Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T0FGA6

Protein Details
Accession A0A2T0FGA6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
164-189QQQSKERGGRGRPKKQNKPAARTNSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
168-183KERGGRGRPKKQNKPA
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 12.5, cyto 10, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025742  CSTF2_hinge  
IPR026896  CSTF_C  
IPR038192  CSTF_C_sf  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0031124  P:mRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF14327  CSTF2_hinge  
PF14304  CSTF_C  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSKTIYVGRIPFDYTEEQVRSIFQSAGPIQDIRFVFDKETGKSKGFAFVEYFDAEAAASAVRNLDNHKVGNMKLKVDFSNEGGSAARPGQSAFEYIAMFVNEMSPDEKRQLITDFKGFTVNSRTQALELLQQSPQIAYALVQAMIETGKIDQKIADTLLPAGPQQQSKERGGRGRPKKQNKPAARTNSSRQNTPQPPVPVAPAAPAAAAPPSEAMETAASHPTPQNPEETAMIRQVMALTDSQVAGLPPDQRQMVLDIKAKVQRGDIRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.29
3 0.28
4 0.27
5 0.26
6 0.26
7 0.24
8 0.23
9 0.22
10 0.15
11 0.2
12 0.2
13 0.22
14 0.23
15 0.21
16 0.19
17 0.25
18 0.25
19 0.21
20 0.24
21 0.22
22 0.21
23 0.27
24 0.3
25 0.26
26 0.33
27 0.33
28 0.31
29 0.33
30 0.32
31 0.34
32 0.31
33 0.3
34 0.25
35 0.24
36 0.25
37 0.23
38 0.22
39 0.14
40 0.13
41 0.11
42 0.09
43 0.07
44 0.05
45 0.04
46 0.04
47 0.05
48 0.05
49 0.07
50 0.09
51 0.14
52 0.17
53 0.17
54 0.19
55 0.21
56 0.22
57 0.3
58 0.3
59 0.27
60 0.27
61 0.29
62 0.28
63 0.29
64 0.3
65 0.22
66 0.23
67 0.21
68 0.19
69 0.17
70 0.16
71 0.14
72 0.13
73 0.12
74 0.08
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.09
80 0.11
81 0.1
82 0.1
83 0.11
84 0.09
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.06
89 0.06
90 0.07
91 0.07
92 0.08
93 0.1
94 0.11
95 0.11
96 0.12
97 0.15
98 0.17
99 0.18
100 0.2
101 0.2
102 0.19
103 0.21
104 0.2
105 0.18
106 0.21
107 0.2
108 0.19
109 0.19
110 0.19
111 0.17
112 0.18
113 0.17
114 0.16
115 0.15
116 0.14
117 0.13
118 0.13
119 0.13
120 0.12
121 0.11
122 0.07
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.04
134 0.04
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.08
141 0.09
142 0.08
143 0.07
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.08
148 0.09
149 0.11
150 0.12
151 0.14
152 0.19
153 0.23
154 0.26
155 0.31
156 0.33
157 0.37
158 0.43
159 0.52
160 0.56
161 0.62
162 0.69
163 0.75
164 0.81
165 0.85
166 0.88
167 0.87
168 0.85
169 0.83
170 0.83
171 0.79
172 0.73
173 0.7
174 0.7
175 0.63
176 0.59
177 0.53
178 0.53
179 0.52
180 0.5
181 0.51
182 0.43
183 0.44
184 0.42
185 0.4
186 0.31
187 0.26
188 0.24
189 0.18
190 0.14
191 0.12
192 0.1
193 0.09
194 0.08
195 0.08
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.09
204 0.11
205 0.14
206 0.13
207 0.14
208 0.16
209 0.19
210 0.22
211 0.22
212 0.24
213 0.22
214 0.25
215 0.26
216 0.27
217 0.25
218 0.23
219 0.23
220 0.19
221 0.17
222 0.15
223 0.13
224 0.12
225 0.1
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.09
232 0.1
233 0.12
234 0.14
235 0.14
236 0.18
237 0.18
238 0.18
239 0.19
240 0.22
241 0.24
242 0.27
243 0.31
244 0.29
245 0.34
246 0.39
247 0.41
248 0.38
249 0.39