FuNGI

J7QZY5

Protein Details

Accession

J7QZY5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-40	MTTSMSYRKRNIPKDVTNNTANSSPLLKRQRKSNDNNGGF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto 3.5, cyto_mito 3.5, mito 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043954 Snu56_snRNP
Gene Ontology	GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF19097 Snu56_snRNP

Amino Acid Sequences

MTTSMSYRKRNIPKDVTNNTANSSPLLKRQRKSNDNNGGFESQNIWKNLERIRASMFDADKAIKNSCLFVPILANSRSQACVNLLHDYISSDKLKLVRVGKRTASSAPAYIALKNFSVLDCCLALTALFAVKDKSWVRQYNEEVLTISETVRIGGSVYFPKNTLWKTHNNVLSDPNFYISKSTMSSISEFQEYHLQLSTNESMTYFINGIGNFIVSLKFGKLKKDMDKSFSLALNSYNNSINLSIYETLLGPDALLDMKTVTTQNSPLIERSKKFMESYIHSLVHGETQPGKMQPVMQNNSVKETPRETPIVTQRYRSNVLHTSRMQTVRTTQPVNQGSPNNETHNAHYRRPEEVKSYCLTTLRASMDLVKKKQAQQIFKAYITCPKQGYLDKLTEKLEDIQSKTSCNVVVLHLNNIHESEPWFDSLKINRSATASPPPPSTMKIISVGGVGEYINRALKMIEKILDS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.82
2	0.82
3	0.79
4	0.74
5	0.67
6	0.6
7	0.52
8	0.42
9	0.34
10	0.32
11	0.28
12	0.32
13	0.41
14	0.46
15	0.48
16	0.57
17	0.66
18	0.72
19	0.78
20	0.8
21	0.8
22	0.78
23	0.77
24	0.72
25	0.64
26	0.54
27	0.46
28	0.39
29	0.34
30	0.34
31	0.32
32	0.3
33	0.29
34	0.34
35	0.38
36	0.43
37	0.39
38	0.35
39	0.38
40	0.37
41	0.38
42	0.39
43	0.35
44	0.28
45	0.29
46	0.29
47	0.29
48	0.29
49	0.28
50	0.25
51	0.25
52	0.25
53	0.23
54	0.23
55	0.2
56	0.18
57	0.19
58	0.18
59	0.23
60	0.22
61	0.22
62	0.21
63	0.23
64	0.23
65	0.2
66	0.2
67	0.16
68	0.2
69	0.21
70	0.23
71	0.21
72	0.2
73	0.2
74	0.19
75	0.2
76	0.19
77	0.18
78	0.15
79	0.18
80	0.19
81	0.22
82	0.26
83	0.32
84	0.34
85	0.39
86	0.44
87	0.46
88	0.47
89	0.47
90	0.43
91	0.4
92	0.35
93	0.31
94	0.26
95	0.25
96	0.23
97	0.22
98	0.21
99	0.18
100	0.16
101	0.16
102	0.15
103	0.12
104	0.13
105	0.11
106	0.11
107	0.1
108	0.1
109	0.09
110	0.08
111	0.08
112	0.06
113	0.06
114	0.06
115	0.06
116	0.06
117	0.08
118	0.08
119	0.15
120	0.15
121	0.2
122	0.27
123	0.34
124	0.38
125	0.45
126	0.48
127	0.5
128	0.51
129	0.46
130	0.38
131	0.32
132	0.28
133	0.21
134	0.17
135	0.1
136	0.09
137	0.09
138	0.08
139	0.07
140	0.06
141	0.06
142	0.09
143	0.12
144	0.14
145	0.14
146	0.15
147	0.16
148	0.2
149	0.21
150	0.24
151	0.23
152	0.3
153	0.35
154	0.42
155	0.45
156	0.42
157	0.42
158	0.42
159	0.4
160	0.35
161	0.29
162	0.24
163	0.2
164	0.18
165	0.18
166	0.13
167	0.13
168	0.11
169	0.12
170	0.11
171	0.12
172	0.14
173	0.14
174	0.15
175	0.15
176	0.14
177	0.14
178	0.19
179	0.18
