Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2S4PMB1

Protein Details
Accession A0A2S4PMB1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-26SEYWKSTPKFWCKHCKIFVRDTKLEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR040023  WBP4  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Amino Acid Sequences MSEYWKSTPKFWCKHCKIFVRDTKLETANHNASPKHQGNLKRFLRDLQRNHDKDEKDKERAKLEVARLNDIVPGKRSQVKSSLENGGQLQSHYSTSRVTNKSIVSESQRKQNLAQLAEMGISIPSELRPDMAMPGEWEVISEHVIDPNKVEENQKKTLSGSQKRAADVGQEEDEMEKEFVSKKKKSHWRLAEEDNDKELNALLTTATQFKKQDIKSEITTEIPICNTKICQKKEQDDHVSIKSEPGDDSKILPQLLNKEIPERSEPTNNIFFAKRKAKNIR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.83
3 0.83
4 0.8
5 0.82
6 0.83
7 0.81
8 0.77
9 0.7
10 0.68
11 0.62
12 0.57
13 0.5
14 0.49
15 0.44
16 0.43
17 0.43
18 0.37
19 0.36
20 0.43
21 0.42
22 0.38
23 0.39
24 0.43
25 0.47
26 0.57
27 0.59
28 0.55
29 0.54
30 0.56
31 0.6
32 0.61
33 0.62
34 0.61
35 0.67
36 0.63
37 0.67
38 0.69
39 0.61
40 0.59
41 0.63
42 0.6
43 0.58
44 0.62
45 0.61
46 0.58
47 0.57
48 0.54
49 0.5
50 0.48
51 0.45
52 0.41
53 0.4
54 0.36
55 0.34
56 0.33
57 0.28
58 0.24
59 0.21
60 0.21
61 0.2
62 0.26
63 0.28
64 0.28
65 0.33
66 0.35
67 0.37
68 0.4
69 0.42
70 0.36
71 0.36
72 0.34
73 0.28
74 0.24
75 0.2
76 0.17
77 0.12
78 0.13
79 0.12
80 0.12
81 0.11
82 0.15
83 0.24
84 0.25
85 0.25
86 0.28
87 0.28
88 0.3
89 0.3
90 0.29
91 0.27
92 0.34
93 0.33
94 0.38
95 0.4
96 0.38
97 0.38
98 0.4
99 0.38
100 0.3
101 0.28
102 0.21
103 0.18
104 0.17
105 0.16
106 0.11
107 0.06
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.03
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.08
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.1
136 0.11
137 0.16
138 0.19
139 0.24
140 0.29
141 0.3
142 0.29
143 0.29
144 0.34
145 0.39
146 0.41
147 0.42
148 0.42
149 0.44
150 0.44
151 0.44
152 0.37
153 0.3
154 0.24
155 0.21
156 0.15
157 0.13
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.11
162 0.1
163 0.06
164 0.07
165 0.1
166 0.15
167 0.22
168 0.26
169 0.28
170 0.38
171 0.49
172 0.55
173 0.62
174 0.67
175 0.68
176 0.7
177 0.73
178 0.72
179 0.66
180 0.6
181 0.52
182 0.43
183 0.35
184 0.29
185 0.23
186 0.14
187 0.09
188 0.08
189 0.05
190 0.06
191 0.07
192 0.12
193 0.13
194 0.16
195 0.16
196 0.2
197 0.28
198 0.28
199 0.36
200 0.36
201 0.4
202 0.4
203 0.43
204 0.41
205 0.34
206 0.35
207 0.27
208 0.24
209 0.2
210 0.18
211 0.15
212 0.15
213 0.16
214 0.23
215 0.31
216 0.35
217 0.42
218 0.48
219 0.57
220 0.64
221 0.71
222 0.71
223 0.68
224 0.69
225 0.64
226 0.59
227 0.5
228 0.44
229 0.36
230 0.29
231 0.24
232 0.22
233 0.22
234 0.2
235 0.22
236 0.24
237 0.26
238 0.25
239 0.25
240 0.25
241 0.27
242 0.31
243 0.33
244 0.3
245 0.31
246 0.32
247 0.35
248 0.37
249 0.35
250 0.35
251 0.39
252 0.4
253 0.41
254 0.46
255 0.43
256 0.42
257 0.42
258 0.4
259 0.41
260 0.49
261 0.49