Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J7S5W6

Protein Details
Accession J7S5W6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
162-186ASSAAAKKPRKPRQSKKTPVHTPAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
167-178AKKPRKPRQSKK
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020998  Med3  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF11593  Med3  
Amino Acid Sequences MSLKELVPNGTKLADLEKRMVEDTMVRDGLVVGLRQVREEILPIRLKFNAFLNKMSHLDSEPQGAKTNEERFKEVRDNLLDLYKSIQTLSARFHEIQPLFSVIEQFGAVDGEKQFCPLETLGNGPTVSSIPTTVPTAPVGKKSAVSTPANNDKPSPSVGPTASSAAAKKPRKPRQSKKTPVHTPAGNPTPRTAAQTPLSVPSSSGPGGDVGVSSGAAAAAAASAMNSTISMPQHILSSAMSPMMGSTMGTPNNMNQMSSSQQPQAPQQQQQQVHAPFMGANPAASTNNTSAQSLTPANILSMNNGNMNATNAERPERYGSVDLSSMDLGNLDLGSLNMDFL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.29
4 0.29
5 0.31
6 0.32
7 0.31
8 0.25
9 0.23
10 0.24
11 0.26
12 0.24
13 0.21
14 0.2
15 0.2
16 0.21
17 0.18
18 0.15
19 0.11
20 0.15
21 0.16
22 0.16
23 0.17
24 0.16
25 0.14
26 0.18
27 0.18
28 0.2
29 0.27
30 0.27
31 0.3
32 0.31
33 0.31
34 0.29
35 0.34
36 0.37
37 0.32
38 0.35
39 0.35
40 0.37
41 0.38
42 0.38
43 0.32
44 0.24
45 0.26
46 0.24
47 0.28
48 0.26
49 0.26
50 0.29
51 0.27
52 0.29
53 0.31
54 0.39
55 0.39
56 0.39
57 0.43
58 0.4
59 0.45
60 0.5
61 0.45
62 0.43
63 0.39
64 0.39
65 0.35
66 0.38
67 0.32
68 0.25
69 0.25
70 0.19
71 0.17
72 0.15
73 0.17
74 0.13
75 0.15
76 0.19
77 0.19
78 0.22
79 0.23
80 0.24
81 0.28
82 0.28
83 0.27
84 0.24
85 0.23
86 0.2
87 0.19
88 0.19
89 0.11
90 0.11
91 0.1
92 0.08
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.07
97 0.08
98 0.09
99 0.09
100 0.11
101 0.1
102 0.1
103 0.12
104 0.11
105 0.12
106 0.1
107 0.13
108 0.12
109 0.14
110 0.14
111 0.11
112 0.11
113 0.1
114 0.1
115 0.08
116 0.08
117 0.06
118 0.08
119 0.1
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.14
124 0.15
125 0.17
126 0.18
127 0.17
128 0.18
129 0.18
130 0.21
131 0.22
132 0.23
133 0.22
134 0.26
135 0.34
136 0.35
137 0.35
138 0.32
139 0.27
140 0.27
141 0.27
142 0.23
143 0.15
144 0.16
145 0.15
146 0.16
147 0.16
148 0.16
149 0.14
150 0.14
151 0.12
152 0.14
153 0.22
154 0.24
155 0.3
156 0.39
157 0.48
158 0.58
159 0.68
160 0.75
161 0.78
162 0.86
163 0.9
164 0.88
165 0.89
166 0.87
167 0.81
168 0.75
169 0.65
170 0.56
171 0.53
172 0.51
173 0.42
174 0.35
175 0.31
176 0.29
177 0.28
178 0.31
179 0.25
180 0.22
181 0.22
182 0.23
183 0.23
184 0.22
185 0.23
186 0.18
187 0.18
188 0.14
189 0.14
190 0.13
191 0.12
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.02
206 0.02
207 0.02
208 0.02
209 0.02
210 0.02
211 0.02
212 0.02
213 0.03
214 0.03
215 0.06
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.08
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.05
232 0.04
233 0.06
234 0.1
235 0.1
236 0.11
237 0.12
238 0.12
239 0.2
240 0.2
241 0.18
242 0.15
243 0.17
244 0.19
245 0.21
246 0.23
247 0.19
248 0.21
249 0.22
250 0.27
251 0.35
252 0.38
253 0.42
254 0.46
255 0.51
256 0.52
257 0.54
258 0.58
259 0.49
260 0.45
261 0.39
262 0.32
263 0.24
264 0.22
265 0.22
266 0.13
267 0.11
268 0.1
269 0.12
270 0.13
271 0.13
272 0.16
273 0.14
274 0.19
275 0.2
276 0.19
277 0.18
278 0.18
279 0.21
280 0.19
281 0.18
282 0.14
283 0.14
284 0.14
285 0.16
286 0.15
287 0.15
288 0.18
289 0.18
290 0.18
291 0.18
292 0.18
293 0.16
294 0.18
295 0.16
296 0.15
297 0.16
298 0.17
299 0.21
300 0.21
301 0.24
302 0.28
303 0.28
304 0.3
305 0.3
306 0.3
307 0.28
308 0.29
309 0.26
310 0.23
311 0.22
312 0.17
313 0.14
314 0.13
315 0.1
316 0.09
317 0.08
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.07