Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2S4PTI4

Protein Details
Accession A0A2S4PTI4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
562-589SGSVKEDKDKNERPKKKARTSVEQSGHEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
572-579NERPKKKA
Subcellular Location(s) cyto 14.5, cyto_nucl 14, nucl 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR013719  RTT106/SPT16-like_middle_dom  
IPR000969  SSRP1/POB3  
IPR035417  SSRP1/POB3_N  
IPR024954  SSRP1_DD  
IPR038167  SSRP1_sf  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF17292  POB3_N  
PF08512  Rtt106  
PF03531  SSrecog  
CDD cd13230  PH1_SSRP1-like  
cd13231  PH2_SSRP1-like  
cd13229  PH_TFIIH  
Amino Acid Sequences MVSDSFKPLIIIKNVCPEESFDNIYLDLSKVSGKCRFAETGLGWKPSGGGEAFTLDHSNIGAAQWSRAAKGYELKILLRNSGLVQLDGFPHEDYDRLSKIFKNWYSTNLQQKEHALCGWNWGKGEFGKAELAFNVQNRPAFEIPYSEISNTNLAGKNEVAVEFTLPPNGHDSINGSLGGAHSKGKRAGAGKDQLVEMRFYIPGVTTKKATSEGEEPSSGGEEQNAANLFYDTLMDKAEIGEVAGDTFATFLDVLHLTPRYGPETVQRNSLINYRGRFDIDMYENSFRLRGKTYDYKIQYDTLKKFMILPKPDEMHYMICIGLDPPLRQGQTRYPFLVMQFKKDEEVTIDLNMTEEMMKDKYNGRLAPHYEQPLHQVITQVFRGLTGKKVNQPAQGFTSHHGQYGIKCSIKASEGFLYCLEKAFMFVPKPATFIQFDHIDRIVLSRIGGAISASRTFDITIKMKEGTESQFSNINREEQNPLEEFFKIKNLKTINEMDDDSNALLAAALRDPDMASSDDEEIVTRTNRDSEDDEDESVDEDFKTDSESDVAEEYDSGHESAGSGSVKEDKDKNERPKKKARTSVEQSGHEPKNPYQQVGRKDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.41
3 0.39
4 0.36
5 0.34
6 0.34
7 0.35
8 0.26
9 0.26
10 0.26
11 0.25
12 0.23
13 0.19
14 0.14
15 0.11
16 0.15
17 0.15
18 0.2
19 0.26
20 0.27
21 0.29
22 0.34
23 0.36
24 0.32
25 0.38
26 0.35
27 0.39
28 0.42
29 0.42
30 0.37
31 0.34
32 0.33
33 0.27
34 0.27
35 0.17
36 0.13
37 0.11
38 0.13
39 0.14
40 0.15
41 0.16
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.11
46 0.08
47 0.08
48 0.11
49 0.1
50 0.11
51 0.15
52 0.16
53 0.17
54 0.2
55 0.21
56 0.19
57 0.26
58 0.28
59 0.29
60 0.31
61 0.32
62 0.35
63 0.35
64 0.34
65 0.28
66 0.26
67 0.21
68 0.24
69 0.23
70 0.17
71 0.16
72 0.16
73 0.17
74 0.17
75 0.17
76 0.12
77 0.12
78 0.12
79 0.13
80 0.14
81 0.18
82 0.19
83 0.19
84 0.21
85 0.22
86 0.27
87 0.36
88 0.37
89 0.39
90 0.38
91 0.42
92 0.47
93 0.52
94 0.57
95 0.54
96 0.51
97 0.47
98 0.51
99 0.49
100 0.44
101 0.39
102 0.31
103 0.25
104 0.32
105 0.33
106 0.29
107 0.27
108 0.25
109 0.25
110 0.23
111 0.26
112 0.18
113 0.16
114 0.18
115 0.18
116 0.19
117 0.17
118 0.19
119 0.17
120 0.18
121 0.2
122 0.18
123 0.2
124 0.2
125 0.26
126 0.24
127 0.23
128 0.22
129 0.21
130 0.22
131 0.24
132 0.24
133 0.19
134 0.2
135 0.2
136 0.21
137 0.18
138 0.2
139 0.19
140 0.18
141 0.19
142 0.18
143 0.17
144 0.17
145 0.16
146 0.13
147 0.09
148 0.11
149 0.1
150 0.11
151 0.13
152 0.12
153 0.12
154 0.15
155 0.16
156 0.14
157 0.13
158 0.16
159 0.15
160 0.16
161 0.16
162 0.12
163 0.11
164 0.11
165 0.12
166 0.1
167 0.12
168 0.11
169 0.15
170 0.17
171 0.17
172 0.21
173 0.23
174 0.26
175 0.3
176 0.35
177 0.33
178 0.33
179 0.32
180 0.31
181 0.28
182 0.25
183 0.18
184 0.13
185 0.12
186 0.1
187 0.1
188 0.08
189 0.13
190 0.16
191 0.17
192 0.17
193 0.17
194 0.19
195 0.22
196 0.22
197 0.2
198 0.21
199 0.22
200 0.23
201 0.23
202 0.22
203 0.19
204 0.2
205 0.16
206 0.12
207 0.09
208 0.07
209 0.07
210 0.1
211 0.1
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.08
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.07
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.11
248 0.11
249 0.16
250 0.23
251 0.24
252 0.27
253 0.27
254 0.25
255 0.26
256 0.3
257 0.27
258 0.23
259 0.23
260 0.22
261 0.21
262 0.21
263 0.2
264 0.17
265 0.18
266 0.16
267 0.17
268 0.18
269 0.18
270 0.18
271 0.18
272 0.18
273 0.14
274 0.13
275 0.14
276 0.12
277 0.17
278 0.25
279 0.27
280 0.34
281 0.36
282 0.37
283 0.36
284 0.38
285 0.36
286 0.35
287 0.34
288 0.29
289 0.27
290 0.25
291 0.27
292 0.29
293 0.31
294 0.28
295 0.29
296 0.29
297 0.3
298 0.3
299 0.29
300 0.25
301 0.19
302 0.17
303 0.15
304 0.11
305 0.09
306 0.09
307 0.07
308 0.08
309 0.09
310 0.08
311 0.1
312 0.13
313 0.13
314 0.14
315 0.16
316 0.21
317 0.26
318 0.28
319 0.28
320 0.26
321 0.27
322 0.28
323 0.36
324 0.28
325 0.27
326 0.26
327 0.25
328 0.25
329 0.24
330 0.23
331 0.15
332 0.17
333 0.14
334 0.12
335 0.12
336 0.1
337 0.11
338 0.1
339 0.08
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.11
347 0.15
348 0.2
349 0.21
350 0.22
351 0.27
352 0.31
353 0.33
354 0.35
355 0.35
356 0.31
357 0.3
358 0.32
359 0.29
360 0.26
361 0.23
362 0.21
363 0.19
364 0.21
365 0.2
366 0.17
367 0.14
368 0.13
369 0.15
370 0.13
371 0.16
372 0.18
373 0.22
374 0.26
375 0.34
376 0.37
377 0.41
378 0.42
379 0.4
380 0.37
381 0.38
382 0.33
383 0.28
384 0.31
385 0.25
386 0.24
387 0.23
388 0.21
389 0.19
390 0.25
391 0.28
392 0.22
393 0.21
394 0.21
395 0.22
396 0.23
397 0.22
398 0.18
399 0.19
400 0.19
401 0.2
402 0.2
403 0.21
404 0.19
405 0.19
406 0.16
407 0.1
408 0.11
409 0.11
410 0.14
411 0.13
412 0.15
413 0.19
414 0.19
415 0.22
416 0.21
417 0.23
418 0.21
419 0.21
420 0.23
421 0.23
422 0.23
423 0.24
424 0.23
425 0.21
426 0.19
427 0.19
428 0.17
429 0.12
430 0.11
431 0.08
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.07
436 0.07
437 0.08
438 0.09
439 0.09
440 0.09
441 0.1
442 0.11
443 0.12
444 0.16
445 0.18
446 0.19
447 0.21
448 0.22
449 0.21
450 0.22
451 0.24
452 0.22
453 0.23
454 0.22
455 0.21
456 0.26
457 0.26
458 0.31
459 0.29
460 0.3
461 0.26
462 0.28
463 0.31
464 0.26
465 0.3
466 0.26
467 0.26
468 0.23
469 0.22
470 0.21
471 0.18
472 0.25
473 0.24
474 0.23
475 0.29
476 0.3
477 0.31
478 0.35
479 0.39
480 0.34
481 0.34
482 0.35
483 0.29
484 0.28
485 0.27
486 0.21
487 0.16
488 0.13
489 0.09
490 0.07
491 0.06
492 0.07
493 0.06
494 0.06
495 0.07
496 0.07
497 0.07
498 0.08
499 0.1
500 0.1
501 0.1
502 0.12
503 0.13
504 0.13
505 0.14
506 0.14
507 0.12
508 0.14
509 0.14
510 0.13
511 0.13
512 0.16
513 0.17
514 0.2
515 0.23
516 0.24
517 0.3
518 0.31
519 0.3
520 0.28
521 0.27
522 0.24
523 0.21
524 0.17
525 0.1
526 0.09
527 0.08
528 0.08
529 0.1
530 0.1
531 0.1
532 0.11
533 0.11
534 0.12
535 0.13
536 0.13
537 0.1
538 0.1
539 0.11
540 0.11
541 0.12
542 0.11
543 0.1
544 0.09
545 0.1
546 0.1
547 0.12
548 0.11
549 0.1
550 0.11
551 0.18
552 0.19
553 0.24
554 0.29
555 0.32
556 0.41
557 0.51
558 0.61
559 0.66
560 0.74
561 0.78
562 0.84
563 0.88
564 0.89
565 0.89
566 0.87
567 0.87
568 0.86
569 0.88
570 0.85
571 0.78
572 0.73
573 0.73
574 0.68
575 0.62
576 0.58
577 0.51
578 0.54
579 0.52
580 0.51
581 0.5
582 0.54