FuNGI

A0A2S4PXE4

Protein Details

Accession

A0A2S4PXE4

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
16-50	GERPLFVRKSRKTDPLRPRKKPLKRPPPHLKSSLV	Basic
417-440	AEARKKLGKKVKKALKKRERNYIY	Basic
522-545	SSGNESSRKKLKKKHFTQTVETTY	Hydrophilic
600-622	RGDIIDRAKKRHKPNVSINSSSR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
23-44	RKSRKTDPLRPRKKPLKRPPPH
414-435	KKEAEARKKLGKKVKKALKKRE
529-535	RKKLKKK

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSASPSGQSNGPTPNGERPLFVRKSRKTDPLRPRKKPLKRPPPHLKSSLVPPTSGASPLYPVNGLAPSDRAFKQQTDSNTRELNGGWTSQPEGDFCDYPLITTKRALREGLRYHIARFISKKDIDPRDQNQFTRPVVLHRRDPQQPSGKGSRNGEIEPDQLTDSKERERQEIARAEKEKQRVIDLAQIAPSGNNASSLATKKVISGRVEKTTQIYHLDTSEEDKKASDLRYEEALPWHLEDADNRNTWVGNYEAALSDMNVAFVIQDGVFKMIPIEKWYRFSSKGQFKTYTIDEAEAKMGKKVKESRWAMKEIEKKEADRANLEGRKAMARLFTVKTESSTFKNSSKREIEDMDELDFNGEDLFQDDDELATVEPDKDEETKEAQNRIKKEQLGANVFDQADEAEVDRELLEEKKEAEARKKLGKKVKKALKKRERNYIYDSESDHPYSEISEDDTSDEEKVKEIDKRLEEENKNKLKVDLKSVPNTSIKSATTSVSRSKENDALKKSHSRKRLGSPNLSESSGNESSRKKLKKKHFTQTVETTYPTSGPQIISPTSQHSSGQQNRYNSTASNATNMGKASDNYSASTNLSPNSDSEAIRGDIIDRAKKRHKPNVSINSSSRAGSRQGSPTLASPPITSQKVGPITTSDIISALPESGISIGNLMKSFGGRVGDDPATQTQKADFIKLVRANAKFGLDRLLRPK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.42
3	0.4
4	0.38
5	0.38
6	0.45
7	0.48
8	0.53
9	0.55
10	0.56
11	0.65
12	0.7
13	0.76
14	0.75
15	0.79
16	0.83
17	0.83
18	0.86
19	0.86
20	0.9
21	0.9
22	0.92
23	0.93
24	0.93
25	0.93
26	0.92
27	0.94
28	0.94
29	0.93
30	0.9
31	0.84
32	0.78
33	0.71
34	0.71
35	0.7
36	0.59
37	0.5
38	0.43
39	0.4
40	0.37
41	0.34
42	0.25
43	0.16
44	0.17
45	0.18
46	0.18
47	0.15
48	0.14
49	0.14
50	0.15
51	0.15
52	0.14
53	0.16
54	0.16
55	0.21
56	0.22
57	0.24
58	0.26
59	0.27
60	0.3
61	0.33
62	0.39
63	0.43
64	0.46
65	0.46
66	0.46
67	0.45
68	0.41
69	0.36
70	0.32
71	0.25
72	0.23
73	0.19
74	0.18
75	0.19
76	0.2
77	0.2
78	0.16
79	0.18
80	0.21
81	0.2
82	0.19
83	0.23
84	0.21
85	0.21
86	0.29
87	0.27
88	0.25
89	0.29
90	0.34
91	0.35
92	0.39
93	0.41
94	0.36
95	0.43
96	0.47
97	0.49
98	0.5
99	0.45
100	0.43
101	0.45
102	0.43
103	0.39
104	0.36
105	0.35
106	0.36
107	0.37
108	0.42
109	0.46
110	0.52
111	0.54
112	0.6
113	0.6
114	0.62
115	0.65
116	0.61
117	0.56
118	0.54
119	0.48
120	0.45
121	0.41
122	0.39
123	0.44
124	0.47
125	0.5
126	0.51
127	0.58
128	0.59
129	0.63
130	0.63
131	0.64
132	0.62
133	0.61
134	0.63
135	0.63
136	0.61
137	0.59
138	0.56
139	0.5
140	0.46
141	0.43
142	0.37
143	0.31
144	0.27
145	0.25
146	0.2
147	0.18
148	0.19
149	0.18
