Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2S4PQ78

Protein Details
Accession A0A2S4PQ78    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20METIKKSTIEQKLKPKNLNLHydrophilic
58-77NSLRAKMSKKHKLSNIPPLTHydrophilic
467-488IGLLRLRKCSKKYTFRPELVSQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 11, cyto 8, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039661  ELP3  
IPR034687  ELP3-like  
IPR006638  Elp3/MiaA/NifB-like_rSAM  
IPR032432  Radical_SAM_C  
IPR007197  rSAM  
Gene Ontology GO:0051539  F:4 iron, 4 sulfur cluster binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000049  F:tRNA binding  
GO:0106261  F:tRNA uridine(34) acetyltransferase activity  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04055  Radical_SAM  
PF16199  Radical_SAM_C  
CDD cd01335  Radical_SAM  
Amino Acid Sequences METIKKSTIEQKLKPKNLNLPSENERFIRACSDIVRFLVQEHEAQQDPSNPKKDINLNSLRAKMSKKHKLSNIPPLTAIIAAIPEHYKKQLLPRLIAKPIRSASGIAVVAVMCKPHRCPHIAFTGNICVYCPGGPDSDFEYSTQSYTGYEPTSMRAIRARYDPFEQARGRVDQIKSLGHSVDKVEYIIMGGTFMSLPESYRDEFISQLHNALSGYQGNDVDECVAAGEMSNIKCVGITIETRPDYCLQPHLSSMLRYGCTRLEIGVQSLYEDVARDTNRGHTVSSVAETFCLSKDAGFKVVSHMMPDLPNVGVERDLDQFREYFENPAFRTDGLKIYPTLVIRGTGLYELWRTGRFKNYTPNALIDIVARILALVPPWVRIYRVQRDIPMPLVTSGVENGNLRELALSRMKDFGTTCRDVRTREVGINEVKNKIRPNQVELVRRDYVANGGWETFLAYEDPKQDILIGLLRLRKCSKKYTFRPELVSQPTSLVRELHVYGSAVPVHARDPKKFQHQATAHY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.79
3 0.79
4 0.78
5 0.8
6 0.72
7 0.69
8 0.67
9 0.66
10 0.62
11 0.53
12 0.48
13 0.39
14 0.37
15 0.34
16 0.28
17 0.25
18 0.25
19 0.28
20 0.27
21 0.28
22 0.28
23 0.24
24 0.23
25 0.25
26 0.23
27 0.21
28 0.2
29 0.23
30 0.22
31 0.23
32 0.25
33 0.29
34 0.34
35 0.39
36 0.43
37 0.4
38 0.4
39 0.45
40 0.52
41 0.51
42 0.54
43 0.55
44 0.56
45 0.6
46 0.62
47 0.58
48 0.53
49 0.51
50 0.5
51 0.52
52 0.55
53 0.57
54 0.62
55 0.69
56 0.75
57 0.79
58 0.82
59 0.78
60 0.69
61 0.62
62 0.54
63 0.47
64 0.36
65 0.28
66 0.17
67 0.11
68 0.09
69 0.1
70 0.11
71 0.11
72 0.13
73 0.15
74 0.17
75 0.18
76 0.27
77 0.33
78 0.36
79 0.4
80 0.46
81 0.5
82 0.57
83 0.59
84 0.51
85 0.51
86 0.48
87 0.44
88 0.38
89 0.32
90 0.25
91 0.26
92 0.25
93 0.17
94 0.16
95 0.14
96 0.14
97 0.13
98 0.13
99 0.08
100 0.1
101 0.13
102 0.19
103 0.24
104 0.27
105 0.3
106 0.34
107 0.43
108 0.44
109 0.43
110 0.4
111 0.43
112 0.39
113 0.36
114 0.31
115 0.21
116 0.19
117 0.18
118 0.16
119 0.1
120 0.11
121 0.11
122 0.13
123 0.16
124 0.17
125 0.18
126 0.16
127 0.18
128 0.17
129 0.17
130 0.16
131 0.12
132 0.11
133 0.12
134 0.13
135 0.11
136 0.12
137 0.12
138 0.14
139 0.18
140 0.17
141 0.18
142 0.2
143 0.2
144 0.22
145 0.28
146 0.29
147 0.27
148 0.31
149 0.35
150 0.34
151 0.39
152 0.37
153 0.33
154 0.33
155 0.32
156 0.3
157 0.31
158 0.29
159 0.26
160 0.27
161 0.26
162 0.24
163 0.24
164 0.22
165 0.16
166 0.17
167 0.14
168 0.14
169 0.12
170 0.11
171 0.1
172 0.09
173 0.08
174 0.07
175 0.06
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.04
183 0.05
184 0.07
185 0.1
186 0.1
187 0.11
188 0.12
189 0.12
190 0.12
191 0.13
192 0.15
193 0.13
194 0.14
195 0.12
196 0.12
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.06
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.03
213 0.03
214 0.04
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.07
225 0.08
226 0.14
227 0.14
228 0.15
229 0.16
230 0.17
231 0.17
232 0.16
233 0.19
234 0.17
235 0.17
236 0.17
237 0.18
238 0.17
239 0.16
240 0.17
241 0.15
242 0.14
243 0.13
244 0.14
245 0.12
246 0.13
247 0.12
248 0.11
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.09
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.07
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.12
265 0.14
266 0.15
267 0.14
268 0.12
269 0.13
270 0.13
271 0.14
272 0.11
273 0.09
274 0.08
275 0.08
276 0.09
277 0.07
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.1
282 0.11
283 0.13
284 0.13
285 0.13
286 0.15
287 0.19
288 0.18
289 0.16
290 0.15
291 0.14
292 0.14
293 0.14
294 0.12
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.07
300 0.07
301 0.09
302 0.11
303 0.11
304 0.12
305 0.12
306 0.12
307 0.13
308 0.16
309 0.15
310 0.15
311 0.16
312 0.2
313 0.2
314 0.22
315 0.21
316 0.18
317 0.19
318 0.18
319 0.19
320 0.16
321 0.17
322 0.15
323 0.16
324 0.18
325 0.16
326 0.16
327 0.13
328 0.12
329 0.11
330 0.11
331 0.1
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.1
338 0.12
339 0.14
340 0.17
341 0.25
342 0.27
343 0.29
344 0.38
345 0.42
346 0.44
347 0.43
348 0.43
349 0.37
350 0.34
351 0.31
352 0.22
353 0.18
354 0.12
355 0.1
356 0.08
357 0.06
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.07
362 0.07
363 0.09
364 0.11
365 0.11
366 0.13
367 0.18
368 0.27
369 0.33
370 0.4
371 0.41
372 0.43
373 0.45
374 0.46
375 0.43
376 0.36
377 0.28
378 0.22
379 0.2
380 0.16
381 0.14
382 0.13
383 0.11
384 0.11
385 0.1
386 0.1
387 0.12
388 0.12
389 0.11
390 0.11
391 0.11
392 0.13
393 0.18
394 0.19
395 0.17
396 0.2
397 0.2
398 0.21
399 0.22
400 0.24
401 0.26
402 0.29
403 0.29
404 0.34
405 0.37
406 0.37
407 0.42
408 0.42
409 0.38
410 0.37
411 0.38
412 0.36
413 0.39
414 0.44
415 0.42
416 0.41
417 0.4
418 0.41
419 0.43
420 0.45
421 0.48
422 0.45
423 0.48
424 0.51
425 0.56
426 0.61
427 0.6
428 0.61
429 0.52
430 0.5
431 0.44
432 0.35
433 0.31
434 0.24
435 0.23
436 0.17
437 0.16
438 0.15
439 0.15
440 0.15
441 0.12
442 0.1
443 0.09
444 0.09
445 0.12
446 0.14
447 0.16
448 0.16
449 0.16
450 0.15
451 0.15
452 0.15
453 0.16
454 0.16
455 0.17
456 0.23
457 0.24
458 0.29
459 0.35
460 0.4
461 0.41
462 0.5
463 0.57
464 0.62
465 0.71
466 0.77
467 0.81
468 0.79
469 0.82
470 0.77
471 0.75
472 0.72
473 0.64
474 0.53
475 0.46
476 0.44
477 0.39
478 0.35
479 0.27
480 0.21
481 0.23
482 0.24
483 0.22
484 0.2
485 0.19
486 0.18
487 0.2
488 0.19
489 0.16
490 0.15
491 0.14
492 0.16
493 0.24
494 0.28
495 0.31
496 0.38
497 0.46
498 0.56
499 0.63
500 0.62
501 0.64