180	0.17
181	0.17
182	0.15
183	0.14
184	0.18
185	0.18
186	0.12
187	0.12
188	0.11
189	0.11
190	0.11
191	0.12
192	0.08
193	0.07
194	0.09
195	0.08
196	0.09
197	0.08
198	0.07
199	0.06
200	0.06
201	0.06
202	0.04
203	0.05
204	0.05
205	0.11
206	0.12
207	0.15
208	0.19
209	0.24
210	0.32
211	0.4
212	0.41
213	0.41
214	0.41
215	0.4
216	0.38
217	0.34
218	0.27
219	0.19
220	0.18
221	0.16
222	0.14
223	0.14
224	0.12
225	0.11
226	0.11
227	0.11
228	0.1
229	0.08
230	0.09
231	0.08
232	0.07
233	0.08
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.03
245	0.04
246	0.05
247	0.05
248	0.06
249	0.07
250	0.08
251	0.1
252	0.12
253	0.13
254	0.15
255	0.2
256	0.23
257	0.23
258	0.26
259	0.27
260	0.26
261	0.26
262	0.28
263	0.26
264	0.27
265	0.33
266	0.34
267	0.31
268	0.29
269	0.29
270	0.25
271	0.24
272	0.2
273	0.15
274	0.12
275	0.13
276	0.15
277	0.15
278	0.15
279	0.12
280	0.16
281	0.2
282	0.27
283	0.3
284	0.33
285	0.37
286	0.37
287	0.41
288	0.38
289	0.34
290	0.27
291	0.28
292	0.25
293	0.24
294	0.26
295	0.22
296	0.27
297	0.34
298	0.4
299	0.37
300	0.39
301	0.39
302	0.42
303	0.47
304	0.41
305	0.38
306	0.37
307	0.4
308	0.43
309	0.41
310	0.39
311	0.4
312	0.42
313	0.37
314	0.32
315	0.33
316	0.33
317	0.37
318	0.36
319	0.32
320	0.39
321	0.41
322	0.42
323	0.42
324	0.39
325	0.37
326	0.39
327	0.4
328	0.34
329	0.34
330	0.33
331	0.33
332	0.4
333	0.41
334	0.39
335	0.43
336	0.42
337	0.45
338	0.48
339	0.46
340	0.43
341	0.42
342	0.42
343	0.37
344	0.38
345	0.33
346	0.3
347	0.29
348	0.23
349	0.25
350	0.23
351	0.22
352	0.2
353	0.25
354	0.31
355	0.37
356	0.38
357	0.4
358	0.43
359	0.48
360	0.55
361	0.55
362	0.54
363	0.54
364	0.62
365	0.59
366	0.56
367	0.53
368	0.47
369	0.48
370	0.46
371	0.42
372	0.33
373	0.3
374	0.33
375	0.35
376	0.4
377	0.37
378	0.41
379	0.4
380	0.42
381	0.42
382	0.38
383	0.36
384	0.34
385	0.35
386	0.33
387	0.33
388	0.36
389	0.36
390	0.37
391	0.35
392	0.33
393	0.26
394	0.22
395	0.21
396	0.17
397	0.23
398	0.23
399	0.27
400	0.28
401	0.28
402	0.28
403	0.27
404	0.25
405	0.19
406	0.19
407	0.18
408	0.16
409	0.18
410	0.19
411	0.19
412	0.24
413	0.29
414	0.35
415	0.38
416	0.37
417	0.37
418	0.39
419	0.4
420	0.39
421	0.42
422	0.4
423	0.36
424	0.38
425	0.4
426	0.39
427	0.39
428	0.39
429	0.33
430	0.32
431	0.31
432	0.29
433	0.26
434	0.25
435	0.23
436	0.17
437	0.14
438	0.11
439	0.09
440	0.09
441	0.1
442	0.12
443	0.11
444	0.12
445	0.12
446	0.17
447	0.21
448	0.24

J7QZY5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer