Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T0FD96

Protein Details
Accession A0A2T0FD96    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
484-503YLRGQGQRQRPNRRNERQALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
340-361KPAKSEKAAKPARQPKEERSSK
Subcellular Location(s) nucl 16, pero 6, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0016853  F:isomerase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MSFYGVQAQVEDGSKLEKYDFEADASALDPTIDEKNDETFGRTGQVGKDFDFAGQTASVAGTLDEEAIKYERRSQSHIPALQPLASLWQTPGDPNAFDQLQQQPQQPMSVQELEQMMRSMPMPGMPMPMGMPSGMPMMPQGMPQMPQGMPQIPQGMSQMHQGMSQMHQGMPQMHPMAQGMPHMGMPGMQPMGMAPPGFQPWGYGAPMMPGMVPPHMMGQMGQPGMGSQEGQTSSPAHQQGTENTQAQVQAQAQAQAQAHAQAQAQAHAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQSQAESQAQATQAPSAEPVHVHEETKQVEEAKPAKSEKAAKPARQPKEERSSKVDKPVKQASPAANSEDSRSGETLYSLNRTNRPVKSISEARSALQAQAAADREKQASRDRQRFNRSRYSGLMGDWDKNFIMRLQLQQLVSQDPDSDDFYYQVYSTIQKNRSGPHQPLNAFAKIYLRGQGQRQRPNRRNERQALLQQVKEVVEKVRSRTPKERAVHEGILGSQPSVGNAVRPRKALDLQTGNLDTRKTTSDVYRPADVPFIIETAFGAVLDLEAHERLRPAPDSEAAADWAAAIPQLQDTLWDALKVLDPVDPNKNQPFVMMLAHNKGKKLLPRVFPHLDNRRRLTVFTRMVSAIDQLDVVKNGAYDGEQDLPANVRKSIDIFSQTVLPPIVHLISEAELGIVTGFFDILLSSTDLIHLTRTKVGQTIFTVLISRAELILQEQPENETNPEIEAWKLSFARLFNAIKSDLGKLFPPRQIDNSYVWHFLASLALAADLDMQRELVDGVRDRIFATISEAKALPVDVGTPKITNLNMFLNVMGLNATFDDITEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.15
3 0.15
4 0.13
5 0.17
6 0.22
7 0.23
8 0.22
9 0.23
10 0.22
11 0.21
12 0.2
13 0.16
14 0.1
15 0.09
16 0.07
17 0.08
18 0.12
19 0.12
20 0.13
21 0.14
22 0.17
23 0.21
24 0.21
25 0.23
26 0.2
27 0.2
28 0.21
29 0.21
30 0.21
31 0.22
32 0.28
33 0.26
34 0.26
35 0.28
36 0.25
37 0.25
38 0.24
39 0.2
40 0.15
41 0.13
42 0.12
43 0.1
44 0.1
45 0.09
46 0.08
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.09
54 0.11
55 0.14
56 0.15
57 0.24
58 0.3
59 0.33
60 0.4
61 0.44
62 0.52
63 0.58
64 0.62
65 0.55
66 0.55
67 0.53
68 0.47
69 0.41
70 0.31
71 0.27
72 0.23
73 0.21
74 0.15
75 0.16
76 0.16
77 0.16
78 0.2
79 0.17
80 0.17
81 0.17
82 0.22
83 0.2
84 0.2
85 0.24
86 0.27
87 0.32
88 0.35
89 0.38
90 0.37
91 0.37
92 0.39
93 0.35
94 0.31
95 0.3
96 0.3
97 0.25
98 0.25
99 0.26
100 0.24
101 0.24
102 0.22
103 0.16
104 0.14
105 0.14
106 0.12
107 0.1
108 0.11
109 0.12
110 0.12
111 0.15
112 0.14
113 0.15
114 0.13
115 0.14
116 0.13
117 0.1
118 0.1
119 0.07
120 0.1
121 0.09
122 0.08
123 0.08
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.13
128 0.13
129 0.14
130 0.15
131 0.19
132 0.16
133 0.19
134 0.22
135 0.21
136 0.2
137 0.22
138 0.25
139 0.21
140 0.22
141 0.21
142 0.2
143 0.19
144 0.21
145 0.21
146 0.17
147 0.17
148 0.17
149 0.17
150 0.17
151 0.2
152 0.18
153 0.16
154 0.17
155 0.18
156 0.2
157 0.19
158 0.22
159 0.2
160 0.19
161 0.19
162 0.18
163 0.18
164 0.16
165 0.16
166 0.13
167 0.12
168 0.11
169 0.11
170 0.1
171 0.09
172 0.08
173 0.1
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.07
182 0.09
183 0.11
184 0.12
185 0.11
186 0.1
187 0.12
188 0.14
189 0.14
190 0.13
191 0.11
192 0.12
193 0.13
194 0.12
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.09
200 0.08
201 0.09
202 0.1
203 0.1
204 0.09
205 0.1
206 0.14
207 0.13
208 0.13
209 0.11
210 0.1
211 0.11
212 0.11
213 0.09
214 0.05
215 0.09
216 0.1
217 0.11
218 0.12
219 0.13
220 0.14
221 0.2
222 0.21
223 0.18
224 0.19
225 0.21
226 0.23
227 0.27
228 0.3
229 0.25
230 0.24
231 0.25
232 0.23
233 0.21
234 0.21
235 0.16
236 0.15
237 0.14
238 0.17
239 0.16
240 0.19
241 0.19
242 0.17
243 0.16
244 0.15
245 0.15
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.14
250 0.14
251 0.15
252 0.14
253 0.14
254 0.14
255 0.14
256 0.13
257 0.13
258 0.15
259 0.15
260 0.15
261 0.15
262 0.16
263 0.16
264 0.15
265 0.15
266 0.14
267 0.13
268 0.14
269 0.14
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.14
274 0.14
275 0.14
276 0.14
277 0.14
278 0.14
279 0.14
280 0.14
281 0.14
282 0.14
283 0.14
284 0.14
285 0.14
286 0.14
287 0.14
288 0.14
289 0.14
290 0.14
291 0.15
292 0.14
293 0.14
294 0.14
295 0.14
296 0.13
297 0.13
298 0.12
299 0.12
300 0.11
301 0.11
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.1
310 0.09
311 0.09
312 0.08
313 0.1
314 0.14
315 0.14
316 0.15
317 0.15
318 0.19
319 0.19
320 0.21
321 0.2
322 0.17
323 0.17
324 0.22
325 0.24
326 0.21
327 0.24
328 0.24
329 0.23
330 0.26
331 0.33
332 0.31
333 0.39
334 0.43
335 0.43
336 0.52
337 0.61
338 0.63
339 0.63
340 0.64
341 0.61
342 0.65
343 0.67
344 0.61
345 0.59
346 0.59
347 0.54
348 0.6
349 0.59
350 0.52
351 0.53
352 0.58
353 0.52
354 0.48
355 0.5
356 0.42
357 0.41
358 0.39
359 0.35
360 0.28
361 0.27
362 0.25
363 0.24
364 0.22
365 0.18
366 0.17
367 0.14
368 0.12
369 0.13
370 0.12
371 0.1
372 0.12
373 0.14
374 0.16
375 0.18
376 0.23
377 0.28
378 0.28
379 0.3
380 0.3
381 0.29
382 0.32
383 0.36
384 0.35
385 0.34
386 0.34
387 0.31
388 0.32
389 0.3
390 0.24
391 0.18
392 0.16
393 0.1
394 0.12
395 0.13
396 0.1
397 0.1
398 0.12
399 0.12
400 0.12
401 0.15
402 0.18
403 0.27
404 0.34
405 0.43
406 0.48
407 0.55
408 0.65
409 0.7
410 0.7
411 0.71
412 0.65
413 0.59
414 0.54
415 0.5
416 0.41
417 0.33
418 0.33
419 0.24
420 0.23
421 0.2
422 0.19
423 0.15
424 0.14
425 0.14
426 0.09
427 0.1
428 0.09
429 0.11
430 0.13
431 0.16
432 0.16
433 0.18
434 0.18
435 0.17
436 0.16
437 0.14
438 0.12
439 0.09
440 0.1
441 0.1
442 0.1
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.09
448 0.08
449 0.07
450 0.09
451 0.12
452 0.19
453 0.21
454 0.24
455 0.26
456 0.27
457 0.34
458 0.37
459 0.37
460 0.37
461 0.41
462 0.38
463 0.41
464 0.44
465 0.37
466 0.32
467 0.28
468 0.24
469 0.19
470 0.19
471 0.17
472 0.15
473 0.16
474 0.22
475 0.29
476 0.35
477 0.43
478 0.52
479 0.6
480 0.65
481 0.73
482 0.78
483 0.79
484 0.81
485 0.77
486 0.73
487 0.69
488 0.66
489 0.65
490 0.58
491 0.49
492 0.4
493 0.36
494 0.32
495 0.26
496 0.22
497 0.14
498 0.17
499 0.18
500 0.21
501 0.27
502 0.3
503 0.36
504 0.44
505 0.48
506 0.51
507 0.53
508 0.54
509 0.54
510 0.55
511 0.5
512 0.42
513 0.37
514 0.28
515 0.26
516 0.21
517 0.14
518 0.09
519 0.08
520 0.07
521 0.09
522 0.08
523 0.1
524 0.15
525 0.22
526 0.23
527 0.24
528 0.26
529 0.27
530 0.31
531 0.3
532 0.32
533 0.3
534 0.29
535 0.32
536 0.31
537 0.28
538 0.26
539 0.24
540 0.17
541 0.14
542 0.15
543 0.13
544 0.14
545 0.18
546 0.23
547 0.29
548 0.32
549 0.33
550 0.32
551 0.31
552 0.31
553 0.26
554 0.21
555 0.15
556 0.12
557 0.09
558 0.08
559 0.08
560 0.07
561 0.07
562 0.05
563 0.05
564 0.04
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.04
569 0.05
570 0.05
571 0.06
572 0.07
573 0.07
574 0.1
575 0.12
576 0.13
577 0.15
578 0.16
579 0.18
580 0.18
581 0.18
582 0.16
583 0.15
584 0.13
585 0.1
586 0.09
587 0.06
588 0.05
589 0.04
590 0.04
591 0.04
592 0.04
593 0.04
594 0.05
595 0.07
596 0.1
597 0.1
598 0.09
599 0.1
600 0.1
601 0.12
602 0.11
603 0.1
604 0.1
605 0.11
606 0.14
607 0.21
608 0.22
609 0.25
610 0.28
611 0.29
612 0.27
613 0.26
614 0.24
615 0.19
616 0.2
617 0.19
618 0.18
619 0.21
620 0.27
621 0.28
622 0.26
623 0.27
624 0.28
625 0.31
626 0.38
627 0.41
628 0.44
629 0.48
630 0.56
631 0.58
632 0.59
633 0.63
634 0.64
635 0.64
636 0.64
637 0.62
638 0.61
639 0.57
640 0.55
641 0.5
642 0.49
643 0.47
644 0.4
645 0.39
646 0.32
647 0.32
648 0.31
649 0.28
650 0.18
651 0.12
652 0.12
653 0.09
654 0.1
655 0.1
656 0.1
657 0.08
658 0.08
659 0.07
660 0.07
661 0.07
662 0.07
663 0.09
664 0.11
665 0.11
666 0.11
667 0.12
668 0.14
669 0.18
670 0.18
671 0.16
672 0.15
673 0.15
674 0.17
675 0.19
676 0.2
677 0.2
678 0.2
679 0.2
680 0.24
681 0.23
682 0.23
683 0.21
684 0.17
685 0.14
686 0.14
687 0.14
688 0.09
689 0.09
690 0.09
691 0.09
692 0.09
693 0.09
694 0.07
695 0.06
696 0.06
697 0.06
698 0.05
699 0.04
700 0.03
701 0.03
702 0.03
703 0.03
704 0.03
705 0.04
706 0.05
707 0.06
708 0.07
709 0.07
710 0.08
711 0.08
712 0.09
713 0.11
714 0.12
715 0.14
716 0.17
717 0.18
718 0.19
719 0.22
720 0.23
721 0.24
722 0.24
723 0.26
724 0.23
725 0.22
726 0.22
727 0.19
728 0.19
729 0.16
730 0.14
731 0.1
732 0.09
733 0.09
734 0.1
735 0.15
736 0.14
737 0.15
738 0.15
739 0.18
740 0.2
741 0.22
742 0.21
743 0.18
744 0.17
745 0.17
746 0.18
747 0.16
748 0.14
749 0.14
750 0.13
751 0.16
752 0.16
753 0.16
754 0.18
755 0.18
756 0.2
757 0.25
758 0.26
759 0.23
760 0.27
761 0.27
762 0.25
763 0.27
764 0.27
765 0.22
766 0.23
767 0.25
768 0.28
769 0.34
770 0.36
771 0.39
772 0.39
773 0.42
774 0.45
775 0.44
776 0.42
777 0.43
778 0.43
779 0.4
780 0.36
781 0.31
782 0.27
783 0.24
784 0.2
785 0.13
786 0.1
787 0.07
788 0.07
789 0.07
790 0.07
791 0.1
792 0.09
793 0.1
794 0.09
795 0.09
796 0.09
797 0.1
798 0.1
799 0.08
800 0.13
801 0.14
802 0.18
803 0.2
804 0.21
805 0.21
806 0.21
807 0.2
808 0.16
809 0.21
810 0.24
811 0.22
812 0.26
813 0.25
814 0.24
815 0.24
816 0.24
817 0.17
818 0.11
819 0.13
820 0.12
821 0.15
822 0.16
823 0.16
824 0.17
825 0.2
826 0.21
827 0.2
828 0.21
829 0.22
830 0.22
831 0.22
832 0.21
833 0.19
834 0.18
835 0.16
836 0.13
837 0.09
838 0.08
839 0.07
840 0.08
841 0.07