FuNGI

A0A2S4PKN4

Protein Details

Accession

A0A2S4PKN4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
47-69	QVGVTKRKGKSRRFIFPRFPSEW	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
53-58	RKGKSR

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, mito_nucl 13, mito 11.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50158 ZF_CCHC

Amino Acid Sequences

MSLSSTRIASQILKFINSNRIYIDELNEEFNERVRKAAENDCDGSIQVGVTKRKGKSRRFIFPRFPSEWSKSKEAFGRAINSFEDKFKIGQSNKVAATILPGNYPHSPSPQISLAYNSPRGHLPERNIQQIPNLSRSSENYQAHMPLNPREIMALFSSFDKLDDLNWTTWKGHMKDNLEMHDLWEIVTGEEKKPSHDMSSAVKWMSREKVARTVIKNSLGVKDYHQVQYMNNVAEIWRILTGLHQKIGVQAKADLIWKFWSMRCAEGASVRDYIGAIRAVHMELAEMGTIIEDHLLAIAITKSLPQSYDTYVSTIFATLVNLEEADPIYITNKILEEEMRRESKSEDVNIATQKICYNCKKPGHTKEECYSKGGEAVKKKKDAGKIEQDIQVAEDDAFHASHMALVRTPKIESKNSTSYYWSHDLWIADSGANSHIANHREIFFNYTPSKGTLNVAGGLTANIEGTSVVYMRGIVNGKQNDLKLMNAGGGVKYEKGTCQFWNSKYKLIATETLDGNLYHVNAKAYMFHFPTVNSVSSPVVSWNQAHKRLGHTSLTSSTKIFDNGLIEGIKISEHEMRLKELNCESCIAAKAHRAPFSKLAERRSSQFGDLTHPDASVRQKLLNYCNSVHIQYGWWPKRVRTDNAAEYEGCRVWLEERGIELNTFALYAPQQNSVSERMNRTLLDLARAMRIEKNLPETLWGEAVLHAAWIRNRCPTEALNGATPIESLTGERPNLSMTREFRNDARKVVFTGLEDGPKAIRYFDESTRRIKISRNYNFIVKTPVDQNKERDEIESMRNNCESGESPTSERRNQISTRGKPINEIQKSALENNPRELRETTASGTSTRRNYAELSGFNPRKFIRYSKASNTVSTSSEGYLAGEYYVNSPYFTNIANELMIKNGDDELPNTIKEARQRSDWLSWDKAIQIELETLNQKCNWELVEPPKDKNKI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.32
3	0.4
4	0.37
5	0.36
6	0.3
7	0.31
8	0.32
9	0.32
10	0.32
11	0.27
12	0.27
13	0.29
14	0.27
15	0.27
16	0.24
17	0.27
18	0.3
19	0.25
20	0.26
21	0.25
22	0.29
23	0.32
24	0.4
25	0.42
26	0.42
27	0.45
28	0.43
29	0.42
30	0.37
31	0.33
32	0.24
33	0.17
34	0.15
35	0.19
36	0.21
37	0.27
38	0.35
39	0.38
40	0.48
41	0.57
42	0.63
43	0.67
44	0.73
45	0.78
46	0.79
47	0.85
48	0.85
49	0.85
50	0.84
51	0.78
52	0.73
53	0.7
54	0.67
55	0.67
56	0.62
57	0.6
58	0.53
59	0.54
60	0.56
61	0.52
62	0.51
63	0.47
64	0.48
65	0.41
66	0.42
67	0.38
68	0.36
69	0.33
70	0.3
71	0.28
72	0.24
73	0.23
74	0.25
75	0.32
76	0.3
77	0.37
78	0.41
79	0.45
80	0.43
81	0.44
82	0.4
83	0.3
84	0.33
85	0.29
86	0.24
87	0.19
88	0.2
89	0.22
90	0.24
91	0.28
92	0.25
93	0.25
94	0.28
95	0.27
96	0.31
97	0.31
98	0.31
99	0.28
100	0.31
101	0.31
102	0.33
103	0.39
104	0.35
105	0.33
106	0.35
107	0.39
108	0.4
109	0.4
110	0.4
111	0.43
112	0.48
113	0.54
114	0.52
115	0.48
116	0.48
117	0.5
118	0.48
119	0.44
120	0.4
121	0.33
122	0.34
123	0.38
124	0.39
125	0.4
126	0.38
127	0.34
128	0.35
129	0.37
130	0.36
