FuNGI

A0A2S4PMC0

Protein Details

Accession

A0A2S4PMC0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
93-119	DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAKEAKEKA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
395-422	RRRKQIEDRREANNKRRKIEKDRGGHGK

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 10.333, cyto 7, pero 5, cyto_mito 4.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MQSQPKIVSAVIEEQPRNIDGQILPVDSRGPNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCSHPEDGPAPKNEDEMMMAIFKYTDRVVKMVRPRKLLMIAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAKEAKEKADDKAEFIKLLKSQGSNIEDSEVKIAWDSNEITPGTPFMDVLAASLRYWIAYKLNTDLAWANMKVIISDSTVPGEGEHKIMEFIRSQRSSPHHNPNTKHVMYGLDADLIMLGLGTHEPYFRVLREDVFAQDSKPRVCKLCNQAGHEARECTGAPKIKAGEFDEKQNAPHIKPYIWLHVSILREYLAAELYIPNQPFKFDLERAIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIRENGIDTLIAIWRDNIPTMGGYLTKDGHVDLERAQIILRGLAKQEDAIFRRRKQIEDRREANNKRRKIEKDRGGHGKLNERSNLQESPSIKRQTINYRHSAPSGLPIFAPGDISKEAKALTYDMVVNRGANFKANQANKSAAAALKSKINGNIDEKSSAYEETATEFTTTPTALKRKASVLEDENSGTHENTPQSDSPQTSSDEPPIDTVRLWEEGYADRYYEQKFGADPKDIAFRHKVARAYVEGLAWVLLYYFQGCPSWEWYYPYHYAPFAADFAEISDMKISFKKGRIFRPFEQLMGVLPAGSRQAIPKEFHHLMTNPDSEIIDFYPEDFTIDLNGKKWAWQGVALLPFIDSKRLLDAMAKIYPHLPTEVAARNSVGKDVMLFAENNQLLYDEVAKNFYSKKQGSRNFKLNPKISQGLSGEIEKNDAHLPHSSLISPLTSGNLPNLDDDRSITVHYQMPKFNFIHKSMLLRGASIPPPALTPEEIETTRDKAVRSGRSYGGVPLNGDGRGRKQFNYGPKNHQFNQNNNHHGQRNYSANYGNNFATNSFPEFLQGWQQPPSGGYVNYGRGHASYPPPPPPYVNHQNSNYSNYGRANTSNFRRQSSGPRQHEPYR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.33
3	0.31
4	0.3
5	0.23
6	0.23
7	0.16
8	0.22
9	0.23
10	0.22
11	0.22
12	0.21
13	0.24
14	0.21
15	0.25
16	0.26
17	0.25
18	0.27
19	0.3
20	0.35
21	0.35
22	0.37
23	0.36
24	0.32
25	0.33
26	0.3
27	0.26
28	0.22
29	0.18
30	0.16
31	0.13
32	0.1
33	0.09
34	0.09
35	0.09
36	0.09
37	0.1
38	0.13
39	0.17
40	0.19
41	0.19
42	0.22
43	0.29
44	0.36
45	0.42
46	0.43
47	0.44
48	0.42
49	0.43
50	0.39
51	0.33
52	0.26
53	0.21
54	0.18
55	0.14
56	0.13
57	0.11
58	0.11
59	0.1
60	0.11
61	0.11
62	0.14
63	0.15
64	0.19
65	0.22
66	0.29
67	0.4
68	0.47
69	0.52
70	0.54
71	0.54
72	0.56
73	0.58
74	0.53
75	0.45
76	0.42
77	0.36
78	0.31
79	0.3
80	0.24
81	0.2
82	0.18
83	0.15
84	0.1
85	0.13
86	0.19
87	0.26
88	0.37
89	0.46
90	0.55
91	0.66
92	0.74
93	0.8
94	0.84
95	0.83
96	0.79
97	0.8
98	0.8
99	0.8
100	0.81
101	0.79
102	0.72
103	0.75
104	0.71
105	0.64
106	0.63
107	0.53
108	0.46
109	0.47
110	0.44
111	0.37
112	0.35
113	0.36
114	0.28
115	0.31
116	0.31
117	0.24
118	0.25
119	0.31
120	0.34
121	0.31
122	0.29
123	0.29
124	0.25
125	0.25
126	0.25
127	0.17
128	0.14
129	0.13
130	0.13
131	0.11
132	0.14
133	0.15
134	0.14
135	0.18
136	0.18
137	0.18
138	0.18
139	0.18
140	0.15
141	0.13
142	0.12
143	0.08
144	0.09
145	0.08
146	0.08
147	0.11
148	0.1
149	0.1
150	0.11
151	0.1
152	0.09
153	0.1
154	0.11
155	0.12
156	0.13
157	0.15
158	0.17
159	0.2
160	0.2
161	0.21
162	0.21
163	0.2
164	0.22
165	0.2
166	0.18
167	0.16
168	0.16
169	0.14
170	0.15
171	0.13
172	0.11
173	0.12
174	0.12
175	0.12
176	0.13
177	0.12
178	0.12
179	0.12
180	0.11
181	0.11
182	0.11
183	0.1
184	0.11
185	0.11
186	0.12
187	0.14
188	0.17
189	0.25
190	0.27
191	0.27
192	0.32
193	0.37
194	0.45
195	0.49
196	0.57
197	0.57
198	0.63
199	0.65
200	0.67
201	0.72
202	0.63
203	0.55
204	0.44
205	0.37
206	0.31
207	0.32
208	0.23
209	0.14
210	0.14
211	0.13
212	0.11
213	0.09
214	0.07
215	0.04
216	0.03
217	0.03
218	0.03
219	0.04
220	0.04
221	0.05
222	0.05
223	0.08
224	0.1
225	0.11
226	0.15
227	0.15
228	0.16
229	0.18
230	0.19
231	0.18
232	0.2
233	0.2
234	0.17
235	0.2
236	0.23
237	0.24
238	0.26
239	0.27
240	0.27
241	0.29
242	0.36
243	0.41
244	0.47
245	0.5
246	0.51
247	0.57
248	0.59
249	0.61
250	0.55
251	0.48
252	0.38
253	0.35
254	0.3
255	0.23
256	0.23
257	0.23
258	0.21
259	0.24
260	0.25
261	0.24
262	0.28
263	0.3
264	0.33
265	0.3
266	0.35
267	0.37
268	0.35
269	0.35
270	0.39
271	0.37
272	0.29
273	0.34
274	0.3
275	0.25
276	0.29
277	0.31
278	0.32
279	0.3
280	0.3
281	0.26
282	0.28
283	0.29
284	0.25
285	0.22
286	0.14
287	0.13
288	0.13
289	0.12
290	0.08
291	0.06
292	0.06
293	0.06
294	0.08
295	0.11
296	0.12
297	0.13
298	0.12
299	0.13
300	0.13
301	0.16
302	0.19
303	0.17
304	0.21
305	0.24
306	0.25
307	0.26
308	0.28
309	0.24
310	0.2
311	0.19
312	0.14
313	0.1
314	0.08
315	0.08
316	0.05
317	0.05
318	0.06
319	0.06
320	0.06
321	0.06
322	0.07
323	0.07
324	0.08
325	0.08
326	0.08
327	0.07
328	0.08
329	0.12
330	0.15
331	0.15
332	0.15
333	0.16
334	0.15
335	0.15
336	0.14
337	0.09
338	0.05
339	0.06
340	0.07
341	0.06
342	0.06
343	0.07
344	0.08
345	0.09
346	0.09
347	0.08
348	0.07
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.08
355	0.08
356	0.08
357	0.08
358	0.08
359	0.09
360	0.1
361	0.1
362	0.1
363	0.13
364	0.13
365	0.12
366	0.12
367	0.12
368	0.11
369	0.12
370	0.12
371	0.09
372	0.1
373	0.1
374	0.1
375	0.09
376	0.11
377	0.14
378	0.16
379	0.23
380	0.29
381	0.3
382	0.39
383	0.4
384	0.42
385	0.48
386	0.56
387	0.58
388	0.62
389	0.64
390	0.62
391	0.7
392	0.73
393	0.73
394	0.71
395	0.66
396	0.61
397	0.65
398	0.65
399	0.65
400	0.69
401	0.68
402	0.67
403	0.68
404	0.72
405	0.68
406	0.64
407	0.57
408	0.56
409	0.51
410	0.48
411	0.42
412	0.35
413	0.33
414	0.32
415	0.31
416	0.23
417	0.22
418	0.2
419	0.24
420	0.31
421	0.31
422	0.28
423	0.29
424	0.32
425	0.38
426	0.46
427	0.46
428	0.43
429	0.46
430	0.46
431	0.45
432	0.41
433	0.31
434	0.28
435	0.24
436	0.19
437	0.14
438	0.14
439	0.14
440	0.13
441	0.13
442	0.07
443	0.08
444	0.09
445	0.1
446	0.09
447	0.09
448	0.09
449	0.09
450	0.09
451	0.07
452	0.07
453	0.07
454	0.08
455	0.08
456	0.1
457	0.1
458	0.09
459	0.09
460	0.11
461	0.1
462	0.1
463	0.1
464	0.12
465	0.18
466	0.2
467	0.21
468	0.21
469	0.22
470	0.21
471	0.21
472	0.19
473	0.13
474	0.12
475	0.13
476	0.12
477	0.13
478	0.13
479	0.14
480	0.15
481	0.16
482	0.17
483	0.18
484	0.2
485	0.19
486	0.19
487	0.18
488	0.16
489	0.16
490	0.13
491	0.1
492	0.09
493	0.08
494	0.09
495	0.09
496	0.09
497	0.09
498	0.09
499	0.09
500	0.09
501	0.09
502	0.07
503	0.11
504	0.13
505	0.15
506	0.16
507	0.17
508	0.19
509	0.23
510	0.24
511	0.24
512	0.24
513	0.24
514	0.24
515	0.23
516	0.2
517	0.18
518	0.17
519	0.13
520	0.1
521	0.11
522	0.1
523	0.11
524	0.14
525	0.13
526	0.15
527	0.17
528	0.17
529	0.16
530	0.18
531	0.18
532	0.18
533	0.19
534	0.2
535	0.19
536	0.18
537	0.18
538	0.17
539	0.16
540	0.13
541	0.13
542	0.12
543	0.12
544	0.12
545	0.1
546	0.1
547	0.11
548	0.14
549	0.13
550	0.12
551	0.11
552	0.13
553	0.15
554	0.15
555	0.13
556	0.11
557	0.12
558	0.16
559	0.18
560	0.18
561	0.17
562	0.17
563	0.24
564	0.24
565	0.26
566	0.24
567	0.24
568	0.26
569	0.3
570	0.3
571	0.24
572	0.26
573	0.25
574	0.25
575	0.23
576	0.19
577	0.15
578	0.13
579	0.12
580	0.09
581	0.07
582	0.04
583	0.03
584	0.03
585	0.05
586	0.05
587	0.05
588	0.06
589	0.07
590	0.08
591	0.12
592	0.16
593	0.16
594	0.18
595	0.19
596	0.24
597	0.26
598	0.26
599	0.24
600	0.2
601	0.2
602	0.17
603	0.17
604	0.13
605	0.11
606	0.09
607	0.07
608	0.08
609	0.1
610	0.09
611	0.08
612	0.09
613	0.09
614	0.1
615	0.12
616	0.14
617	0.16
618	0.21
619	0.28
620	0.33
621	0.42
622	0.51
623	0.57
624	0.57
625	0.62
626	0.58
627	0.51
628	0.46
629	0.36
630	0.27
631	0.21
632	0.18
633	0.09
634	0.08
635	0.08
636	0.07
637	0.07
638	0.07
639	0.07
640	0.11
641	0.15
642	0.18
643	0.19
644	0.27
645	0.28
646	0.29
647	0.31
648	0.28
649	0.28
650	0.31
651	0.3
652	0.22
653	0.22
654	0.2
655	0.17
656	0.17
657	0.13
658	0.1
659	0.09
660	0.09
661	0.09
662	0.09
663	0.1
664	0.08
665	0.08
666	0.09
667	0.12
668	0.12
669	0.12
670	0.15
671	0.14
672	0.16
673	0.17
674	0.18
675	0.16
676	0.16
677	0.17
678	0.19
679	0.22
680	0.2
681	0.18
682	0.16
683	0.17
684	0.15
685	0.16
686	0.11
687	0.09
688	0.12
689	0.12
690	0.12
691	0.13
692	0.15
693	0.17
694	0.2
695	0.19
696	0.17
697	0.19
698	0.19
699	0.18
700	0.16
701	0.12
702	0.1
703	0.16
704	0.22
705	0.22
706	0.21
707	0.21
708	0.23
709	0.23
710	0.23
711	0.18
712	0.11
713	0.1
714	0.11
715	0.11
716	0.1
717	0.09
718	0.09
719	0.17
720	0.17
721	0.17
722	0.15
723	0.15
724	0.14
725	0.14
726	0.18
727	0.12
728	0.12
729	0.14
730	0.14
731	0.16
732	0.18
733	0.21
734	0.25
735	0.27
736	0.35
737	0.43
738	0.52
739	0.61
740	0.67
741	0.73
742	0.72
743	0.76
744	0.77
745	0.73
746	0.68
747	0.65
748	0.61
749	0.52
750	0.5
751	0.43
752	0.37
753	0.34
754	0.32
755	0.27
756	0.23
757	0.24
758	0.18
759	0.19
760	0.18
761	0.17
762	0.16
763	0.16
764	0.18
765	0.18
766	0.19
767	0.18
768	0.16
769	0.16
770	0.15
771	0.13
772	0.11
773	0.11
774	0.11
775	0.11
776	0.13
777	0.14
778	0.14
779	0.15
780	0.16
781	0.16
782	0.15
783	0.16
784	0.17
785	0.16
786	0.17
787	0.16
788	0.17
789	0.2
790	0.25
791	0.28
792	0.3
793	0.32
794	0.37
795	0.38
796	0.42
797	0.43
798	0.4
799	0.42
800	0.39
801	0.41
802	0.38
803	0.44
804	0.36
805	0.32
806	0.31
807	0.3
808	0.3
809	0.26
810	0.24
811	0.17
812	0.18
813	0.19
814	0.19
815	0.15
816	0.15
817	0.16
818	0.2
819	0.2
820	0.22
821	0.22
822	0.23
823	0.26
824	0.26
825	0.24
826	0.26
827	0.33
828	0.39
829	0.42
830	0.44
831	0.42
832	0.44
833	0.44
834	0.44
835	0.41
836	0.34
837	0.3
838	0.26
839	0.26
840	0.23
841	0.24
842	0.21
843	0.21
844	0.29
845	0.31
846	0.31
847	0.35
848	0.41
849	0.5
850	0.58
851	0.59
852	0.61
853	0.68
854	0.74
855	0.71
856	0.76
857	0.72
858	0.71
859	0.75
860	0.74
861	0.71
862	0.67
863	0.71
864	0.65
865	0.6
866	0.56
867	0.52
868	0.5
869	0.46
870	0.46
871	0.43
872	0.42
873	0.43
874	0.41
875	0.35
876	0.29
877	0.27
878	0.24
879	0.23
880	0.21
881	0.22
882	0.2
883	0.19
884	0.19
885	0.2
886	0.2
887	0.26
888	0.27
889	0.25
890	0.28
891	0.29
892	0.27
893	0.26
894	0.3
895	0.24
896	0.21
897	0.22
898	0.23
899	0.29
900	0.3
901	0.3
902	0.26
903	0.24
904	0.26
905	0.27
906	0.29
907	0.29
908	0.34
909	0.41
910	0.44
911	0.45
912	0.46
913	0.46
914	0.5
915	0.54
916	0.55
917	0.56
918	0.57
919	0.64
920	0.64
921	0.65
922	0.6
923	0.51
924	0.48
925	0.43
926	0.41
927	0.36
928	0.36
929	0.36
930	0.41
931	0.47
932	0.52
933	0.53
934	0.54
935	0.55
936	0.56
937	0.6
938	0.63
939	0.65
940	0.63
941	0.68

A0A2S4PMC0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer