FuNGI

A0A2S4KMF5

Protein Details

Accession

A0A2S4KMF5

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
436-456	APVPTRKRKAIDIFMRPKKRV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
270-273	AAKK
442-444	KRK
451-455	RPKKR

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010684 RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A
Gene Ontology	GO:0070449 C:elongin complex GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF06881 Elongin_A

Amino Acid Sequences

MPPIKSLMEIATMVCIKNIKGLESVGDYLPYESVRHILLKVDSAYQMRQIELNSPQLQGETGEIWIKIIENDFPLEYKATAYKPQSPDKWYRVWEKYKKEHDLAIEESENKLKNALAGLQEVKEKNTSKIIGRKYLPRAGRTGPKRAWGQRDTTSSALTFNAGGRTKTNTGASVMRKVRREVKEIAAIHGQRSRPIQGPTRQTEVRRAPPAMVNDYRRAANPQYRSTNKAPESLSAVEQYEKRATFISDSEDDDDAPFGEAAKKPTTKPAAKKPATAPVKNSVAEAAKVSLLKKKPTIQPTVLRPASSTKPAVKAQPTTPATPRQTAKTTTTTNTATPQKQDKPGTVTKPSTTTTTTTAGKGAATLANKFRRSPTKPRATSNSPADSATTRPSAVPDQPLPEADSHLPAARTTPPREGSAGPSSSEELVAALAEAAPVPTRKRKAIDIFMRPKKRVH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.18
3	0.15
4	0.21
5	0.21
6	0.18
7	0.19
8	0.2
9	0.21
10	0.23
11	0.25
12	0.2
13	0.2
14	0.18
15	0.17
16	0.18
17	0.16
18	0.13
19	0.11
20	0.13
21	0.13
22	0.15
23	0.15
24	0.17
25	0.18
26	0.21
27	0.22
28	0.23
29	0.24
30	0.25
31	0.26
32	0.28
33	0.27
34	0.24
35	0.24
36	0.23
37	0.24
38	0.26
39	0.33
40	0.28
41	0.28
42	0.27
43	0.26
44	0.25
45	0.21
46	0.18
47	0.11
48	0.11
49	0.12
50	0.12
51	0.12
52	0.12
53	0.11
54	0.11
55	0.11
56	0.11
57	0.11
58	0.12
59	0.13
60	0.13
61	0.14
62	0.14
63	0.13
64	0.13
65	0.16
66	0.16
67	0.23
68	0.26
69	0.33
70	0.38
71	0.46
72	0.5
73	0.53
74	0.59
75	0.58
76	0.61
77	0.58
78	0.61
79	0.62
80	0.67
81	0.69
82	0.7
83	0.75
84	0.78
85	0.79
86	0.73
87	0.67
88	0.6
89	0.57
90	0.49
91	0.44
92	0.37
93	0.3
94	0.29
95	0.29
96	0.26
97	0.21
98	0.19
99	0.15
100	0.14
101	0.14
102	0.16
103	0.13
104	0.15
105	0.17
106	0.17
107	0.22
108	0.22
109	0.22
110	0.24
111	0.24
112	0.24
113	0.27
114	0.29
115	0.3
116	0.37
117	0.4
118	0.43
119	0.44
120	0.5
121	0.51
122	0.56
123	0.54
124	0.49
125	0.49
126	0.46
127	0.52
128	0.49
129	0.52
130	0.47
131	0.49
132	0.54
133	0.56
134	0.59
135	0.53
136	0.53
137	0.5
138	0.52
139	0.5
140	0.44
141	0.38
142	0.3
143	0.28
144	0.23
145	0.17
146	0.13
147	0.1
148	0.14
149	0.14
150	0.14
151	0.15
152	0.19
153	0.2
154	0.22
155	0.22
156	0.17
157	0.19
158	0.24
159	0.25
160	0.29
161	0.33
162	0.35
163	0.36
164	0.39
165	0.46
166	0.44
167	0.47
168	0.42
169	0.41
170	0.45
171	0.43
172	0.42
173	0.39
174	0.35
175	0.32
176	0.32
177	0.28
178	0.22
179	0.23
180	0.24
181	0.22
182	0.25
183	0.31
184	0.33
185	0.4
186	0.41
187	0.45
188	0.45
189	0.43
190	0.47
191	0.46
192	0.46
193	0.43
194	0.4
195	0.36
196	0.36
197	0.37
198	0.34
199	0.33
200	0.29
201	0.28
202	0.29
203	0.28
204	0.25
205	0.26
206	0.24
207	0.25
208	0.27
209	0.3
210	0.36
211	0.38
212	0.43
213	0.43
214	0.47
215	0.42
216	0.42
217	0.37
218	0.31
219	0.33
220	0.28
221	0.26
222	0.19
223	0.18
224	0.15
225	0.15
226	0.16
227	0.15
228	0.14
229	0.14
230	0.13
231	0.13
232	0.13
233	0.13
234	0.15
235	0.13
236	0.15
237	0.16
238	0.15
239	0.15
240	0.14
241	0.13
242	0.09
243	0.08
244	0.07
245	0.05
246	0.08
247	0.09
248	0.12
249	0.16
250	0.18
251	0.18
252	0.25
253	0.33
254	0.36
255	0.42
256	0.5
257	0.57
258	0.57
259	0.61
260	0.57
261	0.59
262	0.59
263	0.54
264	0.47
265	0.43
266	0.45
267	0.4
268	0.38
269	0.3
270	0.24
271	0.23
272	0.2
273	0.14
274	0.11
275	0.12
276	0.13
277	0.17
278	0.19
279	0.22
280	0.25
281	0.31
282	0.38
283	0.43
284	0.49
285	0.48
286	0.52
287	0.55
288	0.61
289	0.55
290	0.48
291	0.42
292	0.4
293	0.38
294	0.35
295	0.32
296	0.25
297	0.3
298	0.32
299	0.36
300	0.36
301	0.37
302	0.35
303	0.41
304	0.41
305	0.39
306	0.4
307	0.44
308	0.43
309	0.45
310	0.45
311	0.4
312	0.42
313	0.42
314	0.43
315	0.4
316	0.41
317	0.37
318	0.39
319	0.36
320	0.33
321	0.36
322	0.38
323	0.34
324	0.36
325	0.42
326	0.43
327	0.49
328	0.51
329	0.48
330	0.49
331	0.54
332	0.54
333	0.54
334	0.51
335	0.45
336	0.46
337	0.44
338	0.4
339	0.35
340	0.31
341	0.27
342	0.28
343	0.28
344	0.25
345	0.25
346	0.22
347	0.19
348	0.17
349	0.15
350	0.14
351	0.13
352	0.16
353	0.23
354	0.3
355	0.32
356	0.33
357	0.38
358	0.45
359	0.51
360	0.58
361	0.62
362	0.65
363	0.69
364	0.75
365	0.77
366	0.74
367	0.76
368	0.73
369	0.68
370	0.58
371	0.53
372	0.48
373	0.41
374	0.36
375	0.31
376	0.25
377	0.2
378	0.19
379	0.22
380	0.24
381	0.26
382	0.31
383	0.29
384	0.31
385	0.32
386	0.33
387	0.32
388	0.28
389	0.28
390	0.23
391	0.22
392	0.2
393	0.21
394	0.21
395	0.19
396	0.21
397	0.25
398	0.3
399	0.32
400	0.38
401	0.38
402	0.4
403	0.43
404	0.43
405	0.41
406	0.42
407	0.39
408	0.33
409	0.32
410	0.31
411	0.28
412	0.26
413	0.2
414	0.12
415	0.11
416	0.09
417	0.07
418	0.06
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.07
424	0.1
425	0.15
426	0.24
427	0.3
428	0.36
429	0.4
430	0.49
431	0.56
432	0.64
433	0.69
434	0.71
435	0.77
436	0.81
437	0.86

A0A2S4KMF5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer