Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2S5B5I0

Protein Details
Accession A0A2S5B5I0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
338-358KDDAPTSRTSRRQRSPSESEGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-23KKRKGAPAGLRKK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039971  CWC24-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd16539  RING-HC_RNF113A_B  
Amino Acid Sequences MSSDAPVTFIKKRKGAPAGLRKKPTLGGDDHASSSSSSQPATSEVIHATKRAVASHLIQGTGNKRRKTQQDAAGDLSDSGDDAGDDGKKDSFAVRHSTERRAQRRRSESPPAWMSSEQVKELKRDKNAAPEEEIAEDGLYHGSSKQRNQVPKAAGPVKAGPTNVRQITVVDYQPDVCKDYKETGFCGFGDTCKFLHDRGDYLHGWQLDNSFLSNQAASGSFMAKQRARDGDDASDADSDTDDLPFACLICRKPFGPDPVVTLCGHYFDSACAIKRFAKTGKCFACGSSTNGVFNRATKLVARQKEREALNAKAREEEEGEAAGDDDEGIEIEGLAEVKDDAPTSRTSRRQRSPSESEGEYEEEVENEVPRRRPIIEIQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.64
3 0.67
4 0.71
5 0.74
6 0.77
7 0.79
8 0.72
9 0.67
10 0.63
11 0.57
12 0.51
13 0.45
14 0.4
15 0.4
16 0.41
17 0.39
18 0.34
19 0.3
20 0.25
21 0.23
22 0.22
23 0.18
24 0.15
25 0.14
26 0.15
27 0.16
28 0.18
29 0.18
30 0.15
31 0.17
32 0.21
33 0.22
34 0.21
35 0.2
36 0.2
37 0.21
38 0.2
39 0.19
40 0.18
41 0.2
42 0.26
43 0.26
44 0.24
45 0.24
46 0.27
47 0.32
48 0.39
49 0.44
50 0.4
51 0.43
52 0.51
53 0.58
54 0.64
55 0.65
56 0.64
57 0.65
58 0.66
59 0.65
60 0.58
61 0.5
62 0.4
63 0.31
64 0.22
65 0.14
66 0.09
67 0.05
68 0.04
69 0.04
70 0.06
71 0.06
72 0.07
73 0.08
74 0.09
75 0.09
76 0.1
77 0.12
78 0.13
79 0.15
80 0.21
81 0.23
82 0.32
83 0.35
84 0.42
85 0.46
86 0.54
87 0.61
88 0.64
89 0.69
90 0.71
91 0.76
92 0.77
93 0.77
94 0.78
95 0.71
96 0.7
97 0.66
98 0.58
99 0.52
100 0.45
101 0.39
102 0.35
103 0.34
104 0.27
105 0.27
106 0.26
107 0.28
108 0.35
109 0.39
110 0.36
111 0.4
112 0.4
113 0.46
114 0.49
115 0.46
116 0.42
117 0.38
118 0.35
119 0.3
120 0.28
121 0.18
122 0.13
123 0.1
124 0.07
125 0.06
126 0.05
127 0.04
128 0.05
129 0.1
130 0.13
131 0.16
132 0.23
133 0.29
134 0.35
135 0.39
136 0.45
137 0.44
138 0.44
139 0.49
140 0.44
141 0.4
142 0.36
143 0.35
144 0.3
145 0.28
146 0.26
147 0.21
148 0.2
149 0.25
150 0.24
151 0.22
152 0.19
153 0.18
154 0.21
155 0.22
156 0.2
157 0.14
158 0.14
159 0.14
160 0.15
161 0.15
162 0.13
163 0.11
164 0.11
165 0.12
166 0.16
167 0.18
168 0.18
169 0.19
170 0.19
171 0.2
172 0.19
173 0.2
174 0.15
175 0.13
176 0.14
177 0.13
178 0.12
179 0.12
180 0.13
181 0.1
182 0.14
183 0.14
184 0.14
185 0.14
186 0.19
187 0.17
188 0.18
189 0.21
190 0.17
191 0.16
192 0.15
193 0.15
194 0.1
195 0.11
196 0.1
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.09
208 0.11
209 0.15
210 0.17
211 0.17
212 0.21
213 0.24
214 0.26
215 0.26
216 0.26
217 0.24
218 0.24
219 0.23
220 0.2
221 0.17
222 0.14
223 0.12
224 0.1
225 0.08
226 0.06
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.08
235 0.11
236 0.14
237 0.17
238 0.17
239 0.22
240 0.26
241 0.31
242 0.33
243 0.31
244 0.32
245 0.33
246 0.35
247 0.3
248 0.27
249 0.21
250 0.18
251 0.18
252 0.13
253 0.11
254 0.09
255 0.13
256 0.13
257 0.15
258 0.15
259 0.17
260 0.21
261 0.22
262 0.27
263 0.28
264 0.35
265 0.37
266 0.46
267 0.48
268 0.47
269 0.46
270 0.42
271 0.42
272 0.36
273 0.36
274 0.33
275 0.3
276 0.3
277 0.3
278 0.32
279 0.26
280 0.26
281 0.26
282 0.2
283 0.2
284 0.18
285 0.27
286 0.33
287 0.4
288 0.45
289 0.45
290 0.5
291 0.56
292 0.56
293 0.54
294 0.51
295 0.5
296 0.52
297 0.53
298 0.48
299 0.45
300 0.44
301 0.38
302 0.36
303 0.3
304 0.22
305 0.18
306 0.18
307 0.13
308 0.13
309 0.11
310 0.08
311 0.07
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.08
328 0.1
329 0.14
330 0.2
331 0.28
332 0.37
333 0.46
334 0.56
335 0.65
336 0.72
337 0.78
338 0.81
339 0.81
340 0.79
341 0.75
342 0.66
343 0.58
344 0.52
345 0.45
346 0.36
347 0.3
348 0.23
349 0.17
350 0.17
351 0.16
352 0.16
353 0.18
354 0.23
355 0.25
356 0.28
357 0.31
358 0.31