Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R596

Protein Details
Accession C4R596    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-100EMAKRFERRRCNHNYKEPKTPSHydrophilic
188-256AEGAPKSKKRSGPKGPNPLSVKKKKKEPKPLNDKENASKPGNTEEAQPKKRRRKHGKSGEKPEEKSKEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
191-256APKSKKRSGPKGPNPLSVKKKKKEPKPLNDKENASKPGNTEEAQPKKRRRKHGKSGEKPEEKSKEK
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0070181  F:small ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG ppa:PAS_chr3_0683  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
CDD cd09865  PIN_ScUtp23p-like  
Amino Acid Sequences MRQKRAKSYRKQMGVYLHAFKFREPYQTLLDDQIILQCHRTAFDLEKGLNRTVQSEVKPMITQCCMQALYMSRDEGAIEMAKRFERRRCNHNYKEPKTPSECIEDVVVVDGKNKHRYVVATLDEGLRNALRVIPGVPLIYINRSVMIMEPLSKASKAVQIAVESGKLTGGLNDAKLAGLRQKDDGLEAEGAPKSKKRSGPKGPNPLSVKKKKKEPKPLNDKENASKPGNTEEAQPKKRRRKHGKSGEKPEEKSKEKSDEKSQQNNEADHVGTHAETSAQAVEEFEQHSQDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.66
3 0.62
4 0.54
5 0.51
6 0.49
7 0.44
8 0.42
9 0.36
10 0.39
11 0.33
12 0.35
13 0.35
14 0.37
15 0.38
16 0.35
17 0.33
18 0.25
19 0.23
20 0.23
21 0.2
22 0.17
23 0.17
24 0.16
25 0.15
26 0.16
27 0.17
28 0.17
29 0.18
30 0.23
31 0.26
32 0.25
33 0.31
34 0.33
35 0.33
36 0.32
37 0.29
38 0.26
39 0.26
40 0.29
41 0.25
42 0.27
43 0.27
44 0.27
45 0.28
46 0.27
47 0.27
48 0.24
49 0.23
50 0.19
51 0.21
52 0.19
53 0.17
54 0.19
55 0.2
56 0.22
57 0.22
58 0.22
59 0.18
60 0.18
61 0.18
62 0.15
63 0.12
64 0.1
65 0.09
66 0.1
67 0.11
68 0.14
69 0.18
70 0.22
71 0.28
72 0.36
73 0.41
74 0.49
75 0.58
76 0.66
77 0.72
78 0.78
79 0.82
80 0.76
81 0.82
82 0.77
83 0.73
84 0.68
85 0.61
86 0.53
87 0.48
88 0.43
89 0.34
90 0.3
91 0.23
92 0.18
93 0.16
94 0.15
95 0.08
96 0.11
97 0.13
98 0.16
99 0.22
100 0.22
101 0.21
102 0.22
103 0.23
104 0.24
105 0.26
106 0.24
107 0.2
108 0.2
109 0.21
110 0.2
111 0.19
112 0.16
113 0.1
114 0.08
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.07
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.08
142 0.12
143 0.11
144 0.12
145 0.12
146 0.11
147 0.13
148 0.13
149 0.12
150 0.09
151 0.09
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.09
165 0.1
166 0.11
167 0.12
168 0.13
169 0.13
170 0.14
171 0.14
172 0.13
173 0.12
174 0.11
175 0.13
176 0.12
177 0.13
178 0.13
179 0.15
180 0.18
181 0.23
182 0.3
183 0.36
184 0.46
185 0.56
186 0.66
187 0.73
188 0.8
189 0.79
190 0.8
191 0.77
192 0.75
193 0.75
194 0.74
195 0.74
196 0.69
197 0.76
198 0.76
199 0.81
200 0.83
201 0.84
202 0.85
203 0.86
204 0.89
205 0.87
206 0.86
207 0.81
208 0.76
209 0.74
210 0.69
211 0.6
212 0.52
213 0.45
214 0.42
215 0.41
216 0.34
217 0.33
218 0.37
219 0.44
220 0.51
221 0.59
222 0.64
223 0.71
224 0.8
225 0.84
226 0.85
227 0.86
228 0.89
229 0.92
230 0.93
231 0.93
232 0.95
233 0.95
234 0.92
235 0.84
236 0.83
237 0.81
238 0.75
239 0.7
240 0.66
241 0.66
242 0.64
243 0.67
244 0.68
245 0.69
246 0.73
247 0.77
248 0.74
249 0.74
250 0.71
251 0.66
252 0.58
253 0.5
254 0.41
255 0.31
256 0.27
257 0.19
258 0.14
259 0.13
260 0.11
261 0.09
262 0.08
263 0.1
264 0.1
265 0.09
266 0.09
267 0.1
268 0.11
269 0.13
270 0.15
271 0.14