Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2S5BBE0

Protein Details
Accession A0A2S5BBE0    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
198-222RPPPLTTPSARKRRRRDPLDPELDEBasic
356-380PALGKDGKPKKARPKKPKPGEAASGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
208-212RKRRR
267-270KKRR
316-375KKEEGGTPAEEKKAEPKGKGKAKDKDGAPATPSGKGGADSPALGKDGKPKKARPKKPKPG
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11.5, mito 6, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MASRTAMPQSWDATRAPPPSTGQPQSLQLPQQANAPAQTTTPGPAPSSNGQQLQPGASAAGRGPSADPEAGPSEPARATNVDSLMDAVGASGVDLGAEEESLRATNERLHAQAMAAQASAQGSNPNAYTGVDRLRKQDFIDPGALAEVVKKVAAAFALKTLEPDTIPFIALATRHRLESLITASVAARDHRQSSSHFRPPPLTTPSARKRRRRDPLDPELDEPEDEDNEMEDLSDLPKQPAWDTLVYDDPERYLTVLERVDRDEERKKRRERMLRDQKEQEERELAEAMAAAEAAQRALESDGPGGGSGGSGGGSKKEEGGTPAEEKKAEPKGKGKAKDKDGAPATPSGKGGADSPALGKDGKPKKARPKKPKPGEAASGTSTPLPAGGSGVKNLSEDVRKRLTDQHALRSLGGQKFSWLNAGVGSPSPAGMGGFGTPLGLPKPKFATPSSLPPPSFAPLGNASGSATTSTSGLNPANNAPSTPAGPSRTDGFALDASAAASALTTSRLNVPQLHDAQRSQVAKEAWEAGHHIVELPDLLFALERERGMGVGRGSGKNSAVRGRAGVTRGGGKPALGSSQGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.34
3 0.33
4 0.33
5 0.35
6 0.41
7 0.48
8 0.48
9 0.45
10 0.44
11 0.47
12 0.48
13 0.49
14 0.43
15 0.41
16 0.39
17 0.36
18 0.39
19 0.37
20 0.34
21 0.31
22 0.3
23 0.24
24 0.21
25 0.22
26 0.18
27 0.17
28 0.18
29 0.18
30 0.18
31 0.19
32 0.24
33 0.26
34 0.32
35 0.36
36 0.36
37 0.35
38 0.36
39 0.36
40 0.33
41 0.29
42 0.22
43 0.18
44 0.14
45 0.14
46 0.11
47 0.12
48 0.1
49 0.1
50 0.11
51 0.12
52 0.16
53 0.15
54 0.15
55 0.16
56 0.19
57 0.18
58 0.19
59 0.17
60 0.17
61 0.17
62 0.18
63 0.17
64 0.16
65 0.18
66 0.21
67 0.22
68 0.19
69 0.18
70 0.18
71 0.16
72 0.14
73 0.11
74 0.07
75 0.06
76 0.05
77 0.04
78 0.03
79 0.03
80 0.03
81 0.03
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.05
88 0.05
89 0.06
90 0.06
91 0.07
92 0.12
93 0.15
94 0.18
95 0.19
96 0.19
97 0.19
98 0.19
99 0.21
100 0.18
101 0.15
102 0.12
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.12
116 0.13
117 0.2
118 0.24
119 0.26
120 0.3
121 0.33
122 0.34
123 0.34
124 0.38
125 0.34
126 0.32
127 0.33
128 0.28
129 0.25
130 0.24
131 0.21
132 0.14
133 0.12
134 0.09
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.1
144 0.11
145 0.11
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.13
152 0.11
153 0.12
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.12
159 0.15
160 0.16
161 0.16
162 0.16
163 0.16
164 0.16
165 0.18
166 0.18
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.14
172 0.14
173 0.12
174 0.12
175 0.13
176 0.15
177 0.16
178 0.18
179 0.2
180 0.29
181 0.37
182 0.43
183 0.44
184 0.43
185 0.47
186 0.48
187 0.51
188 0.47
189 0.42
190 0.37
191 0.43
192 0.51
193 0.57
194 0.63
195 0.66
196 0.7
197 0.76
198 0.84
199 0.83
200 0.84
201 0.83
202 0.84
203 0.84
204 0.76
205 0.68
206 0.6
207 0.51
208 0.41
209 0.32
210 0.22
211 0.13
212 0.11
213 0.09
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.09
225 0.1
226 0.1
227 0.12
228 0.14
229 0.13
230 0.14
231 0.15
232 0.18
233 0.18
234 0.18
235 0.15
236 0.13
237 0.12
238 0.11
239 0.1
240 0.07
241 0.07
242 0.09
243 0.11
244 0.12
245 0.12
246 0.13
247 0.16
248 0.16
249 0.21
250 0.27
251 0.34
252 0.42
253 0.5
254 0.55
255 0.61
256 0.69
257 0.74
258 0.74
259 0.77
260 0.79
261 0.78
262 0.79
263 0.76
264 0.72
265 0.71
266 0.63
267 0.53
268 0.44
269 0.36
270 0.3
271 0.25
272 0.19
273 0.11
274 0.1
275 0.08
276 0.05
277 0.05
278 0.03
279 0.03
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.04
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.04
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.07
304 0.07
305 0.08
306 0.09
307 0.11
308 0.13
309 0.16
310 0.18
311 0.18
312 0.18
313 0.18
314 0.22
315 0.28
316 0.28
317 0.28
318 0.32
319 0.4
320 0.48
321 0.56
322 0.59
323 0.58
324 0.61
325 0.64
326 0.59
327 0.58
328 0.53
329 0.46
330 0.38
331 0.35
332 0.31
333 0.26
334 0.25
335 0.18
336 0.16
337 0.15
338 0.14
339 0.11
340 0.1
341 0.09
342 0.1
343 0.09
344 0.1
345 0.1
346 0.1
347 0.17
348 0.24
349 0.32
350 0.38
351 0.44
352 0.55
353 0.66
354 0.76
355 0.78
356 0.82
357 0.85
358 0.9
359 0.91
360 0.87
361 0.82
362 0.78
363 0.71
364 0.63
365 0.54
366 0.44
367 0.36
368 0.28
369 0.22
370 0.15
371 0.12
372 0.08
373 0.05
374 0.06
375 0.08
376 0.09
377 0.1
378 0.11
379 0.11
380 0.11
381 0.11
382 0.13
383 0.16
384 0.18
385 0.22
386 0.27
387 0.27
388 0.29
389 0.36
390 0.4
391 0.43
392 0.45
393 0.48
394 0.49
395 0.49
396 0.47
397 0.43
398 0.44
399 0.37
400 0.35
401 0.26
402 0.22
403 0.23
404 0.23
405 0.22
406 0.16
407 0.13
408 0.12
409 0.13
410 0.11
411 0.1
412 0.11
413 0.09
414 0.08
415 0.07
416 0.07
417 0.06
418 0.05
419 0.06
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.06
426 0.08
427 0.12
428 0.12
429 0.16
430 0.21
431 0.22
432 0.26
433 0.27
434 0.33
435 0.32
436 0.41
437 0.44
438 0.46
439 0.44
440 0.42
441 0.43
442 0.37
443 0.35
444 0.25
445 0.23
446 0.19
447 0.21
448 0.2
449 0.17
450 0.15
451 0.14
452 0.14
453 0.11
454 0.09
455 0.07
456 0.08
457 0.08
458 0.08
459 0.11
460 0.12
461 0.12
462 0.13
463 0.15
464 0.19
465 0.19
466 0.19
467 0.18
468 0.18
469 0.19
470 0.19
471 0.22
472 0.21
473 0.22
474 0.24
475 0.25
476 0.25
477 0.24
478 0.22
479 0.2
480 0.18
481 0.17
482 0.15
483 0.12
484 0.1
485 0.09
486 0.08
487 0.05
488 0.05
489 0.04
490 0.04
491 0.06
492 0.07
493 0.08
494 0.13
495 0.15
496 0.18
497 0.22
498 0.26
499 0.32
500 0.38
501 0.43
502 0.42
503 0.4
504 0.42
505 0.46
506 0.43
507 0.36
508 0.35
509 0.3
510 0.27
511 0.3
512 0.3
513 0.23
514 0.23
515 0.25
516 0.21
517 0.21
518 0.2
519 0.18
520 0.13
521 0.13
522 0.13
523 0.1
524 0.08
525 0.07
526 0.07
527 0.06
528 0.07
529 0.09
530 0.11
531 0.11
532 0.12
533 0.12
534 0.13
535 0.14
536 0.17
537 0.15
538 0.19
539 0.24
540 0.25
541 0.26
542 0.29
543 0.3
544 0.3
545 0.33
546 0.34
547 0.32
548 0.31
549 0.31
550 0.32
551 0.34
552 0.32
553 0.31
554 0.28
555 0.32
556 0.32
557 0.34
558 0.32
559 0.27
560 0.27
561 0.25
562 0.25