Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J7RP93

Protein Details
Accession J7RP93    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
409-433VGSTTVHKRRKSSNKNKRPSFTESTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
416-425KRRKSSNKNK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019680  Mediator_Med1  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10744  Med1  
Amino Acid Sequences MAVDSYVEVLDQMVKLFKVYKPGEVTLENILRLCQTLNLESFIEDVGEGTERLSTASKIIVIDIDFDKMEGKVKQVKLVLASTYNSFNYYAPDATGNPNKEDNILLNSLVNFADLKQFQANLQFLYLLDTYSQLDMENGSSTTNGHGNNNNADSSANSTNPIGGGNSLSSTTKNGKLDLFKYYTELVEFLGQYFIDFNIQLEVTPNLNSIFGIYIHSGDQILAVIKLAKAKSPTTRLYEYVYSKETKRWINEFPENYVNGLSLVMEIQDKAVWFPREFLSEDIIFERLKDDDFVAPIVDVLINNTTEGVNGSISNRLFNTSQNISLLNDFTTKLINVTKFDISNDNLDLVAEIQKWILWYNTVLQRIVETLNRNSLRGGSLDVPNGAENNEDDLGNKHGGRLRRQSIVVGSTTVHKRRKSSNKNKRPSFTESTMLKEQGLQQFNLHDILTQPVIEENGMDASNEEALVIEGDDDDKMDICADDEQVPTAGTAMHQLVISEDHISLNGKINCSLYEPPENWKKFFRAFETWAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.13
3 0.16
4 0.17
5 0.25
6 0.27
7 0.33
8 0.36
9 0.38
10 0.41
11 0.39
12 0.4
13 0.38
14 0.39
15 0.32
16 0.27
17 0.25
18 0.21
19 0.21
20 0.19
21 0.14
22 0.15
23 0.18
24 0.19
25 0.21
26 0.21
27 0.21
28 0.21
29 0.17
30 0.14
31 0.1
32 0.09
33 0.07
34 0.08
35 0.08
36 0.07
37 0.08
38 0.08
39 0.09
40 0.11
41 0.1
42 0.1
43 0.12
44 0.13
45 0.12
46 0.13
47 0.13
48 0.12
49 0.15
50 0.15
51 0.15
52 0.13
53 0.13
54 0.14
55 0.12
56 0.17
57 0.14
58 0.18
59 0.25
60 0.27
61 0.32
62 0.34
63 0.35
64 0.34
65 0.35
66 0.32
67 0.26
68 0.27
69 0.23
70 0.23
71 0.22
72 0.2
73 0.19
74 0.17
75 0.18
76 0.19
77 0.17
78 0.15
79 0.17
80 0.17
81 0.22
82 0.29
83 0.28
84 0.28
85 0.3
86 0.29
87 0.28
88 0.28
89 0.24
90 0.21
91 0.2
92 0.17
93 0.16
94 0.16
95 0.16
96 0.15
97 0.13
98 0.09
99 0.08
100 0.14
101 0.13
102 0.15
103 0.16
104 0.16
105 0.17
106 0.23
107 0.23
108 0.18
109 0.18
110 0.16
111 0.14
112 0.17
113 0.17
114 0.11
115 0.1
116 0.1
117 0.11
118 0.11
119 0.11
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.09
130 0.12
131 0.12
132 0.14
133 0.17
134 0.2
135 0.24
136 0.25
137 0.23
138 0.2
139 0.19
140 0.17
141 0.19
142 0.19
143 0.15
144 0.15
145 0.15
146 0.14
147 0.14
148 0.14
149 0.09
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.11
158 0.14
159 0.19
160 0.19
161 0.2
162 0.23
163 0.26
164 0.28
165 0.3
166 0.3
167 0.25
168 0.26
169 0.25
170 0.22
171 0.19
172 0.17
173 0.12
174 0.11
175 0.11
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.12
217 0.15
218 0.2
219 0.25
220 0.28
221 0.3
222 0.33
223 0.32
224 0.33
225 0.35
226 0.33
227 0.3
228 0.28
229 0.25
230 0.24
231 0.26
232 0.28
233 0.27
234 0.29
235 0.3
236 0.32
237 0.36
238 0.42
239 0.4
240 0.39
241 0.38
242 0.34
243 0.31
244 0.26
245 0.19
246 0.13
247 0.11
248 0.08
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.1
259 0.11
260 0.11
261 0.13
262 0.14
263 0.15
264 0.17
265 0.17
266 0.16
267 0.14
268 0.15
269 0.14
270 0.14
271 0.11
272 0.1
273 0.1
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.06
285 0.05
286 0.04
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.1
300 0.1
301 0.11
302 0.1
303 0.12
304 0.12
305 0.13
306 0.18
307 0.16
308 0.17
309 0.17
310 0.17
311 0.16
312 0.16
313 0.15
314 0.11
315 0.1
316 0.1
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.12
322 0.13
323 0.14
324 0.16
325 0.18
326 0.17
327 0.19
328 0.21
329 0.18
330 0.19
331 0.18
332 0.15
333 0.13
334 0.13
335 0.12
336 0.09
337 0.1
338 0.08
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.08
343 0.09
344 0.08
345 0.07
346 0.07
347 0.13
348 0.18
349 0.2
350 0.2
351 0.19
352 0.19
353 0.2
354 0.21
355 0.18
356 0.17
357 0.17
358 0.26
359 0.26
360 0.26
361 0.25
362 0.25
363 0.22
364 0.19
365 0.2
366 0.15
367 0.16
368 0.17
369 0.17
370 0.17
371 0.16
372 0.15
373 0.13
374 0.1
375 0.08
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.12
381 0.14
382 0.16
383 0.16
384 0.15
385 0.18
386 0.24
387 0.3
388 0.38
389 0.39
390 0.41
391 0.42
392 0.42
393 0.41
394 0.39
395 0.33
396 0.25
397 0.21
398 0.23
399 0.29
400 0.34
401 0.38
402 0.38
403 0.42
404 0.51
405 0.62
406 0.67
407 0.72
408 0.76
409 0.8
410 0.88
411 0.92
412 0.88
413 0.83
414 0.8
415 0.77
416 0.7
417 0.68
418 0.59
419 0.56
420 0.54
421 0.48
422 0.4
423 0.34
424 0.35
425 0.35
426 0.36
427 0.3
428 0.27
429 0.27
430 0.28
431 0.28
432 0.22
433 0.14
434 0.12
435 0.14
436 0.14
437 0.12
438 0.11
439 0.1
440 0.11
441 0.1
442 0.1
443 0.08
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.08
448 0.08
449 0.09
450 0.08
451 0.07
452 0.05
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.05
457 0.05
458 0.05
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.09
468 0.11
469 0.13
470 0.13
471 0.14
472 0.14
473 0.14
474 0.13
475 0.11
476 0.1
477 0.07
478 0.1
479 0.1
480 0.11
481 0.1
482 0.1
483 0.11
484 0.13
485 0.14
486 0.12
487 0.11
488 0.1
489 0.12
490 0.14
491 0.14
492 0.22
493 0.24
494 0.24
495 0.25
496 0.26
497 0.26
498 0.29
499 0.31
500 0.27
501 0.33
502 0.33
503 0.39
504 0.48
505 0.51
506 0.5
507 0.52
508 0.53
509 0.52
510 0.58
511 0.57
512 0.54