150	0.19
151	0.23
152	0.26
153	0.27
154	0.29
155	0.33
156	0.34
157	0.39
158	0.45
159	0.44
160	0.48
161	0.49
162	0.5
163	0.51
164	0.54
165	0.49
166	0.43
167	0.41
168	0.34
169	0.33
170	0.35
171	0.31
172	0.27
173	0.24
174	0.22
175	0.19
176	0.17
177	0.16
178	0.11
179	0.08
180	0.08
181	0.07
182	0.08
183	0.11
184	0.14
185	0.15
186	0.15
187	0.16
188	0.17
189	0.22
190	0.26
191	0.26
192	0.31
193	0.33
194	0.37
195	0.39
196	0.37
197	0.35
198	0.32
199	0.31
200	0.27
201	0.24
202	0.2
203	0.19
204	0.19
205	0.16
206	0.19
207	0.23
208	0.2
209	0.18
210	0.18
211	0.18
212	0.21
213	0.22
214	0.21
215	0.16
216	0.18
217	0.2
218	0.21
219	0.21
220	0.2
221	0.2
222	0.17
223	0.16
224	0.15
225	0.12
226	0.12
227	0.12
228	0.16
229	0.19
230	0.19
231	0.18
232	0.18
233	0.18
234	0.17
235	0.17
236	0.13
237	0.08
238	0.08
239	0.09
240	0.08
241	0.09
242	0.09
243	0.07
244	0.08
245	0.07
246	0.07
247	0.06
248	0.05
249	0.05
250	0.05
251	0.05
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.07
259	0.08
260	0.08
261	0.12
262	0.17
263	0.17
264	0.21
265	0.24
266	0.27
267	0.29
268	0.33
269	0.38
270	0.43
271	0.48
272	0.49
273	0.49
274	0.46
275	0.47
276	0.44
277	0.37
278	0.28
279	0.23
280	0.19
281	0.17
282	0.18
283	0.17
284	0.15
285	0.15
286	0.18
287	0.17
288	0.23
289	0.29
290	0.32
291	0.39
292	0.45
293	0.5
294	0.5
295	0.54
296	0.49
297	0.49
298	0.52
299	0.44
300	0.47
301	0.4
302	0.36
303	0.39
304	0.4
305	0.34
306	0.28
307	0.28
308	0.29
309	0.3
310	0.29
311	0.24
312	0.22
313	0.22
314	0.21
315	0.19
316	0.12
317	0.1
318	0.14
319	0.14
320	0.14
321	0.15
322	0.15
323	0.16
324	0.17
325	0.18
326	0.17
327	0.2
328	0.22
329	0.25
330	0.32
331	0.31
332	0.35
333	0.37
334	0.36
335	0.35
336	0.34
337	0.31
338	0.27
339	0.26
340	0.21
341	0.17
342	0.15
343	0.13
344	0.11
345	0.08
346	0.05
347	0.04
348	0.03
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.05
357	0.04
358	0.03
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.05
363	0.05
364	0.06
365	0.07
366	0.09
367	0.11
368	0.16
369	0.19
370	0.25
371	0.28
372	0.32
373	0.34
374	0.38
375	0.4
376	0.36
377	0.36
378	0.34
379	0.36
380	0.35
381	0.33
382	0.29
383	0.27
384	0.26
385	0.23
386	0.19
387	0.12
388	0.09
389	0.08
390	0.07
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.06
397	0.06
398	0.07
399	0.07
400	0.08
401	0.11
402	0.15
403	0.17
404	0.23
405	0.27
406	0.31
407	0.39
408	0.44
409	0.49
410	0.55
411	0.61
412	0.63
413	0.68
414	0.74
415	0.74
416	0.79
417	0.83
418	0.84
419	0.87
420	0.83
421	0.84
422	0.8
423	0.75
424	0.71
425	0.67
426	0.59
427	0.51
428	0.49
429	0.41
430	0.38
431	0.34
432	0.27
433	0.2
434	0.16
435	0.14
436	0.12
437	0.09
438	0.09
439	0.09
440	0.09
441	0.09
442	0.1
443	0.1
444	0.11
445	0.12
446	0.09
447	0.1
448	0.1
449	0.13
450	0.16
451	0.18
452	0.24
453	0.25
454	0.28
455	0.32
456	0.4
457	0.42
458	0.45
459	0.52
460	0.52
461	0.52
462	0.5
463	0.48
464	0.46
465	0.43
466	0.45
467	0.43
468	0.42
469	0.46
470	0.47
471	0.48
472	0.45
473	0.43
474	0.37
475	0.31
476	0.27
477	0.24
478	0.23
479	0.21
480	0.2
481	0.22
482	0.26
483	0.26
484	0.28
485	0.27
486	0.3
487	0.36
488	0.39
489	0.44
490	0.42
491	0.43
492	0.45
493	0.53
494	0.57
495	0.58
496	0.59
497	0.58
498	0.6
499	0.66
500	0.72
501	0.7
502	0.7
503	0.68
504	0.68
505	0.63
506	0.58
507	0.48
508	0.39
509	0.39
510	0.34
511	0.29
512	0.26
513	0.25
514	0.3
515	0.39
516	0.46
517	0.46
518	0.53
519	0.63
520	0.7
521	0.78
522	0.83
523	0.85
524	0.83
525	0.83
526	0.82
527	0.78
528	0.69
529	0.61
530	0.51
531	0.41
532	0.35
533	0.28
534	0.21
535	0.15
536	0.14
537	0.14
538	0.16
539	0.17
540	0.18
541	0.19
542	0.22
543	0.22
544	0.23
545	0.22
546	0.22
547	0.31
548	0.38
549	0.45
550	0.45
551	0.47
552	0.48
553	0.5
554	0.47
555	0.37
556	0.33
557	0.3
558	0.26
559	0.25
560	0.25
561	0.23
562	0.24
563	0.24
564	0.21
565	0.17
566	0.17
567	0.17
568	0.2
569	0.2
570	0.19
571	0.21
572	0.21
573	0.21
574	0.22
575	0.2
576	0.17
577	0.18
578	0.17
579	0.16
580	0.21
581	0.22
582	0.2
583	0.19
584	0.22
585	0.2
586	0.2
587	0.19
588	0.14
589	0.16
590	0.2
591	0.26
592	0.26
593	0.33
594	0.43
595	0.51
596	0.6
597	0.66
598	0.72
599	0.73
600	0.81
601	0.84
602	0.83
603	0.81
604	0.75
605	0.7
606	0.62
607	0.53
608	0.44
609	0.35
610	0.31
611	0.27
612	0.29
613	0.29
614	0.31
615	0.32
616	0.32
617	0.31
618	0.33
619	0.32
620	0.27
621	0.22
622	0.25
623	0.3
624	0.31
625	0.3
626	0.26
627	0.32
628	0.36
629	0.35
630	0.31
631	0.27
632	0.3
633	0.31
634	0.3
635	0.22
636	0.18
637	0.17
638	0.17
639	0.14
640	0.09
641	0.07
642	0.07
643	0.07
644	0.07
645	0.08
646	0.07
647	0.08
648	0.09
649	0.11
650	0.12
651	0.12
652	0.11
653	0.11
654	0.12
655	0.14
656	0.15
657	0.14
658	0.15
659	0.2
660	0.21
661	0.21
662	0.24
663	0.27
664	0.3
665	0.29
666	0.29
667	0.24
668	0.3
669	0.31
670	0.31
671	0.28
672	0.25
673	0.34
674	0.37
675	0.42
676	0.43
677	0.43
678	0.43
679	0.43
680	0.45
681	0.37
682	0.34
683	0.37
684	0.32

A0A2S4PXE4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer