Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T0FND9

Protein Details
Accession A0A2T0FND9    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MDRRKRRPPRRQRPLPLAPPELVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-16RRKRRPPRRQRPLP
Subcellular Location(s) mito 15, cyto_nucl 6, nucl 5.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MDRRKRRPPRRQRPLPLAPPELVKTAQGLAERPRKSRWDIHAKGYEEISTEQLKLSGEIAPGSPLPDQVPKQLLKIASLPDLVPEQSVSIRKLLCDGEDAEVLSYLSKFGSVEKQGNAFVVENAKLAAIALATPGPFKFGRPANVVSALQGDIYTNTNTWYGDSDTAADEIVQLKGSKLFLSPASTDGLTPLFDSRYGQPPLSKQLARMAKQACDKAPAPPSTELVVFNAVDQTAPEGAQAVCGEIEQACKKHGAVVDIQFVSPKDGLSYIQVSFARAEDCTKALDQLGGIEFDGKPLICAYK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.94
2 0.93
3 0.9
4 0.83
5 0.73
6 0.66
7 0.58
8 0.51
9 0.4
10 0.31
11 0.24
12 0.21
13 0.22
14 0.19
15 0.2
16 0.25
17 0.34
18 0.37
19 0.39
20 0.43
21 0.46
22 0.5
23 0.56
24 0.57
25 0.59
26 0.6
27 0.66
28 0.68
29 0.66
30 0.62
31 0.54
32 0.44
33 0.35
34 0.32
35 0.26
36 0.2
37 0.17
38 0.16
39 0.16
40 0.15
41 0.14
42 0.13
43 0.13
44 0.11
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.12
49 0.13
50 0.12
51 0.1
52 0.12
53 0.17
54 0.18
55 0.21
56 0.26
57 0.25
58 0.26
59 0.29
60 0.28
61 0.24
62 0.26
63 0.24
64 0.2
65 0.2
66 0.19
67 0.16
68 0.17
69 0.15
70 0.12
71 0.1
72 0.09
73 0.11
74 0.14
75 0.14
76 0.15
77 0.15
78 0.15
79 0.18
80 0.17
81 0.15
82 0.15
83 0.15
84 0.14
85 0.14
86 0.14
87 0.12
88 0.11
89 0.1
90 0.08
91 0.07
92 0.05
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.06
97 0.11
98 0.14
99 0.17
100 0.18
101 0.2
102 0.2
103 0.2
104 0.2
105 0.15
106 0.12
107 0.11
108 0.11
109 0.09
110 0.09
111 0.08
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.12
126 0.14
127 0.18
128 0.21
129 0.23
130 0.22
131 0.25
132 0.25
133 0.2
134 0.19
135 0.15
136 0.11
137 0.09
138 0.07
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.06
143 0.07
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.08
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.08
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.07
166 0.09
167 0.09
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.13
172 0.13
173 0.13
174 0.12
175 0.11
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.09
182 0.11
183 0.18
184 0.2
185 0.2
186 0.21
187 0.23
188 0.29
189 0.33
190 0.31
191 0.25
192 0.32
193 0.39
194 0.38
195 0.43
196 0.39
197 0.38
198 0.43
199 0.45
200 0.37
201 0.35
202 0.34
203 0.33
204 0.37
205 0.34
206 0.33
207 0.31
208 0.32
209 0.29
210 0.3
211 0.24
212 0.19
213 0.19
214 0.15
215 0.13
216 0.12
217 0.1
218 0.09
219 0.08
220 0.09
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.1
227 0.1
228 0.08
229 0.08
230 0.07
231 0.08
232 0.07
233 0.12
234 0.14
235 0.15
236 0.16
237 0.17
238 0.17
239 0.21
240 0.23
241 0.21
242 0.23
243 0.26
244 0.32
245 0.31
246 0.31
247 0.28
248 0.27
249 0.27
250 0.22
251 0.18
252 0.12
253 0.12
254 0.13
255 0.15
256 0.18
257 0.15
258 0.2
259 0.21
260 0.21
261 0.21
262 0.21
263 0.18
264 0.16
265 0.18
266 0.15
267 0.16
268 0.17
269 0.17
270 0.18
271 0.17
272 0.17
273 0.15
274 0.16
275 0.16
276 0.14
277 0.14
278 0.14
279 0.13
280 0.14
281 0.16
282 0.12
283 0.11