Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J7S0G8

Protein Details
Accession J7S0G8    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-64EQDGKRSRGRRGKTKRTAGATBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
48-84KRSRGRRGKTKRTAGATEVKIEPGSLLTRREKRAKRR
192-193KR
197-206HEQRSAKRRR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.5, mito 6, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000690  Matrin/U1-C_Znf_C2H2  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR013085  U1-CZ_Znf_C2H2  
IPR017340  U1_snRNP-C  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF06220  zf-U1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50171  ZF_MATRIN  
Amino Acid Sequences MARYYCEYCHSYLTHDTLSVRKSHLVGKNHLRVVADYYRNKQLEQDGKRSRGRRGKTKRTAGATEVKIEPGSLLTRREKRAKRRVPSLYPLAGLSSLYRGSPGYNRVFISENRFDIASGVASSQLPQRANTRTPGGVGTQAPRDAEFDGLLQSTTPLAPPLVLSAWSSTVPKRSVFHGGPQHHAQAARDSRKRIVAHEQRSAKRRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.28
3 0.28
4 0.28
5 0.29
6 0.28
7 0.25
8 0.24
9 0.25
10 0.31
11 0.37
12 0.39
13 0.45
14 0.52
15 0.58
16 0.57
17 0.57
18 0.5
19 0.43
20 0.43
21 0.43
22 0.41
23 0.38
24 0.4
25 0.47
26 0.47
27 0.46
28 0.43
29 0.43
30 0.45
31 0.46
32 0.52
33 0.51
34 0.57
35 0.64
36 0.64
37 0.65
38 0.64
39 0.66
40 0.67
41 0.7
42 0.75
43 0.78
44 0.84
45 0.81
46 0.78
47 0.74
48 0.67
49 0.65
50 0.55
51 0.49
52 0.4
53 0.33
54 0.27
55 0.24
56 0.2
57 0.12
58 0.13
59 0.11
60 0.15
61 0.21
62 0.27
63 0.32
64 0.42
65 0.48
66 0.56
67 0.66
68 0.71
69 0.71
70 0.75
71 0.78
72 0.74
73 0.73
74 0.68
75 0.58
76 0.49
77 0.42
78 0.32
79 0.24
80 0.18
81 0.12
82 0.08
83 0.07
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.07
88 0.09
89 0.13
90 0.14
91 0.16
92 0.16
93 0.18
94 0.2
95 0.2
96 0.25
97 0.23
98 0.21
99 0.2
100 0.2
101 0.18
102 0.16
103 0.15
104 0.08
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.08
111 0.12
112 0.12
113 0.13
114 0.17
115 0.21
116 0.23
117 0.25
118 0.26
119 0.23
120 0.23
121 0.23
122 0.2
123 0.18
124 0.18
125 0.17
126 0.16
127 0.17
128 0.16
129 0.16
130 0.16
131 0.14
132 0.13
133 0.11
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.07
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.11
153 0.12
154 0.14
155 0.14
156 0.19
157 0.2
158 0.23
159 0.23
160 0.25
161 0.32
162 0.32
163 0.39
164 0.43
165 0.44
166 0.48
167 0.5
168 0.48
169 0.43
170 0.42
171 0.35
172 0.35
173 0.41
174 0.45
175 0.47
176 0.49
177 0.5
178 0.57
179 0.57
180 0.52
181 0.54
182 0.55
183 0.57
184 0.62
185 0.68
186 0.68
187 0.76