Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T0FDJ5

Protein Details
Accession A0A2T0FDJ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
245-273AGAPKSKAPPPRKKDWKRGRRSENPLLEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
247-265APKSKAPPPRKKDWKRGRR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR033133  PUM-HD  
IPR033712  Pumilio_RNA-bd  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0017148  P:negative regulation of translation  
GO:0065008  P:regulation of biological quality  
Pfam View protein in Pfam  
PF00806  PUF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
PS50303  PUM_HD  
CDD cd07920  Pumilio  
Amino Acid Sequences MSSNPQSQAEYTNQMTTEIPAAIPLSRGIWASPSPVRSPFASEASLAYPATYDSVASSAADYEAYRSGGIAWGSATSASGRRSSHALTEPEGSHRSLSRGDTDFPRRSSLNGRVGTKQSSAPFLSSLSFHPQPKNNFLGPSISLLDQFSNLADATRQTELAHRLENVHVSDVPSKYQTTTSSSSSKSTSPVSSESRLWNGAWKPQDLAPAPVAPAQMASPAPVAPPSVVSPAPHPVAASVVPPLAGAPKSKAPPPRKKDWKRGRRSENPLLEELRSRNHPLRIEDMLGQVLEVSTDQHGSRFIQEQLSQATPEVRQRFFEETEPHRLQLMTDVFGNYVIQQLFELGTPAQRSTMVKQMSTRVLSLSLQMYGCRVVQMAIRHSSEAEQVSLVDELRTHVVRCIKDHNGNHVIQKAIECVAPKHVQFIYKDLMNHTLELSRHTYGCRVVQRILEFGDAETRHKLVIELKALIDRLVEDQYGNYVVQHIVDHGPAEDRDWVLERLVPRLVVLSTHKYASNVIEKCFLRGTPRQRSAMITAILENDIYGVPSVVTMIRDQYANYVVQKMLDNATADDRRRLVAAIKPHIATIKRNFYGKHLAAIEKLLHE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.28
3 0.25
4 0.23
5 0.18
6 0.15
7 0.13
8 0.14
9 0.13
10 0.13
11 0.12
12 0.11
13 0.12
14 0.12
15 0.12
16 0.14
17 0.15
18 0.19
19 0.23
20 0.26
21 0.28
22 0.31
23 0.33
24 0.31
25 0.36
26 0.35
27 0.34
28 0.31
29 0.29
30 0.27
31 0.26
32 0.27
33 0.2
34 0.16
35 0.13
36 0.12
37 0.12
38 0.11
39 0.09
40 0.07
41 0.08
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.08
46 0.08
47 0.09
48 0.08
49 0.09
50 0.11
51 0.12
52 0.11
53 0.1
54 0.11
55 0.13
56 0.13
57 0.11
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.12
65 0.13
66 0.17
67 0.17
68 0.19
69 0.23
70 0.24
71 0.29
72 0.32
73 0.33
74 0.31
75 0.35
76 0.35
77 0.36
78 0.36
79 0.31
80 0.26
81 0.25
82 0.25
83 0.23
84 0.24
85 0.25
86 0.26
87 0.29
88 0.35
89 0.42
90 0.46
91 0.44
92 0.46
93 0.41
94 0.41
95 0.45
96 0.46
97 0.46
98 0.46
99 0.47
100 0.48
101 0.51
102 0.51
103 0.46
104 0.41
105 0.34
106 0.33
107 0.3
108 0.26
109 0.24
110 0.22
111 0.2
112 0.17
113 0.18
114 0.21
115 0.25
116 0.27
117 0.32
118 0.38
119 0.42
120 0.47
121 0.5
122 0.45
123 0.41
124 0.39
125 0.36
126 0.31
127 0.29
128 0.24
129 0.19
130 0.18
131 0.17
132 0.16
133 0.13
134 0.12
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.08
141 0.1
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.15
146 0.19
147 0.21
148 0.22
149 0.19
150 0.21
151 0.22
152 0.24
153 0.21
154 0.19
155 0.17
156 0.17
157 0.21
158 0.2
159 0.2
160 0.19
161 0.19
162 0.18
163 0.19
164 0.19
165 0.2
166 0.23
167 0.25
168 0.28
169 0.29
170 0.3
171 0.29
172 0.28
173 0.25
174 0.25
175 0.22
176 0.2
177 0.24
178 0.26
179 0.27
180 0.29
181 0.29
182 0.29
183 0.29
184 0.26
185 0.28
186 0.25
187 0.28
188 0.28
189 0.26
190 0.25
191 0.25
192 0.31
193 0.25
194 0.26
195 0.22
196 0.2
197 0.2
198 0.2
199 0.18
200 0.12
201 0.12
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.06
212 0.07
213 0.08
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.12
218 0.15
219 0.16
220 0.15
221 0.14
222 0.11
223 0.12
224 0.12
225 0.11
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.09
235 0.14
236 0.15
237 0.2
238 0.29
239 0.37
240 0.46
241 0.52
242 0.61
243 0.68
244 0.75
245 0.82
246 0.85
247 0.86
248 0.86
249 0.9
250 0.89
251 0.87
252 0.88
253 0.86
254 0.82
255 0.74
256 0.66
257 0.57
258 0.48
259 0.41
260 0.32
261 0.25
262 0.21
263 0.22
264 0.23
265 0.25
266 0.28
267 0.27
268 0.3
269 0.29
270 0.28
271 0.26
272 0.22
273 0.19
274 0.15
275 0.13
276 0.08
277 0.07
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.03
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.07
286 0.07
287 0.09
288 0.11
289 0.11
290 0.12
291 0.13
292 0.14
293 0.16
294 0.16
295 0.14
296 0.12
297 0.13
298 0.12
299 0.17
300 0.19
301 0.17
302 0.18
303 0.21
304 0.24
305 0.24
306 0.27
307 0.27
308 0.27
309 0.36
310 0.35
311 0.33
312 0.3
313 0.28
314 0.24
315 0.24
316 0.22
317 0.13
318 0.13
319 0.13
320 0.12
321 0.12
322 0.12
323 0.07
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.06
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.08
332 0.05
333 0.07
334 0.07
335 0.08
336 0.08
337 0.09
338 0.1
339 0.12
340 0.19
341 0.18
342 0.19
343 0.2
344 0.24
345 0.26
346 0.26
347 0.24
348 0.18
349 0.18
350 0.17
351 0.17
352 0.14
353 0.12
354 0.11
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.08
360 0.08
361 0.07
362 0.09
363 0.12
364 0.16
365 0.18
366 0.19
367 0.19
368 0.19
369 0.19
370 0.19
371 0.17
372 0.14
373 0.1
374 0.09
375 0.1
376 0.1
377 0.09
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.09
382 0.1
383 0.09
384 0.12
385 0.18
386 0.19
387 0.21
388 0.27
389 0.3
390 0.38
391 0.4
392 0.44
393 0.45
394 0.45
395 0.45
396 0.42
397 0.36
398 0.29
399 0.27
400 0.2
401 0.15
402 0.15
403 0.13
404 0.11
405 0.17
406 0.19
407 0.19
408 0.21
409 0.22
410 0.24
411 0.24
412 0.27
413 0.25
414 0.24
415 0.25
416 0.23
417 0.27
418 0.24
419 0.24
420 0.2
421 0.2
422 0.18
423 0.21
424 0.22
425 0.18
426 0.18
427 0.19
428 0.2
429 0.19
430 0.25
431 0.28
432 0.27
433 0.28
434 0.32
435 0.32
436 0.32
437 0.3
438 0.25
439 0.2
440 0.17
441 0.21
442 0.18
443 0.19
444 0.19
445 0.18
446 0.16
447 0.16
448 0.17
449 0.16
450 0.21
451 0.22
452 0.22
453 0.22
454 0.24
455 0.24
456 0.23
457 0.18
458 0.13
459 0.12
460 0.12
461 0.11
462 0.09
463 0.09
464 0.11
465 0.12
466 0.11
467 0.09
468 0.09
469 0.09
470 0.09
471 0.09
472 0.1
473 0.1
474 0.1
475 0.1
476 0.09
477 0.12
478 0.11
479 0.13
480 0.13
481 0.12
482 0.13
483 0.16
484 0.16
485 0.14
486 0.17
487 0.17
488 0.17
489 0.19
490 0.17
491 0.14
492 0.15
493 0.14
494 0.15
495 0.19
496 0.22
497 0.23
498 0.25
499 0.25
500 0.24
501 0.26
502 0.28
503 0.32
504 0.28
505 0.28
506 0.35
507 0.34
508 0.36
509 0.36
510 0.32
511 0.29
512 0.35
513 0.43
514 0.46
515 0.53
516 0.54
517 0.54
518 0.57
519 0.54
520 0.52
521 0.44
522 0.34
523 0.29
524 0.27
525 0.25
526 0.21
527 0.16
528 0.11
529 0.09
530 0.08
531 0.07
532 0.06
533 0.06
534 0.06
535 0.07
536 0.07
537 0.08
538 0.09
539 0.11
540 0.12
541 0.13
542 0.13
543 0.15
544 0.17
545 0.19
546 0.2
547 0.2
548 0.19
549 0.21
550 0.22
551 0.21
552 0.21
553 0.21
554 0.2
555 0.19
556 0.27
557 0.31
558 0.31
559 0.34
560 0.32
561 0.31
562 0.3
563 0.3
564 0.26
565 0.26
566 0.34
567 0.37
568 0.4
569 0.39
570 0.4
571 0.45
572 0.43
573 0.46
574 0.46
575 0.48
576 0.47
577 0.51
578 0.51
579 0.51
580 0.59
581 0.52
582 0.5
583 0.44
584 0.42
585 0.4
586 0.42