Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J7RMG9

Protein Details
Accession J7RMG9    Localization Confidence Low Confidence Score 8.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
343-362RDTPCRKPPLEAKRKQSQIFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 11.999, mito 4.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MIPSLKELCTRSIVKNKDGLVSVENVPLRLIKDSLKRINIGVGQMTRYERSNPLYVLDREADTEFWLEFLKQDFPTNVHDQYVTSKDSIKEYYTNVLLDFGVDLNDGSQLDEYRVYRILLKRWLVRDATLGKYNVPYRMLYFKYQQDEKRKQEQVVERLRIQVQMAKKERELKSTVAVNESFYINNIKNKTRKGPSSVKLQSQFGVSKPKTVVRRNVERVAFGGMAGRKLDPAKIRAVSRDLPNVVPSIPPVGKKPQNSTIATNTSTIDPPRGRPAPEPIPRSTRKRQDDSQNIFLTTKKPKRPLVLAKKTEHHGAITRHTQDSNVKAGTAGTTTPEELSRNRDTPCRKPPLEAKRKQSQIFGPRTATTSGPTRLEQKPHPVHPSNTPEVPQQATARRVRSLKNYLGERHRPFRGM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.54
3 0.53
4 0.51
5 0.48
6 0.42
7 0.35
8 0.34
9 0.31
10 0.31
11 0.29
12 0.24
13 0.23
14 0.23
15 0.22
16 0.2
17 0.2
18 0.2
19 0.29
20 0.38
21 0.45
22 0.47
23 0.47
24 0.46
25 0.5
26 0.46
27 0.4
28 0.36
29 0.3
30 0.28
31 0.29
32 0.31
33 0.27
34 0.26
35 0.27
36 0.26
37 0.29
38 0.32
39 0.29
40 0.3
41 0.35
42 0.34
43 0.35
44 0.33
45 0.28
46 0.26
47 0.27
48 0.24
49 0.18
50 0.18
51 0.13
52 0.12
53 0.12
54 0.1
55 0.1
56 0.12
57 0.15
58 0.15
59 0.18
60 0.19
61 0.2
62 0.26
63 0.3
64 0.29
65 0.26
66 0.25
67 0.23
68 0.27
69 0.28
70 0.24
71 0.2
72 0.23
73 0.23
74 0.26
75 0.27
76 0.25
77 0.24
78 0.24
79 0.28
80 0.25
81 0.24
82 0.21
83 0.2
84 0.17
85 0.14
86 0.12
87 0.08
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.05
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.11
99 0.11
100 0.12
101 0.14
102 0.14
103 0.19
104 0.22
105 0.26
106 0.3
107 0.34
108 0.38
109 0.39
110 0.43
111 0.38
112 0.36
113 0.36
114 0.34
115 0.33
116 0.32
117 0.3
118 0.26
119 0.3
120 0.31
121 0.28
122 0.25
123 0.22
124 0.2
125 0.25
126 0.27
127 0.26
128 0.29
129 0.31
130 0.36
131 0.41
132 0.46
133 0.5
134 0.57
135 0.61
136 0.65
137 0.64
138 0.6
139 0.62
140 0.62
141 0.61
142 0.61
143 0.58
144 0.49
145 0.48
146 0.47
147 0.4
148 0.33
149 0.28
150 0.23
151 0.28
152 0.32
153 0.31
154 0.33
155 0.41
156 0.42
157 0.42
158 0.42
159 0.34
160 0.33
161 0.35
162 0.33
163 0.27
164 0.26
165 0.22
166 0.2
167 0.19
168 0.15
169 0.11
170 0.14
171 0.12
172 0.17
173 0.19
174 0.23
175 0.27
176 0.31
177 0.38
178 0.4
179 0.42
180 0.45
181 0.51
182 0.49
183 0.55
184 0.56
185 0.54
186 0.51
187 0.48
188 0.41
189 0.35
190 0.33
191 0.24
192 0.29
193 0.23
194 0.24
195 0.25
196 0.29
197 0.33
198 0.37
199 0.44
200 0.41
201 0.5
202 0.52
203 0.57
204 0.53
205 0.46
206 0.42
207 0.36
208 0.29
209 0.2
210 0.18
211 0.12
212 0.12
213 0.12
214 0.11
215 0.1
216 0.1
217 0.14
218 0.13
219 0.15
220 0.18
221 0.21
222 0.22
223 0.23
224 0.27
225 0.28
226 0.28
227 0.3
228 0.27
229 0.24
230 0.24
231 0.23
232 0.19
233 0.15
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.13
238 0.15
239 0.23
240 0.28
241 0.31
242 0.36
243 0.39
244 0.45
245 0.46
246 0.47
247 0.45
248 0.43
249 0.41
250 0.37
251 0.29
252 0.24
253 0.24
254 0.2
255 0.21
256 0.18
257 0.19
258 0.26
259 0.28
260 0.28
261 0.29
262 0.36
263 0.41
264 0.47
265 0.49
266 0.45
267 0.51
268 0.55
269 0.6
270 0.62
271 0.62
272 0.63
273 0.65
274 0.69
275 0.71
276 0.76
277 0.76
278 0.75
279 0.67
280 0.6
281 0.53
282 0.47
283 0.42
284 0.41
285 0.42
286 0.41
287 0.46
288 0.5
289 0.56
290 0.64
291 0.7
292 0.71
293 0.73
294 0.74
295 0.71
296 0.71
297 0.68
298 0.62
299 0.52
300 0.43
301 0.39
302 0.34
303 0.35
304 0.38
305 0.39
306 0.37
307 0.36
308 0.36
309 0.35
310 0.35
311 0.35
312 0.28
313 0.24
314 0.22
315 0.22
316 0.2
317 0.16
318 0.13
319 0.1
320 0.11
321 0.11
322 0.12
323 0.13
324 0.15
325 0.16
326 0.22
327 0.26
328 0.28
329 0.3
330 0.37
331 0.42
332 0.5
333 0.58
334 0.61
335 0.56
336 0.6
337 0.68
338 0.71
339 0.76
340 0.75
341 0.73
342 0.73
343 0.8
344 0.76
345 0.72
346 0.7
347 0.69
348 0.68
349 0.65
350 0.59
351 0.52
352 0.52
353 0.47
354 0.39
355 0.32
356 0.31
357 0.3
358 0.29
359 0.3
360 0.34
361 0.38
362 0.44
363 0.46
364 0.5
365 0.54
366 0.58
367 0.66
368 0.65
369 0.63
370 0.66
371 0.69
372 0.65
373 0.59
374 0.54
375 0.49
376 0.47
377 0.46
378 0.41
379 0.39
380 0.39
381 0.44
382 0.48
383 0.48
384 0.5
385 0.53
386 0.54
387 0.58
388 0.6
389 0.6
390 0.62
391 0.65
392 0.67
393 0.71
394 0.75
395 0.74
396 0.73