131	0.35
132	0.33
133	0.28
134	0.31
135	0.29
136	0.27
137	0.24
138	0.23
139	0.21
140	0.19
141	0.16
142	0.13
143	0.13
144	0.15
145	0.13
146	0.13
147	0.12
148	0.11
149	0.1
150	0.15
151	0.17
152	0.18
153	0.2
154	0.22
155	0.21
156	0.25
157	0.32
158	0.28
159	0.31
160	0.36
161	0.38
162	0.43
163	0.47
164	0.47
165	0.43
166	0.41
167	0.35
168	0.31
169	0.26
170	0.19
171	0.17
172	0.14
173	0.11
174	0.16
175	0.17
176	0.16
177	0.22
178	0.22
179	0.22
180	0.25
181	0.27
182	0.24
183	0.24
184	0.26
185	0.26
186	0.32
187	0.33
188	0.29
189	0.29
190	0.27
191	0.3
192	0.31
193	0.32
194	0.3
195	0.3
196	0.39
197	0.43
198	0.49
199	0.48
200	0.51
201	0.5
202	0.5
203	0.49
204	0.42
205	0.4
206	0.35
207	0.32
208	0.28
209	0.28
210	0.29
211	0.28
212	0.29
213	0.26
214	0.24
215	0.3
216	0.31
217	0.26
218	0.22
219	0.19
220	0.17
221	0.17
222	0.17
223	0.11
224	0.07
225	0.07
226	0.06
227	0.1
228	0.18
229	0.19
230	0.2
231	0.19
232	0.19
233	0.25
234	0.31
235	0.28
236	0.21
237	0.2
238	0.2
239	0.22
240	0.25
241	0.19
242	0.15
243	0.16
244	0.17
245	0.18
246	0.19
247	0.21
248	0.19
249	0.21
250	0.21
251	0.2
252	0.2
253	0.21
254	0.22
255	0.2
256	0.19
257	0.18
258	0.16
259	0.15
260	0.14
261	0.12
262	0.12
263	0.09
264	0.09
265	0.1
266	0.1
267	0.1
268	0.1
269	0.08
270	0.06
271	0.06
272	0.05
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.04
278	0.03
279	0.03
280	0.03
281	0.03
282	0.03
283	0.03
284	0.04
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.05
289	0.06
290	0.06
291	0.07
292	0.09
293	0.11
294	0.14
295	0.17
296	0.17
297	0.18
298	0.17
299	0.17
300	0.15
301	0.13
302	0.11
303	0.08
304	0.07
305	0.06
306	0.07
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.05
314	0.05
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.08
322	0.1
323	0.12
324	0.15
325	0.2
326	0.22
327	0.22
328	0.22
329	0.23
330	0.26
331	0.26
332	0.25
333	0.22
334	0.21
335	0.24
336	0.25
337	0.25
338	0.2
339	0.17
340	0.18
341	0.18
342	0.23
343	0.25
344	0.28
345	0.35
346	0.41
347	0.48
348	0.55
349	0.62
350	0.66
351	0.65
352	0.66
353	0.65
354	0.68
355	0.61
356	0.54
357	0.45
358	0.36
359	0.36
360	0.34
361	0.32
362	0.31
363	0.39
364	0.42
365	0.44
366	0.47
367	0.46
368	0.5
369	0.52
370	0.51
371	0.52
372	0.51
373	0.52
374	0.52
375	0.48
376	0.4
377	0.34
378	0.26
379	0.17
380	0.12
381	0.09
382	0.05
383	0.06
384	0.06
385	0.05
386	0.05
387	0.04
388	0.06
389	0.07
390	0.07
391	0.08
392	0.09
393	0.1
394	0.11
395	0.12
396	0.14
397	0.17
398	0.21
