41	0.13
42	0.13
43	0.14
44	0.16
45	0.21
46	0.23
47	0.17
48	0.2
49	0.23
50	0.27
51	0.25
52	0.24
53	0.19
54	0.17
55	0.18
56	0.16
57	0.13
58	0.09
59	0.09
60	0.08
61	0.09
62	0.09
63	0.09
64	0.11
65	0.11
66	0.13
67	0.13
68	0.14
69	0.14
70	0.14
71	0.14
72	0.14
73	0.15
74	0.14
75	0.15
76	0.15
77	0.17
78	0.16
79	0.15
80	0.13
81	0.12
82	0.11
83	0.1
84	0.1
85	0.06
86	0.07
87	0.06
88	0.07
89	0.06
90	0.08
91	0.09
92	0.09
93	0.1
94	0.1
95	0.12
96	0.13
97	0.14
98	0.14
99	0.15
100	0.2
101	0.2
102	0.2
103	0.24
104	0.29
105	0.27
106	0.29
107	0.31
108	0.29
109	0.28
110	0.28
111	0.28
112	0.27
113	0.3
114	0.34
115	0.32
116	0.33
117	0.35
118	0.37
119	0.37
120	0.37
121	0.35
122	0.31
123	0.34
124	0.39
125	0.43
126	0.5
127	0.53
128	0.49
129	0.5
130	0.56
131	0.58
132	0.55
133	0.54
134	0.51
135	0.46
136	0.46
137	0.47
138	0.41
139	0.39
140	0.37
141	0.41
142	0.43
143	0.42
144	0.48
145	0.55
146	0.61
147	0.64
148	0.65
149	0.67
150	0.64
151	0.63
152	0.58
153	0.49
154	0.44
155	0.36
156	0.31
157	0.2
158	0.14
159	0.13
160	0.1
161	0.07
162	0.05
163	0.03
164	0.04
165	0.04
166	0.05
167	0.05
168	0.05
169	0.05
170	0.06
171	0.06
172	0.06
173	0.07
174	0.07
175	0.06
176	0.06
177	0.06
178	0.05
179	0.05
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.06
184	0.07
185	0.1
186	0.18
187	0.22
188	0.21
189	0.23
190	0.27
191	0.34
192	0.41
193	0.49
194	0.53
195	0.6
196	0.69
197	0.77
198	0.78
199	0.79
200	0.81
201	0.8
202	0.78
203	0.72
204	0.67
205	0.6
206	0.55
207	0.46
208	0.36
209	0.27
210	0.18
211	0.14
212	0.1
213	0.08
214	0.08
215	0.08
216	0.1
217	0.16
218	0.2
219	0.26
220	0.29
221	0.34
222	0.36
223	0.36
224	0.34
225	0.29
226	0.26
227	0.19
228	0.2
229	0.18
230	0.17
231	0.18
232	0.17
233	0.17
234	0.16
235	0.16
236	0.13
237	0.12
238	0.1
239	0.11
240	0.13
241	0.13
242	0.14
243	0.14
244	0.12
245	0.11
246	0.11
247	0.09
248	0.07
249	0.06
250	0.05
251	0.05
252	0.06
253	0.07
254	0.08
255	0.08
256	0.1
257	0.1
258	0.1
259	0.13
260	0.13
261	0.13
262	0.16
263	0.18
264	0.19
265	0.21
266	0.23
267	0.31
268	0.34
269	0.39
270	0.39
271	0.42
272	0.41
273	0.41
274	0.4
275	0.3
276	0.28
277	0.21
278	0.21
279	0.16
280	0.14
281	0.12
282	0.11
283	0.11
284	0.1
285	0.1
286	0.12
287	0.14
288	0.14
289	0.15
290	0.23
291	0.29
292	0.35
293	0.38
294	0.36
295	0.35
296	0.38
297	0.38
298	0.31
299	0.29
300	0.28
301	0.27
302	0.31
303	0.3
304	0.27
305	0.26
306	0.25
307	0.21
308	0.14
309	0.12
310	0.06
311	0.06
312	0.05
313	0.04
314	0.04
315	0.03
316	0.04
317	0.06
318	0.06
319	0.08
320	0.12
321	0.16
322	0.17
323	0.21
324	0.22
325	0.26
326	0.31
327	0.33
328	0.39
329	0.4
330	0.44
331	0.44
332	0.46
333	0.44
334	0.41
335	0.37
336	0.29
337	0.25
338	0.22
339	0.21
340	0.23
341	0.23
342	0.21
343	0.23
344	0.23
345	0.23
346	0.2
347	0.18
348	0.12
349	0.08
350	0.08
351	0.06
352	0.06
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.03
361	0.03
362	0.05
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.08
368	0.09
369	0.09
370	0.13
371	0.15
372	0.17
373	0.25
374	0.33
375	0.36
376	0.44
377	0.49
378	0.48
379	0.53
380	0.53
381	0.49
382	0.42
383	0.39
384	0.31
385	0.26
386	0.24
387	0.16
388	0.13
389	0.09
390	0.07
391	0.07
392	0.06
393	0.06
394	0.03
395	0.03
396	0.04
397	0.04
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.06
402	0.12
403	0.12
404	0.15
405	0.23
406	0.26
407	0.31
408	0.39
409	0.46
410	0.51
411	0.56
412	0.63
413	0.66
414	0.72
415	0.71
416	0.69
417	0.64
418	0.57
419	0.52
420	0.44
421	0.33
422	0.24
423	0.23
424	0.19
425	0.15
426	0.14
427	0.14
428	0.13
429	0.12
430	0.13
431	0.1
432	0.08
433	0.08
434	0.07
435	0.1
436	0.09
437	0.11
438	0.1
439	0.11
440	0.11
441	0.12
442	0.13
443	0.1
444	0.1
445	0.12
446	0.13
447	0.12
448	0.14
449	0.14
450	0.16
451	0.15
452	0.16
453	0.17
454	0.16
455	0.15
456	0.14
457	0.12
458	0.1
459	0.1
460	0.09
461	0.07
462	0.08
463	0.09
464	0.16
465	0.21
466	0.24
467	0.31
468	0.35
469	0.44
470	0.54
471	0.62
472	0.63
473	0.63
474	0.65
475	0.59
476	0.55
477	0.49
478	0.43
479	0.35
480	0.28
481	0.25
482	0.22
483	0.21
484	0.22
485	0.21
486	0.17
487	0.17
488	0.18
489	0.21
490	0.23
491	0.24
492	0.29
493	0.27
494	0.28
495	0.32
496	0.31
497	0.26
498	0.24
499	0.22
500	0.16
501	0.17
502	0.16
503	0.22
504	0.24
505	0.26
506	0.3
507	0.3
508	0.31
509	0.33
510	0.32
511	0.23
512	0.24
513	0.22
514	0.2
515	0.19
516	0.18
517	0.17
518	0.16
519	0.16
520	0.12
521	0.12
522	0.1
523	0.12
524	0.12
525	0.12
526	0.15
527	0.19
528	0.19
529	0.21
530	0.22
531	0.21
532	0.26
533	0.29
534	0.27
535	0.26
536	0.27
537	0.26
538	0.24
539	0.23
540	0.21
541	0.22
542	0.21
543	0.19
544	0.17
545	0.16
546	0.16
547	0.24
548	0.3
549	0.33
550	0.4
551	0.47
552	0.51
553	0.53
554	0.54
555	0.47
556	0.41
557	0.36
558	0.36
559	0.36
560	0.37
561	0.4
562	0.44
563	0.47
564	0.48
565	0.54
566	0.56
567	0.55
568	0.58
569	0.61
570	0.66
571	0.71
572	0.77
573	0.72
574	0.68
575	0.69
576	0.66
577	0.64
578	0.62
579	0.61
580	0.55
581	0.56
582	0.53
583	0.51
584	0.52
585	0.45
586	0.38
587	0.34
588	0.31

A0A2T0FM35

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer