Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J7S7M8

Protein Details
Accession J7S7M8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
159-183RYDGQTIKSKLKKQKKSYSCTCHIFHydrophilic
356-376GATNSRKRRRFRSPNEKTDALHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038609  HDA1_su2/3_sf  
IPR021006  Hda2/3  
IPR026216  HDA3  
Gene Ontology GO:0070823  C:HDA1 complex  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF11496  HDA2-3  
Amino Acid Sequences MDLLRILDTRPVPSIVDATILGVSGNVSGDYWLPTTMCTYQRELTDQIVSLHYSDILRYFETKNYKEDVVLGSMETMCRNNELVATHPYLLIDHFLPKSLVTRDVPSYLAETSGKFQVLRDLVALVQEYETDTAVVCRPGRTMDLVEALLLGSNVNVKRYDGQTIKSKLKKQKKSYSCTCHIFPSKSWDPETLPITKGTRQFDMLIAVDSSVDPDTPEMQVVLTHARSNRGRRTRAPVVRLVAINSIDHCALYFGKLYEKNSREYLENVTAAVVVLRDRVGALPPDLRPIYYQHLNYLLEWLENPLIPWPLPDVFPIQKYNSMDVERSLLSEVKFSSKRASIGNANFGESDDNDGGATNSRKRRRFRSPNEKTDALNTEDNASAPSFYETKRLKNDYSKNPTKQGMGQLTGIISSDQKMESDYHLSSNILTHKLIQNMGQLYVDILRQIKDIQMYFEMDSIEEGHITFYQEEDQKISHKLDDAKAVVADNVKKSDVLEQENKLYYTETENLEVEFASLLESLKARTPELKECTDLFEKSNSLNEEIEREQRISESKTLENEYMEREIKRADEAMQSAGEELVKVKESITSIELEIEASSNKFIAKQEDVKAGMARLNHQIEDRKETNTQFKKNLEDLTQKLQKVPISRARSSNQLASSATMTATSSSSNSTSNISSNRKIKNPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.18
3 0.18
4 0.16
5 0.14
6 0.13
7 0.12
8 0.1
9 0.08
10 0.08
11 0.06
12 0.07
13 0.06
14 0.06
15 0.06
16 0.08
17 0.09
18 0.1
19 0.1
20 0.1
21 0.11
22 0.14
23 0.19
24 0.23
25 0.24
26 0.28
27 0.31
28 0.34
29 0.38
30 0.36
31 0.35
32 0.33
33 0.31
34 0.28
35 0.26
36 0.24
37 0.2
38 0.18
39 0.17
40 0.14
41 0.13
42 0.14
43 0.14
44 0.15
45 0.18
46 0.2
47 0.25
48 0.33
49 0.35
50 0.36
51 0.38
52 0.38
53 0.35
54 0.36
55 0.31
56 0.25
57 0.23
58 0.19
59 0.17
60 0.16
61 0.16
62 0.15
63 0.14
64 0.12
65 0.13
66 0.14
67 0.13
68 0.14
69 0.15
70 0.17
71 0.21
72 0.23
73 0.22
74 0.22
75 0.21
76 0.19
77 0.19
78 0.17
79 0.13
80 0.15
81 0.14
82 0.15
83 0.16
84 0.16
85 0.2
86 0.2
87 0.24
88 0.21
89 0.25
90 0.26
91 0.28
92 0.28
93 0.25
94 0.24
95 0.19
96 0.2
97 0.17
98 0.15
99 0.16
100 0.18
101 0.18
102 0.16
103 0.16
104 0.21
105 0.21
106 0.21
107 0.19
108 0.17
109 0.16
110 0.17
111 0.17
112 0.1
113 0.09
114 0.08
115 0.09
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.09
122 0.13
123 0.13
124 0.13
125 0.14
126 0.15
127 0.17
128 0.18
129 0.18
130 0.17
131 0.19
132 0.18
133 0.17
134 0.15
135 0.13
136 0.11
137 0.09
138 0.06
139 0.04
140 0.09
141 0.09
142 0.11
143 0.11
144 0.13
145 0.17
146 0.19
147 0.26
148 0.24
149 0.28
150 0.35
151 0.41
152 0.49
153 0.52
154 0.59
155 0.62
156 0.7
157 0.76
158 0.77
159 0.82
160 0.83
161 0.85
162 0.87
163 0.86
164 0.83
165 0.78
166 0.7
167 0.68
168 0.64
169 0.58
170 0.49
171 0.49
172 0.48
173 0.46
174 0.46
175 0.4
176 0.36
177 0.38
178 0.4
179 0.33
180 0.28
181 0.27
182 0.28
183 0.3
184 0.32
185 0.3
186 0.29
187 0.28
188 0.28
189 0.26
190 0.26
191 0.22
192 0.17
193 0.14
194 0.12
195 0.11
196 0.09
197 0.1
198 0.07
199 0.06
200 0.05
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.07
206 0.06
207 0.07
208 0.08
209 0.1
210 0.1
211 0.12
212 0.13
213 0.19
214 0.24
215 0.31
216 0.39
217 0.45
218 0.49
219 0.52
220 0.6
221 0.64
222 0.66
223 0.64
224 0.59
225 0.54
226 0.52
227 0.47
228 0.39
229 0.31
230 0.25
231 0.21
232 0.16
233 0.14
234 0.11
235 0.1
236 0.09
237 0.08
238 0.07
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.13
243 0.16
244 0.19
245 0.27
246 0.28
247 0.3
248 0.32
249 0.33
250 0.29
251 0.29
252 0.3
253 0.24
254 0.22
255 0.19
256 0.17
257 0.15
258 0.14
259 0.12
260 0.07
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.06
268 0.07
269 0.08
270 0.11
271 0.11
272 0.15
273 0.15
274 0.15
275 0.15
276 0.17
277 0.21
278 0.23
279 0.23
280 0.2
281 0.24
282 0.24
283 0.23
284 0.22
285 0.16
286 0.12
287 0.11
288 0.11
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.07
293 0.08
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.09
299 0.1
300 0.12
301 0.13
302 0.15
303 0.18
304 0.17
305 0.2
306 0.21
307 0.22
308 0.21
309 0.21
310 0.19
311 0.17
312 0.18
313 0.14
314 0.13
315 0.12
316 0.11
317 0.1
318 0.11
319 0.11
320 0.14
321 0.15
322 0.15
323 0.17
324 0.17
325 0.19
326 0.18
327 0.21
328 0.22
329 0.23
330 0.29
331 0.26
332 0.25
333 0.23
334 0.22
335 0.2
336 0.14
337 0.15
338 0.08
339 0.08
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.09
344 0.11
345 0.14
346 0.22
347 0.29
348 0.36
349 0.41
350 0.49
351 0.57
352 0.67
353 0.72
354 0.76
355 0.79
356 0.82
357 0.83
358 0.77
359 0.66
360 0.6
361 0.51
362 0.43
363 0.34
364 0.25
365 0.2
366 0.19
367 0.18
368 0.15
369 0.12
370 0.08
371 0.07
372 0.09
373 0.08
374 0.08
375 0.17
376 0.18
377 0.23
378 0.29
379 0.33
380 0.35
381 0.43
382 0.51
383 0.53
384 0.61
385 0.65
386 0.62
387 0.63
388 0.62
389 0.54
390 0.49
391 0.46
392 0.39
393 0.32
394 0.29
395 0.24
396 0.22
397 0.2
398 0.17
399 0.1
400 0.07
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.08
406 0.08
407 0.1
408 0.13
409 0.13
410 0.13
411 0.14
412 0.14
413 0.12
414 0.14
415 0.15
416 0.13
417 0.13
418 0.14
419 0.17
420 0.19
421 0.19
422 0.18
423 0.19
424 0.18
425 0.19
426 0.16
427 0.13
428 0.12
429 0.12
430 0.11
431 0.08
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.09
436 0.1
437 0.12
438 0.12
439 0.13
440 0.14
441 0.15
442 0.15
443 0.16
444 0.14
445 0.11
446 0.11
447 0.11
448 0.09
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.08
454 0.08
455 0.07
456 0.11
457 0.13
458 0.14
459 0.14
460 0.15
461 0.16
462 0.19
463 0.2
464 0.17
465 0.19
466 0.22
467 0.23
468 0.28
469 0.26
470 0.24
471 0.23
472 0.23
473 0.2
474 0.19
475 0.2
476 0.17
477 0.17
478 0.17
479 0.16
480 0.17
481 0.22
482 0.22
483 0.26
484 0.29
485 0.3
486 0.34
487 0.36
488 0.35
489 0.3
490 0.26
491 0.21
492 0.2
493 0.22
494 0.19
495 0.19
496 0.19
497 0.19
498 0.18
499 0.17
500 0.12
501 0.09
502 0.07
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.07
508 0.08
509 0.11
510 0.13
511 0.13
512 0.18
513 0.22
514 0.29
515 0.34
516 0.36
517 0.35
518 0.35
519 0.4
520 0.38
521 0.35
522 0.29
523 0.26
524 0.25
525 0.23
526 0.28
527 0.24
528 0.22
529 0.22
530 0.21
531 0.23
532 0.24
533 0.28
534 0.25
535 0.24
536 0.22
537 0.22
538 0.26
539 0.25
540 0.26
541 0.26
542 0.26
543 0.3
544 0.33
545 0.32
546 0.3
547 0.28
548 0.27
549 0.28
550 0.28
551 0.25
552 0.23
553 0.23
554 0.22
555 0.22
556 0.2
557 0.18
558 0.19
559 0.2
560 0.21
561 0.2
562 0.19
563 0.18
564 0.17
565 0.14
566 0.09
567 0.09
568 0.09
569 0.1
570 0.1
571 0.1
572 0.12
573 0.13
574 0.15
575 0.15
576 0.15
577 0.14
578 0.15
579 0.15
580 0.13
581 0.12
582 0.11
583 0.1
584 0.09
585 0.09
586 0.08
587 0.09
588 0.11
589 0.12
590 0.17
591 0.23
592 0.28
593 0.32
594 0.38
595 0.39
596 0.39
597 0.39
598 0.35
599 0.3
600 0.25
601 0.24
602 0.26
603 0.27
604 0.26
605 0.29
606 0.35
607 0.37
608 0.44
609 0.43
610 0.39
611 0.42
612 0.45
613 0.52
614 0.53
615 0.57
616 0.55
617 0.57
618 0.6
619 0.6
620 0.6
621 0.56
622 0.55
623 0.52
624 0.55
625 0.58
626 0.52
627 0.5
628 0.49
629 0.46
630 0.43
631 0.48
632 0.48
633 0.49
634 0.53
635 0.57
636 0.56
637 0.61
638 0.6
639 0.58
640 0.5
641 0.45
642 0.41
643 0.37
644 0.35
645 0.27
646 0.23
647 0.16
648 0.15
649 0.13
650 0.12
651 0.11
652 0.11
653 0.13
654 0.14
655 0.15
656 0.16
657 0.18
658 0.19
659 0.23
660 0.31
661 0.35
662 0.41
663 0.48
664 0.54