Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R5C6

Protein Details
Accession C4R5C6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
180-209HSSAKNRSVKPKAEKKVKKERSTHNMIEKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
184-200KNRSVKPKAEKKVKKER
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0046983  F:protein dimerization activity  
KEGG ppa:PAS_chr3_0712  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
CDD cd11399  bHLHzip_scHMS1_like  
Amino Acid Sequences MNEDYNYGYPDTESLLVALNQDQTQLYELQNENDNVNANNLNMDYAIDDAETRKTEGYFEKSSNPYAADLNPVTNLSSGESFSETGTTPSPMLSGDVNRAIDSQMYLPVKQEVASPDFFGSGNVSSEGPNTFDSNGGQALDTSAENQQQGANAAMTTNAPDPNLSSYSTTPTTTTADSGHSSAKNRSVKPKAEKKVKKERSTHNMIEKKYRTNINSKIIALRDAVPSLRIAAYADNSLTIDDLEGLTPASKLNKASILTKATEYIKHLEGKNRRLMDEVTILKGYMQQAPGQLNRRFLSTPQPQQHQQLQTDSQQQQSHQQQQSLQQQPHGQSIPMGNTFGYPEFSSYPPSNSIPLGQKIALGGLTGMVGTQLYAGQDSDLKGLSTLPFAHVFPILQNAKLIHTLKIFFVCYALFYLLYPIFVHNKPSKTQHGTSNFPFIHSVTRLITDAPALVRDAFTGWLKKGSLTATDKIKLIEEINNTVDAFVIREISRPDGEIVSHRRVFFELGKILLRMNILDDQFLTITQSENVLIFQFYRSIIYKLIKFSLASRFPYFFDYSKLTAYDRSFLASTKEMRSTKFDTPTTKFFQSFSSSDEIFTGPTCLSLLAKWLNLMPSQVTDEQQDYQNLKNNVLNQKVEDLNFYTICICIRSSFVLETVFLEYLNTFLDNKKISQEEIENKRHKISQLIATTPEIFSYLILNNRVFCSLLDPSNGKHLQFFVDTIKERSLQKLESIKFNDLSGADSARSSISESSIFSYPHGSVLESTDEDEEDDRFSEDENSVESASDTETDTKGAQVKVICKPARPILLDESRIIEDEGIAKLFDNSQRSKQVDLISSEDYQKLTSMVILYYVSKKETISLGLRLLPLMKPPINDEYGCRSLVWLGCMIQLLCTIIDNKDILTQLKPDHRQVLEENVVALIISINSSLKVHNKLFSQLSYIDKVNLSSKLSNLDLKLNGYIN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.13
4 0.14
5 0.16
6 0.16
7 0.15
8 0.16
9 0.16
10 0.14
11 0.16
12 0.18
13 0.16
14 0.21
15 0.22
16 0.23
17 0.29
18 0.29
19 0.27
20 0.27
21 0.28
22 0.21
23 0.23
24 0.21
25 0.16
26 0.16
27 0.16
28 0.15
29 0.13
30 0.12
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.07
35 0.08
36 0.09
37 0.13
38 0.14
39 0.15
40 0.16
41 0.16
42 0.2
43 0.25
44 0.31
45 0.32
46 0.33
47 0.39
48 0.41
49 0.43
50 0.42
51 0.37
52 0.31
53 0.29
54 0.27
55 0.27
56 0.24
57 0.23
58 0.22
59 0.21
60 0.2
61 0.18
62 0.18
63 0.13
64 0.14
65 0.13
66 0.13
67 0.15
68 0.14
69 0.14
70 0.15
71 0.13
72 0.14
73 0.15
74 0.15
75 0.13
76 0.12
77 0.12
78 0.11
79 0.12
80 0.13
81 0.14
82 0.17
83 0.21
84 0.22
85 0.22
86 0.22
87 0.21
88 0.19
89 0.18
90 0.15
91 0.18
92 0.19
93 0.19
94 0.2
95 0.22
96 0.21
97 0.2
98 0.22
99 0.2
100 0.22
101 0.23
102 0.23
103 0.21
104 0.22
105 0.21
106 0.18
107 0.16
108 0.13
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.12
113 0.14
114 0.14
115 0.14
116 0.14
117 0.14
118 0.13
119 0.14
120 0.14
121 0.15
122 0.15
123 0.14
124 0.12
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.1
129 0.1
130 0.12
131 0.14
132 0.14
133 0.14
134 0.14
135 0.14
136 0.15
137 0.14
138 0.12
139 0.1
140 0.1
141 0.1
142 0.09
143 0.1
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.12
149 0.16
150 0.17
151 0.16
152 0.17
153 0.17
154 0.22
155 0.24
156 0.23
157 0.2
158 0.21
159 0.22
160 0.2
161 0.2
162 0.16
163 0.17
164 0.18
165 0.19
166 0.21
167 0.22
168 0.24
169 0.26
170 0.34
171 0.39
172 0.41
173 0.5
174 0.53
175 0.59
176 0.67
177 0.73
178 0.75
179 0.79
180 0.83
181 0.83
182 0.86
183 0.87
184 0.86
185 0.85
186 0.85
187 0.83
188 0.84
189 0.82
190 0.81
191 0.77
192 0.7
193 0.71
194 0.65
195 0.62
196 0.59
197 0.58
198 0.52
199 0.54
200 0.59
201 0.56
202 0.56
203 0.52
204 0.5
205 0.44
206 0.42
207 0.35
208 0.29
209 0.23
210 0.2
211 0.19
212 0.15
213 0.14
214 0.14
215 0.13
216 0.1
217 0.09
218 0.09
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.07
227 0.06
228 0.05
229 0.06
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.07
236 0.08
237 0.1
238 0.1
239 0.12
240 0.16
241 0.18
242 0.2
243 0.24
244 0.26
245 0.25
246 0.25
247 0.27
248 0.25
249 0.25
250 0.26
251 0.24
252 0.24
253 0.28
254 0.3
255 0.35
256 0.41
257 0.45
258 0.5
259 0.48
260 0.46
261 0.43
262 0.42
263 0.36
264 0.36
265 0.31
266 0.25
267 0.23
268 0.23
269 0.2
270 0.22
271 0.2
272 0.16
273 0.15
274 0.14
275 0.17
276 0.21
277 0.26
278 0.31
279 0.32
280 0.34
281 0.33
282 0.35
283 0.33
284 0.31
285 0.35
286 0.36
287 0.43
288 0.43
289 0.48
290 0.48
291 0.53
292 0.59
293 0.55
294 0.49
295 0.44
296 0.41
297 0.4
298 0.45
299 0.42
300 0.4
301 0.36
302 0.34
303 0.38
304 0.43
305 0.48
306 0.42
307 0.43
308 0.4
309 0.46
310 0.55
311 0.54
312 0.48
313 0.41
314 0.43
315 0.43
316 0.45
317 0.37
318 0.27
319 0.21
320 0.22
321 0.22
322 0.19
323 0.17
324 0.12
325 0.12
326 0.13
327 0.12
328 0.12
329 0.09
330 0.1
331 0.11
332 0.12
333 0.16
334 0.16
335 0.17
336 0.19
337 0.2
338 0.19
339 0.17
340 0.21
341 0.21
342 0.22
343 0.22
344 0.19
345 0.18
346 0.17
347 0.17
348 0.13
349 0.08
350 0.06
351 0.04
352 0.04
353 0.03
354 0.03
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.03
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.06
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.09
381 0.16
382 0.14
383 0.13
384 0.14
385 0.14
386 0.15
387 0.2
388 0.2
389 0.15
390 0.16
391 0.17
392 0.16
393 0.18
394 0.17
395 0.12
396 0.11
