Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2S4L4I3

Protein Details
Accession A0A2S4L4I3    Localization Confidence Low Confidence Score 8.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-29HTNQLFAFPRKRRRDLVCRATRLRVHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 9, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037363  Sec13/Seh1_fam  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005643  C:nuclear pore  
GO:0005198  F:structural molecule activity  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0015031  P:protein transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MDMHTNQLFAFPRKRRRDLVCRATRLRVHRKIPLILAPGAGAAACGLAGRGITCSSTPPAVTKACRHRYQQTDSFKLSNQNRLLSSHLLSLRRPSLTPAASTARRSTTQDANNPHKAAQVIANSGHDDMIHDAVLDYYGRKLATCSSDRTIKIFEIEGESQRLIETLKGHEGAVWCVAWAHPKYGNILASAGYDGKVFIWKEQGAQNNQWQRIYDFPLHKASVNIVAWSPHEAGCLLACASSDGNVSVLEFKDNAVDHTTFPAHGLGVNSVSWAPATSPGSIVSSTPNPGSVGNRRFVTGGSDNVLKIWAFDQASQSYKQEREPLAGHTDWVRDVAWSPTVLQKSYIASASQDKTVRIWTSDASSGGQWDCKVLNFEAAVWRVSWSLSGNVLAVSGADNKVSLWKENLRGEWECVKSIEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.71
3 0.77
4 0.81
5 0.83
6 0.85
7 0.84
8 0.84
9 0.82
10 0.82
11 0.79
12 0.78
13 0.78
14 0.76
15 0.72
16 0.71
17 0.73
18 0.69
19 0.67
20 0.63
21 0.57
22 0.49
23 0.42
24 0.34
25 0.27
26 0.22
27 0.18
28 0.1
29 0.05
30 0.04
31 0.03
32 0.03
33 0.03
34 0.03
35 0.04
36 0.04
37 0.05
38 0.06
39 0.07
40 0.08
41 0.11
42 0.13
43 0.15
44 0.15
45 0.16
46 0.21
47 0.25
48 0.29
49 0.35
50 0.43
51 0.51
52 0.56
53 0.6
54 0.65
55 0.68
56 0.72
57 0.73
58 0.71
59 0.69
60 0.67
61 0.64
62 0.57
63 0.58
64 0.53
65 0.53
66 0.48
67 0.45
68 0.42
69 0.41
70 0.42
71 0.36
72 0.34
73 0.3
74 0.32
75 0.3
76 0.29
77 0.33
78 0.33
79 0.31
80 0.3
81 0.28
82 0.3
83 0.29
84 0.3
85 0.28
86 0.31
87 0.32
88 0.35
89 0.34
90 0.31
91 0.32
92 0.35
93 0.35
94 0.37
95 0.4
96 0.45
97 0.5
98 0.53
99 0.57
100 0.54
101 0.5
102 0.44
103 0.37
104 0.32
105 0.28
106 0.23
107 0.19
108 0.19
109 0.2
110 0.18
111 0.18
112 0.17
113 0.12
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.06
124 0.05
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.11
130 0.17
131 0.19
132 0.23
133 0.24
134 0.31
135 0.31
136 0.33
137 0.31
138 0.26
139 0.25
140 0.21
141 0.18
142 0.17
143 0.18
144 0.17
145 0.17
146 0.17
147 0.15
148 0.14
149 0.14
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.09
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.14
158 0.14
159 0.13
160 0.13
161 0.11
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.11
166 0.11
167 0.13
168 0.14
169 0.15
170 0.17
171 0.19
172 0.2
173 0.15
174 0.15
175 0.13
176 0.11
177 0.11
178 0.09
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.05
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.11
187 0.11
188 0.13
189 0.17
190 0.22
191 0.22
192 0.25
193 0.3
194 0.33
195 0.34
196 0.33
197 0.29
198 0.25
199 0.25
200 0.26
201 0.26
202 0.22
203 0.23
204 0.27
205 0.27
206 0.26
207 0.24
208 0.2
209 0.2
210 0.18
211 0.16
212 0.12
213 0.12
214 0.12
215 0.14
216 0.14
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.05
231 0.06
232 0.05
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.09
240 0.09
241 0.1
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.14
246 0.15
247 0.12
248 0.13
249 0.12
250 0.09
251 0.09
252 0.1
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.06
260 0.06
261 0.05
262 0.09
263 0.11
264 0.1
265 0.11
266 0.12
267 0.13
268 0.13
269 0.13
270 0.12
271 0.12
272 0.13
273 0.13
274 0.13
275 0.12
276 0.13
277 0.18
278 0.23
279 0.26
280 0.28
281 0.29
282 0.29
283 0.28
284 0.27
285 0.29
286 0.23
287 0.21
288 0.19
289 0.2
290 0.19
291 0.19
292 0.2
293 0.13
294 0.11
295 0.1
296 0.12
297 0.11
298 0.13
299 0.16
300 0.18
301 0.21
302 0.22
303 0.24
304 0.25
305 0.26
306 0.28
307 0.32
308 0.3
309 0.32
310 0.31
311 0.33
312 0.33
313 0.31
314 0.3
315 0.24
316 0.24
317 0.2
318 0.2
319 0.16
320 0.11
321 0.12
322 0.14
323 0.13
324 0.12
325 0.13
326 0.18
327 0.2
328 0.2
329 0.2
330 0.2
331 0.21
332 0.22
333 0.22
334 0.17
335 0.17
336 0.23
337 0.24
338 0.27
339 0.27
340 0.26
341 0.26
342 0.31
343 0.3
344 0.25
345 0.25
346 0.22
347 0.24
348 0.26
349 0.25
350 0.21
351 0.2
352 0.2
353 0.2
354 0.2
355 0.16
356 0.16
357 0.16
358 0.16
359 0.19
360 0.17
361 0.2
362 0.18
363 0.19
364 0.23
365 0.24
366 0.23
367 0.19
368 0.2
369 0.17
370 0.16
371 0.16
372 0.12
373 0.13
374 0.14
375 0.14
376 0.14
377 0.13
378 0.13
379 0.11
380 0.09
381 0.09
382 0.1
383 0.1
384 0.1
385 0.1
386 0.1
387 0.17
388 0.19
389 0.2
390 0.22
391 0.29
392 0.36
393 0.42
394 0.45
395 0.45
396 0.46
397 0.49
398 0.51
399 0.48
400 0.42