399	0.23
400	0.29
401	0.34
402	0.36
403	0.36
404	0.35
405	0.32
406	0.34
407	0.34
408	0.27
409	0.21
410	0.21
411	0.2
412	0.18
413	0.18
414	0.13
415	0.1
416	0.09
417	0.09
418	0.07
419	0.08
420	0.07
421	0.08
422	0.11
423	0.12
424	0.14
425	0.14
426	0.15
427	0.15
428	0.16
429	0.2
430	0.17
431	0.2
432	0.19
433	0.19
434	0.19
435	0.19
436	0.19
437	0.14
438	0.14
439	0.12
440	0.12
441	0.12
442	0.11
443	0.1
444	0.09
445	0.08
446	0.07
447	0.06
448	0.05
449	0.03
450	0.03
451	0.03
452	0.03
453	0.03
454	0.03
455	0.03
456	0.03
457	0.04
458	0.04
459	0.07
460	0.07
461	0.09
462	0.14
463	0.15
464	0.16
465	0.18
466	0.18
467	0.18
468	0.17
469	0.16
470	0.11
471	0.1
472	0.09
473	0.08
474	0.08
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.06
479	0.07
480	0.07
481	0.07
482	0.09
483	0.11
484	0.12
485	0.18
486	0.22
487	0.26
488	0.35
489	0.35
490	0.37
491	0.36
492	0.36
493	0.32
494	0.29
495	0.29
496	0.23
497	0.25
498	0.21
499	0.2
500	0.2
501	0.17
502	0.16
503	0.12
504	0.1
505	0.07
506	0.07
507	0.07
508	0.07
509	0.08
510	0.1
511	0.1
512	0.13
513	0.13
514	0.13
515	0.13
516	0.13
517	0.16
518	0.15
519	0.15
520	0.12
521	0.12
522	0.12
523	0.11
524	0.11
525	0.1
526	0.09
527	0.1
528	0.11
529	0.18
530	0.23
531	0.27
532	0.29
533	0.29
534	0.32
535	0.34
536	0.36
537	0.3
538	0.25
539	0.23
540	0.27
541	0.28
542	0.25
543	0.22
544	0.2
545	0.18
546	0.18
547	0.16
548	0.12
549	0.11
550	0.1
551	0.11
552	0.1
553	0.09
554	0.08
555	0.08
556	0.07
557	0.06
558	0.07
559	0.08
560	0.09
561	0.13
562	0.14
563	0.16
564	0.2
565	0.21
566	0.22
567	0.23
568	0.24
569	0.21
570	0.22
571	0.2
572	0.18
573	0.19
574	0.17
575	0.15
576	0.17
577	0.23
578	0.26
579	0.32
580	0.32
581	0.33
582	0.39
583	0.43
584	0.47
585	0.44
586	0.46
587	0.46
588	0.45
589	0.45
590	0.45
591	0.41
592	0.34
593	0.32
594	0.27
595	0.26
596	0.27
597	0.26
598	0.21
599	0.19
600	0.18
601	0.19
602	0.21
603	0.2
604	0.19
605	0.18
606	0.2
607	0.24
608	0.3
609	0.32
610	0.33
611	0.3
612	0.33
613	0.32
614	0.31
615	0.28
616	0.22
617	0.18
618	0.2
619	0.3
620	0.29
621	0.33
622	0.34
623	0.35
624	0.44
625	0.49
626	0.48
627	0.44
628	0.48
629	0.48
630	0.5
631	0.5
632	0.41
633	0.36
634	0.34
635	0.27
636	0.2
637	0.14
638	0.11
639	0.1
640	0.15
641	0.15
642	0.13
643	0.14
644	0.16
645	0.16
646	0.16
647	0.14
648	0.1
649	0.09
650	0.08
651	0.07
652	0.06
653	0.06
654	0.09
655	0.11
656	0.14
657	0.15
658	0.15
659	0.17
660	0.2
661	0.25
662	0.25
663	0.27
664	0.26
665	0.28
666	0.27
667	0.27
668	0.28
669	0.24
670	0.22
671	0.21
672	0.2
673	0.2
674	0.21
675	0.2
676	0.17
677	0.19
678	0.19
679	0.19
680	0.24
681	0.23
682	0.22
683	0.24
684	0.22
685	0.21
686	0.19
687	0.17
688	0.12
689	0.1
690	0.11
691	0.08
692	0.07
693	0.07
694	0.08
695	0.11
696	0.13
697	0.15
698	0.2
699	0.22
700	0.23
701	0.26
702	0.25
703	0.28
704	0.29
705	0.3
706	0.25
707	0.25
708	0.24
709	0.21
710	0.2
711	0.14
712	0.1
713	0.08
714	0.07
715	0.1
716	0.13
717	0.13
718	0.14
719	0.14
720	0.15
721	0.17
722	0.18
723	0.22
724	0.21
725	0.28
726	0.31
727	0.33
728	0.35
729	0.43
730	0.42
731	0.41
732	0.42
733	0.36
734	0.35
735	0.36
736	0.33
737	0.25
738	0.28
739	0.24
740	0.22
741	0.21
742	0.19
743	0.17
744	0.18
745	0.17
746	0.13
747	0.11
748	0.15
749	0.2
750	0.27
751	0.36
752	0.36
753	0.41
754	0.46
755	0.47
756	0.43
757	0.46
758	0.46
759	0.48
760	0.54
761	0.56
762	0.54
763	0.57
764	0.58
765	0.52
766	0.5
767	0.4
768	0.34
769	0.36
770	0.41
771	0.41
772	0.44
773	0.47
774	0.48
775	0.51
776	0.48
777	0.41
778	0.38
779	0.36
780	0.39
781	0.42
782	0.38
783	0.38
784	0.38
785	0.36
786	0.32
787	0.3
788	0.25
789	0.23
790	0.26
791	0.24
792	0.27
793	0.35
794	0.41
795	0.42
796	0.44
797	0.41
798	0.42
799	0.42
800	0.49
801	0.51
802	0.52
803	0.58
804	0.61
805	0.57
806	0.56
807	0.61
808	0.62
809	0.55
810	0.52
811	0.45
812	0.44
813	0.46
814	0.46
815	0.43
816	0.41
817	0.39
818	0.44
819	0.48
820	0.43
821	0.44
822	0.42
823	0.41
824	0.38
825	0.38
826	0.33
827	0.3
828	0.3
829	0.29
830	0.31
831	0.33
832	0.32
833	0.33
834	0.32
835	0.3
836	0.31
837	0.35
838	0.37
839	0.33
840	0.33
841	0.4
842	0.43
843	0.42
844	0.45
845	0.4
846	0.38
847	0.4
848	0.42
849	0.4
850	0.44
851	0.52
852	0.55
853	0.65
854	0.63
855	0.62
856	0.6
857	0.54
858	0.47
859	0.41
860	0.34
861	0.25
862	0.23
863	0.21
864	0.16
865	0.14
866	0.12
867	0.11
868	0.1
869	0.09
870	0.1
871	0.13
872	0.13
873	0.13
874	0.13
875	0.14
876	0.15
877	0.15
878	0.16
879	0.14
880	0.16
881	0.16
882	0.17
883	0.15
884	0.16
885	0.16
886	0.14
887	0.13
888	0.13
889	0.13
890	0.13
891	0.14
892	0.18
893	0.2
894	0.19
895	0.2
896	0.21
897	0.23
898	0.29
899	0.37
900	0.34
901	0.37
902	0.42
903	0.47
904	0.51
905	0.56
906	0.55
907	0.52
908	0.5
909	0.46
910	0.43
911	0.39
912	0.32
913	0.26
914	0.21
915	0.19
916	0.18
917	0.21
918	0.23
919	0.23
920	0.26
921	0.27
922	0.26
923	0.24
924	0.25
925	0.23
926	0.2
927	0.27
928	0.32
929	0.41
930	0.44
931	0.48

A0A2S4PKN4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer