Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2S4PSB4

Protein Details
Accession A0A2S4PSB4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-46EVPVGVTKRKGKSRRSVVPRFPSEWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-35RKGKSR
359-373HIARRKKAEAERKKD
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11, nucl 10.5, cyto 10.5, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSFVPTRIASQLHAADKEPDEEVPVGVTKRKGKSRRSVVPRFPSEWASSIEVFRKAVRTFEHSHLPKYQNQGKNMTAESSRKQPISPTYINSLDSPELATPIQTRENANFGSKISANYNISNVPKYVWLLFSGFDKLDAENLDIWKGHMQDNLERCDLWEIVIGKEVKPSEAYREQLDAWRRREMTPRVVIKNSLGVKDYLQVQHAKTGADIWKSLIGSHQPSRALGKADLVWRFWNKMYAEGEPVHEHIGEIRTLHAELTEIGIIVEDHMVAILMSKSLPPSYDTYVSSIFAGIRDLEQADSGFVANKIFEEEMRRRRKSLDSNVAVFKHCSNCGKTGHVIGDCFSKGGGKEGQCPRHIARRKKAEAERKKDEKDIKNVQLAEQENFYASNMALSHNSWIADSGASNHVANRRDMFATYTPCKGTLNVAGGLTATIEGTGVVYMRGIVNDCIKDFKLINVLYVPSTRYCLISGPMLDKAGGRVIYGNGKCTFWNSNGDAIATGTLDGNLYRMNAKVLVHKVPVSNVVDTQILSWQEAHRHYSTKAIAF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.34
3 0.34
4 0.35
5 0.29
6 0.23
7 0.22
8 0.21
9 0.19
10 0.16
11 0.18
12 0.17
13 0.2
14 0.26
15 0.31
16 0.39
17 0.49
18 0.55
19 0.62
20 0.71
21 0.77
22 0.82
23 0.84
24 0.87
25 0.87
26 0.89
27 0.86
28 0.79
29 0.72
30 0.66
31 0.59
32 0.51
33 0.44
34 0.38
35 0.33
36 0.32
37 0.33
38 0.31
39 0.29
40 0.28
41 0.3
42 0.26
43 0.29
44 0.29
45 0.32
46 0.35
47 0.39
48 0.48
49 0.44
50 0.48
51 0.53
52 0.53
53 0.51
54 0.54
55 0.59
56 0.55
57 0.58
58 0.59
59 0.53
60 0.54
61 0.5
62 0.44
63 0.39
64 0.38
65 0.36
66 0.38
67 0.41
68 0.37
69 0.37
70 0.39
71 0.41
72 0.45
73 0.45
74 0.4
75 0.41
76 0.42
77 0.43
78 0.39
79 0.35
80 0.27
81 0.23
82 0.21
83 0.15
84 0.15
85 0.13
86 0.14
87 0.12
88 0.14
89 0.18
90 0.19
91 0.21
92 0.21
93 0.25
94 0.25
95 0.26
96 0.24
97 0.21
98 0.23
99 0.22
100 0.22
101 0.2
102 0.25
103 0.25
104 0.25
105 0.26
106 0.26
107 0.27
108 0.26
109 0.24
110 0.19
111 0.19
112 0.19
113 0.19
114 0.15
115 0.15
116 0.14
117 0.14
118 0.15
119 0.16
120 0.14
121 0.13
122 0.13
123 0.12
124 0.13
125 0.13
126 0.13
127 0.13
128 0.14
129 0.14
130 0.13
131 0.14
132 0.15
133 0.15
134 0.16
135 0.15
136 0.17
137 0.22
138 0.27
139 0.3
140 0.28
141 0.26
142 0.25
143 0.26
144 0.23
145 0.18
146 0.17
147 0.14
148 0.14
149 0.19
150 0.19
151 0.16
152 0.2
153 0.2
154 0.16
155 0.17
156 0.18
157 0.2
158 0.24
159 0.26
160 0.24
161 0.26
162 0.26
163 0.29
164 0.37
165 0.38
166 0.36
167 0.41
168 0.41
169 0.41
170 0.49
171 0.49
172 0.48
173 0.49
174 0.53
175 0.51
176 0.51
177 0.49
178 0.41
179 0.43
180 0.37
181 0.3
182 0.24
183 0.2
184 0.19
185 0.2
186 0.23
187 0.17
188 0.17
189 0.18
190 0.18
191 0.21
192 0.21
193 0.19
194 0.15
195 0.18
196 0.19
197 0.17
198 0.17
199 0.14
200 0.16
201 0.16
202 0.16
203 0.14
204 0.14
205 0.17
206 0.19
207 0.21
208 0.19
209 0.2
210 0.23
211 0.23
212 0.22
213 0.18
214 0.17
215 0.17
216 0.21
217 0.21
218 0.2
219 0.21
220 0.2
221 0.22
222 0.2
223 0.23
224 0.19
225 0.22
226 0.23
227 0.21
228 0.23
229 0.22
230 0.23
231 0.19
232 0.19
233 0.15
234 0.13
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.09
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.05
250 0.04
251 0.05
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.03
256 0.03
257 0.02
258 0.02
259 0.02
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.06
269 0.09
270 0.12
271 0.14
272 0.15
273 0.16
274 0.17
275 0.17
276 0.15
277 0.13
278 0.1
279 0.08
280 0.08
281 0.06
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.05
286 0.06
287 0.06
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.12
300 0.19
301 0.29
302 0.38
303 0.39
304 0.4
305 0.43
306 0.5
307 0.53
308 0.56
309 0.57
310 0.52
311 0.54
312 0.57
313 0.54
314 0.48
315 0.39
316 0.31
317 0.24
318 0.22
319 0.22
320 0.21
321 0.24
322 0.25
323 0.27
324 0.26
325 0.26
326 0.26
327 0.24
328 0.21
329 0.18
330 0.19
331 0.16
332 0.15
333 0.12
334 0.1
335 0.09
336 0.12
337 0.16
338 0.15
339 0.23
340 0.31
341 0.37
342 0.36
343 0.41
344 0.4
345 0.45
346 0.53
347 0.54
348 0.56
349 0.61
350 0.65
351 0.7
352 0.77
353 0.78
354 0.79
355 0.79
356 0.79
357 0.77
358 0.75
359 0.73
360 0.73
361 0.69
362 0.68
363 0.68
364 0.63
365 0.61
366 0.58
367 0.52
368 0.49
369 0.44
370 0.36
371 0.27
372 0.22
373 0.17
374 0.17
375 0.16
376 0.1
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.09
381 0.09
382 0.1
383 0.11
384 0.11
385 0.12
386 0.1
387 0.1
388 0.1
389 0.09
390 0.09
391 0.1
392 0.11
393 0.12
394 0.12
395 0.14
396 0.18
397 0.2
398 0.22
399 0.21
400 0.21
401 0.21
402 0.22
403 0.24
404 0.23
405 0.28
406 0.29
407 0.31
408 0.29
409 0.29
410 0.29
411 0.25
412 0.24
413 0.22
414 0.23
415 0.21
416 0.2
417 0.19
418 0.19
419 0.18
420 0.14
421 0.09
422 0.06
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.05
432 0.05
433 0.06
434 0.07
435 0.09
436 0.14
437 0.15
438 0.16
439 0.19
440 0.19
441 0.21
442 0.2
443 0.21
444 0.24
445 0.22
446 0.23
447 0.22
448 0.23
449 0.21
450 0.22
451 0.22
452 0.15
453 0.18
454 0.17
455 0.17
456 0.16
457 0.16
458 0.17
459 0.19
460 0.2
461 0.2
462 0.21
463 0.21
464 0.2
465 0.19
466 0.18
467 0.19
468 0.17
469 0.14
470 0.14
471 0.16
472 0.24
473 0.25
474 0.29
475 0.26
476 0.27
477 0.27
478 0.29
479 0.31
480 0.24
481 0.31
482 0.28
483 0.31
484 0.31
485 0.31
486 0.27
487 0.23
488 0.21
489 0.14
490 0.12
491 0.08
492 0.08
493 0.08
494 0.07
495 0.07
496 0.08
497 0.09
498 0.1
499 0.1
500 0.12
501 0.14
502 0.16
503 0.23
504 0.27
505 0.31
506 0.33
507 0.35
508 0.35
509 0.35
510 0.41
511 0.36
512 0.33
513 0.28
514 0.28
515 0.25
516 0.24
517 0.22
518 0.2
519 0.18
520 0.17
521 0.19
522 0.2
523 0.25
524 0.28
525 0.33
526 0.32
527 0.35
528 0.35
529 0.4