397 0.09
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.06
402 0.06
403 0.08
404 0.07
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.12
409 0.12
410 0.17
411 0.2
412 0.22
413 0.24
414 0.29
415 0.34
416 0.36
417 0.39
418 0.42
419 0.43
420 0.45
421 0.44
422 0.48
423 0.41
424 0.36
425 0.33
426 0.26
427 0.23
428 0.19
429 0.2
430 0.12
431 0.13
432 0.12
433 0.12
434 0.11
435 0.08
436 0.08
437 0.07
438 0.07
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.05
443 0.06
444 0.07
445 0.08
446 0.09
447 0.09
448 0.1
449 0.1
450 0.11
451 0.12
452 0.11
453 0.15
454 0.17
455 0.21
456 0.22
457 0.23
458 0.24
459 0.23
460 0.22
461 0.18
462 0.15
463 0.16
464 0.14
465 0.14
466 0.15
467 0.15
468 0.14
469 0.13
470 0.12
471 0.08
472 0.07
473 0.05
474 0.06
475 0.06
476 0.07
477 0.08
478 0.1
479 0.1
480 0.1
481 0.11
482 0.09
483 0.1
484 0.13
485 0.18
486 0.21
487 0.23
488 0.23
489 0.23
490 0.23
491 0.25
492 0.21
493 0.2
494 0.16
495 0.14
496 0.15
497 0.15
498 0.14
499 0.13
500 0.11
501 0.08
502 0.08
503 0.1
504 0.1
505 0.09
506 0.09
507 0.09
508 0.09
509 0.09
510 0.08
511 0.05
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.05
521 0.05
522 0.06
523 0.06
524 0.08
525 0.09
526 0.1
527 0.12
528 0.15
529 0.16
530 0.17
531 0.18
532 0.17
533 0.16
534 0.18
535 0.23
536 0.24
537 0.25
538 0.26
539 0.26
540 0.26
541 0.29
542 0.29
543 0.21
544 0.21
545 0.21
546 0.2
547 0.2
548 0.2
549 0.17
550 0.19
551 0.19
552 0.19
553 0.15
554 0.16
555 0.15
556 0.15
557 0.17
558 0.15
559 0.17
560 0.18
561 0.24
562 0.24
563 0.25
564 0.3
565 0.32
566 0.35
567 0.38
568 0.38
569 0.38
570 0.41
571 0.45
572 0.45
573 0.43
574 0.38
575 0.32
576 0.32
577 0.31
578 0.28
579 0.25
580 0.24
581 0.21
582 0.21
583 0.21
584 0.18
585 0.13
586 0.13
587 0.11
588 0.07
589 0.07
590 0.07
591 0.06
592 0.06
593 0.06
594 0.09
595 0.09
596 0.1
597 0.1
598 0.11
599 0.12
600 0.12
601 0.12
602 0.09
603 0.09
604 0.12
605 0.13
606 0.13
607 0.13
608 0.14
609 0.15
610 0.17
611 0.19
612 0.18
613 0.19
614 0.25
615 0.25
616 0.25
617 0.26
618 0.3
619 0.33
620 0.35
621 0.33
622 0.27
623 0.3
624 0.3
625 0.28
626 0.24
627 0.2
628 0.18
629 0.17
630 0.17
631 0.14
632 0.12
633 0.12
634 0.11
635 0.09
636 0.08
637 0.09
638 0.1
639 0.11
640 0.11
641 0.12
642 0.12
643 0.12
644 0.12
645 0.13
646 0.11
647 0.09
648 0.09
649 0.08
650 0.08
651 0.08
652 0.07
653 0.06
654 0.07
655 0.11
656 0.12
657 0.13
658 0.16
659 0.17
660 0.17
661 0.19
662 0.25
663 0.31
664 0.38
665 0.47
666 0.48
667 0.48
668 0.5
669 0.5
670 0.44
671 0.4
672 0.36
673 0.35
674 0.35
675 0.35
676 0.35
677 0.34
678 0.34
679 0.29
680 0.24
681 0.16
682 0.12
683 0.1
684 0.1
685 0.11
686 0.13
687 0.16
688 0.17
689 0.17
690 0.18
691 0.18
692 0.16
693 0.14
694 0.15
695 0.15
696 0.16
697 0.18
698 0.19
699 0.19
700 0.27
701 0.29
702 0.24
703 0.22
704 0.22
705 0.21
706 0.21
707 0.22
708 0.16
709 0.2
710 0.22
711 0.23
712 0.24
713 0.25
714 0.25
715 0.29
716 0.29
717 0.25
718 0.29
719 0.35
720 0.35
721 0.4
722 0.43
723 0.42
724 0.39
725 0.38
726 0.33
727 0.25
728 0.25
729 0.18
730 0.16
731 0.12
732 0.12
733 0.12
734 0.1
735 0.1
736 0.1
737 0.09
738 0.1
739 0.1
740 0.11
741 0.14
742 0.16
743 0.16
744 0.15
745 0.17
746 0.16
747 0.17
748 0.17
749 0.14
750 0.12
751 0.14
752 0.17
753 0.14
754 0.15
755 0.13
756 0.13
757 0.13
758 0.13
759 0.11
760 0.1
761 0.1
762 0.09
763 0.09
764 0.1
765 0.11
766 0.11
767 0.11
768 0.11
769 0.12
770 0.12
771 0.12
772 0.11
773 0.09
774 0.09
775 0.1
776 0.1
777 0.1
778 0.11
779 0.12
780 0.12
781 0.14
782 0.18
783 0.17
784 0.19
785 0.2
786 0.26
787 0.31
788 0.4
789 0.39
790 0.37
791 0.42
792 0.45
793 0.48
794 0.45
795 0.42
796 0.41
797 0.46
798 0.46
799 0.42
800 0.39
801 0.33
802 0.32
803 0.28
804 0.2
805 0.13
806 0.13
807 0.13
808 0.1
809 0.1
810 0.09
811 0.1
812 0.13
813 0.17
814 0.21
815 0.24
816 0.29
817 0.37
818 0.39
819 0.41
820 0.42
821 0.43
822 0.42
823 0.41
824 0.4
825 0.35
826 0.35
827 0.35
828 0.32
829 0.27
830 0.22
831 0.19
832 0.15
833 0.12
834 0.12
835 0.1
836 0.09
837 0.1
838 0.1
839 0.12
840 0.16
841 0.17
842 0.17
843 0.17
844 0.18
845 0.19
846 0.2
847 0.23
848 0.22
849 0.24
850 0.25
851 0.26
852 0.27
853 0.25
854 0.25
855 0.2
856 0.2
857 0.24
858 0.24
859 0.22
860 0.26
861 0.31
862 0.33
863 0.33
864 0.33
865 0.34
866 0.35
867 0.35
868 0.3
869 0.26
870 0.26
871 0.27
872 0.25
873 0.19
874 0.17
875 0.17
876 0.19
877 0.19
878 0.15
879 0.14
880 0.13
881 0.11
882 0.12
883 0.12
884 0.11
885 0.14
886 0.13
887 0.13
888 0.16
889 0.18
890 0.18
891 0.19
892 0.22
893 0.26
894 0.35
895 0.4
896 0.42
897 0.48
898 0.47
899 0.49
900 0.48
901 0.5
902 0.45
903 0.4
904 0.36
905 0.27
906 0.26
907 0.22
908 0.19
909 0.1
910 0.05
911 0.05
912 0.06
913 0.06
914 0.07
915 0.08
916 0.12
917 0.17
918 0.24
919 0.27
920 0.31
921 0.33
922 0.38
923 0.41
924 0.39
925 0.38
926 0.34
927 0.36
928 0.36
929 0.35
930 0.31
931 0.28
932 0.29
933 0.29
934 0.29
935 0.29
936 0.27
937 0.27
938 0.3
939 0.32
940 0.34
941 0.32
942 0.34
943 0.32
944 0.32