FuNGI

A0A2T0FFU3

Protein Details

Accession

A0A2T0FFU3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
103-122	GVAPRAKMNQQRSRRFRSAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
375-407	RRRDQEARRMANDKARKAGQKRMKNERAQARGA

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto 7, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPAFFRWLSSKYPKIIKPCLEDEPVEINGIEYPGDYSLPNKNGELDNLYLDMNGIVHPCTHPEGRPAPENEDEMMLEVFKYTDRVVTMARPRKLLMIAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQDAEAAQVAKEEKIAEARRRGEEIDEAIHGKKAWDTNVITPGTPFMEFLASSLRYWISFKLNSDPAWKDLKVIISDASVPGEGEHKIMELIRSQRNDPEHDPNTSHAIYGLDADLIFLGLATHEPNFRILREDVFAQNRTAKASGLKSFIWLDVGILRQYLEIELDIPRTGFPFDLERAIDDWIFMAFFCGNDFLPHLPSLDVRENGIDVLLKAWRQSLSRMQGYMTCDGSVNLSRVQILLRVVAGAESDIFRRRRDQEARRMANDKARKAGQKRMKNERAQARGAAIAKTRGESAPTNPLDNIPLYTPSGESVGQTHMTNQELVAHRNEITMENQTQVEAQAGLKRPADDIDDDHEAEDNIRLWEPGYHHRYYERKFHTSDKNLEFVNEVVQKYIEGVCWTLAYYYQGCPSWTWYYPYHYAPFAQDMTDLDHLKIEFDGGEPFLPYEQLMSVLPAASSHTLPKVFRPLMSDSDSPIIDFYPVDFPIDMNGKKMAWQGIALLPFIDEQRLLAAVRAKYSELTEAERERNARREPVLLVAPENVQRADFAKLYKTDKVVPFSFKSWRAKGLAGTVFRLEDFSPDKPLICPVSSTEHPDIASNGSVMVEYHVPENQMHKSMILQGYNEPNLVLSYDERSQIISRRNKSDRGDERFDRRGRDRPQEFSEPRPLSEDGYIGFLQHQAQLKAQGYDQQHQGGYGGGHTGDRGGYHNGYQNGYQNGHRNYNDGGYGGFNPGGYGGGQNYQGYQRYQGYQGYQGDRQR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.53
2	0.57
3	0.62
4	0.69
5	0.68
6	0.66
7	0.65
8	0.64
9	0.6
10	0.55
11	0.5
12	0.46
13	0.39
14	0.33
15	0.27
16	0.21
17	0.18
18	0.18
19	0.13
20	0.09
21	0.09
22	0.09
23	0.1
24	0.09
25	0.11
26	0.19
27	0.22
28	0.24
29	0.24
30	0.27
31	0.28
32	0.31
33	0.31
34	0.25
35	0.24
36	0.23
37	0.22
38	0.18
39	0.16
40	0.14
41	0.1
42	0.09
43	0.08
44	0.08
45	0.09
46	0.09
47	0.12
48	0.17
49	0.19
50	0.2
51	0.27
52	0.33
53	0.37
54	0.44
55	0.45
56	0.45
57	0.46
58	0.47
59	0.4
60	0.35
61	0.3
62	0.24
63	0.21
64	0.15
65	0.12
66	0.1
67	0.09
68	0.07
69	0.09
70	0.08
71	0.1
72	0.11
73	0.13
74	0.14
75	0.22
76	0.32
77	0.39
78	0.42
79	0.42
80	0.42
81	0.44
82	0.43
83	0.39
84	0.31
85	0.27
86	0.25
87	0.24
88	0.24
89	0.2
90	0.2
91	0.17
92	0.15
93	0.1
94	0.13
95	0.19
96	0.26
97	0.36
98	0.45
99	0.55
100	0.65
101	0.74
102	0.8
103	0.82
104	0.78
105	0.75
106	0.76
107	0.72
108	0.65
109	0.61
110	0.53
111	0.45
112	0.44
113	0.37
114	0.26
115	0.21
116	0.18
117	0.13
118	0.13
119	0.13
120	0.11
121	0.19
122	0.26
123	0.3
124	0.37
125	0.42
126	0.44
127	0.46
128	0.46
129	0.4
130	0.37
131	0.33
132	0.27
133	0.24
134	0.23
135	0.21
136	0.22
137	0.19
138	0.16
139	0.17
140	0.18
141	0.18
142	0.22
143	0.24
144	0.27
145	0.33
146	0.34
147	0.3
148	0.28
149	0.27
150	0.23
151	0.2
152	0.16
153	0.1
154	0.11
155	0.1
156	0.11
157	0.15
158	0.14
159	0.14
160	0.16
161	0.15
162	0.14
163	0.16
164	0.18
165	0.19
166	0.21
167	0.23
168	0.28
169	0.31
170	0.32
171	0.37
172	0.36
173	0.33
174	0.36
175	0.34
176	0.29
177	0.28
178	0.3
179	0.26
180	0.24
181	0.21
182	0.17
183	0.18
184	0.16
185	0.14
186	0.1
187	0.09
188	0.09
189	0.1
190	0.09
191	0.09
192	0.08
193	0.07
194	0.08
195	0.09
196	0.09
197	0.12
198	0.18
199	0.24
200	0.26
201	0.27
202	0.32
203	0.35
204	0.4
205	0.4
206	0.43
207	0.4
208	0.41
209	0.41
210	0.38
211	0.4
212	0.35
213	0.29
214	0.21
215	0.18
216	0.15
217	0.15
218	0.13
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.06
223	0.05
224	0.05
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.04
230	0.05
231	0.06
232	0.07
233	0.11
234	0.12
235	0.13
236	0.17
237	0.17
238	0.18
239	0.19
240	0.21
241	0.22
242	0.26
243	0.27
244	0.24
245	0.27
246	0.25
247	0.26
248	0.24
249	0.2
250	0.2
251	0.23
252	0.24
253	0.24
254	0.24
255	0.24
256	0.24
257	0.23
258	0.2
259	0.15
260	0.12
261	0.11
262	0.12
263	0.1
264	0.09
265	0.09
266	0.08
267	0.08
268	0.08
269	0.06
270	0.05
271	0.06
272	0.07
273	0.08
274	0.08
275	0.08
276	0.08
277	0.08
278	0.09
279	0.08
280	0.08
281	0.1
282	0.11
283	0.14
284	0.14
285	0.14
286	0.14
287	0.15
288	0.14
289	0.1
290	0.1
291	0.07
292	0.07
293	0.06
294	0.06
295	0.05
296	0.05
297	0.05
298	0.06
299	0.06
300	0.07
301	0.08
302	0.08
303	0.1
304	0.1
305	0.1
306	0.09
307	0.1
308	0.14
309	0.17
310	0.16
311	0.15
312	0.15
313	0.15
314	0.14
315	0.14
316	0.09
317	0.05
318	0.06
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.09
323	0.1
324	0.11
325	0.14
326	0.2
327	0.25
328	0.27
329	0.27
330	0.26
331	0.28
332	0.3
333	0.29
334	0.22
335	0.16
336	0.15
337	0.14
338	0.16
339	0.14
340	0.13
341	0.11
342	0.1
343	0.1
344	0.1
345	0.1
346	0.1
347	0.09
348	0.08
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.06
353	0.06
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.05
358	0.11
359	0.13
360	0.14
361	0.19
362	0.22
363	0.31
364	0.4
365	0.47
366	0.52
367	0.62
368	0.65
369	0.64
370	0.64
371	0.56
372	0.55
373	0.52
374	0.43
375	0.37
376	0.37
377	0.39
378	0.4
379	0.48
380	0.49
381	0.52
382	0.58
383	0.64
384	0.69
385	0.67
386	0.71
387	0.7
388	0.66
389	0.59
390	0.52
391	0.42
392	0.37
393	0.33
394	0.27
395	0.19
396	0.17
397	0.15
398	0.15
399	0.15
400	0.12
401	0.13
402	0.13
403	0.14
404	0.2
405	0.21
406	0.21
407	0.2
408	0.2
409	0.19
410	0.18
411	0.17
412	0.08
413	0.09
414	0.08
415	0.09
416	0.08
417	0.08
418	0.09
419	0.08
420	0.07
421	0.07
422	0.09
423	0.09
424	0.09
425	0.1
426	0.1
427	0.1
428	0.1
429	0.09
430	0.13
431	0.13
432	0.15
433	0.15
434	0.14
435	0.14
436	0.14
437	0.15
438	0.11
439	0.11
440	0.12
441	0.12
442	0.12
443	0.11
444	0.11
445	0.11
446	0.1
447	0.09
448	0.06
449	0.06
450	0.09
451	0.11
452	0.13
453	0.13
454	0.14
455	0.13
456	0.14
457	0.15
458	0.12
459	0.11
460	0.13
461	0.14
462	0.14
463	0.14
464	0.13
465	0.12
466	0.11
467	0.1
468	0.08
469	0.06
470	0.06
471	0.06
472	0.06
473	0.09
474	0.11
475	0.19
476	0.23
477	0.23
478	0.24
479	0.29
480	0.35
481	0.36
482	0.44
483	0.41
484	0.4
485	0.42
486	0.48
487	0.52
488	0.52
489	0.57
490	0.5
491	0.47
492	0.43
493	0.4
494	0.34
495	0.25
496	0.23
497	0.19
498	0.16
499	0.14
500	0.14
501	0.14
502	0.14
503	0.14
504	0.1
505	0.07
506	0.07
507	0.07
508	0.07
509	0.07
510	0.06
511	0.06
512	0.08
513	0.08
514	0.09
515	0.11
516	0.12
517	0.12
518	0.12
519	0.17
520	0.18
521	0.18
522	0.21
523	0.21
524	0.25
525	0.28
526	0.3
527	0.28
528	0.25
529	0.24
530	0.22
531	0.23
532	0.18
533	0.15
534	0.13
535	0.11
536	0.14
537	0.17
538	0.16
539	0.13
540	0.15
541	0.14
542	0.14
543	0.13
544	0.1
545	0.06
546	0.06
547	0.07
548	0.06
549	0.06
550	0.06
551	0.06
552	0.06
553	0.06
554	0.05
555	0.05
556	0.05
557	0.06
558	0.06
559	0.06
560	0.06
561	0.06
562	0.06
563	0.06
564	0.07
565	0.07
566	0.08
567	0.08
568	0.11
569	0.13
570	0.14
571	0.16
572	0.23
573	0.22
574	0.23
575	0.26
576	0.27
577	0.29
578	0.34
579	0.32
580	0.25
581	0.27
582	0.26
583	0.22
584	0.18
585	0.14
586	0.1
587	0.09
588	0.09
589	0.09
590	0.1
591	0.11
592	0.1
593	0.1
594	0.13
595	0.18
596	0.17
597	0.15
598	0.16
599	0.15
600	0.17
601	0.2
602	0.19
603	0.14
604	0.14
605	0.14
606	0.16
607	0.17
608	0.15
609	0.12
610	0.11
611	0.11
612	0.11
613	0.09
614	0.06
615	0.05
616	0.06
617	0.07
618	0.07
619	0.08
620	0.14
621	0.14
622	0.15
623	0.16
624	0.16
625	0.16
626	0.17
627	0.19
628	0.15
629	0.18
630	0.21
631	0.24
632	0.25
633	0.27
634	0.29
635	0.29
636	0.35
637	0.35
638	0.35
639	0.33
640	0.34
641	0.32
642	0.33
643	0.33
644	0.27
645	0.24
646	0.21
647	0.21
648	0.21
649	0.21
650	0.17
651	0.13
652	0.13
653	0.14
654	0.16
655	0.15
656	0.14
657	0.17
658	0.22
659	0.26
660	0.28
661	0.29
662	0.33
663	0.36
664	0.41
665	0.4
666	0.41
667	0.4
668	0.4
669	0.44
670	0.44
671	0.47
672	0.44
673	0.45
674	0.43
675	0.42
676	0.4
677	0.41
678	0.39
679	0.34
680	0.33
681	0.29
682	0.26
683	0.24
684	0.24
685	0.17
686	0.15
687	0.17
688	0.17
689	0.2
690	0.21
691	0.21
692	0.2
693	0.25
694	0.24
695	0.2
696	0.2
697	0.18
698	0.25
699	0.26
700	0.32
701	0.3
702	0.29
703	0.28
704	0.28
705	0.27
706	0.22
707	0.21
708	0.14
709	0.12
710	0.1
711	0.09
712	0.08
713	0.09
714	0.08
715	0.08
716	0.09
717	0.1
718	0.12
719	0.13
720	0.17
721	0.18
722	0.21
723	0.2
724	0.19
725	0.19
726	0.25
727	0.28
728	0.25
729	0.23
730	0.25
731	0.3
732	0.31
733	0.3
734	0.22
735	0.19
736	0.18
737	0.17
738	0.14
739	0.09
740	0.12
741	0.14
742	0.16
743	0.16
744	0.18
745	0.2
746	0.24
747	0.32
748	0.38
749	0.42
750	0.51
751	0.56
752	0.61
753	0.63
754	0.68
755	0.69
756	0.68
757	0.7
758	0.67
759	0.7
760	0.72
761	0.71
762	0.68
763	0.64
764	0.65
765	0.64
766	0.68
767	0.66
768	0.64
769	0.67
770	0.7
771	0.68
772	0.65
773	0.68
774	0.59
775	0.54
776	0.51
777	0.45
778	0.37
779	0.35
780	0.29
781	0.19
782	0.22
783	0.21
784	0.16
785	0.16
786	0.15
787	0.15
788	0.18
789	0.22
790	0.19
791	0.21
792	0.27
793	0.29
794	0.29
795	0.28
796	0.31
797	0.31
798	0.35
799	0.37
800	0.34
801	0.32
802	0.3
803	0.3
804	0.25
805	0.2
806	0.15
807	0.13
808	0.1
809	0.1
810	0.09
811	0.1
812	0.09
813	0.09
814	0.12
815	0.15
816	0.16
817	0.19
818	0.26
819	0.28
820	0.3
821	0.31
822	0.34
823	0.34
824	0.35
825	0.37
826	0.39
827	0.42
828	0.48
829	0.46
830	0.43
831	0.41
832	0.41
833	0.38
834	0.29
835	0.24
836	0.19
837	0.2
838	0.2
839	0.18
840	0.14
841	0.13
842	0.13
843	0.13
844	0.1
845	0.1
846	0.09
847	0.12
848	0.14
849	0.14
850	0.16
851	0.2
852	0.23
853	0.23
854	0.27
855	0.29
856	0.3
857	0.34
858	0.36
859	0.35
860	0.39
861	0.44
862	0.45

A0A2T0FFU3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer